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論東北地區(qū)主栽楊樹品種的SSR 分析及鑒定

2023-01-03 15:38:01王成剛
農(nóng)村科學實驗 2022年6期

王成剛

(遼寧省法庫縣自然資源與行政執(zhí)法中心,遼寧 沈陽 104000)

通過對東北地區(qū)林木栽種情況的調(diào)研,發(fā)現(xiàn)楊樹品種栽種居多,其主要原因來自楊樹具有改善氣候條件、凈化空氣以及降低噪聲污染等功能作用,但在目前楊樹品種鑒別過程中,對其進行SSR 分析及鑒定,能為楊樹育種研究高效工作開展提供極大地便利,提升楊樹品種鑒別能力,切實解決因市場中不斷出現(xiàn)多種類楊樹品種而引發(fā)的識種辯種難度大問題,維護苗木交易市場秩序,從根本上保障品種權人合法權益不受損害。本次研究結果可為遼寧省沈陽市法庫縣地區(qū)楊樹品種保護及鑒定工作開展提供強有力支撐。

1.栽種楊樹的作用

栽種楊樹的作用具體表現(xiàn)在以下幾個方面:

一是環(huán)境質(zhì)量有效改善。楊樹栽種區(qū)域周邊環(huán)境溫度調(diào)節(jié)、空氣質(zhì)量有著明顯變化,大樹冠且茂密是楊樹外觀基本特點,夏季時節(jié),其茂密的樹冠可將一部分太陽輻射進行吸收,在蒸騰與光合作用影響,使得輻射熱量降低,即時溫度升高也不會產(chǎn)生過熱感受。北方地區(qū)通常選擇楊樹作為主要樹種進行栽種,防暑降熱效果十分明顯,有效改善環(huán)境質(zhì)量同時,也能為居民打造更加舒適和涼爽的城市環(huán)境。

二是空氣得到有效凈化。由于空氣中含有大量粉塵、二氧化碳以及其他有害有毒氣體等,栽種高大型楊樹,并將其用于防護林,可將空氣中多種類型有害有毒氣體進行部分吸收,并會有大量氧氣釋放出來,進而起到有效凈化空氣的作用,提升大氣環(huán)境質(zhì)量。

三是預防疾病及減少噪音污染。楊樹栽種區(qū)域,可將周邊環(huán)境空氣中微顆粒數(shù)量變少,細菌沒有可依附的物體,進而使得空氣中原有病菌含量下降,疾病得到有效預防和控制。加上楊樹自身具備較強抗污染性,合理化栽種楊樹有利于降低城市居民發(fā)生疾病的幾率。另外,楊樹可對周邊產(chǎn)生的噪音進行吸收,起到對噪音強度進行減弱的作用,加上楊樹樹冠比較茂密,其降低污染影響愈加明顯。

2.栽楊樹品種SSR 分析及鑒定的必要性

在林木育種研究過程中,鑒定林木品種是其中最為重要的一項工作內(nèi)容,形態(tài)學標記、細胞學標記、生化標記,也稱之為同工酶法,是以往較常運用的鑒定方式,但在實際運用過程中,此鑒定方式具有一定局限性,無法通過同工酶與蛋白質(zhì)電泳技術只能檢測出數(shù)量相對較少的位點,受多態(tài)性水平限制,針對具有極近親緣關系的林木品種進行鑒定,無法起到精準鑒別的作用。

站在分類學角度上分析,楊樹被劃分在楊柳科,在華北、西北、東北等地域較為遼闊地區(qū)廣泛分布,目前楊樹品類較為豐富,含有多個品種,也包含從國外引進的品種。在現(xiàn)代農(nóng)業(yè)與林業(yè)經(jīng)濟發(fā)展中,楊樹作為一種經(jīng)濟性木材,發(fā)揮著重要作用,所帶來的經(jīng)濟效益十分可觀,因楊樹特殊性,也是工業(yè)領域生產(chǎn)中較為常用的材料,進而具備較強的用途適用性。隨著市場需求不斷變化,楊樹新品種研究持續(xù)深入,雖然經(jīng)濟生產(chǎn)要求得到充分滿足,但卻給楊樹品種鑒定工作提升了難度。若選擇傳統(tǒng)鑒定方式,在實際楊樹品種鑒定過程中,其鑒定結果準確性較低,楊樹品種難以精準且高效區(qū)分,在一定程度上加劇苗木交易不法行為,帶給品種保護工作落實極大地阻礙,也會嚴重損害品種權人的合法權益。

