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耐碳青霉烯類鮑曼不動桿菌基因檢測及同源性分析*

2016-01-11 09:20:59陸丹倩芮勇宇顧向明王巧媚鄧聚輝
現代檢驗醫學雜志 2016年6期
關鍵詞:耐藥檢測

陸丹倩,芮勇宇,楊 秋,顧向明,鄧 沖,王巧媚,鄧聚輝

(1.廣東省中山市中醫院檢驗科,廣東中山 528400;2.南方醫科大學南方醫院,廣州 510515)

鮑曼不動桿菌(acinetobacterbaumannii,Ab)是一種專性需氧的非發酵革蘭陰性球桿菌,屬于條件致病菌,引起多重耐藥并體外生存時間長(數月),易造成流行,對其臨床治療造成較大的困難。鮑曼不動桿菌的耐藥機制主要是產碳青霉烯酶水解酶,碳青霉烯酶按Ambler法,分為A,B和D三類,本文主要是中山市中醫院2012~2013年臨床分離出的40株耐碳青霉烯類鮑曼不動桿菌(CRAB)進行B類金屬酶、D類苯唑西林酶以及ERIC-PCR法聚類分析的研究,以了解我院CRAB的耐藥機制及流行克隆的情況。

1 材料與方法

1.1 研究對象 40株耐碳青霉烯類鮑曼不動桿菌來自我院2012年7月~2013年12月住院患者送檢痰液29份、傷口分泌物9份、血液及尿液各1份標本,其中臨床分布ICU 18株、內科10株、骨科7株及外科5株,同一患者留取初次分離菌株。

1.2 儀器及試劑 美國BD公司PhoenixTM100全自動細菌及藥敏鑒定儀,PCR擴增儀器(德國Eppendorf),凝膠成像儀(Bio-Rad)。dNTPs TaqDNA聚合酶、蛋白酶K和DNA Marker由大連瑞真生物技術有限公司提供。PCR引物由上海英濰捷基貿易有限公司合成。Tris飽和酚、氯仿、異戊醇、10%十二烷基磺酸鈉由北京鼎國生物技術有限公司提供。

1.3 方法

1.3.1 細菌DNA模板制備:用SDS-蛋白酶K-酚-氯仿方法提取,加入適量緩沖液III(10 mmol/L Tris-HCl pH8.0,1 mmol/L EDTA)溶解DNA沉淀,-20℃保存備用。

1.3.2 PCR方法檢測常見碳青霉烯酶基因:PCR分別檢測B類金屬酶基因NDM,VIM,IMP[1],多重PCR同時擴增D類OXA類酶基因OXA-23-like,OXA-24-like,OXA-51-like,OXA-58-like 4個基因[2]。

1.3.3 ERIC-PCR:進行ERIC-PCR基因分型[3]。1.5 g/dl瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR產物。利用Quantity one 軟件進行ERIC-PCR圖譜的分析。

2 結果

2.1 碳青霉烯酶基因檢測結果 40株CRAB中,OXA-51-like陽性40株占100%,OXA-23-like陽性38株占95%,未檢出NDM,VIM,IPM,OXA-24-like及OXA-58-like。電泳結果見圖1。

2.2 ERIC-PCR基因分型結果 相似性聚類分析結果,40株菌相似水平大于80%(圖中虛線所示),可認為是同一克隆群。這40株菌在相似水平被聚為33個類群(克隆株)。見圖2。

OXA51 OXA23

圖2 ERIC-PCR基因分型電泳圖譜及聚類圖

3 討論

目前,由于廣譜抗菌素在臨床廣泛應用,導致鮑曼不動桿菌引起的感染檢出率逐年升高,隨多重耐藥、泛耐藥、全耐藥的鮑曼不動桿菌的出現[4,5],已成為全球性臨床治療的難題。鮑曼不動桿菌產碳青霉烯酶是它的主要耐藥機制,碳青霉烯酶主要包括A,B和D三類酶,本文主要針對B類金屬酶,目前常見的NDM,VIM及IPM,D類苯唑西林酶,鮑曼不動桿菌常見OXA-23-like,OXA-24-like,OXA-51-like及OXA-58-like進行檢測。

本實驗檢測40株CAAB的結果顯示以痰標本最多[6,7],成為呼吸系統感染的主要致病菌[8]。而分布的科室主要是以ICU為主[9,10], 這可能與ICU病區多為老年患者且住院時間長病情嚴重、機體免疫力差,多有嚴重基礎疾病,大量使用廣譜抗生素及各種侵入性檢查和治療等有關。

碳青霉烯酶基因檢測結果顯示未檢出B類金屬酶NDM,VIM及IPM,提示本地區鮑曼不動桿菌可能未攜帶此3種耐藥基因。D類苯唑西林酶,檢出40株OXA-51-like陽性占100%,38株OXA-23-like陽性占95%,未檢出OXA-24-like及OXA-58-like。說明本地區鮑曼不動桿菌的基因型是以OXA-51-like和OXA-23-like為主,與王麗娟等[11]報道一致。OXA-51是鮑曼不動桿菌的重要標志,它是鮑曼不動桿菌的固有基因[12], 以區別于其他不動桿菌屬,水解碳青霉烯酶類藥物能力較弱,并不能水解頭孢菌素類藥物。OXA-23能介導細菌耐碳青霉烯類藥物,它是目前流行傳播最廣的D類碳青霉烯類基因,與國內外報道一致[13~15]。

為了了解本院近兩年臨床分離出的40株CRAB是否存在醫院感染流行及暴發,對臨床分離出的40株CRAB進行ERIC-PCR基因分型,研究其傳播機制。ERIC-PCR是腸桿菌科基因重復序列為引物進行PCR擴增出多態性DNA圖譜。它操作簡便、快速經濟、重復性較好,是研究多重耐藥、泛耐藥及全耐藥菌傳播機制的首選方法。檢測的40株菌均能擴增出條帶,分辨率高,40株CRAB菌相似水平大于80%(圖中虛線所示),可認為是同一克隆群。這40株菌在相似水平被聚為33個類群(克隆株)[16]。

碳青霉烯酶基因檢測及ERIC-PCR基因分型的檢測結果均顯示,本院近兩年臨床分離出的40株CRAB具有高度的相似性,親緣關系緊密,可認為是同一克隆群,提示本院存在CRAB的克隆現象可能已經發生,且攜帶OXA-23-like及OXA-51-like基因是引起其耐碳青霉烯類藥物的主要原因之一,而且也是造成CAAB不斷增加的原因。因此,應規范臨床合理使用抗菌藥物,加強對本地區CRAB耐藥性及耐藥機制的監測及關注,加強手衛生,患者隔離,環境清潔消毒等感控措施,避免在醫院內的進一步傳播,這對指導臨床合理用藥及避免CA-AB醫院感染暴發流行具有重要意義。

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