·特載·
中國醫藥生物技術協會生物樣本庫標準(試行)
編者按
醫學標準化、高質量的生物樣本庫是重大疾病(尤其腫瘤)基礎與臨床研究、臨床診治技術研發、藥物研發、健康(預測預防)研究與產業化,即實現轉化醫學的最寶貴資源、最重要環節之一,毫無疑問也是當今生命科學原創性研究、生物醫藥產業自主創新體系中至關重要的環節與保證。2009 年 9 月美國國家癌癥研究所(NCI)開始籌劃建立美國第一個國家級腫瘤生物樣本庫,Times 更是將這個國家生物樣本庫列為“2009 年改變世界十大規劃”之八。我國疾病樣本資源極其豐富,是任何一個國家所無法比擬的,我們必須搶占重大疾病生物樣本庫建設先機,以搶占我國在生命科學研究與生物醫藥產業領域國際制高點。
然而,目前我國醫院生物樣本庫建設尚處于初創階段,存在無序、分散、封閉、缺乏標準化流程、缺乏質控體系與信息化管理、臨床資料殘缺不全(尤其治療與隨訪資料)、倫理學與法律不健全等問題,嚴重降低了我國生命科學研究水平、阻礙了創新性新藥研發與臨床診治技術開發進程。中國醫藥生物技術協會生物樣本庫分會于2010 年組織全國范圍內的組織生物樣本庫建設現狀調研發現,我國各相關大學、研究院所與醫院都非常重視生物樣本庫的建立與轉化醫學的研究,建設單位都急盼行業與國家標準的出臺。
為此,中國醫藥生物技術協會生物樣本庫分會組織國內基礎、臨床、病理、建庫技術、法律等領域 20 位專家,共同編制了中國醫藥生物技術協會《生物樣本庫》的標準。該標準分為兩個部分:第 1 部分:生物樣本庫設施與保障;第 2 部分:腫瘤生物樣本操作規程。該標準雖經專家們反復討論、修改,想必在全國范圍內實施過程中,一定還會存在問題,希望同道們能及時反饋,以利于進一步修改、完善。
1范圍
本部分規定了生物樣本庫相關的術語、環境、設備和保障。
本部分適用于生物樣本庫的建設。
2規范性引用文件
下列文件對于本文件的應用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,僅注日期的版本適用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本文件。
GB 50052-2009 供配電系統設計規范
GB 19489-2008 實驗室生物安全通用要求
GB/T 18883-2002 室內空氣質量標準
GB/T 20269-2006 信息安全技術信息系統安全管理要求
AQ3013-2008 危險化學品從業單位安全標準化通用規范
3術語和定義
下列術語和定義適用于本文件。
3.1生物樣本
任何包含人體生物信息的生物物質,包括人體組織、血液、分泌物、排泄物及其衍生物。
3.2生物樣本庫
規范化收集、保存和處置離體生物樣本的機構,為人類健康、疾病診斷與藥物研發等生物醫學研究提供資源。
3.3新鮮樣本
離體的、未經處理的生物樣本。
3.4冷凍樣本
保存于 –40 ℃ 以下環境中的生物樣本。
3.5石蠟樣本
經過中性福爾馬林等適宜的固定液固定、脫水、石蠟包埋處理所保存的生物樣本。
3.6生物樣本庫信息管理系統
記錄生物樣本庫所保存的生物樣本及其相關臨床、病理、隨訪、倫理審查及知情同意等信息的應用軟件及硬件。
3.7樣本捐贈者
捐贈個體生物樣本以用于生物醫學研究的自然人,簡稱捐贈者。
3.8知情同意書
捐贈者或其法定監護人表示自愿捐贈個體生物樣本而簽署的文件。
4生物樣本庫的規模
根據樣本儲存容量,生物樣本庫的規模分為四個級別,即:小型生物樣本庫、中型生物樣本庫、大型生物樣本庫和超大型生物樣本庫。詳見表 1。