基于此,加大針對行之有效鑒定方式研究非常必要,精準、快速區(qū)分楊樹品種,如SSR 分子標記鑒定法,因具備操作便捷、多等位、高多態(tài)性等特點,在對多樣性遺傳資源、系統(tǒng)發(fā)育等方面進行探究時,運用SSR 分子標記鑒定法,不僅有著明顯運用優(yōu)勢,也能進一步提升楊樹品種鑒別與良種保護工作效率和質(zhì)量。

3.東北地區(qū)主栽楊樹品種如何開展SSR 分析及鑒定

本文選擇遼寧省沈陽市法庫縣地區(qū)的楊樹新品種、良種以及主要栽培品種作為試驗研究對象,通過SSR 分析對各楊樹品種的無性系進行研究和鑒定。

3.1 試驗楊樹品種選擇

通過選取遼寧省沈陽市法庫縣地區(qū)主要栽種的楊樹品種,選定40 個楊樹品種進行試驗,楊樹品種均由當?shù)亓謽I(yè)科學研究機構單位提供。

3.2 試驗方法

楊樹品種DNA 提取與瓊脂糖凝膠電泳檢測:第一,需要確認楊樹葉片新鮮程度,對應每個楊樹品種進行3-4個葉片采集,并在塑封袋中完整存放,再放置實驗室冰箱中,此時冰箱溫度設置為零下20 度;第二,楊樹基因組DNA 可選用現(xiàn)階段行業(yè)內(nèi)新型基因組DNA 提取試劑盒,有利于提升楊樹基因組DNA 提取效率,樣品規(guī)格為2μL,瓊脂糖凝膠電泳的質(zhì)量濃度設置為10g/L,將準備的樣品放置其中并進行檢驗,委托地方生物科技單位幫助合成21 對SSR 引物。

瓊脂糖凝膠電泳質(zhì)量濃度設置為30g/L,將此時獲得的PCR 產(chǎn)物放置其中并進行檢測,確認是否有其他產(chǎn)物存在。

PCR 產(chǎn)物的電泳檢測流程:

3.2.1 潔凈玻璃板準備2 塊,同等長梳子一只,厚度規(guī)格為1mm。

3.2.2 制備非變性聚丙烯酰胺凝膠留用,根據(jù)試驗要求,質(zhì)量濃度設置為80g/L。

3.2.3 試驗人員先確認凝膠是否已經(jīng)處于凝固狀態(tài),若未凝固,則需要繼續(xù)等待,等待完全凝固后對擴增產(chǎn)物進行提取,規(guī)格為2-3μL 即可,并在規(guī)格為1μL 的上樣緩沖液中加入,待完全混合均勻后在上樣孔中點入,設置恒定電壓為200v,移動指示劑中的二甲苯青,電泳停止70 分鐘后,在前提配置好的染色液中放置聚丙烯酰胺凝膠(染色液由質(zhì)量濃度為2g/L 的AgNO3、體積分數(shù)1%的冰乙酸等物質(zhì)配置而成),持續(xù)搖動20 分鐘。

3.2.4 確認電泳示蹤液完全消失后,將一定量的蒸餾水加入,每次清洗間隔15 秒,共計兩次,間隔15 秒期間,瀝水需要取出,再將現(xiàn)場配置的顯影液加入其中,輕輕搖晃8 秒,待目的條帶出現(xiàn)后,對各樣品進行拍照記錄。

3.3 數(shù)據(jù)處理

數(shù)據(jù)處理過程中共分為四個階段:

3.3.1 建立矩陣圖。為了保證電泳結果能夠順利轉化為電子譜圖,試驗人員盡可能選擇人工束帶方式進行操作,待上一個環(huán)節(jié)完成后,結合電子圖譜所顯示的信息完成0/1 二位矩陣制作,多態(tài)性位點無條帶標記為0,有條帶標記為1。同時試驗人員需要將等位基因矩陣圖在表格軟件中進行建立。多態(tài)性條帶比率(RPP):RPP=a/b,a=多態(tài)性條帶數(shù)、b=條帶總數(shù)。

3.3.2 基因片段長度。縱坐標設置為DNA 分子標準物(DL2000)片段長度對數(shù)值;橫坐標則是對應目的條帶位移距離。用直尺等輔助工具對不同等位基因位移距離進行測量,最后各等位基因片段長度數(shù)值獲得,相對準確性較高一些。

