邢秋婷 郭興國 邢萬靜 闞云超 喬惠麗
摘要 [目的] 研究家蠶Polycomb蛋白家族基因BmSu(z)12在家蠶幼蟲中的表達情況。[方法] 根據家蠶基因組預測的BmSu(z)12基因序列,設計特異引物,利用qRTPCR對該基因在家蠶不同齡期幼蟲中的表達進行研究。[結果] BmSu(z)12基因在5齡幼蟲蛻皮后2 d和變態前2 d有較高表達,而在1~5齡取食中期表達量較低,表達特征具有一定的規律性。 [結論] BmSu(z)12基因在家蠶幼蟲生長發育中具有重要作用,該研究為進一步研究家蠶SU(Z)12蛋白的功能奠定基礎。
關鍵詞 家蠶;polycomb蛋白;Su(z)12基因;表達
中圖分類號 S188 文獻標識碼 A 文章編號 0517-6611(2014)27-09286-02
Study on Expression of Polycomb Group Gene BmSu(z)12 in Silkworm Larvae.
XING Qiuting, GUO Xingguo, XING Wanjing, QIAO Huili et al
(Henan Key Laboratory of Insect Biology in Funiu Mountain, Nanyang Normal University, Nanyang, Henan 473061)
Abstract [Objective] The aim was to study the expression of polycomb group gene BmSu(z)12, in silkworm larvae. [Method] Based on the predicted BmSu(z)12 gene sequence in the genome of silkworm, the specific primers were designed. qRTPCR was applied to analyze the expression of BmSu(z)12 in different instar larvae of silkworm. [Result] The expression level of BmSu(z)12 was high in the first and the last 2 days of the 5th newly molted larvae, low expression was observed in the eating larvae of each instar. It showed regular expression patterns in the different developmental stages of larva. [Conclusion] BmSu(z)12 may have important roles in the development of the silkworm larvae, the study will provide fundamental knowledge for further investigation of SU(Z)12 protein function in silkworm.
Key words Silkworm; Polycomb protein; Su(z)12 gene; Expression
Polycomb蛋白復合體(Polycomb Group Proteins,PcG)是通過對組蛋白進行甲基化修飾來調控靶基因的表觀遺傳調控因子,廣泛存在于果蠅、線蟲、小鼠、人和擬南芥等各種生物體中,在進化上高度保守。PcG蛋白家族最初在果蠅中被發現,主要包含2個核心蛋白復合體,即PRC1(Polycomb Repressive Complex 1)和PRC2(Polycomb Repressive Complex 2),其中PRC2在轉錄抑制起始階段發揮作用,PRC1主要維持處于阻抑狀態染色質的穩定性[1-4]。
在果蠅中,PRC1是由PC、PH、PSC和dRing組成的一個蛋白復合體,PRC2主要包括ESC、E(Z)、Rpd3、SU(Z)12和組蛋白結合蛋白p55/RbAp48[5-6]。在哺乳動物中,PRC1由HPC、HPH、Bmi1/Mel18和Ring1A/B組成,PRC2由EED、EZH2、SU(Z)12、RbAp48和AEBP2組成,其中PRC2催化核心組蛋白的甲基化,而甲基化的組蛋白為PRC1復合體識別和結合提供位點[7]。
近年來,PcG蛋白作為轉錄水平上的表觀遺傳修飾因子和細胞命運的調節子受到越來越多研究者的關注。在生物生長發育和病變過程中,PcG蛋白通過形成多復合體,作用于染色體上的不同位點,致使染色體變構,以期調控基因表達[8]。PcG蛋白的主要作用靶標是Hox基因簇,Hox基因在決定細胞的定向分化與增殖、調控機體組織器官發育方面起決定性作用。其中PRC2主要參與H3K27的甲基化修飾來抑制靶基因的表達,而SU(Z)12是PRC2蛋白復合體發揮其內在的組蛋白甲基轉移酶(Histone methyltransferase,HMTase)活性所必需的成分之一,其VEFS結構域在果蠅、人和擬南芥中高度保守,目前發現SU(Z)12在胚胎發育、細胞周期、細胞增殖和分化的調控中起著極其重要的作用[9-12]。
