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SORL1基因rs2070045單核苷酸多態性與遺忘型輕度認知功能障礙的關聯分析

2013-10-18 06:38:04于會艷曾湘豫高芳堃
卒中與神經疾病 2013年2期

高 欣 于會艷 孫 亮 曾湘豫 劉 銘 楊 澤 高芳堃 秦 斌

阿爾茨海默病(Alzheimer’s disease,AD)是以進行性認知功能障礙和記憶損害為特征的神經系統變性性疾病。AD病因復雜,涉及到遺傳、環境、代謝、病毒感染等多種因素。1991年,Goate A等發現早發家族性AD患者的21號染色體上淀粉樣前體蛋白(amyloid precursor protein,APP)基因17號外顯子發生了突變[1],由此人們對AD的研究進入了分子遺傳學這一嶄新的領域,對AD患者相關致病基因的篩查已成為近20年來研究的熱點。輕度認知功能障礙(mild cognitive impairment,MCI)是介于正常老齡和癡呆的過渡階段,相當一部分MCI患者會進展為AD。尤其是遺忘型 MCI(amnestic mild cognitive impairment,aMCI),其以記憶損害為主要表現,Mayo老年癡呆研究中隨訪一組患者,證明在第6年時大約80%的aMCI患者已轉化為AD[2],而相應年齡的正常人群每年AD的發病率僅約1%~2%[3],因此越來越多的學者注重于aMCI的研究,尤其是aMCI向AD轉化的相關因素和生物學標記。2007年Rogaeva等首次提出分 揀 蛋 白 相 關 受 體 1(sortilin-related receptor1,SORL1,又稱SORLA或LR11)基因可能是AD患病的第二風險因子,研究發現遺傳性或獲得性的SORL1受體表達或功能改變[4],可能涉及AD發生的機制。目前對SORL1基因研究比較多的單核苷酸多態性(single nucleotide polymorphism,SNP)是SNP19(rs2070045),Meta分析表明rs2070045攜帶G等位基因的人群患AD的風險大于攜帶T等位基因的人群[5],但是SORL1基因rs2070045單核苷酸多態性在中國漢族aMCI人群中鮮有報道,本研究通過對aMCI患者SORL1基因rs2070045進行多態性檢測,探討該位點多態性與aMCI的相關性和風險。

1 對象與方法

1.1 研究對象 本研究樣本人群來自國家自然科學基金“社區老年人輕度認知障礙綜合篩查模式的研究”課題。于2011年1月~2011年6月在北京某社區經篩查得到aMCI患者139例,男41例,女98例,平均年齡(74.5±5.7)歲,作為aMCI組;體檢正常者213例作為對照組,男82例,女131例,平均年齡(69.4±7.1)歲。對照組與aMCI組性別、文化程度、生活背景等相互匹配,并確定為無血緣關系的健康者。

1.2 方法

1.2.1 診斷標準 aMCI診斷標準參見文獻[6]并略作修改:(1)記憶障礙是基本和主要的主訴;(2)有記憶減退的客觀檢查證據,記憶障礙的客觀檢查低于同年齡及教育程度1.5個標準差以上;(3)一般認知功能正常,精神狀態簡易速查表(mini-mental state examination,MMSE)總分≥24分;(4)日常生活能力保留,日常生活能力量表(activities of daily living scale,ADL)<26分(21項);(5)無癡呆,臨床癡呆評定量表(Clinical Dementia Rating,CDR)為0.5分,沒有足夠的認知障礙診斷為癡呆,不符合美國神經病學、語言障礙和卒中-老年性癡呆和相關疾病學會(NINCDS-ADRDA)的有關癡呆的診斷標準;(6)排除其他神經系統疾病和其他軀體疾病導致的記憶力下降;(7)經漢密爾頓抑郁量表(hamilton depression scale,HAMD)篩查排除抑郁狀態;(8)Hachinski缺血評分:以≤4分排除血管性認知障礙。每個病例根據病史體檢量表測試成績,結合CT或MRI進行反復討論分析,最后作出診斷。對照組為同期入組相匹配的正常對照者,均符合(1)無記憶力減退主訴,無嚴重軀體疾病,檢查合作;(2)MMSE總分≥26分;(3)CDR=0。排除標準:排除AD、血管性癡呆﹑帕金森氏性癡呆及腦器質性疾病所致的各種癡呆患者。排除正處于心血管、肺、肝、腎等重大軀體疾病急性期的患者,排除頭部外傷史、特殊藥物服用史等。兩組間年齡性別差異不明顯(P>0.05)。