3.4 結果分析

3.4.1SSR 擴增結果及多態(tài)性。對照21 對SSR 引物序列信息,完成40 份樣品基因組DNA 的PCR 產(chǎn)物擴增,經(jīng)過若干程序操作,選用顯示高擴增效率、好特異性、良好穩(wěn)定性以及動態(tài)性較為豐富的18 對SSR 引物,制作供試材料的指紋圖譜,分析各樣品遺傳關系。

40 個楊樹品種基因組DNA 的PCR 擴增利用上述已經(jīng)選定的18 對引物,并通過非變性聚丙烯酰胺凝膠完成電泳分離操作,在此基礎上相對應擴增條帶直接獲得。通過查閱本次試驗數(shù)據(jù)記錄,其中多態(tài)性條帶獲得總計100 條,每個引物平均擴增條帶約為5.6條,表示100%多態(tài)性比率,擴增條帶數(shù)量最多為引物PMGC_2030,擴增條帶數(shù)量最少為引物PN1297275。

3.4.2 楊樹雜交品種遺傳相似性。格式處理上述統(tǒng)計好的40 個試驗材料0/1 矩陣圖,并借助相關軟件進一步分析楊樹雜交品種遺傳相似性。通過觀察40 個楊樹品種遺傳相似性系數(shù)變化,各項數(shù)據(jù)均將其遺傳相似性較為準確的反應出來,如各品種間遠近親緣關系的呈現(xiàn)。

雜交親緣本質(zhì)上為同一種品系,說明遺傳相似性概率較高,如通過小葉楊與黑楊進行雜交的子代,其遺傳相似系數(shù)達到最高值0.88,可以充分說明,利用上述篩選好的18 對引物,再通過SSR 分子標記技術處理,所獲得的對應分子指紋圖譜之間相似性極高。當分析具有相同遺傳背景的楊樹品種樣品時,利用SSR 指紋圖譜不僅能夠將其快速區(qū)分,其可辨識度也進一步提升。

3.4.3 試驗樣品遺傳相似系數(shù)聚類分析。從40 個楊樹品種聚類分析結果來看,對上述40 個試驗樣品遺傳相似系數(shù)進行聚類分析時,發(fā)現(xiàn)將樹種父母系為同一品類的雜交楊樹品種劃分在一起,如將父本為小葉楊、母本為歐洲黑楊的樹種將其匯聚一類,并將達到0.74 遺傳相似系數(shù)的樹種再進行劃分。聚類時,先聚類母本效應較強的雜交品種,再根據(jù)父本之間遺傳不同性來構成差異性聚集狀況。各項數(shù)據(jù)顯示,屬于同一種雜交品系的父母本,在聚類過程中,可在較大遺傳相似系數(shù)位置劃分一類,兩個相同品種間的遺傳相似系數(shù)也均達到0.73 數(shù)值水平,可將其聚為一個類別。此外,當某一個楊樹品種的母本和另一個楊樹品種的父本為同一個品種,相較于父母本屬于不同的雜交品系的遺傳相似性,前者更高一些。

3.5 試驗結果

通過分析與總結上述各項試驗數(shù)據(jù)信息,得知楊樹品種的遺傳相似系數(shù)和遺傳背景有著極為密切的關聯(lián)性。一般情況下,越相似的楊樹品種遺傳背景,其遺傳相似系數(shù)數(shù)值更加接近。本次試驗選擇40 個楊樹品種作為樣品,其中以小葉楊或黑楊為父母本或者父本或母本的品種數(shù)量為34 個,屬于小葉楊和黑楊的雜交子代品種數(shù)量為15 個,均體現(xiàn)出了較高的遺傳相似性。在試驗過程中也發(fā)現(xiàn),以小葉楊與黑楊進行雜交得出的白城小黑楊,其遺傳相似系數(shù)較低,通過深入研究得知,其品種父母本雖然屬于同一品種,但以小葉楊或歐洲黑楊為親本的品種,可能由于種源不同性等同性質(zhì)因素干擾,促使分子水平上遺傳相似系數(shù)表現(xiàn)出的數(shù)值較小。

