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花生DNA三種不同限制酶切組合的AFLP多態性標記分析

2011-12-31 00:00:00丁錦平
湖北農業科學 2011年12期

摘要:利用擴增片段長度多態性(Amplified fragment length polymorphism,AFLP)標記技術,3種不同的酶切組合,其中EcoRⅠ/MseⅠ240對引物、PstⅠ/MseⅠ96對引物、PstⅠ/TaqⅠ96對引物,對汕油162×Sunoliec95R作圖親本進行分析,統計了不同酶切組合的擴增總帶數、多態性位點及多態性率。多態性位點、多態性率及擴增總帶數都有不同程度的差異,說明嘗試不同的限制酶組合可以揭示出花生品系間更為豐富的遺傳變異。有望開發AFLP分子標記,為花生分子育種打下基礎。

關鍵詞:花生;AFLP;多態性;內切酶

中圖分類號:S565.2文獻標識碼:A文章編號:0439-8114(2011)12-2555-03

The AFLP Polymorphic Analysis in Peanut of Three Different Enzyme Combinations

DING Jin-ping

(Key Laboratory of Plant-Microbe Interactions,Department of Life Science,Shangqiu Normal University,Shangqiu476000,China)

Abstract:Totally 240 EcoRⅠ/MseⅠAFLP selective primer pairs, 96 PstⅠ/ MseⅠAFLP selective primer pairs and 96 PstⅠ/ TaqⅠAFLP selective primer pairs were used in the analysis of Shanyou162×Sunoliec95R peanut mapping parental lines, The results showed significant difference in total number of bands, polymorphic bands and polymorphic percentage. The study demonstrated that resorting to alternative enzyme combinations may be disclosed in genetic variations in the cultivated peanut. It is judicious options in developing AFLP markers so that to lay the foundation for molecular breeding of the peanut.

Key words: peanut;AFLP;polymorphic;endonulease

花生(Arachis hypogaea,2n=4x=40)是我國重要的油料作物和經濟作物,優良品種花生仁粗脂肪含量在50%左右,其中油酸和亞油酸之和占總脂肪酸的80%。油酸和亞油酸分別含有一個和兩個不飽和鍵十八碳烯酸,二者之比——油酸亞油酸比值(O/L值)是影響花生及其制品耐儲藏性的重要指標。一般花生品種油酸含量為37%~67%[1]。花生是一種普通農作物,但其在DNA分子水平上卻表現出與其他作物不同的特性。盡管不同類型間和同一類型不同品種間的花生,在農藝性狀如生長開花習性、抗逆性、品質特性等方面存在著廣泛的遺傳變異,但早期用隨機擴增多態性DNA(Random amplified polymorphic DNA,RAPD)和限制性內切酶片段長度多態性(Restriction fragment length polymorphism,RFLP)等分子鑒定技術檢測到栽培花生DNA幾乎沒有或只有很低的多態性[2-4]。基于花生基因組DNA的特殊性和相關基礎分子遺傳學研究的不足,目前尚未建立栽培花生的遺傳連鎖圖,與其他主要農作物相比,花生分子標記研究尚處于起步階段。目前在花生上可用的微衛星SSR(Simple sequence repeats)標記數量仍然很有限,而且不是所有的基因或農藝性狀都可以用SSR進行標記,因此,在花生上還需要分離更多其他類型的標記。AFLP由于無需預先知道目標生物的序列信息并且一次可同時檢測多個位點,AFLP和分離群體分組分析(Bulked segregant analysis,BSA)方法相結合被認為是挖掘緊密的分子標記和構建目標基因區飽和連鎖圖最為有效的方法之一[5-7]。研究利用AFLP標記技術,選用不同的酶切組合尋找親本的差異,為以后利用AFLP和BSA相結合的方法尋找與O/L值性狀連鎖的AFLP標記奠定了基礎,也為花生分子輔助育種奠定了基礎。

1材料與方法

1.1材料

花生汕油162(由廣東省汕頭市農業科學研究所育成),其O/L值為1.12;花生Sunoliec95R(F1250)是美國弗羅里達大學于1997年注冊的高油酸新品種,其油酸含量高達80.6%,而亞油酸含量僅為2.8%,O/L值高達28.79。

1.2DNA的提取

取花生幼苗的幼嫩葉子,按唐榮華[8]方法稍加改進進行。

1.3AFLP分析

AFLP分析流程參考文獻[8],3對內切酶組合分別合成240、96、96對引物(表1),采用6%聚丙烯酰胺凝膠分離分析,常規銀染法染色,按照清晰可辨的原則統計擴增條帶。

2結果與分析

圖1為3種限制性酶組合部分AFLP擴增圖譜。應用3種不同的酶切組合合成的引物對,對親本Sunoliec95R和汕油162 DNA進行擴增,不同的酶切組合擴增的結果不同。

EcoRⅠ/MseⅠ共240對引物,每對引物擴增出條帶數為12~88,總共擴增出的條帶數為11 640條,其中90對引物在兩個親本間可以擴增出多態性,每對AFLP引物在兩個親本間擴增出的多態性位點為1~3個,共174個多態性位點,多態性率為1.49%。

PstⅠ/MseⅠ共96對引物,每對引物擴增出條帶數為12~61,總共擴增出的條帶數為3 210條,其中34對引物在兩個親本間可以擴增出多態性,每對AFLP引物在兩個親本間擴增出的多態性位點為1~6個,共76個多態性位點,多態性率為2.37%。

PstⅠ/TaqⅠ共96對引物,每對引物擴增出條帶數為10~56,總共擴增出的條帶數為2 530條,其中28對引物在兩個親本間可以擴增出多態性,每對AFLP引物在兩個親本間擴增出的多態性位點為1~8個,共61個多態性位點,多態性率為2.41%。

3討論

通過試驗獲得了能揭示作圖親本間遺傳差異的不同引物對,不同的酶切組合多態性位點不同,多態性率也有差異,為今后構建圖譜打下了基礎,為今后分子標記的開發提供了一些參考依據。2004年Herselman[9]在定位與花生抗蚜性相關的AFLP

標記時曾采用過不同的酶切組合,檢出不同組合間多態性率存在顯著的差異;2005年徐建芝[10]研究了兩種酶切組合在親本和F1代之間多態性比率,發現不同酶切組合間也存在極顯著差異。本文利用AFLP方法在研究花生O/L值時,發現不同的限制性酶組合,其親本間多態性位點數,多態性率也存在差異。說明AFLP分析時,嘗試不同的限制性酶可顯著提高AFLP分析的辨別力。至于在花生栽培研究中,更優的限制性酶切組合還需要根據不同的研究目的,采用更多的材料進一步驗證。

參考文獻:

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[8] 唐榮華.花生屬種質資源遺傳多態性和分子分類研究[D].福州:福建農林大學,2004.

[9] HERSELMAN L,THWAITES R,KIMMINS F M,et al. Identification and mapping of AFLP markers linked to peanut(Arschis hypogoea L.)resistance to the aphid vector of groundnut rosette disease[J].Theor Appl Genet,2004,109(7):1426-1433.

[10] 徐建芝,王傳堂. 花生DNA分子標記的研究III不同限制酶切組合AFLP分析效果比較[J].中國農學通報,2005,21(12):40-42.

注:本文中所涉及到的圖表、注解、公式等內容請以PDF格式閱讀原文

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