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布魯菌wzt基因的原核表達及生物信息學分析

2014-09-15 04:39:14王秀然康立恒郝芳芳許春曉盧天成周曉麗
東北師大學報(自然科學版) 2014年3期

王秀然,康立恒,安 偉,郝芳芳,陳 思,許春曉,盧天成,周曉麗

(1.吉林農業大學生命科學學院,吉林 長春 130118;2.吉林大學白求恩醫學部,吉林 長春 130021;3.吉林大學第一醫院,吉林 長春 130021;4.軍事醫學科學院軍事獸醫研究所,吉林 長春 130122)

布魯菌病是一種人畜共患疾病,該病不但嚴重影響養殖業的發展,對人類健康也構成了巨大威脅.人畜布魯菌病難以防控的原因是多方面的,其中,其致病機理(包括胞內寄生機理)和免疫機理不清楚是主要原因.

引起布魯菌病的布魯菌是兼性細胞內寄生的革蘭氏陰性球桿菌,不產生芽孢和莢膜.雖然布魯菌不能自主運動,但其攜帶組裝鞭毛的所有基因,也不含趨化系統[1].脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)是布魯菌主要的毒力因子,也是引起哺乳動物免疫的主要抗原之一[2].目前布魯菌脂多糖合成的途徑并不完全清晰,已經發現的與布魯菌脂多糖合成相關的關鍵基因有wbkA,gmd,wzm,wzt,wbkB,wbkC等,其中wzt基因為ABC轉運系統(ABC transporter)的重要組成部分[3],布魯菌LPS-O側鏈的合成即是通過ABC轉運途徑.有研究顯示[4],線性O多糖大多是通過這一途徑完成的,這一過程中糖苷連接到UDP-PP-糖鏈上,在細胞膜內膜上完成聚合物的合成,然后借助ABC轉運蛋白運到膜外,鏈接到核心寡糖和類脂A上;其中,wzt基因編碼ABC型轉運體(ATP酶結構域)O抗原輸出系統ATP結合蛋白,其突變導致B.melitensis 16M形成粗糙型突變體,ELISA檢測S-LPS的O側鏈可確定O側鏈缺失.O多糖合成前體由wzt形成的ABC轉運系統通過十一異戊烯聯聚合物轉移到膜,在那里它被連接到脂質A核心和易位到外膜的周質面[5].ABC轉運系統在細菌中是一個主要的細胞轉運機器,由一系列同源基因編碼的操縱子組成[6].該操縱子由ATP結合蛋白、膜蛋白、亞基結合蛋白3部分組成,通常情況下,形成由6個跨膜片段組成的2個完整的膜蛋白[7].ABC轉運系統是膜外生物大分子合成的主要運輸通道之一,參與胞外多糖的合成[8].此外,ABC轉運系統在細菌營養成分的運輸、獨立分子的外排等過程中也起著重要的作用[9].研究發現,wzt基因缺失會造成布魯菌O側鏈缺失,同時降低布魯菌的毒力[10];缺失wzt基因的布魯菌突變株與親本株相比,細胞免疫水平下降,體液免疫水平上升[11-12].

本研究對源于布魯菌的wzt基因進行了克隆并對原核進行了表達,對其進行了生物信息學分析和結構預測,以為闡明布魯菌wzt基因的功能提供理論依據.

1 材料與方法

1.1 菌株及載體

布魯菌Brucella abortus S19DNA、感受態菌株Eschericholia.coli DH5α、E.coli BL21(DE3)由軍事醫學科學院軍事獸醫研究所五室贈送;Trans-T1感受態、原核表達載體pEASY-E1expression kit購自北京全式金生物技術有限公司.

1.2 方法

1.2.1 培養基

液體LB培養基:蛋白胨1g,酵母粉0.5g,NaCl 1g,蒸餾水100mL,pH=7.2.

固體培養基(Ampicillin,Ampr):蛋白胨1g,酵母粉0.5g,NaCl 1g,瓊脂1.5g,蒸餾水100mL,pH=7.2.121℃滅菌20min.滅菌后加除菌的氨芐西林至100μg/mL.

1.2.2 引物的設計及合成

根據GenBank中B.abortus S19的序列信息設計引物.上游引物(Nde I酶切位點)F:catatgATGATCCAGCCATCGATTACCCTGT;下游引物R(Xho I 酶切位點):ctcgagTCATGCTATAGCTCCCATTCCCGAG.引物由長春華大中天生物技術有限公司合成.

