基于生物信息學(xué)構(gòu)建卵巢漿液性腺癌預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)模型 及潛在中藥預(yù)測(cè)分析

盛超，金芳和

1 湖南中醫(yī)藥大學(xué) 湖南長(zhǎng)沙 410208 2 湖南中醫(yī)藥大學(xué)附屬常德醫(yī)院 湖南常德 415000

根據(jù)卵巢惡性腫瘤診斷與治療指南（2021年版）指出[1]，卵巢癌是嚴(yán)重威脅婦女健康的惡性腫瘤之一，發(fā)病率在女性生殖系統(tǒng)惡性腫瘤中位居第3 位，病死率居?jì)D科惡性腫瘤之首。卵巢癌以上皮性腫瘤最為常見(jiàn)，占90%以上。占5%~6%，生殖細(xì)胞腫瘤占2%~3%[2]。在上皮性卵巢癌中，高級(jí)別漿液性癌（high grade serous carcinoma，HGSC）占70%，子宮內(nèi)膜樣癌占10%，透明細(xì)胞癌占10%，黏液性癌占3%，低級(jí)別漿液性癌（low grade serous carcinoma，LGSC）＜5%[3]。其中在卵巢漿液性腺癌（Ovarian serous cystadenocarcinoma，OV）中，高級(jí)別漿液性癌與低級(jí)別漿液性癌均為惡性腫瘤[1]。而對(duì)于上皮性卵巢癌的化療，卡鉑-紫杉醇聯(lián)合化療仍然是一線(xiàn)化療的首選方 案[4]。然而，由于耐藥性強(qiáng)，大多數(shù)患者最終復(fù)發(fā)，特別是對(duì)于鉑類(lèi)藥物[5]。因此，藥物的選擇對(duì)于OV 靶點(diǎn)的干預(yù)顯得尤為重要。

本研究采用生物信息學(xué)方法，以O(shè)V 核心差異預(yù)后基因?yàn)槁淠_點(diǎn)，構(gòu)建OV 預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分系統(tǒng)，開(kāi)發(fā)有效的臨床預(yù)后預(yù)測(cè)模型，分析預(yù)后基因的免疫浸潤(rùn)情況，望篩選出臨床有效治療OV 的潛在中藥，為中醫(yī)藥干預(yù)卵巢癌提供了新思路。

資料與方法

1 卵巢漿液性腺癌差異預(yù)后基因的獲取

通過(guò)癌癥基因組圖譜TCGA（https：//portal.gdc.cancer.gov/）數(shù)據(jù)庫(kù)，下載卵巢漿液性腺癌RNAseq 及其對(duì)應(yīng)臨床信息數(shù)據(jù)。

采 用R 語(yǔ) 言DESeq2 包[6]，以 |log2（FC）|＞1.0、p.adj＜0.05 為篩選條件，對(duì)卵巢漿液性腺癌轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行差異分析，獲取卵巢漿液性腺癌差異基因（Differentially Expressed Genes，DEGs）。

采用R 語(yǔ)言survminer、survival 包，以卵巢漿液性腺癌患者的總體生存期（Overall Survival，OS）及生存時(shí)間為結(jié)局變量，通過(guò)單因素Cox 回歸分析，以P＜0.05 為篩選條件，獲取卵巢漿液性腺癌預(yù)后分子[7]。……