張晶晶,張慶華,惠玲,何靜,潘海瑞,郝勝菊*
(1.甘肅省婦幼保健院醫(yī)學遺傳中心,蘭州 730050;2.甘肅省出生缺陷與罕見病臨床研究中心,蘭州 730050)
Joubert綜合征(Joubert syndrome,JBTS)是一種以小腦蚓部發(fā)育不良伴陣發(fā)性呼吸困難、眼球運動障礙、共濟失調(diào)和智力低下為主要臨床表現(xiàn)的神經(jīng)發(fā)育障礙性疾病,部分患兒還伴有視網(wǎng)膜發(fā)育不良、肝纖維囊腫、多指(趾)癥等情況[1-4]。其主要的影像學特征為頭顱磁共振成像(MRI)發(fā)現(xiàn)中腦呈“磨牙征”[5-6]。該疾病自1969年發(fā)現(xiàn)并報道以來,目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)至少有40個纖毛相關(guān)基因與JBTS有關(guān)[7-8],主要表現(xiàn)為常染色體隱性遺傳。
近年來,有研究報道OFD1基因變異導致JBTS為X連鎖隱性遺傳[9-10]。本文將對我院1例OFD1基因截短變異導致患兒JBTS的臨床資料及基因檢測結(jié)果進行報道,同時對OFD1基因變異相關(guān)JBTS的文獻進行復(fù)習匯總,為OFD1基因變異攜帶者的優(yōu)生優(yōu)育提供重要指導依據(jù)。
1.臨床情況:患兒系第3胎第2產(chǎn),胎齡36+3周,因“瘢痕子宮、臀位”于2022年2月11日自然分娩于當?shù)蒯t(yī)院。出生體重2 650 g,生后1分鐘Apgar評分6分;給予清理呼吸道、常壓給氧,5分鐘Apgar評分7分;繼續(xù)予以清理呼吸道,常壓給氧,10分鐘Apgar評分8分。分娩時無臍帶繞頸,無胎膜早破,羊水清亮,無胎盤早剝。為進一步診治,遂來我院。門診以“先天性腦積水、新生兒窒息、早產(chǎn)兒、多指畸形”收住院。患兒入院后5 d出現(xiàn)呼吸困難,予以持續(xù)氣道正壓通氣呼吸支持后病情未見改善,家屬放棄治療,已夭折。
家系情況:父母親非近親結(jié)婚,平時身體健康。先證者母親曾因“胎兒顱內(nèi)占位性病變”引產(chǎn)1男胎。先證者有1個姐姐,體健。先證者的家系圖譜見圖1。
Ⅰ-1:母親;Ⅰ-2:父親;Ⅱ-1:姐姐;Ⅱ-2:引產(chǎn)男胎;Ⅱ-3先證者。圖1 患兒家系圖
入院查體:精神反應(yīng)良好,發(fā)育幼稚,呼吸平穩(wěn),無三凹征,雙手及左腳六指,肌張力稍弱,原始反射未能完全引出。
頭顱MRI平掃+磁敏感加權(quán)成像檢查結(jié)果示:全腦室擴張,多考慮腦積水;大枕大池、小腦蚓部增深,小腦發(fā)育不良不除外,雙側(cè)基底節(jié)區(qū)小靜脈擴張,雙側(cè)大腦實質(zhì)水腫;小腦蚓部部分缺如;中腦、腦橋連接部增寬、變形,頭側(cè)至尾側(cè)第四腦室增寬、變形,呈“蝙蝠翼征”,腳間池凹陷加深、增厚的小腦上包繞拉長的第四腦室,形成“磨牙征”(圖2)。
A:T1加權(quán)成像;B:T2加權(quán)成像;黑色箭頭所示為腳間池凹陷加深、增厚的小腦上包繞拉長的第四腦室,形成“磨牙征”。圖2 JBTS患兒的頭顱MRI影像
2.全外顯子組測序檢測:對患兒及父母進行Trio全外顯子組測序(含患者拷貝數(shù)變異測序)。經(jīng)醫(yī)院倫理委員會批準(2021GSFY倫審[65]號),患兒家屬簽訂知情同意書,用EDTA抗凝管采集先證者及其家屬外周血2~3 ml,取200 μl外周血采用全自動核酸提取儀(廈門致善生物)提取DNA,然后使用核酸濃度測定儀(NanoDrop 2000,ThermoFisher,美國)測定DNA濃度。保證DNA濃度在50 ng/μl左右,OD260/280在1.8~2.0。經(jīng)過基因組文庫構(gòu)建,采用xGen Exome Research Panel v2.0捕獲探針(IDT,美國)進行全外顯子目標區(qū)域捕獲并測序。應(yīng)用BWA軟件對測序結(jié)果與UCSC數(shù)據(jù)庫參考基因組(GRCh37/hg19)標準序列進行比對,通過GATK軟件重排序列,進行變異信息檢測及篩選,通過ANNOVAR軟件對篩選出的SNPs和InDels進行注釋并進行致病性分析。
