小鼠急性未分型流感嗜血桿菌中耳炎差異基因的互作網絡特征分析

劉佳麗王維王子萌范芳梅馬毓蓉余林何於娟

1重慶醫科大學附屬第一醫院耳鼻咽喉科（重慶400016）2重慶醫科大學檢驗醫學院,臨床檢驗診斷學教育部重點實驗室（重慶400016）3重慶市第六人民醫院（重慶400080）

·基礎研究·

小鼠急性未分型流感嗜血桿菌中耳炎差異基因的互作網絡特征分析

劉佳麗1王維2，3王子萌2范芳梅2馬毓蓉2余林1何於娟2

1重慶醫科大學附屬第一醫院耳鼻咽喉科（重慶400016）2重慶醫科大學檢驗醫學院,臨床檢驗診斷學教育部重點實驗室（重慶400016）3重慶市第六人民醫院（重慶400080）

目的利用基因表達數據庫（GEO）查找小鼠中耳炎表達譜基因芯片原始數據，建立中耳炎基因互作網絡圖。方法從公共數據庫GEO中下載小鼠中耳炎相關數據集，采用Affymetrix Expression Console軟件和Tran?scriptome Analysis Console（TAC）軟件篩選差異表達基因，將差異基因導入STRING在線數據庫進行分析，繪制差異基因互作網絡圖，并將互作網絡數據導入Cytoscape 3.4.0軟件中，篩選網絡中心節點，并取其中相對獨立、作用較為集中且與炎癥基因相關子網絡，采用David在線工具對其進行功能注釋富集分析。結果共篩選出1166個差異表達基因，其中表達上調793個，表達下調373個，經STRING在線工具篩選后共有459個小鼠中耳炎差異基因編碼的蛋白存在相互作用，并得到相應蛋白互作網絡，分析其中與炎癥相關子網絡。結論本研究利用生物信息學技術構建了中耳炎差異基因互作網絡，其中的網絡中心節點基因，對于中耳炎分子機制研究及靶向治療具有指導作用。

未分型流感嗜血桿菌；……