1.2.3 wzt基因的擴增

以B.abortus S19總DNA為模板,反應體系50μL:模板DNA 2μL,上游引物1μL,下游引物1μL,Ex Taq酶0.5μL,10×Buffer 5μL,dNTP 4μL,水36.5μL.反應條件:94℃5min;94℃1min,58℃30s,72℃1min,30個循環;72℃延伸10min.

1.2.4 重組表達質粒的構建及鑒定

利用凝膠回收試劑盒純化回收PCR產物,將回收產物與pEASY-E1載體連接并轉化Trans-T1感受態細胞,轉化后加入250μL經室溫平衡的LB培養基,于37℃,180r/min恒溫搖床中培養1h.取200μL菌液均勻地涂布于準備好的Ampr固體培養基平板上,37℃培養過夜.

挑取單菌落接種于LB(Amp)液體培養基中,180r/min,37℃恒溫搖床中培養12h,采用載體正向引物(E Control Forward Primer:GGAATTGTGAGCGGATAACAATTCC)和下游引物R進行PCR鑒定.

提取陽性菌液質粒,進行Nde I和Xho I雙酶切鑒定,37℃水浴鍋酶切3h.酶切體系:質粒4μL,限制性內切酶Nde I 0.5μL,限制性內切酶Xho I 0.5μL,Buffer 1μL,無菌水4μL.將鑒定正確的質粒pEASY-wzt進行測序.

1.2.5 誘導表達

將pEASY-wzt轉化到E.coli BL21(DE3).挑取陽性單克隆菌落,接種到5mL含有Amp的抗性LB液體培養基中,37℃,180r/min培養6h;至菌液D(600)為0.6時,加入終濃度為1mmol/L 的IPTG,37℃繼續誘導4h.

1.2.6 聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE電泳)分析

收集1.5mL誘導的菌液,以未誘導菌液作為陰性對照,于室溫12000r/min離心1min,棄上清,用1mL PBS懸浮;12000r/min離心1min,用50μL蒸餾水懸浮沉淀,加入50μL 2×SDS Buffer,在沸水中孵育5~10min.12000r/min離心5min,取上清液進行8%SDS-PAGE電泳分析.凝膠用考馬斯亮藍R-250染色.

1.2.7 表達蛋白質的純化

收集100mL誘導表達的菌液,4℃,5000r/min離心5min;棄上清,加入100mL的PBS洗滌菌液,4℃,5000r/min離心5min;重復洗滌一次,棄上清,將菌體置于冰水中,用20mL的Binding Buffer結合液進行重懸.超聲裂解細菌,超聲10s,間歇10s,功率400W持續工作30min,直至上清液變清澈.4℃,13000r/min離心10min,取上清,經0.22μm的濾膜過濾后,用1mL HisTrapTMFF親和層析柱純化蛋白.

1.2.8 表達產物的Western Blotting鑒定

純化產物經SDS-PAGE分析后,根據SDS-PAGE凝膠的大小,剪裁PVDF膜和濾紙.將濾紙放在轉膜緩沖液中完全浸透;PVDF膜先在甲醇中敏化15s,隨后放入蒸餾水中浸泡2min.組裝轉膜裝置,從陽極到陰極依次為:8層濾紙-PVDF膜-凝膠-8層濾紙.PVDF膜要略大于凝膠,以保證所有蛋白能夠轉到膜上;并將濾紙、凝膠、PVDF膜對齊,趕走氣泡.恒流110mA,電壓控制在25V內,電轉25min.用洗滌液清洗PVDF膜3次,每次5min.加入5%脫脂奶粉常溫封閉,在搖床上輕輕搖動1~2h.倒掉封閉液,用洗滌液洗膜3次,每次5min.一抗孵育:加入1∶200(體積比)倍稀釋的鼠抗His標簽單克隆抗體,37℃孵育2h,倒掉一抗,洗滌液洗膜(方法同上);二抗孵育:加入1∶2000(體積比)倍稀釋的辣根過氧化物酶標記的羊抗鼠IgG,37℃孵育2h.倒掉二抗,洗滌液洗膜(方法同上)[13].加入TMB顯色液顯色10min,加純水終止,掃描保存圖片.

1.3 wzt基因表達產物的生物信息學分析與結構預測

1.3.1 wzt蛋白結構預測

采用Discovery Studio 2.5軟件以Swiss-Model模式對蛋白質結構進行預測[14].

1.3.2 wzt基因表達產物的生物信息學分析

在NCBI數據庫中對與wzt基因功能相關的蛋白序列進行檢索,并采用Clustalx1.83和MEGA5.0進行生物信息學分析.