采用的神經心理學量表:精神狀態簡易速查表(mini-mental state examination,MMSE)、臨床記憶量表(clinical memory scale,CMS)、臨床癡呆量表(Clinical Dementia Rating,CDR)、日常生活行為量表(activities of daily living scale,ADL)、Hachinski缺血積分表(hachinski ischaemic scale,HIS)及漢密爾頓抑郁量表(hamilton depression scale,HAMD)。

1.2.2 靜脈血采集 在受檢者知情同意情況下,清晨取空腹靜脈血5 ml,血樣加EDTA抗凝劑后保存于-80℃冰箱中,用于DNA提取。

1.2.3 基因組DNA提取及定量取EDTA抗凝的受試者靜脈血0.5 ml,用全基因組DNA提取試劑盒抽提DNA,通過蛋白/核酸比色儀對提取的基因組DNA進行濃度和純度的分析,根據測定結果將樣本DNA稀釋至20μg/μl的工作液置于4℃冰箱。

1.2.4 位點選擇 SORL1基因rs2070045(G/T)SNP多態性位點。引物序列分別為上游引物:5’-AACGACTGGA CGGACTGGT-3’,下游引物5’-CGGATGAGTGCTGTCAACTGAG-3’,擴增產物長度為78 bp。

1.2.5 PCR反應 PCR反應體系10μl,其中包含DNA模板1μl,10×PCR Buffer 1μl,10mmol/L dNTP0.2μl,Taq DNA 聚合酶(5 U/μl)0.2μl,rs2070045上下游引物(10 pmol/μl)各0.2μl,1×LC-green PLUS飽和熒光染料1μl,寡核苷酸內參0.2μl(高溫寡核苷酸內參與低溫寡核苷酸內參4個片段各0.05μl),去離子水補充總體積至10μl。PCR反應條件為95℃預變性5 min后進入主循環,95℃ 變性30 s,55℃ 退火30 s,72℃延伸6 s,總共45個循環,完成后72℃延伸7 min,之后進行HRM分析之前的變性和復性處理,程序為95℃30 s,25℃2 min,94℃30 s,24℃4 min。

表1 HRM-PCR的引物序列、退火溫度及其產物長度

1.2.6 HRM檢測 將PCR產物移入HRM專用96孔板內,在 Lightscanner TMHR-I 96上進行HRM分析:從45℃開始,以0.3℃/s的斜率采集熔解曲線,到98℃結束,用Light-Scanner Call IT軟件對采集后的曲線進行分析,判定基因型。

1.2.7 測序驗證 根據HRM分析的不同曲線確定不同的基因型。從所得的不同基因型的個體中分別隨機抽取5例樣本進行測序驗證。測序樣本重新進 行 PCR 擴 增,上 游 引 物 為 5'-CCGGAGTGACGAGTACAA-3',下 游 引 物 為 5'-CTCGCTGATTTCTAAGGTCC-3',擴增片段長度為229bp。PCR反應體系30μl,包含 DNA 模板3μl,10×PCRBuffer 5μl,10mmol/L dNTP1μl,Taq DNA聚合酶(5 U/μl)1μl,上下游引物(10 pmol/μl)各0.6μl,去離子水補充總體積至30μl。PCR反應條件為95℃預變性5 min后進入主循環,95℃變性30 s,58.5℃退火30 s,72℃延伸45 s,總共35個循環,完成后72℃延伸7 min。PCR產物經8%聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測,凝膠成像系統觀察合格后送華大基因測序部進行測序驗證。

