李艷君,李妍妮,錢揚會,丁賠賠,丁毅偉,趙強元
(海軍總醫(yī)院檢驗科,北京 100048)
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·論 著·
應用多位點VNTR分析進行銅綠假單胞菌院內(nèi)感染溯源的研究*
李艷君,李妍妮,錢揚會,丁賠賠,丁毅偉,趙強元△
(海軍總醫(yī)院檢驗科,北京 100048)
目的 應用多位點可變數(shù)目串聯(lián)重復序列(VNTR)分析方法進行多重耐藥銅綠假單胞菌分子分型,為由銅綠假單胞菌引發(fā)的院內(nèi)感染的溯源和流行病學調(diào)研提供依據(jù)。方法 從銅綠假單胞菌基因組中篩選12個VNTR位點,設計合成引物;對98株多重耐藥銅綠假單胞菌進行PCR擴增,產(chǎn)物毛細管電泳;根據(jù)產(chǎn)物大小計算各VNTR位點的重復數(shù),構建系統(tǒng)發(fā)育樹,進行數(shù)據(jù)分析。結果 12個位點的多態(tài)性指數(shù)(DI)為0.45~0.88,將98株銅綠假單胞菌分成5個群,88個基因型,同病區(qū)分離的菌株具有一定的同源性。結論 多位點VNTR分析具有很高的分辨率,適用于銅綠假單胞菌基因分型和溯源研究,具有很好的應用前景。
銅綠假單胞菌; VNTR; 基因分型; 同源性
隨著抗生素的廣泛使用和各種侵入性治療技術的開展,院內(nèi)感染發(fā)生率居高不下,給臨床治療帶來了很大困難,同時給醫(yī)療機構和患者帶來巨大的經(jīng)濟負擔。銅綠假單胞菌是院內(nèi)感染最主要的病原菌之一[1],可引起多部位、多系統(tǒng)的感染,銅綠假單胞菌肺炎致死率達30%以上,敗血癥的病死率則高達80%~90%。近年來,銅綠假單胞菌耐藥形勢日趨嚴峻,多重耐藥及泛耐藥株的分離率呈逐年上升趨勢[2-3]。因此,早期診斷并控制由銅綠假單胞菌引起的院內(nèi)感染,是提高治愈率,減少病死率的關鍵。……