2 結果與分析

2.1 wzt基因擴增產物的鑒定

以B.abortus S19總DNA為模板,PCR擴增wzt基因,成功獲得目的基因,擴增產物經1%瓊脂糖凝膠電泳檢查,得到與目的基因大小相符的約756bp的條帶(見圖1).

2.2 重組表達質粒的酶切鑒定

將重組質粒pEASY-wzt經Xho I單酶切、Nde I和Xho I雙酶切進行鑒定,得到的結果同理論值相符,表明重組表達質粒pEASY-wzt構建正確.經測序,與GenBank注冊序列一致.

圖1 目的基因wzt的PCR擴增產物凝膠電泳圖

圖2 表達產物的SDS-PAGE分析

2.3 表達產物的鑒定

將構建好的重組質粒pEASY-wzt轉到大腸桿菌BL21中,加入IPTG使其終濃度為1.0mmol/L,37℃,誘導4h.通過8%SDS-PAGE分析鑒定,表明重組質粒能夠成功表達目的蛋白,在相對分子質量約28000處可見差異蛋白條帶,與理論值相符(見圖2),表明wzt基因成功表達.

2.4 表達產物的分離純化

SDS-PAGE結果表明,蛋白表達成功,經親和層析純化可獲得純化的重組蛋白,經Lowry法測定純化蛋白的質量濃度為0.43mg/mL.

2.5 目的蛋白的鑒定

Western Blotting分析顯示,在相對分子質量約28000處可見特異反應條帶(見圖3),表明純化的重組蛋白能被His標簽單克隆抗體所識別,表明所表達蛋白為wzt蛋白.

圖3 純化產物的Western blot分析

圖4 ABC轉運系統結構圖

2.6 wzt編碼蛋白的結構預測

由Discovery Studio 2.5生成、通過Swiss-Model構建的結構示意圖見圖4.模板選擇1oxv,與來自Sulfolobus solfataricus的蔗糖ABC轉運系統的ABC-ATP酶的序列一致性僅23.11%.三維構象顯示,該蛋白可能由8個α螺旋、7個β片層構成.

圖5 wzt基因及部分功能相同的基因編碼的蛋白序列的系統進化分析

2.7 wzt編碼蛋白的同源性分析

將wzt基因編碼的蛋白序列與GenBank中功能相關的基因序列進行同源性比較,發現該基因編碼的蛋白質序列在多數種屬中具有較高的種屬特異性.布魯菌屬不同種的該基因蛋白同源性接近100%(見圖5),與其他種屬相關蛋白的差異較大,但與耶爾森氏菌的O:9菌株的該蛋白序列同源性較高.

3 討論

布魯菌是一種重要的人畜共患病病原,其LPS既是其主要的毒力因子,同時也是引起免疫的重要抗原,wzt基因作為其合成的關鍵基因,在O多糖跨膜合成過程中起著重要的作用.

O多糖是在內膜上由糖基轉移酶催化形成的脂質鏈接的O側鏈重復單位,可通過某種機制將脂質鏈接的O多糖傳遞到細胞周質空間,并將O多糖鏈接到核心寡糖上形成LPS[5].在細菌中參與O多糖合成的基因往往形成RFB基因[15-16],RFB基因編碼合成新型糖苷前體的糖基轉移酶,作為運輸過程所需要的酶,因此,RFB基因座位的多態性影響O多糖的結構多樣性[17].

目前已知有3種途徑參與O多糖的合成運輸過程,分別為WZY依賴型途徑、ABC轉運型和合酶依賴型途徑.在WZY依賴型途徑中,由wzx蛋白同源類似物完成跨膜運輸;而在ABC轉運型途徑中則由ABC轉運子完成運輸,其ATP結合域的序列高度保守,特別是核苷酸結合區[18].本研究的結果顯示,ABC轉運系統中的wzt蛋白、ATP結合域,在布魯菌中具有高度保守的種屬特異性,因此ATP結合域的保守性具有屬的特異性.目前,有關O多糖合成的ABC轉運子的確切組織形式和模式尚未見報道,沒有結構數據可以參考,大部分信息是來自大腸桿菌等細菌的2型莢膜合成過程的研究和假說[18-19].本研究發現wzt蛋白具有8個α螺旋、7個β片層結構,為進一步研究ABC轉運系統的組織形式及形成模式提供了依據.

本研究成功表達了wzt蛋白,并對其結構進行了初步的預測,研究結果為進一步揭示wzt基因在LPS合成過程中的作用機制,闡述其在細菌組成物質的合成和免疫調節中的作用具有重要的意義.

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