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上海外來入侵種加拿大一枝黃花種群的遺傳結(jié)構(gòu)研究

2011-04-29 00:00:00廖夏偉,徐瀟凡,徐曉燕,余夢圓,李媛媛
湖北農(nóng)業(yè)科學(xué) 2011年3期

摘要:采用分子標(biāo)記(RAPDs)對上海地區(qū)入侵種加拿大一枝黃花(Solidago canadensis)種群遺傳結(jié)構(gòu)進行分析。采用10條引物擴增了8個種群185個個體,共得到92條條帶。95%標(biāo)準(zhǔn)下,多態(tài)位點百分比為100%。平均有效等位基因數(shù)目為1.359 7,期望雜合度為0.401 8,Shannon指數(shù)為0.367 6。上海地區(qū)加拿大一枝黃花種群整體遺傳多樣性較高,但單個種群的遺傳多樣性水平中等,可能與加拿大一枝黃花有廣泛種質(zhì)來源,通過有性繁殖入侵,但通過無性繁殖擴張的過程有關(guān)。基因分化系數(shù)GST為0.341 5,AMOVA表明41.65%的總DNA遺傳變異方差存在于種群間,說明加拿大一枝黃花種群的遺傳分化程度較大,表明了其以無性繁殖為主的擴散方式。

關(guān)鍵詞:加拿大一枝黃花;RAPD;遺傳多樣性;遺傳分化

中圖分類號:S459文獻標(biāo)識碼:A文章編號:0439-8114(2011)03-0517-03

Population Genetic Structures of An Invasive Species,Solidago canadensis, in Shanghai

LIAO Xia-wei,XU Xiao-fan,XU Xiao-yan,YU Meng-yuan,LI Yuan-yuan

(Department of Environment Science, East China Normal University,Shanghai 200241,China)

Abstract: The population genetic structures of an invasive species, Solidago canadensis, in Shanghai were analyzed using RAPD markers. A total of 10 primers were used and amplified 92 bands among all the 185 individuals of 8 populations. The percentage of polymorphic loci was 100% under 95% standard. The number of mean effective alleles was 1.359 7. The expected heterozygosity was 0.401 8, and Shannon index was 0.367 6. The data suggested genetic diversity of the whole Solidago Canadensis population in Shanghai was relatively high; while that of each population was middling, indicating extensive sources of seeds during the invading process, and asexual propagation in each population during expanding. Both GST(0.341 5) and AMOVA (41.65% of total genetic variance was among populations) showed a high genetic differentiation among populations, and asexual propagation within population during dispersal.

Key words: Solidago canadensis; RAPD; genetic diversity; genetic differentiation

加拿大一枝黃花(Solidago canadensis)原產(chǎn)于北美,1935年作為花卉植物引入我國,因其繁殖能力強、競爭力強、生長速度快等特點而迅速成為一種常見外來雜草,并對當(dāng)?shù)氐纳鷳B(tài)系統(tǒng)造成了較大影響和危害。據(jù)資料顯示,上海近20年來,由于該物種的入侵已造成30多種本土物種消亡,占上海土著物種的1/10[1]。作為惡性外來入侵植物,加拿大一枝黃花在引入后能迅速擴散,在最初地點外建立種群,種群的遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)常常改變,基因型特征也隨之改變[2]。同時,可通過根狀莖和種子分別進行無性繁殖和有性繁殖[3]。繁殖方式的不同直接決定了其不同的防治方法。遺傳多樣性和遺傳分化的研究可在一定程度上體現(xiàn)加拿大一枝黃花繁殖方式的側(cè)重性。所以,在了解其遺傳生態(tài)特性的同時,了解入侵物種加拿大一枝黃花的遺傳結(jié)構(gòu)對入侵機制的研究、入侵種的防治等有著重要意義。而目前國內(nèi)對其研究主要集中于生物學(xué)、生理生態(tài)以及防治等角度,而對于遺傳結(jié)構(gòu)的報道比較有限。馬淼[4]采用ISSR標(biāo)記對浙滬地區(qū)5個加拿大一枝黃花種群進行分析,發(fā)現(xiàn)其具有較高的遺傳多樣性。黃華等[5]利用RAPD標(biāo)記對浙滬地區(qū)4個加拿大一枝黃花種群研究也得到類似的結(jié)果。Dong等[6]分析了采自上海嘉定的兩個加拿大一枝黃花種群ISSR的遺傳結(jié)構(gòu),認(rèn)為有性繁殖是建立新種群的途徑,而克隆生長是其擴展已占領(lǐng)分布區(qū)的方式。

本研究選擇整個上海為樣方,以各區(qū)的野外逸生加拿大一枝黃花為材料,采用RAPD技術(shù)進行比較研究,明確了上海加拿大一枝黃花不同種群的遺傳多樣性,并從遺傳優(yōu)勢和遺傳分化的角度探討了對加拿大一枝黃花的防治及消除危害的策略和方法。

1材料與方法

1.1供試材料

采樣地點及生境見表1,分別采集上海市閔行、奉賢、寶山、金山、普陀、浦東、青浦、松江等8個區(qū)的加拿大一枝黃花樣品。每個地區(qū)隨機采集30份葉片標(biāo)本,每株植株取其頂端幼嫩葉子。由于加拿大一枝黃花是具有很強的無性繁殖能力的克隆植物[7],為了保證所采集樣品不來源于同一植株,每兩個樣品間的間隔至少15 m,分別標(biāo)記裝袋。選取每個區(qū)30份樣品中保存較完整的23~24個樣品(寶山種群由于霉變樣品較多,所以只選擇19個保存較好的樣品做研究),分別提取總DNA并進行RAPD分析。