1.2.8 統計學處理 運用Hardy-Weinberg平衡檢驗研究樣本的群體代表性。用比數比(OR)值及其95%置信區間(95%CI)來評價相對風險。實驗數據中計量資料數據以±s表示,組間比較采用t檢驗,組間基因型頻率及等位基因頻率比較采用χ2檢驗,以P<0.05為差異顯著性標準,采用SPSS 11.5軟件。

2 結 果

2.1 SORL1基因rs2070045單核苷酸多態性的基因型分析 SORL1基因rs2070045單核苷酸多態性位點分為3種基因型:GG,GT,TT。通過HRM分型系統分析,可根據樣本的熔解曲線差異,將所有樣本分為3組基因型。3組之間的熔解曲線差異非常顯著(圖1)。每組中隨機挑選5例樣本進行測序驗證,進行基因型的確定以及HRM分型結果準確性的評估。HRM分型的結果與測序的結果完全吻合,準確率為100%,測序圖見圖2。

2.2 SORL1基因rs2070045單核苷酸多態性的基因型與等位基因頻率在aMCI患者和正常對照者中的分布 以Hardy-Weinberg平衡法檢驗aMCI組和正常對照組的基因型頻率,等位基因的分布具有群體代表性(P>0.05)。

SORL1 rs2070045單核苷酸多態性基因型及等位基因頻率分布見表2,三種基因型頻率在aMCI組和對照組間的分布有顯著差異(χ2=7.109,P=0.029),兩種等位基因頻率在兩組間的分布也有顯著差異(χ2=7.315,P=0.007)。G等位基因為危險等位基因(OR=1.528,95%CI為1.123~2.080),不同遺傳模型下GG+GT基因型與對照組有顯著差異(OR=1.873,95%CI為1.061~3.308),為危險基因型,GG純合基因型與對照組也有顯著差異(OR=1.658,95%CI為1.053~2.612),為危險基因型(表3)。

圖1 SORL1基因rs2070045單核苷酸多態性HRM分型的熔解曲線 紅色代表TT基因型,藍色代表GG基因型,灰色代表GT基因型

圖2 SORL1基因rs668387單核苷酸多態性樣本抽樣測序圖 (A圖為GG型,B圖為TT型,C圖為GT型)

表2 SORL1基因rs2070045基因型和等位基因頻率在aMCI組和對照組的分布[n(%)]

2.3 不同性別aMCI組與對照組SORL1 rs2070045基因型及等位基因頻率比較 男性aMCI組與對照組SORL1基因型及等位基因頻率分布無顯著差異(表4),SORL1基因rs2070045不同遺傳模型下基因型在男性aMCI組和正常對照組的分布無顯著差異(表5),女性aMCI組與對照組基因型無顯著差異但是等位基因頻率分布有顯著差異(表6),SORL1基因rs2070045不同遺傳模型下基因型在女性aMCI組和正常對照組的分布無顯著差異(表7)。

表3 SORL1基因rs2070045不同遺傳模型下基因型在aMCI組和對照組的分布[n(%)]

表4 SORL1基因rs2070045基因型和等位基因頻率在男性aMCI組和對照組的分布[n(%)]

表5 SORL1基因rs2070045不同遺傳模型下基因型在男性aMCI組和對照組的分布[n(%)]

3 討 論

認知障礙的病因及致病機制目前仍不十分清楚,研究表明,除少數家族性AD外,絕大多數AD都呈散發性。散發AD由多因素及多基因導致,目前諸多等位基因中得到廣泛證實是晚發型AD的風險因子的有APOEε4[7]。2007年Rogaeva等首次提出SORL1可能是AD患病的第二風險因子[4],但是對aMCI的遺傳學研究仍然很局限,尤其是aMCI向AD轉化的相關因素和生物學標記。由于缺乏aMCI有效的臨床診斷方法,以及其發展的難以預測性,因此,以遺傳學作為篩選aMCI易感人群的生物學標記物成為熱點。如果能夠發現與aMCI有關的致病基因,就有可能提高對aMCI的診斷,并作為預測aMCI病情發展的標記。從aMCI層面闡明和證實AD的易感基因,可以為AD患者的有效篩查、早期診斷、臨床治療和干預提供線索,具有重要的社會、經濟和科學意義。