表1 生物樣本庫的規模
5生物樣本庫功能區域及主要設備
5.1生物樣本存儲區的主要設備
5.1.1石蠟樣本/切片存儲區的主要設備
a) 石蠟樣本柜
b) 切片柜
5.1.2冷凍樣本存儲區的主要設備
5.1.2.1無熱源區
a) 液氮罐/柜
b) 液氮供應罐
5.1.2.2有熱源區
a) 普通低溫冰箱(–40 ℃)
b) 超低溫冰箱(–86 ℃)
c) 深低溫冰箱(–135 ~ 150 ℃)
5.2生物樣本處理區的主要設備
5.2.1組織樣本處理區的主要設備
5.2.1.1樣本臨時存放設備
a) 冷藏柜
b) 普通液氮罐
c) 生物樣本低溫轉運設備
5.2.1.2樣本取材設備
a) 取材臺
b) 組織取材器具
5.2.1.3樣本記錄設備
a) 數碼照相機
b) 標簽打印機
c) 生物樣本庫信息管理系統終端
5.2.1.4樣本脫水設備組織脫水機
5.2.1.5樣本包埋設備組織包埋機
5.2.1.6樣本制片設備
a) 冰凍切片機
b) 石蠟切片機
c) 撈片機
d) 烤片設備
5.2.1.7切片染片設備
組織切片 HE 染色機
5.2.1.8切片封片設備
HE 染色切片封片機
5.2.2血液-體液及其他樣本處理室
a) 水平離心機
b) 電子秤
c) 移液器
d) 冷凍標簽打印機
e) 生物樣本庫信息管理系統終端
6職能機構
6.1科研管理機構
科研管理機構負責以下工作:
a)生物樣本庫建設的計劃、目標與預算的擬定;
b)生物樣本庫建設的組織協調。
6.2科學技術管理委員會
a)委員會應由生物醫學領域的專家組成;
b)主要負責生物樣本采集與使用的科學審查。
6.3倫理委員會
6.3.1組成
a) 倫理委員會應從生物醫學領域和管理學、法學、社會學等領域的專家中推舉產生,人數不得少于 5 人,其中至少有 1 名醫學專業委員,至少有 1 名非醫學專業委員,至少有 1 名非本單位委員,并且應當有不同性別的委員;
b) 少數民族地區應考慮少數民族委員;
c) 倫理委員會委員任期 5 年,可以連任;
d) 倫理委員會設主任委員 1 名,副主任委員若干名,由倫理委員會委員協商推舉產生,可以連任。
6.3.2權利
a) 對本機構及其所屬機構的生物樣本收集、使用及處置進行倫理審查、監督和檢查;
b) 按照倫理原則不受任何干擾地自主作出決定。
6.3.3義務
a) 組織開展相關倫理培訓;
b) 為接受倫理審查的方案保密;
c) 審查結果應當及時傳達或者發布。
6.4樣本庫執行機構
樣本庫執行機構負責以下工作:
a)在倫理委員會和科研管理機構許可范圍內進行樣本的收集;
b)按照規定流程收集、運輸、儲存與管理樣本;
c)根據科研管理機構的審批進行樣本出庫。
7人員配備與資質
生物樣本庫應配備專業技術人員。生物樣本庫負責人應為醫學相關專業的人員。
每個崗位的專業技術人員應該經過中國醫藥生物技術協會組織生物樣本庫分會的專業培訓,并考核合格。
8倫理準則
a)采集和使用人類生物樣本應建立在保護人的生命和健康,維護人的尊嚴的基礎上;
b)對捐贈者的安全、健康和權益的考慮必須高于對科學和社會利益的考慮,力求使捐贈者最大程度受益和盡可能避免傷害;
c)尊重和保護捐贈者的隱私,如實將涉及捐贈者隱私的資料儲存和使用目地及保密措施告知捐贈者,不得將涉及捐贈者隱私的資料和情況向無關的第三者或者傳播媒體透露;
d)一般情況下,履行知情同意程序,尊重和保障捐贈者自主決定同意捐贈與否,不得使用欺騙、利誘、脅迫等不正當手段使捐贈者作出錯誤的意思表示;
