1.自開票納稅人資格的認定問題。企業(yè)申請自開票納稅人要求具備“交通管理部門核發(fā)的道路運輸經(jīng)營許可證”,還要求“具有自備運輸工具”。由此產(chǎn)生的問題有,一是許多大城市不允許貨運車輛進城,物流企業(yè)大多采取“客車”運貨,在用車輛無法取得“道路運輸經(jīng)營許可證”。二是片面強調(diào)自備車輛,不符合當前物流企業(yè)普遍依靠社會車輛的實際,也不利于從整體上整合社會車輛資源,許多物流企業(yè)因此無法取得自開票納稅人資格。三是集團型物流企業(yè)自開票納稅人資格在所屬網(wǎng)點不能分享。像寶供這樣在全國網(wǎng)絡(luò)型經(jīng)營的大型民營物流企業(yè),在某些新開業(yè)的網(wǎng)點也無法取得自開票資格。
2.物流服務(wù)收入分別核算、稅率不同的問題。把運輸、倉儲、搬運、包裝、加工、配送等物流環(huán)節(jié)集成整合、一體化運作,是物流企業(yè)的基本模式和優(yōu)勢所在,由此帶來物流效率的提高和社會資源的節(jié)約。但目前的稅務(wù)設(shè)計,對運輸和其他物流業(yè)務(wù)實行不同的稅率和增值稅抵扣政策。運輸收入按“交通運輸業(yè)”稅目征收3%的營業(yè)稅,并允許抵扣工商企業(yè)增值稅進項;其余的物流業(yè)務(wù)應(yīng)稅收入按“服務(wù)業(yè)”稅目征收5%的營業(yè)稅,還不能納入工商企業(yè)增值稅進項抵扣范圍。這樣,不僅不利于物流企業(yè)的一體化運作,而且企業(yè)在實際操作中也會造成人為地調(diào)節(jié)運輸收入和其他物流服務(wù)的收入比例。
3.按照車輛運力核定最高收入額的問題。目前,稅務(wù)部門對取得運輸發(fā)票的企業(yè)每輛車核定運輸收入最高限額,超過限額的收入即認為不合理。這同當前物流企業(yè)市場細分、分段操作的運作模式不相適應(yīng)。在實際操作中,往往是一家取貨企業(yè)收取全程運費,或完成其中一段運輸任務(wù),再根據(jù)需要交給另外的企業(yè)中轉(zhuǎn)、分撥、配送,才能保證車輛滿載,降低運營成本。而目前的做法,非常不利于業(yè)務(wù)外包和資源整合,特別是加重了取貨企業(yè)的稅務(wù)負擔(dān)和風(fēng)險。
4.倉庫租賃費的扣除問題。隨著物流市場的細分化、服務(wù)的細分化,出現(xiàn)了“物流地產(chǎn)”的概念,專營物流業(yè)的“物業(yè)”公司快速發(fā)展,更多的物流企業(yè)采取了租賃倉庫的做法。國稅發(fā)[2005]208號文雖然規(guī)定:“試點企業(yè)將承攬的倉儲業(yè)務(wù)分給其他單位并由其統(tǒng)一收取價款的,應(yīng)以該企業(yè)取得的全部收入減去付給其他倉儲合作方的倉儲費后的余額為營業(yè)額計算征收營業(yè)稅。”但對租用倉庫的租金成本卻不能在營業(yè)額中扣除,這塊成本約占倉儲收入的30%。如果不能扣除,實際上并未從根本上減輕試點企業(yè)的負擔(dān)。
5.試點企業(yè)“所屬企業(yè)”的界定問題。國稅發(fā)[2005]208號文雖然提到試點企業(yè)的“所屬企業(yè)”,但沒有明確的界定,是“子公司”,還是“分公司”,在具體執(zhí)行中不好把握。
6.缺乏適合物流企業(yè)運作特點的專用發(fā)票。我國缺乏與物流外包形式相對應(yīng)的物流專用發(fā)票,外包業(yè)務(wù)發(fā)生的代墊費用無法在營業(yè)稅中抵扣,造成物流企業(yè)普遍性的不合理重復(fù)納稅現(xiàn)象。同時,為專門以開發(fā)票為生的“票務(wù)公司”有機可乘,不僅造成國家稅款的流失,也給民營物流企業(yè)的合法經(jīng)營帶來很大風(fēng)險。
7.物流企業(yè)所得稅不能統(tǒng)一繳納的問題。網(wǎng)絡(luò)化經(jīng)營是物流企業(yè)的基本特征,發(fā)展比較好的民營物流企業(yè)都建立了覆蓋全國的經(jīng)營網(wǎng)點,但這些網(wǎng)點經(jīng)營狀況不盡相同。按照目前稅法的規(guī)定,盈利企業(yè)要繳納所得稅,而虧損企業(yè)只能由企業(yè)自身承擔(dān)。就集團型企業(yè)來說,無疑增加了稅務(wù)負擔(dān)。盡管國家稅總出臺國稅函[2006]270號文,規(guī)定“物流企業(yè)在同一省、自治區(qū)、直轄市范圍內(nèi)設(shè)立的跨區(qū)域機構(gòu)(包括場所、網(wǎng)點),凡在總部統(tǒng)一領(lǐng)導(dǎo)下統(tǒng)一經(jīng)營、統(tǒng)一核算,不設(shè)銀行結(jié)算賬戶、不編制財務(wù)報表和賬簿,并與總部微機聯(lián)網(wǎng)、實行統(tǒng)一規(guī)范管理的企業(yè),其企業(yè)所得稅由總部統(tǒng)一繳納,跨區(qū)域機構(gòu)不就地繳納企業(yè)所得稅。”但與物流企業(yè)跨省區(qū)經(jīng)營的實際情況,還有相當距離。部分大型國有物流企業(yè)已有專案解決。中外合資或外商獨資企業(yè)更有《外國企業(yè)和外商投資企業(yè)所得稅法》的規(guī)定,允許匯總繳納。民營物流企業(yè)在這方面,顯然沒有得到同等的待遇。
8.內(nèi)外資企業(yè)所得稅方面的不平等問題。同其他行業(yè)一樣,外資企業(yè)享受著比內(nèi)資企業(yè)低的所得稅稅率。