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細菌黏菌素耐藥性及其逆轉(zhuǎn)機制研究進展

2022-11-05 06:57:52胡功政崔小蝶翟亞軍賀丹丹
生物技術(shù)通報 2022年9期
關(guān)鍵詞:耐藥機制

胡功政 崔小蝶 翟亞軍 賀丹丹

(河南農(nóng)業(yè)大學(xué)動物醫(yī)學(xué)院,鄭州 450046)

黏菌素(colistin,COL)屬于陽離子多肽類抗生素,因腎臟和神經(jīng)毒性于20世紀70年代幾乎被棄用,由于多重耐藥(multidrug-resistant,MDR)革蘭陰性菌的出現(xiàn),醫(yī)學(xué)和獸醫(yī)臨床將面臨無抗菌藥可用的局面,因此COL又被老藥新用,作為治療嚴重MDR革蘭陰性菌感染的最后一道防線。而隨著COL使用的增長,細菌COL耐藥性世界范圍內(nèi)日益增長,已成為全球關(guān)注的焦點。研制具有新作用靶點的新抗菌藥異常艱難,而逆轉(zhuǎn)耐藥性的聯(lián)合用藥(與新的化合物或老藥聯(lián)用)是與MDR細菌斗爭的經(jīng)濟、有效策略。聯(lián)合用藥可利用藥物間的協(xié)同作用,大幅提高抗菌療效,克服細菌耐藥性,減緩耐藥性發(fā)展。逆轉(zhuǎn)COL耐藥性的化合物篩選、逆轉(zhuǎn)作用(聯(lián)合用藥協(xié)同增效)及其機制研究,近年已引起國內(nèi)外高度重視[1-4],并已取得可喜進展。

細菌COL耐藥性,本質(zhì)上是細菌在COL壓力下、為了生存而產(chǎn)生的適應(yīng)性反應(yīng),與COL的作用機制密切相關(guān);而聯(lián)用藥物或佐藥的逆轉(zhuǎn)作用往往也針對其作用機制和耐藥機制,即作用機制、耐藥機制與逆轉(zhuǎn)耐藥機制間具有有機的內(nèi)部聯(lián)系。

1 COL作用機制

過去一般認為COL對革蘭陰性菌的作用機制是膜損害(膜裂解死亡途徑),現(xiàn)在的試驗已證明其作用機制還包括:囊泡-囊泡觸聯(lián)途徑、活性氧(reactive oxygen species,ROS)殺滅途徑及呼吸酶抑制途徑。

1.1 膜裂解死亡途徑

COL可選擇性地與革蘭陰性菌外膜(outer membrane,OM)LPS(起始靶位)結(jié)合,通過膜裂解殺滅細菌[5-7]。首先,COL帶正電荷的二氨基丁酸殘基中的游離r-氨基質(zhì)子化,靜電吸引類脂A中帶負電荷的磷酸頭部,競爭性替代Ca2+和Mg2+。隨后COL分子插入疏水性N-末端脂肪酸鏈和D-phe6-L-leu7片段進入外膜,減弱鄰近類脂A的組裝,引起外膜膨脹并形成不穩(wěn)定區(qū)。最后,COL橫跨疏水頭部和脂肪酸鏈的表面,引起自促攝入(self-promoted uptake),使內(nèi)膜(internal membrane,IM)稀薄并破壞磷脂雙層的完整性,從而導(dǎo)致IM裂解和細菌死亡。

1.2 囊泡-囊泡觸聯(lián)途徑

COL分子可借助于靜電作用和兩個疏水區(qū),與陰離子的磷脂囊泡(即OM內(nèi)葉和IM的外葉)結(jié)合,介導(dǎo)環(huán)繞周質(zhì)的囊泡-囊泡觸聯(lián)融合,引起囊泡間(OM和IM小葉間)的磷脂交換,導(dǎo)致磷脂組成的特異性喪失和滲透性平衡破壞,使細菌裂解死亡[5-7]。

1.3 羥基自由基(·OH)誘導(dǎo)的死亡途徑(活性氧ROS殺滅途徑)

