采用Graphpad prism 5.0繪制生存曲線

高永強，孫芳

1.內蒙古鄂爾多斯市第二人民醫院肝病科，內蒙古鄂爾多斯017000；2.內蒙古鄂爾多斯市中心醫院保健科2區，內蒙古鄂爾多斯017000

采用Graphpad prism 5.0繪制生存曲線

高永強1，孫芳2

1.內蒙古鄂爾多斯市第二人民醫院肝病科，內蒙古鄂爾多斯017000；2.內蒙古鄂爾多斯市中心醫院保健科2區，內蒙古鄂爾多斯017000

醫學論文經常涉及對統計學及圖表的應用，本文簡要闡述科學圖形軟件Graphpad Prism5.0在生存曲線繪制、圖表修改方面的應用。

統計學；科學圖形軟件；生存分析

Graphpad Prism是一款集數據分析和作圖于一體的數據處理軟件，它可以直接輸入原始數據，也可以輸入初步統計數據，然后自動進行基本的生物統計，如t檢驗、卡方檢驗、生存分析等，并根據需要制作科學圖表。雖然其數據分析統計功能沒有SAS、SPSS等專業軟件強大，但其所具有的功能實用精煉，操作簡單，圖表繪制頗具特色，深受生命科學研究領域的研究者喜愛。

生存分析為預后研究的通用方法，主要目的是了解影響疾病病程和轉歸的各種預后因素,為醫生預判患者結局并選擇適當的干預措施提供依據[1]。目前國內學者的醫學論文中統計分析及插圖繪制出錯屢見不鮮，有學者指出應從插圖的物理意義、物理量與單位的搭配以及版面的需求和美學的觀點等方面審核插圖,合理布局,和諧統一[2]。生存曲線繪制對于醫生或者研究生來說也有不小的挑戰。

GraphPad Prism擁有基本的生物統計、曲線擬合和科學作圖功能，并能將3者緊密結合。由于該軟件易于操作，適合應用于生命科學領域中的數據作圖與分析[3]。

1 軟件打開

打開Prism→選擇survival→選擇第一或第四個圖。Show result as中選擇“Fractions”那么縱坐標是從0～1，選擇“Percents”那么縱坐標是從0～100。點擊create，進入下一步(圖1)。

2 數據錄入

錄入生存數據。數據的排列格式如下（以兩組隨訪資料比較為例）(圖2)。

圖1 GraphPad Prism軟件數據作圖與分析

①第一列（X軸）：是研究中患者的隨訪時間。單位可以是月、年等。

②第二列（甲）：是第一組患者對應的生存或死亡的情況，這里0代表生存，1代表死亡。第一行在表中是1,0，說明該患者隨訪了1個月，1個月隨訪時狀態是生存，這一組第一個死亡的病例在表中是：10,1，說明該患者在10個月的時候死亡。

圖2 GraphPad Prism數據的排列格式

③第三列（乙）：是第二組患者對應的生存或死亡的情況，解釋同上。

數據都錄入好了就可以直接點左側Graphs的Data1 (圖3)，這樣可以得到最初的生存曲線(圖4)。

圖3 Graphs的Data1

目前曲線不能直接用，不符合論文統計圖要求，生存曲線需要Y軸的最高點是1或100%，這個圖明顯不合適。下面我們來改改這個圖讓它更符合我們的要求。

3 曲線編輯

把鼠標點向Y軸，雙擊出現以下對話框（圖5）。

①點擊去掉Automatically determine the range and interval。

圖4 最初的生存曲線

②把range中的maximum改成100。

③點擊”OK“就可以獲得我們常常看到的生存曲線了(圖6)。

圖5 曲線編輯

4 曲線的美化

①雙擊任一生存曲線可以改變曲線的顏色，線型。改的同時圖示中的顏色和線型也會同步改過來。

②雙擊Y軸可以添加參考線。大多數研究會討論中位生存時間，只要我們在圖中雙擊Y軸，在”Additional ticks and grid lines“中寫入50，點選Tick Line在Details按鈕中選擇參考線的顏色和線型即可。可以得到以下這條符合要求的生存曲線了（圖7）。

