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新疆漢族及維吾爾族結(jié)直腸癌原發(fā)灶與轉(zhuǎn)移灶中KRAS基因突變分析

2017-04-14 10:58:37龐雪蓮王玻瑋李巧新馬志萍崔文麗
關(guān)鍵詞:基因突變

龐雪蓮,王?,|,李巧新,馬志萍,師 藝,張 巍,崔文麗

新疆漢族及維吾爾族結(jié)直腸癌原發(fā)灶與轉(zhuǎn)移灶中KRAS基因突變分析

龐雪蓮,王?,|,李巧新,馬志萍,師 藝,張 巍,崔文麗

目的 觀察新疆地區(qū)漢族、維吾爾族人群中結(jié)直腸癌(colorectal cancer, CRC)原發(fā)灶與轉(zhuǎn)移灶中KRAS基因狀態(tài)的差異及其與CRC患者臨床病理特征之間的關(guān)系。方法 收集2012年~2014年間新疆地區(qū)漢族及維吾爾族CRC標(biāo)本189例,其中52例有配對(duì)轉(zhuǎn)移灶。采用突變擴(kuò)增阻滯系統(tǒng)(amplification refractory mutation system, ARMS)進(jìn)行KRAS基因12、13密碼子已知常見(jiàn)突變位點(diǎn)檢測(cè)。結(jié)果 KRAS基因在CRC原發(fā)灶病例中漢族、維吾爾族的突變率分別為42.8%(62/145)、43.2%(19/44),兩者差異無(wú)顯著性(P>0.05),T3/T4期及有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的病例中突變率較高(P<0.05),但與患者性別、民族、年齡、分化程度、TNM分期、有無(wú)遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移、原發(fā)灶所在的部位均無(wú)相關(guān)性(P>0.05)。KRAS基因在CRC轉(zhuǎn)移灶中漢族、維吾爾族的突變率分別為33.3% (12/36)、31.3% (5/16),兩者差異無(wú)顯著性(P>0.05),并發(fā)現(xiàn)年齡≥65歲者突變率較高(P<0.05),與所研究的其他臨床病理特征無(wú)相關(guān)性。52例轉(zhuǎn)移灶中KRAS基因的突變率為32.7%(17/52),而對(duì)應(yīng)的原發(fā)灶突變率達(dá)50%(26/52),明顯高于轉(zhuǎn)移灶(P<0.000 1),轉(zhuǎn)移灶突變類(lèi)型與原發(fā)灶一致。結(jié)論 KRAS基因在浸潤(rùn)較深、有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移及65歲以上發(fā)生轉(zhuǎn)移的CRC中突變率較高,在原發(fā)灶的突變率高于配對(duì)轉(zhuǎn)移灶。KRAS基因突變率在新疆漢族、維吾爾族CRC患者中差異無(wú)顯著性,提示KRAS基因突變促進(jìn)CRC的進(jìn)展,并且在原發(fā)灶中更易發(fā)生突變,但漢族、維吾爾族間無(wú)差異。

結(jié)直腸腫瘤;KRAS基因;漢族;維吾爾族;原發(fā)灶;轉(zhuǎn)移灶

結(jié)直腸癌(colorectal cancer, CRC)是全球常見(jiàn)的惡性腫瘤之一[1]。根據(jù)WHO報(bào)道:在常見(jiàn)惡性腫瘤中男性CRC發(fā)病率位居第3位,女性位居第2位。流行病學(xué)研究發(fā)現(xiàn),CRC的發(fā)病與地理位置具有相關(guān)性[2]。中國(guó)CRC的發(fā)病率和病死率呈上升趨勢(shì),每年新發(fā)病例數(shù)達(dá)30萬(wàn)例,居全球首位[3]。CRC的發(fā)生、發(fā)展是多因素、多基因共同參與的結(jié)果[4],表皮生長(zhǎng)因子受體(EGFR)信號(hào)通路與CRC的發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān),KRAS位于EGFR下游,KRAS基因是否發(fā)生突變對(duì)CRC患者能否接受EGFR抗體治療有重要臨床參考價(jià)值[5]。大樣本、多中心Ⅲ期臨床研究結(jié)果顯示KRAS基因2號(hào)外顯子第12、13密碼子基因狀態(tài)與EGFR的單克隆抗體西妥昔單抗、帕尼單抗的療效呈負(fù)相關(guān),當(dāng)其為野生型時(shí)患者才可從EGFR抗體治療中獲益[6],因此準(zhǔn)確檢測(cè)結(jié)直腸患者KRAS基因狀態(tài)對(duì)患者能否接受靶向治療意義重大。

亞洲人群KRAS基因的突變率低于白種人和黑種人,但是不同民族的CRC患者KRAS基因突變率是否一致尚未見(jiàn)報(bào)道[7]。新疆地處內(nèi)陸亞洲中心,維吾爾族是新疆地區(qū)的特有民族,維吾爾族與本地區(qū)漢族CRC患者KRAS基因狀態(tài)是否有差異,KRAS基因狀態(tài)與患者臨床病理特征之間是否有關(guān),以及原發(fā)灶及轉(zhuǎn)移灶之間是否存在異質(zhì)性?本實(shí)驗(yàn)將針對(duì)以上問(wèn)題進(jìn)行分析探討。