COL穿過外膜和內(nèi)膜時,使細菌活性氧(ROS)[超氧化物(O2-)、過氧化氫(H2O2)、羥自由基(·OH)]水平升高,首先促進生成O2-,O2-隨后由超氧化物歧化酶(SOD)轉(zhuǎn)換成H2O2,H2O2將Fe2+氧化成Fe3+并生成·OH(芬頓反應(yīng))。·OH可導(dǎo)致DNA損傷、脂質(zhì)和蛋白質(zhì)的氧化損傷,最終導(dǎo)致細菌死亡[5,7]。這一過程不依賴于COL與OM特異性靶位點的結(jié)合。

此外,COL刺激大腸桿菌soxS的表達,soxS是sodA(編碼含Mn-SOD),fpr(編碼NADPH:鐵氧蛋白氧化還原酶)和ydbK(編碼Fe-S還原酶)等ROS應(yīng)激相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄激活劑[5]。

1.4 呼吸酶抑制途徑

COL穿過外膜和內(nèi)膜進入細胞后,可加速TCA(三羧酸)循環(huán)和增強呼吸鏈,通過抑制細菌呼吸鏈中的NADH氧化酶等關(guān)鍵酶,造成呼吸鏈混亂并生成超氧化物[5-6]。

2 COL耐藥機制研究進展

沙門菌、大腸桿菌等對COL的獲得性耐藥機制十分復(fù)雜,主要有染色體介導(dǎo)的脂多糖(LPS)修飾[由雙組分信號轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)(TCSs)PhoPQ和PmrAB]、質(zhì)粒介導(dǎo)的可轉(zhuǎn)移COL耐藥(mcr基因)及尚未闡明分子機制的主動外排系統(tǒng)等[7-9]。

2.1 染色體介導(dǎo)的LPS修飾(涉及2個TCSs PhoPQ和PmrAB)

2.1.1 PhoPQ介導(dǎo)LPS類脂的AL-Ara4N修飾 TCS PhoPQ由感應(yīng)子激酶PhoQ和調(diào)控子PhoP組成(圖1)。PhoP通過感應(yīng)陽離子抗菌肽等外部信號使自身發(fā)生磷酸化而被激活,后者再激活arnBCADTEF(也稱pmrH)的表達。pmrH編碼4-氨基-4-脫氧-L-阿拉伯糖(Ara4N)轉(zhuǎn)移酶,使陽離子的Ara4N加成到類脂A的磷酸基團,產(chǎn)生L-Ara4N化修飾,導(dǎo)致陽離子COL與外膜陰性LPS的親和力降低,使細菌耐藥[7-9]。MgrB為負性調(diào)控蛋白,通過抑制PhoQ而抑制pmrH的表達。mgrB缺失、變異,均可上調(diào)PhoPQ和pmrH的表達,導(dǎo)致對COL耐藥。

圖1 由脂多糖(LPS)修飾介導(dǎo)的沙門菌對黏菌素的一般耐藥機制Fig. 1 General mechanism of Salmonella resistance to COL mediated by lipopolysaccharide(LPS)modification

2.1.2 PmrAB介導(dǎo)的類脂A的pEtN修飾 TCS PmrAB由感應(yīng)子激酶PmrB和調(diào)控子PmrA組成(圖1)。沙門菌中,PmrD是PhoPQ和PmrAB兩個TCSs間的連接蛋白,發(fā)揮正調(diào)控作用。PmrB感應(yīng)外部信號(如COL等)被激活,通過磷酸轉(zhuǎn)移使PmrA磷酸化而激活,進而上調(diào)pmrC表達,pmrC編碼磷酸乙醇胺(pEtN)轉(zhuǎn)移酶,使pEtN加成到類脂A的1-磷酸上,產(chǎn)生pEtN修飾,使細菌耐藥[8-9]。PhoPQ也可通過激活PmrD,間接激活PmrAB,進而刺激pmrC的表達。PmrA磷酸化后也可上調(diào)pmrH的表達。

PmrA介導(dǎo)的LPS修飾發(fā)生于類脂A、核心多糖和 O-抗原鏈 3 個區(qū)域[6,8]。(1)最內(nèi)的類脂 A區(qū),PmrA除激活pmrC、pmrH外,還可激活L-Ara4N生物合成與類脂A修飾物加合相關(guān)基因ugd(編碼UDP-葡萄糖-脫氫酶)和pbg(編碼L-Ara4N轉(zhuǎn)移酶)的表達;(2)中心的核心多糖區(qū),PmrA可激活eptB和cptA基因,后者的產(chǎn)物可介導(dǎo)LPS核心區(qū)磷酸化的庚糖(I)磷酸基團的PEtN修飾;(3)最外的O-抗原鏈,O抗原長度的增加將導(dǎo)致對COL高度耐藥,PmrA可上調(diào)沙門菌LPS修飾位點Wzzst和Wzzsep基因的轉(zhuǎn)錄,增加LPS中O-抗原量,增加耐藥性。