e)對于喪失或者缺乏能力維護自身權利和利益的捐贈者(弱勢人群),包括兒童、孕婦、智力低下者、精神病患者、囚犯以及經濟條件差和文化程度很低者,應當予以特別保護。
9安全保障
9.1實驗室安全
a)對于生物樣本庫內有使用到有毒、有害物質的工作區域,應遵守危險化學品從業單位安全標準化通用規范(AQ3013-2008)。
b)所有生物樣本都被視為具有生物危害風險,樣本庫建立應采取生物安全預防措施,遵守實驗室生物安全通用要求(GB 19489-2008)。
9.2樣本安全
9.2.1環境維護
a)消防安全。生物樣本庫必須配置消防給水系統和無水阻燃劑滅火器,并定期進行消防設施檢修和維護。
b)供電保障。生物樣本庫應配備雙路市電供電及配置備用電源,并遵循供配電系統設計規范(GB 50052-2009)。
c)空間要求。生物樣本存儲區需有足夠的空間且通風良好。
d)室溫控制。根據室內空氣質量標準(GB/T 18883-2002),生物樣本庫室內溫度須控制在 16 ~ 28 ℃ 水平。
e)濕度控制。根據室內空氣質量標準(GB/T 18883-2002),生物樣本庫相對濕度需控制在 30% ~ 80%。
f)紫外消毒。生物樣本庫須安裝紫外線消毒設施,定期對生物樣本庫各功能區域進行消毒處理。
9.2.2硬件設施
a)設備安全。儀器設備須根據廠商要求定期維護和更換。
b)遠程報警。生物樣本庫的超低溫或深低溫存儲設備,必須安裝自動遠程監控報警系統。
9.2.3管理機制
a)準入權限。樣本存儲區域應建立人員出入管理機制,僅允許授權人員進入。
b)應急預案。生物樣本庫管理應建立應急預案。
9.2.4信息安全
a)遵循信息安全技術信息系統安全管理要求(GB/T 20269-2006),生物樣本庫信息系統應進行權限設置,工作人員只能按照授權進行操作,操作記錄應保留供查詢。
b)定期對保存生物樣本庫數據信息的服務器進行維護。
c)定期對保存于服務器上的數據信息進行備份。
10質量控制
對不同類型的樣本設定相應的質量控制管理體系;
質量管理人員直接向樣本庫負責人報告;
1范圍
本部分規定腫瘤生物樣本庫相關的術語和操作規程。
本部分適用于腫瘤生物樣本的采集、處理和保存。
本部分應與中國醫藥生物技術行業標準的第 1 部分配套使用。
2規范性引用文件
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NIPCGR-DCI-03 中國人類遺傳資源特性信息描述規范(中國人類遺傳資源平臺)
ISBN 7801941950 臨床技術操作規范 · 病理學分冊(中華醫學會)
ISBN 7564105836 全國臨床檢驗操作規程(第三版)(中華人民共和國衛生部醫政司)
3術語和定義
第 1 部分界定的以及下列術語和定義適用于本文件。
3.1樣本采集者
為生命科學研究而采集、保存生物樣本的機構或個人,簡稱采集者。
3.2正常組織
位于同一器官、病理診斷為正常或一般炎癥的組織。
3.3腫瘤旁組織
位于同一器官、病理診斷明確不含腫瘤細胞的炎癥或腫瘤前病變組織。
3.4腫瘤組織
位于腫瘤病灶部位的組織
3.5常溫保存
將樣本保存于 16 ~ 28 ℃。
3.6冷藏保存
將樣本保存于普通冷藏設備中,保存溫度為 2 ~ 8 ℃。
3.7冷凍保存
將樣本保存于低溫存儲設備中。根據低溫程度的不同,分為普通低溫冷凍保存(–40 ℃ 低溫設備)、超低溫冷凍保存(–86 ℃ 低溫設備)、深低溫冷凍保存(–135 ℃ 以下低溫設備)。