家蠶作為人類最早馴化的動物之一,是我國重要的特色經濟昆蟲,且作為鱗翅目昆蟲的模式生物,在研究昆蟲變態發育及農林業害蟲防治中也發揮著重要作用,同時家蠶具有大量的Hox基因。筆者根據家蠶基因組中預測的BmSu(z)12基因序列,利用PCR法對家蠶BmSu(z)12基因VEFS結構域進行克隆,并利用qRTPCR研究BmSu(z)12在家蠶不同齡期幼蟲的表達情況,從而為進一步研究家蠶中BmSu(z)12的功能奠定基礎。
1 材料與方法
1.1 材料
以家蠶品種大造P50作為試驗材料,用新鮮的桑葉飼養。分別取1~4齡幼蟲和5齡每天的整蠶,解剖去中腸并用DEPC水沖洗。所有樣品迅速置于無RNA酶的離心管中,液氮速凍后于-80 ℃冰箱保存備用。
1.2 引物
PCR擴增所用引物序列(5′~3′)BmSu(z)12F:GAGTTCCTAGAGCTGGACGA;
BmSu(z)12R:GAGCATCTGAACGGTCT;
BmactinA3F:ATGTGCGACGAAGAAGTTGC;
BmactinA3R:GTCTCCTACGTACGAGTCCT。由奧科生物技術有限公司合成。
1.3 家蠶幼蟲RNA提取及BmSu(z)12基因克隆
采用Trizol(Invitrogen)法,提取家蠶幼蟲整蠶樣品RNA,利用PrimeScript II反轉錄試劑盒(TaKaRa)反轉錄為cDNA后,以其為模板進行后續試驗。
根據家蠶基因組中預測的BmSu(z)12基因序列BGIBMGA011842PA設計引物。以家蠶5齡第1天幼蟲cDNA為模板進行PCR擴增。擴增條件:94 ℃預變性5 min;94 ℃變性15 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s,循環30次;72 ℃延伸10 min。將純化后的擴增產物與pMD19T simple連接后,轉化至大腸桿菌(E.coli)DH5α,挑取陽性克隆,進行測序驗證。
1.4 BmSu(z)12基因在不同齡期幼蟲中表達的qRTPCR分析
qRTPCR檢測的內參基因為家蠶BmactinA3(GenBank登錄號:U49854)。BmactinA3和BmSu(z)12引物序列見“1.2”。反應檢測儀為BioRad 公司的CFX96系統,qRTPCR擴增程序:94 ℃預變性5 min;94 ℃變性15 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s,40個循環,溶解曲線在65 ~95 ℃用來判定產物特異性。每個樣品設3個重復,BmSu(z)12基因mRNA的相對表達量用2-△CT表示,其中△Ct=Ct(目的基因)- Ct(內參基因)。
2 結果與分析
2.1 BmSu(z)12基因片段的克隆
通過PCR方法,從家蠶幼蟲RNA反轉錄的cDNA中克隆BmSu(z)12基因423 bp的片段,產物經奧科公司測序正確,表明為目的基因。
2.2 BmSu(z)12基因在家蠶幼蟲不同時期的表達分析
采用qRTPCR方法對BmSu(z)12在家蠶不同齡期幼蟲的表達情況進行定量檢測,結果見圖1。由圖1可知,BmSu(z)12基因在家蠶1~4齡的幼蟲中表達量較低,而在5齡各時期樣品中的表達量相對較高,并呈一定的規律。在剛蛻皮后的5齡第1天、第2天和進入變態前的5齡第7天、第8天表達量較高,而在5齡中期(第3、4、5、6天)的表達量較低。
3 討論
PcG蛋白家族通過催化組蛋白H3的27位賴氨酸的甲基化水平來調控靶基因表達,并廣泛參與到發育、增殖、分化及腫瘤發生等重要的生命過程。SU(Z)12本身沒有甲基轉移酶活性,但其對PRC2復合體的功能具有重要作用。研究表明,在過表達SU(Z)12的果蠅突變體中可以檢測到H3K27me3的甲基化程度明顯增加,而敲除SU(Z)12的突變體中H3K27me3完全消失[13]。該試驗在家蠶幼蟲中克隆獲得PcG蛋白PRC2復合體中的重要組分BmSu(z)12基因的VEFS結構域,將其編碼氨基酸序列與其他物種的同源序列進行比對,發現其與果蠅和人類Su(z)12分別有72%和52%的序列相似性。BmSu(z)12家蠶幼蟲的qRT PCR結果顯示,BmSu(z)12基因在5齡幼蟲中蛻皮后2 d和變態前2 d表達量較高,而在1~5齡取食中期表達量較低,該表達特征具有一定的規律性。因為在幼蟲蛻皮后和變態前家蠶各組織都處于組織重構狀態,新的組織細胞將準備進行分化;而到取食中期,家蠶體內組織功能回歸正常,分化過程放緩,表明BmSu(z)12基因在家蠶幼蟲生長發育中起著重要作用。研究發現,在果蠅SU(Z)12突變體中發現果蠅產下的卵不能正常發育[13];家蠶中Su(z)12在胚胎發育早期大量表達,晚期逐漸降低[14],表明該蛋白在胚胎發育過程中也發揮功能;在哺乳動物細胞中敲除SU(Z)12后導致細胞形態變小,進一步表明SU(Z)12可能在細胞分化中發揮作用[15];最近的研究發現,Su(z)12在不同人類腫瘤中表達明顯上調,因此可能是一種新的腫瘤基因治療的分子靶點[16-18]。家蠶屬于完全變態發育昆蟲,幼蟲期每個齡期之間都要經歷眠和蛻皮的過程,不同階段發育過程中細胞的重組和分化都非常重要。因此通過對BmSu(z)12在幼蟲中表達特征的研究,將為進一步研究家蠶SU(Z)12蛋白的功能提供理論依據。
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