2.2 質(zhì)粒介導(dǎo)的耐藥機制

自質(zhì)粒介導(dǎo)的mcr-1(編碼pEtN轉(zhuǎn)移酶)被發(fā)現(xiàn)以來[10],已在全球動物和人的腸桿菌科細菌中相繼檢出。迄今已報道10種mcr基因(mcr-1-mcr-10)[11]。MCR-1編碼一個pEtN轉(zhuǎn)移酶,導(dǎo)致在pEtN加成到LPS的脂質(zhì)A,增加LPS上的陽離子電荷,從而降低COL與LPS的結(jié)合[10]。所有已發(fā)表的MCR-1的晶體結(jié)構(gòu)都表明MCR-1的活性位點有至少一個共同的鋅離子,證實MCR-1是一種鋅離子蛋白[12]。mcr-1可同時位于染色體和質(zhì)粒上,單拷貝mcr-1可致LPS修飾,而多拷貝染色體mcr-1可促進耐藥性的穩(wěn)定持續(xù)[13]。位于質(zhì)粒上的mcr基因加速了COL耐藥性在不同細菌種屬之間的傳播,因此為解決COL耐藥日益嚴重的問題,中國已禁止將COL作為飼料添加劑用于促生長,許多歐洲國家也減少了COL在畜牧業(yè)中的應(yīng)用[14]。

2.3 未闡明分子機制的主動外排系統(tǒng)

采用正向(激活)或反向(基因缺失或外排泵抑制)研究均證明,外排泵如AcrAB-TolC(大腸桿菌、沙門菌等),KpnEF(肺炎克雷伯菌),以及MexXYOprM(綠膿桿菌)等在COL耐藥性中十分重要[8-9]。外排泵抑制劑CCCP能逆轉(zhuǎn)多種細菌對COL的耐藥性,無論涉及pmrB、mgrB變異,還是涉及mcr-1陽性,均有逆轉(zhuǎn)效果[15]。我們前期研究發(fā)現(xiàn),沙門菌主動外排系統(tǒng)(AcrAB-TolC)ΔacrB時,并不明顯改變對COL的敏感性,但當ΔtolC或ΔacrB與CpxAR系統(tǒng)激活協(xié)同作用時,菌株對COL的敏感性顯著增強[16-19]。而SoxRS可通過上調(diào)AcrAB-TolC介導(dǎo)陰溝和阿氏腸桿菌對COL的異質(zhì)性耐藥[20]。盡管現(xiàn)已證明外排泵在COL耐藥性中有重要作用,但其具體分子機制并不清楚。

3 佐藥逆轉(zhuǎn)細菌COL耐藥性的研究進展

3.1 逆轉(zhuǎn)COL耐藥性的藥物或化合物

研發(fā)新抗菌藥耗時長、費用高、風(fēng)險大,而抗生素佐藥(adjuvants)針對細菌的非必須功能,并增強抗生素活性,可提供經(jīng)濟有效的方法逆轉(zhuǎn)細菌耐藥性。

目前,應(yīng)用佐藥逆轉(zhuǎn)COL耐藥性已成為研究熱點,有多種方法用于佐藥篩選,如表型檢測(MIC測定、棋盤試驗等)、分子對接技術(shù)、生物信息學(xué)方法[4]和萬古霉素低溫拮抗作用篩選方法[21]等。萬古霉素低溫拮抗作用是有用的較新的特異性篩選平臺,E.coli在應(yīng)激期間對萬古霉素變得敏感,這種表型可由滅活涉及外膜生物合成尤其是LPS核心多糖合成所必需的基因所逆轉(zhuǎn)。由于涉及非必需的外膜生物合成的基因損害,常常使革蘭陰性菌對經(jīng)典的作用于革蘭陽性菌的抗生素敏感,故在低溫下即15℃對萬古霉素拮抗作用的篩選檢測,可檢出擾亂外膜的非致死分子即逆轉(zhuǎn)COL耐藥性的化合物。已有研究利用該篩選方法對1 440種之前批準的藥物進行了篩選,篩選鑒定出1種活性化合物噴他脒(pentamidine),能夠逆轉(zhuǎn)革蘭陰性菌的COL耐藥性,突顯了這種篩選方法的特異性。