表6 SORL1基因rs2070045基因型和等位基因頻率在女性aMCI組和對照組的分布[n(%)]

表7 SORL1基因rs2070045不同遺傳模型下基因型在女性aMCI組和對照組的分布[n(%)]

SORL1基因位于人類11號染色體的長臂q 23.2-24.2區域,在神經細胞內表達,該基因編碼的受體穿梭于質膜、內涵體和高爾基體,在神經元細胞中發揮轉運作用。SORL1受體可以阻止APP形成Aβ,SORL1受體減少將導致腦內Aβ水平增高,從而導致AD的發生。自2007年Rogaeva等首先報道了對6個不同種群的SORL1基因序列中的單核苷酸多態性研究,關聯分析表明SORL1基因的SNP與散發AD相關聯,但也表現出不同種群的差異性[4]。在此之后,陸續有研究證實SORL1基因多態性與AD相關[8,9],但也有部分研究顯示無明顯關聯[10,11]。與AD相關的SNPs位于SORL1基因的兩個區域,靠近SORL1基因5’端的SNPs 8-10和3’端的SNPs 19-25。我們選取了SORL1基因5’端 的 SNP 8(rs668387)和 3’端 的 SNP19(rs2070045)、SNP23 (rs3824968)和 SNP24(rs2282649)4個位點進行了研究,除了rs2070045位點的基因型和等位基因頻率在aMCI人群和正常對照人群中有顯著差異外,其余3個位點未見差異(結果未顯示)。

SORL1基因rs2070045位點野生型基因型為TT,存在GG和GT兩種變異基因型。SORL1基因多態性與aMCI的關聯尚未見報道,本研究發現,aMCI人群GG,GT,TT三種基因型與正常對照人群三種基因型分布頻率有顯著性差異(P<0.05),G等位基因頻率在aMCI和正常對照有顯著性差異(P<0.01),為危險等位基因(OR=1.528,95%CI為1.123~2.080),該位點G等位基因在女性中也是危險等位基因(OR=1.501,95%CI為1.028~2.191)。本研究結果提示北京漢族人群SORL1基因rs2070045位點的G/T SNP多態性與aMCI關聯,G等位基因是危險等位基因,并且該等位基因在女性人群也是危險等位基因。該位點在西方人群中研究發現,攜帶G等位基因的人群患AD的風險大于攜帶T等位基因的人群[5];亞洲人群中日本人Kimura在晚發型AD人群研究中發現rs2070045位點G等位基因為風險等位基因[12],上海晚發型AD人群中發現rs2070045位點的G等位基因為風險等位基因[13],與本研究在aMCI人群中的發現一致,也就是說aMCI與AD具有相同的遺傳背景,由于aMCI是AD的高危人群,說明從aMCI階段預測其進展是可行的,可能對aMCI診斷和預測有幫助。

綜上所述,本研究結果顯示SORL1基因rs2070045位點G/T SNP多態性與aMCI相關聯,并且在女性中得到了同樣的結果,說明SORL1基因rs2070045位點單核苷酸多態性與aMCI相關,該位點G等位基因可能是aMCI的危險因素之一。但是在男性中沒有看到相同結果,考慮可能與病例樣本量少,分性別后導致樣本量更少,或者是該危險因素與性別相關。由于aMCI人群具有向AD極高的轉化率,因此從aMCI階段尋找與患病相關的遺傳因素,具有非常重要的意義。但是SORL1基因存在多個位點的SNP,并且有人群特異性,要明確該基因與aMCI的關系,還應選擇更多位點進行更大規模人群的研究。

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