針對植物分類、林木遺傳育種等方面研究運用傳統(tǒng)形態(tài)學進行鑒別,相對難度較低,但不適合進行普及推廣,適用性較低。天然雜交這一現(xiàn)象在楊樹栽種中較為常見,其人工雜交相對更加簡易,若依靠外部形態(tài)對楊樹品種進行鑒別,則會受到環(huán)境等因素影響,無法保證鑒別結果準確性,因此,通過應用SSR 分子標記技術,不僅能夠彌補傳統(tǒng)形態(tài)學鑒別方式潛在不足,也能為我國楊樹品種深層次鑒定和良種保護工作高質(zhì)量開展提供強有力技術支撐。

因此,遼寧省沈陽市法庫縣楊樹栽種過程中,應結合實際情況,靈活利用SSR 分子標記技術開展楊樹品種鑒別工作,一方面為良種保護工作提供方便,提升楊樹栽種質(zhì)量,改善本地區(qū)生態(tài)環(huán)境質(zhì)量;另一方面為整個地區(qū)綜合性綠化規(guī)劃方案制定提供參考依據(jù),選擇符合本地區(qū)地質(zhì)條件、環(huán)境條件特點的優(yōu)質(zhì)楊樹品種,徹底解決遼寧省楊樹死亡率高問題。

通過實地調(diào)研得知,法庫縣楊樹純林面積大,生長期間病蟲害發(fā)生幾率較高,楊扇舟蛾、楊毒蛾、舞毒蛾、天幕毛蟲等均屬于法庫縣楊樹常見蟲害,極大地威脅了楊樹健康生長,其中楊樹爛皮病、楊樹潰瘍病等病害也時常發(fā)生,對法庫縣楊樹病蟲害防治工作帶來極大挑戰(zhàn)。

導致法庫縣楊樹死亡率高得因素還包括以下幾個方面:一是,引種不當。從上述40 個楊樹品種分析結果來看,其中部分楊樹品種并不適合在法庫縣地區(qū)進行種植,在實際引種過程中,過于考慮楊樹品種豐產(chǎn)性,并沒有意識到地域跨度過大引種帶來的負面影響,法庫縣冬季溫度較低,其引進的楊樹品種極易發(fā)生凍害問題;二是,選地不當,近些年來,法庫縣降雨量不斷提升,低洼處大量積水無法及時排出,促使楊樹被水澇災害影響導致死亡;三是后期林木管理工作不到位,法庫縣地區(qū)溫差急劇變化,則促使樹干內(nèi)部水分流動不正常,受反復凍結與融化因素干擾下,會造成楊樹表皮開裂,傷口被病菌侵染,病菌侵染面積持續(xù)擴散,同時長勢相對較弱的小楊樹也極易被傳染,導致大面積楊樹死亡情況出現(xiàn),極大地影響了法庫縣林業(yè)健康發(fā)展。由此說明,鑒定法庫縣主栽楊樹品種工作重要性,明確楊樹品種鑒定在保護良種,引進優(yōu)質(zhì)品種等方面產(chǎn)生的積極作用,有利于從根源上規(guī)避上述問題發(fā)生。

楊樹具有生長快、環(huán)境適應性較強、木材產(chǎn)量高等優(yōu)點,將其作為法庫縣主要栽種林木品種,有利于法庫縣林業(yè)產(chǎn)業(yè)化發(fā)展。基于此,可通過對法庫縣主栽楊樹品種進行SSR 分析及鑒定,了解各品種特性,通過對比各楊樹品種特點,篩選出最為優(yōu)質(zhì)的品種作為主要栽種品種,既能增強楊樹抗病性,又能提高楊樹純林病蟲害防治工作水平,加強楊樹種植管理,促進楊樹種植經(jīng)濟效益、社會效益、環(huán)保效益提升,從而為遼寧省沈陽市法庫縣林業(yè)持續(xù)健康發(fā)展提供基礎保障。

4.結束語

綜上所述,林業(yè)作為促進我國經(jīng)濟增長的重要產(chǎn)業(yè),楊樹木材交易為我國林業(yè)產(chǎn)業(yè)創(chuàng)造極高的經(jīng)濟效益,楊樹品種在日益增長社會經(jīng)濟發(fā)展需求作用下越來越豐富,但也伴隨著楊樹品種辨種難度加大等問題出現(xiàn),傳統(tǒng)鑒定方式具有一定局限性,特別是親緣關系較近樹種鑒定,基于此,應用SSR 分子標記技術,發(fā)揮技術優(yōu)勢,高效率、高質(zhì)量研究楊樹品種遺傳資源多樣性、系統(tǒng)發(fā)育等問題。

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