已報道逆轉(zhuǎn)COL耐藥性的佐藥約60余種,主要包括(1)抗寄生蟲藥物:如抗原蟲藥噴他脒、水楊酰苯胺類抗蠕蟲藥五羥氯柳胺、氯硝柳胺、碘醚柳胺等[21-25];(2)大環(huán)內(nèi)酯類抗革蘭陽性菌抗生素克拉霉素、阿奇霉素等[26];(3)其他藥物:褪黑素[27]、紫檀芪(抗癌)[28]、疊氮胸苷[29]、阿司匹林等;(4)天然化合物:如白藜蘆醇、熊果酸、蛇床子素、丁香酚[30-33];(5)藥物衍生物:如苯并咪唑、色胺和苯氨乙酮衍生物和[34-35];(6)新的先導(dǎo)化合物:如廣譜佐藥SLAP-S25[1]、OmpA抑制劑AOA-2[36];(7)小分子化合物 :二氨基咪唑[37]、dephostatin[38]和帶正電荷的二胺嗎啡代寡核苷酸肽[39]。

3.2 逆轉(zhuǎn)COL耐藥性的分子機制

逆轉(zhuǎn)COL耐藥性的機制研究報道不斷增加,但仍處于初步探索階段,大多數(shù)僅針對相應(yīng)藥物的某一方面機制進行研究且不深入,復(fù)雜的逆轉(zhuǎn)機制闡明仍面臨著挑戰(zhàn)。目前已報道的逆轉(zhuǎn)COL耐藥的機制主要分為以下幾個方面:與COL作用機制相關(guān)的逆轉(zhuǎn)機制,與COL耐藥機制相關(guān)的逆轉(zhuǎn)機制、影響外膜蛋白表達的逆轉(zhuǎn)機制以及綜合逆轉(zhuǎn)機制。

與COL作用機制相關(guān)的逆轉(zhuǎn)機制主要有:(1)損害細菌外膜:通過外漏蛋白質(zhì)或核酸含量的測定、膜完整性和通透性試驗、細菌的溶解檢測等試驗證明 :如噴他脒[21]、氯羥柳胺[22]、粉防己堿[40]等逆轉(zhuǎn)細菌(肺炎克雷伯菌、銅綠假單胞菌、鮑曼不動桿菌、大腸桿菌)COL耐藥性,其機制在于損害細菌外膜而增加了細菌外膜的通透性;(2)增強氧化應(yīng)激:質(zhì)子驅(qū)動力(PMF)的破壞會減少ATP的生成,增加氧氣消耗和氧化應(yīng)激。當外排泵受到抑制時,通過PMF、細胞內(nèi)ATP水平、耗氧量及菌體內(nèi)氧化還原電位測定等證明,氯硝柳胺能使大腸桿菌解偶聯(lián)氧化磷酸化,破壞菌株的氧化還原穩(wěn)態(tài),導(dǎo)致氧化應(yīng)激增加,是逆轉(zhuǎn)COL耐藥性的機制之一[41]。

與COL耐藥機制相關(guān)的逆轉(zhuǎn)機制主要有:(1)抑制mcr-1的表達或抑制MCR-1蛋白,如粉防己堿可抑制 mcr-1 的表達[40];蛇床子素[32]、紫檀芪[28]、苯氨乙酮衍生物(能通過氫鍵與MCR-1蛋白互作,抑制MCR-1晶體所導(dǎo)致的磷酸乙醇胺(pEtN)轉(zhuǎn)移反應(yīng),抑制MCR-1的酶活性)[35]、丁香酚[33]不僅可抑制mcr-1的表達,而且其酚羥基還可與MCR-1蛋白的鋅原子結(jié)合,與COL聯(lián)用對大腸桿菌產(chǎn)生協(xié)同抗菌作用;帶正電荷的二胺嗎啡代寡核苷酸肽[39]是以mRNA為靶位、阻止翻譯的MCR-1反義分子,能恢復(fù)mcr-1陽性大腸桿菌對COL的敏感性。(2)下調(diào)TCS pmrAB表達,如小分子二氨基咪唑[37]及亞硝苯胺類化合物dephostatin[38],能顯著下調(diào)或阻斷TCS pmrAB,逆轉(zhuǎn)類脂A修飾,阻斷細菌(沙門菌)對COL的耐藥性。(3)外排泵機制:基因缺失技術(shù)證明,沙門菌標準菌株JS主動外排系統(tǒng)ΔtolC時,能夠明顯改變對COL的敏感性,菌株對COL的敏感性顯著增強[19]。采用表型改變、外排泵活性、分子對接、轉(zhuǎn)錄組、基因缺失、熒光探針檢測等試驗及細菌細胞內(nèi)的抗生素濃度變化證明,多類逆轉(zhuǎn)藥物(如氯羥柳胺[22]、熊果酸[31]、CCCP[15]和粉防己堿[40])均有外排泵抑制作用,能使COL耐藥的大腸桿菌或沙門菌恢復(fù)敏感性。