2結(jié)果

共應(yīng)用10條RAPD引物對加拿大一枝黃花的8個自然種群的185個個體進行擴增,得到92條條帶。每個引物條帶數(shù)從5到14條不等,平均9.2條。

2.1遺傳多樣性

運用Popgene Version 1.31軟件[8]分別觀測平均等位基因數(shù)目(A)、有效等位基因數(shù)(Ae)、Shannon多態(tài)信息指數(shù)(SI),用TFPGA(Tools for Population Genetic Analyses)Version 1.3軟件[9]分別進行多態(tài)位點百分比(P)、期望雜合度(He)分析。具體情況如表2所示。

2.2遺傳分化

2.2.1遺傳一致度與遺傳距離用Nei氏[10]公式計算加拿大一枝黃花種群的遺傳一致度(I)和遺傳距離(D),結(jié)果如表3所示。

2.2.2遺傳分化系數(shù)運用Popgene Version 1.31軟件分別觀測總遺傳多樣性(HT)、種群內(nèi)的多樣性(Hs)、遺傳分化系數(shù)(GST)、基因流(Nm),具體情況如表4所示。

2.2.3AMOVA運用WINAMOVA Ver1.55[11]軟件對加拿大一枝黃花8個種群的遺傳標(biāo)記得到的遺傳多樣性在種群之間和種群內(nèi)的分布進行檢驗,遺傳變異方差的41.65%存在于種群間,58.35%存在于種群內(nèi)。

3小結(jié)與討論

3.1上海加拿大一枝黃花的遺傳多樣性

上海加拿大一枝黃花8個種群總體的多態(tài)位點百分比很高,在95%水平上為100%。但每個種群的多態(tài)位點百分比分布在39.13%~55.43%,平均為47.55%,與同種和其他草本植物比較,小于黃華等[5]觀測的4個加拿大一枝黃花種群多態(tài)位點百分比范圍(57.14%~73.13%),略小于草本植物的平均值(51.30%)[12]。加拿大一枝黃花平均有效等位基因數(shù)目為1.359 7,平均每個種群為1.245 8,小于同科的菊屬10種野生植物的1.488 7[13]。本研究中的期望雜合度總體為0.401 8,平均每種群為0.197 0,大于草本植物的平均值(0.162 0)[12]。Shannon多態(tài)信息指數(shù)為0.367 6,平均0.233 0,小于菊屬10種野生植物的0.446 6[13],與草本植物的平均值0.238 0相當(dāng)[12]。總體上加拿大一枝黃花有較大的遺傳多樣性,這與其入侵特點相對應(yīng)。Pappert等[14]認(rèn)為,現(xiàn)有雜草種群如果由多個不同來源的個體所建立,則具有較高的遺傳多樣性。加拿大一枝黃花可能有多個來源,并且易入侵,而形成現(xiàn)有的種群遺傳格局。但單獨的每個種群遺傳多樣性并不比其他植物高,可能與其侵占某地后以無性繁殖為主的特征有關(guān)[6]。也與外來入侵物種經(jīng)常是起源于少數(shù)幾個個體,由于遺傳的瓶頸效應(yīng)和建立者效應(yīng)常具有較低的遺傳多樣性有關(guān)[15]。就8個種群單獨來看,每個種群的遺傳多樣性指標(biāo)相差都不大,并且遺傳多樣性未表現(xiàn)出與生境和所處地點的密切關(guān)系。

3.2上海加拿大一枝黃花的遺傳分化

本研究采用基因分化指數(shù)GST對上海8個種群的加拿大一枝黃花的遺傳分化進行統(tǒng)計分析,得GST=0.341 5。Wright曾提出GST介于0~0.05說明種群遺傳分化很弱,介于0.05~0.15說明種群遺傳分化中等,介于0.15~0.25說明種群遺傳分化較大,大于0.25表明種群遺傳分化極大。因此,該研究結(jié)果表明上海地區(qū)8個種群的加拿大一枝黃花具有極大的遺傳分化,具有較低的基因流(Nm=0.964 1)。同樣,經(jīng)AMOVA分析后所得種間變異占總變異比例高達41.65%,顯示上海地區(qū)加拿大一枝黃花各種群之間具有很高的遺傳分化,與GST的分析結(jié)果一致。

該研究結(jié)果可能是由于加拿大一枝黃花主要依靠有性繁殖建立新種群[6],而來源的種質(zhì)資源又很廣泛,使得每個種群的奠基者遺傳組成不同,造成較大的遺傳分化。而種群定殖后,主要依賴無性繁殖擴散[6],種群間基因流小,使每個種群保持了原本大的遺傳分化[14]。

3.3上海加拿大一枝黃花的防治策略

從人為因素和上海的發(fā)展歷史來看,加拿大一枝黃花的花粉、種子等傳播體易經(jīng)由人群及交通工具等攜帶擴散入侵,人口遷移、經(jīng)濟交流等方面的因素都會對加拿大一枝黃花的擴散造成影響。本研究表明,加拿大一枝黃花有廣泛的種質(zhì)來源,因此防治應(yīng)從切斷來源入手,如在傳粉、結(jié)種時期采取得力措施盡可能多地清除植株等。另外,根據(jù)風(fēng)向等信息,在對加拿大一枝黃花的控制和防除工作中,要著重關(guān)注上風(fēng)向地區(qū)的防治,防止大量傳播。一旦有少數(shù)個體定殖成功,要清除其根莖部分,防止無性擴散和種群的擴大。

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