甲組的中位生存時間大概是16個月，B組的中位生存時間大概是25個月。當然，要是愿意增加25%或75%都是可以的。只要在”Additional ticks and grid lines“中根據需要添加即可。同樣方法雙擊X軸可以得到1年生存率等等。還可以雙擊修改圖片名稱、坐標軸名稱等等（圖7，圖8）。

圖6 生存曲線1

圖7 生存曲線2

5 圖像輸出

首先選擇上方一排中的工具欄，找到其中的導出（export）工具，接著導出窗口會顯示出來，然后在其中做正確的選擇。選擇不同是依照不同的目的。因研究需要最終投稿印刷。故選擇導出TIF格式[2]。接著在導出的選項中，選擇輸出分辨率（1200dpi）（為保障打印清晰，線圖必須保證在1000dpi以上）。顏色模式（Color mode）選擇RGB顏色，真彩色（millions of colors）選項。在Size選項里輸入8 cm（該研究需打印半版面8 cm，若打印2/3整版面就填15 cm、若打印整個版面就填17 cm）[4]。接著在導出地址的選擇，選擇要導出的文件夾。以及為導出的圖片命名，點擊OK。

圖8 生存曲線3

圖9 整版圖片

該軟件包含另外一個功能，它支持在軟件中將多個圖表同時進行排版，最后輸出一張集合在一起的整版圖片。關鍵要點是選擇排版布局（Layouts）進行完成[3]，見圖9。

一個圖像的大小和清晰度，主要看它的分辨率和尺寸。大小相同的圖像，分辨率越高圖像顯示越清晰。分辨率大小是指單位尺寸范圍內包含的像素數目，所以像素與分辨率有直接關系。在像素數額定前提下，圖像尺寸改變，其分辨率也會發生變動。

科技期刊內，線條圖的比例占有成分很大。為了達到清晰的圖形效果，往往都將模糊的圖形進行重新描繪。

而這樣得出的圖形，不同程度上失去了其原貌，尤其是在兩幅圖差別本來就極小，如波形圖，從而造成圖像混淆、重疊等現象，圖像的質量得不到認可，且描圖時所需工作量很大，既費時又費力。而采該研究的處理方法使用后，一是圖形不失真，二是工作量較小，圖形也可以自己負責處理，這對于自行排版的論文人而言，無疑是有巨大實用價值的。

總之，插圖是科技論文中最具表現力的部分規范而準確的插圖不僅具有活躍和美化版面的功能，還能提高論文的質量和可讀性，對基礎研究、臨床實踐、醫學教研都有很高的實用價值[5]。計算機軟件科學的發展促進和提高了科技論文圖片的編輯加工水平。

[1]李楠,陶立元,趙一鳴.生存分析—兒科預后研究的常用工具[J].中華兒科雜志,2015(2):152.

[2]王蕾.科技論文插圖審核應注意的幾個問題[J].天津科技, 2015，42(4):68-70.

[3]周登遠,崔壯，焦振山.臨床醫學研究中的統計分析和圖形表達實例詳解[M].北京：軍事醫學科學出版社,2011：238-244.

[4]許卓文,杜媛鯤.醫學論文中插圖的正確表達和編輯加工[J].臨床薈萃,2013,28(9):1079-1080.

[5]唐增煦,陳海峰,崔彥紅,等.科技期刊論文插圖常見問題分析[J].衛生研究,2013,42(2):350-352.

Drawing Survival Curve by Graphpad Prism 5.0 Software

GAO Yong-qiang1，SUN Fang2
1.Department of Liver Disease Section,The Second People's Hospital of Ordos City,Ordos,Inner Mongolia，017000 China；2.Department of Care Division 2 Area,Ordos City of Inner Mongolia Hospital,Ordos,Inner Mongolia，017000 China

Statistics and charts was often involved in medical academic papers.This paper briefly expounds the methods of drawing survival curve by scientific graphics software graphpad prism5.0 and modifying the chart.

Statistics;Scientific graphics software;Survival analysis

R19

A

1672-5654(2015）05(b）-0012-04

2015-02-11）

高永強（1979.9-），男，陜西榆林人，碩士，主治醫師，目前從事消化系統疾病、老年病臨床研究及衛生統計相關工作。