對原始數(shù)據(jù)經(jīng)過比對、注釋、過濾、篩選后,發(fā)現(xiàn)臨床表型高度相關(guān)且致病性證據(jù)充分的基因變異:位于X染色體的OFD1基因(NM_001330210)的c.2053G>T變異。該變異位于第19號外顯子,該堿基變異導致第685位的氨酰胺發(fā)生終止,并造成蛋白質(zhì)翻譯提前終止(p.E685*),形成截短蛋白。該位點在dbSNP及HGMD均未收錄,是尚未報道的新變異。根據(jù)美國醫(yī)學遺傳學與基因組學學會指南,該位點為可能致病性變異:PVS1+PM2。結(jié)合患兒的臨床表現(xiàn),判斷OFD1基因半合子突變是導致JBTS 10型的原因,突變來源于母親;考慮到其母2016年曾孕有患頭顱占位性病變的男胎(后引產(chǎn)),推測該男胎亦為OFD1基因半合子突變所致頭顱發(fā)育不良。
Sanger測序驗證結(jié)果示:先證者OFD1基因c.2053G>T位點為半合子變異,來源于母親,父親為野生型半合子,母親為雜合子,先證者姐姐為野生型(圖3)。
箭頭示c.2053G>T位點。圖3 患兒及其家系OFD1基因Sanger測序圖
OFD1編碼一種含有1 012個氨基酸的蛋白質(zhì),是纖毛生物發(fā)生所必需的基底體和中心粒的組成部分。OFD1突變能出現(xiàn)多種表型,從單個組織受累(如視網(wǎng)膜色素變性)到多器官受累(如OFD I型、JBTS 10型和原發(fā)性睫狀體運動障礙);這些疾病的遺傳模式包含了X連鎖的顯性遺傳以及X連鎖的隱性遺傳[11]。而首次證明OFD1與JBTS有關(guān)的是2009年來自Coene等[12]的報道,該病患者均為男性,有“磨牙征”、發(fā)育遲緩、多指、視網(wǎng)膜色素變性等表型。由于臨床特征與其他神經(jīng)發(fā)育綜合征沒有特異性區(qū)別,故識別“磨牙征”的同時進行基因檢測對患者的診斷至關(guān)重要。
然而,在臨床工作中,“磨牙征”并不總是能得到正確識別,故可能導致假陰性診斷(即“磨牙征”患者沒有進行JBTS基因檢測)[13]。因此,對于臨床疑似JBTS的患兒,即使影像學結(jié)果為陰性仍然建議行基因檢測進一步明確診斷。在本例男性患兒的診斷過程中,經(jīng)全外顯子組測序以及Sanger測序結(jié)果發(fā)現(xiàn)OFD1基因c.2053G>T位點半合子變異后,對影像科醫(yī)師分析頭顱磁共振結(jié)果提供了重要指導,最終明確診斷該患兒為OFD1基因變異導致的JBTS。
本例患兒為1例典型的X連鎖隱性遺傳JBTS病例,其母第一胎為男胎,因胎兒顱內(nèi)占位性病變引產(chǎn),結(jié)合基因檢測結(jié)果及家系分析,亦考慮可能為OFD1基因變異導致。
綜上,本文結(jié)合患兒臨床表現(xiàn)及影像學檢查結(jié)果,利用全外顯子組測序技術(shù)發(fā)現(xiàn)了一個新的OFD1基因的可能致病變異。該基因致病位點的國內(nèi)報道病例少,因此本研究在一定程度上擴大了OFD1基因的突變譜,該基因檢測結(jié)果可為該家族女性攜帶者的優(yōu)生優(yōu)育提供重要依據(jù)和參考。此外,由于影像學檢查的局限性,對于臨床上疑似JBTS的患兒行基因檢測具有重要意義。