4生物樣本編碼
4.1相關代碼
4.1.1樣本采集單位代碼
見全國組織機構代碼。
4.1.2手術器官代碼
見《人體器官代碼表》(附錄 A)
4.1.3樣本類型代碼
見《生物樣本類型代碼表》(附錄 B)
4.1.4組織樣本取材部位代碼
a)正常組織用“N”表示;
b)腫瘤旁組織用“P”表示;
c)腫瘤組織用“T”表示;
d)淋巴結用“L”表示。
4.2樣本編碼規則
a)組織樣本編碼:由手術器官代碼(A)、器官內流水號(B)、樣本類型代碼(C)、取材部位代碼(D)、樣本管/ 塊/份編號(E)五部分組成。具體編碼格式如下:ABCDE。
舉例:D09A00001B20T1。D09 表示胃,A00001 表示胃的流水號,B20 表示凍存組織樣本,T 表示腫瘤組織,1 表示第 1 管份。
b)血液、體液、人體排泄物樣本編碼:由手術器官代碼(A)、器官內流水號(B)、樣本類型代碼(C)、樣本管份編號(D)四部分組成。具體編碼格式如下:ABCD。
舉例:D09A00001C201。D09 表示胃,A00001 表示胃的流水號,C20 表示血清樣本,1 表示第 1 管份。
4.3樣本存放位置編碼
a)常溫存儲設備(石蠟柜和切片柜)樣本存放位置采用三級編碼:樣本柜號、樣本盒號、樣本盒內位置編號。三級編碼之間用“-”連接。
b)冷凍存儲設備(液氮罐/柜和超低溫冰箱)樣本存放位置采用四級編碼:設備編號、凍存鋼架編號、凍存盒號、凍存盒內位置編號。四級編碼之間用“-”連接。
5樣本標簽
5.1石蠟樣本標簽
石蠟樣本標簽包含兩部分:
a)樣本識別信息標簽,包含樣本采集單位代碼和組織樣本編碼,粘貼于石蠟樣本的正面;
b)樣本存放位置標簽,粘貼于石蠟樣本的側面。
5.2切片標簽
切片標簽包含:樣本采集單位代碼、組織樣本編碼、切片存放位置信息。切片標簽信息直接打印或粘貼于載玻片的標簽標記區域。
5.3冷凍組織樣本標簽
冷凍組織樣本標簽包含:樣本采集單位代碼、組織樣本編碼、樣本存放位置信息。樣本標簽粘貼于凍存管管壁的標簽標記區域。
5.4血液、體液、排泄物等樣本標簽
血液、體液、排泄物等樣本標簽包含三部分:
a)樣本識別信息,包含樣本采集單位代碼和組織樣本編碼;
b)樣本采集時間;
c)樣本存放位置信息。
對于抗凝血樣本,必須注明抗凝劑名稱。樣本標簽粘貼于凍存管管壁的標簽標記區域。
6操作規程
6.1樣本采集審查
6.1.1采集申請
生物樣本庫負責人,應向科學技術管理委員會與倫理委員會提交樣本收集方案。
6.1.2審查形式
科學技術管理委員會審查通過后,倫理委員會召開會議,審閱討論該申請。倫理委員會對審查意見應在討論后以投票方式作出決定。倫理委員會應建立工作程序,所有會議及其決議均應有書面記錄,簽發書面意見。
6.1.3審查要點
倫理委員會對申請倫理審查的項目進行下列審查:
a)人員、設備條件是否符合要求;
b)是否符合倫理原則的要求;
c)捐贈者可能遭受的風險程度及保護措施;
d)在辦理知情同意過程中,向捐贈者(或其家屬、監護人、法定代理人)提供的有關信息資料是否完整易懂,獲得知情同意的方法是否適當;
e)對捐贈者的資料是否采取了保密措施。
6.1.4決議標準
倫理委員會做出的決定至少應當得到倫理委員會三分之二委員同意。倫理委員會的決定應當說明理由。
6.1.5審查決議
a)同意;
b)修正后再審查;
c)不同意;
d)暫停或終止。
6.1.6倫理委員會審查意見書