影響外膜蛋白表達的逆轉(zhuǎn)機制:AOA-2通過下調(diào)OmpA和上調(diào)OmpA25的表達量,增強COL對鮑曼不動桿菌的殺菌活性[36]。

綜合逆轉(zhuǎn)機制,如SLAP-S25通過膜損害、代謝改變和細胞內(nèi)抗生素蓄積[1]多種機制恢復(fù)細菌對多種抗生素包括COL的敏感性;褪黑素能增加外膜的通透性、促進氧化損傷和抑制外排泵[27],逆轉(zhuǎn)由MCR介導(dǎo)的陰性菌對COL耐藥性。粉防己堿通過增強COL的膜損傷能力、破壞了細菌的質(zhì)子動力、外排泵功能和抑制MCR-1蛋白來逆轉(zhuǎn)由MCR介導(dǎo)的沙門菌對COL的耐藥性(圖2)[40]。

圖2 逆轉(zhuǎn)革蘭陰性菌黏菌素耐藥性的分子機制Fig. 2 Molecular mechanism of reversing COL resistance in gram negative bacteria

4 存在問題與展望

近年文獻報道的逆轉(zhuǎn)細菌COL耐藥性的佐藥已有60余種,但因有效性、安全性、特異性和合理用量等問題尚無一個成功用于臨床。這些佐藥的化學(xué)結(jié)構(gòu)及藥理作用各異,其共性逆轉(zhuǎn)機制除膜損害、mcr-1表達降低或MCR-1活性抑制得到清晰的闡明外,對其他方面分子機制的研究尚不系統(tǒng)深入。例如,抑制外排泵、增加氧化損傷被證明是逆轉(zhuǎn)COL耐藥性的重要機制,但革蘭陰性菌外排泵有多種,除最重要的外排系統(tǒng)AcrAB-TolC外,依賴TolC的RND外排泵還有AcrAD-TolC、AcrEF-TolC、AcrABTolC等多種,每種外排泵又有多個組分,且其表達受marA、soxS、robA、ranA等全局調(diào)控基因的調(diào)控。佐藥抑制何種外排泵、如何抑制外排泵而逆轉(zhuǎn)COL耐藥性及其量效關(guān)系?又如氧化損傷涉及ROS產(chǎn)生、清除、TCA循環(huán)、呼吸鏈等環(huán)節(jié),佐藥通過影響何種環(huán)節(jié),來逆轉(zhuǎn)細菌對COL的耐藥性?其量效關(guān)系如何?目前對佐藥或聯(lián)合用藥逆轉(zhuǎn)COL耐藥性的分子機制遠未闡明,該方面的研究總體處于初步階段,是制約安全高效佐藥篩選及聯(lián)用措施建立的關(guān)鍵瓶頸。

隨著組學(xué)(轉(zhuǎn)錄組、代謝組和蛋白質(zhì)組)技術(shù)的應(yīng)用,結(jié)合差異基因的缺失與回補,將推動佐藥的具體靶點(如外排泵、氧化應(yīng)激和代謝途徑)得以揭示,令新的佐藥篩選更具針對性;而對逆轉(zhuǎn)作用的量效關(guān)系研究,將使得聯(lián)合用藥方案或其復(fù)方制劑中佐藥用量的確定有科學(xué)的理論依據(jù)。可以預(yù)見,一批新的逆轉(zhuǎn)COL耐藥性的高效佐藥將陸續(xù)篩選發(fā)現(xiàn),逆轉(zhuǎn)耐藥性的研究理論將不斷的豐富、深化和完善。

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