a)生物樣本的采集方案需倫理委員會審查批準并簽署《倫理委員會審查意見書》,方可準予立項。
b)人類生物樣本的收集未獲得倫理委員會審查批準的,不得開展工作。
c)當實施程序或者條件發生變化時,必須重新向倫理委員會提出倫理審查申請。
6.2知情同意
應當在充分告知、尊重捐贈者權利的前提下簽署知情同意書,且至少應當載明以下條款:
a)捐贈樣本的種類、來源以及采集方式;
b)捐贈樣本的保存、用途和目的;
c)捐贈者可能遭受的安全、健康和權益的風險,以及相應保護措施;
d)涉及捐贈者相關信息的收集、儲存和使用,以及相應的保密措施;
e)尊重和保障捐贈者自主決定并行使無償捐贈的權利。
6.3樣本采集與保存
6.3.1組織樣本采集與保存
6.3.1.1首要原則
組織樣本取材不能影響常規臨床病理診斷,并遵循臨床技術操作規范(病理學分冊,ISBN 7801941950)。
6.3.1.2組織樣本采集時限
組織樣本采集必須在手術標本離體后 30 min 內完成。
6.3.1.3手術標本清潔
先后用流水及預冷生理鹽水快速將手術標本表面/腔面的血液、黏液以及污物沖洗干凈。
6.3.1.4手術標本描述
遵循臨床技術操作規范(病理學分冊,ISBN 7801941950),對于送檢手術標本的系統性描述和記錄。
6.3.1.5手術標本拍照
a)按照人體器官組織正常的解剖擺放位置擺放手術標本,放置直尺予以標記標本尺寸,拍攝手術標本全景照片。
b)根據手術標本的具體情況及臨床病理學特征,從不同視角進行多張圖片拍照。
6.3.1.6組織樣本取材
遵循距離腫瘤病灶中心由遠及近的原則,先后采集正常組織、腫瘤旁組織、腫瘤組織樣本。所采集組織樣本根據實際大小再行分切,每塊組織大小一般不超過 1 cm3× 1 cm3× 0.4 cm3。
6.3.1.7組織樣本保存
a)新鮮組織樣本冷藏保存不超過 4 h。
b)冷凍組織樣本放入液氮內速凍后深低溫冷凍保存。
c)石蠟組織樣本常溫保存。
6.3.2血液樣本采集與保存
6.3.2.1血液樣本采集時間選擇
一般選擇在治療前采集捐贈者的空腹外周靜脈血。根據研究的需要,也可采集捐贈者治療過程中和治療后的空腹外周靜脈血。
6.3.2.2血液樣本采集
遵循全國臨床檢驗操作規程(第三版,ISBN 7564105836),分別用真空采血管(抗凝管和促凝管)采集捐贈者血液樣本。根據研究的目的選擇不同的抗凝劑。
6.3.2.3血液樣本處理
遵循全國臨床檢驗操作規程(第三版,ISBN 7564105836),從所采集的全血樣本中分離出血漿或血清。血漿、分離血漿后的剩余全血、血清、凝血塊,均予以每管200 ~ 500 μl 分裝。
6.3.2.4血液樣本保存
新鮮血液樣本冷藏保存不超過 12 h。
冷凍血液樣本超低溫或深低溫冷凍保存。
6.3.3其他樣本采集與保存
其他樣本的采集,應遵循全國臨床檢驗操作規程(第三版,ISBN 7564105836)。樣本采集后,遵循無菌原則及時分裝,超低溫或深低溫冷凍保存。
6.4資料采集與管理
6.4.1資料采集
樣本相關的資料信息包括捐贈者的知情同意書、病歷資料和隨訪資料。
6.4.2資料保存
a)生物樣本的電子資料和紙質文檔應同時保存。
b)電子資料信息保存于生物樣本庫信息管理系統。紙質文檔由樣本庫統一保管。
c)入庫生物樣本必須配備知情同意書原件。
6.5樣本使用
6.5.1使用申請
研究者必須如實填寫并遞交生物樣本使用申請及研究方案的摘要,送交科學技術管理委員會。
6.5.2科學審查
科學技術管理委員會對樣本申請及研究方案進行科學審查,判定是否可以調用所申請的樣本。如果有需要修正的,須提出修正意見。研究者根據修改意見重新填寫生物樣本使用申請。委員會專家對與自身利益相關項目應采取回避機制。
6.5.3倫理審查
a)倫理委員會對通過科學審查的樣本使用申請進行倫理審查。
b)生物樣本使用時,須向倫理委員會提交免知情同意申請。
6.5.3.1審查要點
倫理委員會對申請倫理審查的項目進行下列審查:
a)項目的人員配備、經驗及設備條件是否符合要求;
b)項目是否符合倫理原則的要求;
c)對捐贈者的資料是否采取了保密措施;
d)研究人員與捐贈者之間有無利益沖突;
e)對項目提出的修正意見是否可接受。
6.5.3.2審查程序
見本部分 6.1.2,6.1.4,6.1.5。
6.5.3.3倫理委員會審查意見書
a)生物樣本的應用方案需經倫理委員會審查批準并簽署《倫理委員會審查意見書》(附錄 C),方可準予立項。
b)人類生物樣本的應用未獲得倫理委員會審查批準的,不得開展工作。
c)當實施程序或者條件發生變化時,必須重新向倫理委員會提出倫理審查申請。
6.5.4樣本出庫
a)審查通過的樣本申請,生物樣本庫方可準予辦理樣本和相關資料出庫。
b)申請者與生物樣本庫共同簽署樣本使用協議后執行樣本出庫。
c)樣本出庫信息記錄到生物樣本庫信息管理系統。
d)在向樣本使用者提供相關資料信息時,必須隱藏掉任何可識別捐贈者個人身份的信息。
6.6樣本運輸
6.6.1安全規定
所有生物樣本都被視為具有生物危害風險,樣本的包裝和運輸應嚴格遵循國家的相關規定[高致病性病原微生物菌(毒)種或樣本運輸管理規定],委托有資質的運輸公司進行運輸,確保樣本安全和運輸人員的安全。生物樣本的運輸應該遵循以下規則:
a)如實申報運輸樣本以及制冷劑的內容和潛在的危險性;
b)必須單獨包裝,不得以夾帶或其他方式混裝在普通運送包裹中。
6.6.2溫度保障
石蠟樣本常溫條件運輸;冷藏樣本需要用足夠的冰塊或冰袋將樣本溫度維持在 2 ~ 8 ℃;低溫保存的樣本需要在干冰或液氮的保護下進行運輸。運輸過程中應當始終保障制冷劑足量并完全覆蓋樣本。不同溫度條件的樣本在運輸過程中不得混合,應該分成獨立的包裹進行運輸。
6.6.3生物樣本運輸的其他要求
6.6.3.1生物樣本運輸必須由寄送方準備運送清單,以便于收件方核對。
6.6.3.2生物樣本運輸應該用合適的包裝以免造成樣本的破碎或者其他損失。
6.6.3.3收件方在核實樣本后必須對樣本的物理狀況進行核對,然后回復寄送方。如有任何遺漏或者損失,應當及時提出。
6.7樣本銷毀
生物樣本庫應建立無效或過期樣本銷毀制度,銷毀制度應當嚴格依照相關法律法規進行銷毀。
7附錄
志謝牽頭起草單位與專家:上海芯超生物科技有限公司、生物芯片上海國家工程研究中心(郜恒駿、張可浩、張小燕、張寶峰、方靜、何逖、姚海嵩);參與起草單位與專家:北京協和醫院(陳杰、盧朝輝);北京大學人民醫院(劉玉蘭、張育軍);北京大學腫瘤醫院(呂有勇);復旦大學附屬中山醫院(樊嘉、邱雙健);第二軍醫大學附屬長海醫院(朱明華);復旦大學附屬腫瘤醫院(杜祥);第四軍醫大學附屬西京醫院(吳開春、郭長存);中山大學附屬腫瘤醫院(賈衛華)與海爾集團公司(劉占杰)。呂有勇教授還代表國家 863 胃癌分子分型與腫瘤基因組重大項目組參加該標準的起草。


DOI:10.3969/cmba.j.issn.1673-713X.2011.01.018