1 材料與方法

1.1 材料 本實(shí)驗(yàn)通過(guò)新疆醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會(huì)的批準(zhǔn),且術(shù)前均獲得患者知情同意書(shū)。選擇新疆醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院2012年1月~2014年12月間189例術(shù)前未經(jīng)任何治療的CRC手術(shù)標(biāo)本,包括145例漢族及44例維吾爾族,其中52例有配對(duì)轉(zhuǎn)移灶,由兩名資深病理醫(yī)師確診,按WHO診斷標(biāo)準(zhǔn)對(duì)腫瘤進(jìn)行病理分型,病例組織均為腺癌,52例配對(duì)轉(zhuǎn)移灶標(biāo)本包括45例淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移灶,7例肝/肺轉(zhuǎn)移灶。被檢樣本均經(jīng)過(guò)嚴(yán)格質(zhì)控,納入標(biāo)準(zhǔn)必須符合:(1)組織中腫瘤細(xì)胞所占比例≥30%;(2)所有腫瘤細(xì)胞的總數(shù)不能低于200個(gè)。

1.2 方法

1.2.1 DNA提取 使用Qiagen DNA Min Kit(51304),按照試劑說(shuō)明書(shū)完成石蠟組織DNA提取,所提取DNA純度均達(dá)到:OD260/280=(1.8±0.2),OD260/230≥1.7,濃度20~50 ng/μL,DNA提取試劑盒購(gòu)于德國(guó)Qiagen公司。

1.2.2 KRAS基因突變檢測(cè) 按照KRAS突變檢測(cè)試劑盒說(shuō)明書(shū),每個(gè)樣本含8個(gè)孔位,分別用于檢測(cè)12密碼子的G12C、G12S、G12R、G12V、G12D、G12A位點(diǎn),13密碼子的G13D位點(diǎn),以及內(nèi)參基因。采用Agilent Stratagene Mx3000P熒光定量PCR儀進(jìn)行檢測(cè),人KRAS基因突變檢測(cè)試劑盒購(gòu)于北京雅康博公司。

1.2.3 實(shí)驗(yàn)質(zhì)量控制 每批檢測(cè)均含陰性及陽(yáng)性質(zhì)控品,每個(gè)孔位均有FAM和HEX兩個(gè)通道,陰性質(zhì)控兩通道均為陰性,陽(yáng)性質(zhì)控兩通道均為陽(yáng)性;被檢測(cè)樣本HEX通道(為內(nèi)控基因)陽(yáng)性,滿(mǎn)足以上條件才可判讀KRAS基因位點(diǎn)是否突變,樣本FAM通道Ct值<28判讀為突變型(圖1)。

圖1 A.樣本除陰性對(duì)照余內(nèi)控HEX通道位點(diǎn)均為陽(yáng)性;B.FAM通道除了陽(yáng)性對(duì)照位點(diǎn)陽(yáng)性,余位點(diǎn)均陰性,判讀為KRAS基因野生型;C.FAM通道除了陽(yáng)性對(duì)照位點(diǎn)陽(yáng)性,有1個(gè)位點(diǎn)陽(yáng)性,判讀為KRAS基因某位點(diǎn)單突變型;D.FAM通道除了陽(yáng)性對(duì)照位點(diǎn)陽(yáng)性,有2個(gè)位點(diǎn)陽(yáng)性,判讀為KRAS基因某位點(diǎn)雙重突變

1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 所有數(shù)據(jù)采用SPSS 17.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)處理,陽(yáng)性率比較采用χ2檢驗(yàn),相關(guān)性分析采用Spearman相關(guān)分析,P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 KRAS基因在漢族及維吾爾族CRC原發(fā)灶及轉(zhuǎn)移灶中的基因狀態(tài) 189例CRC原發(fā)灶病例中KRAS基因的總突變率為42.9%(81/189),漢族和維吾爾族分別為42.8%(62/145)、43.2%(19/44),兩者差異無(wú)顯著性(P>0.05)。其中69例為12密碼子突變(85.2%,69/81),僅12例為13密碼子突變(14.8%,12/81)。以單突變?yōu)橹鳎?例發(fā)生雙重突變(4.9%,4/81),突變率最高的位點(diǎn)是G12D,占總突變的38.3%(31/81)(表1)。52例配對(duì)轉(zhuǎn)移灶中有45例為淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移灶,7例為肝/肺轉(zhuǎn)移灶,共17例發(fā)生KRAS基因突變,突變率為32.7%(17/52),漢族、維吾爾族突變率分別為33.3%(12/36)、31.3%(5/16),兩者差異無(wú)顯著性(P>0.05),均為12密碼子突變,突變率最高的位點(diǎn)也是G12D(47.1%,8/17)。在淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移灶中的突變率為17.8%(8/45),肝/肺轉(zhuǎn)移灶的突變率為57.1%(4/7),肝/肺轉(zhuǎn)移灶的突變率明顯高于淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移灶(P<0.05,表2)。

2.2 KRAS基因突變與CRC臨床病理特征的關(guān)系 在原發(fā)灶病例中,KRAS基因突變?cè)谀[瘤浸潤(rùn)程度較深(T3+T4)(48.1%,63/131)及有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移(N1+N2)者中的突變率較高(54.4%,37/68)(P<0.05),但與患者性別、民族、年齡、腫瘤分化程度、組織學(xué)分型以及有無(wú)遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移無(wú)關(guān)(P>0.05,表1)。在轉(zhuǎn)移灶病例中發(fā)現(xiàn)KRAS基因在≥65歲時(shí)突變率較高(50.0%,10/20)(P<0.05),此外與所研究的其他臨床病理特征無(wú)相關(guān)性(P>0.05,表2)。

原發(fā)灶病例中12密碼子突變69例,13密碼子突變12例,發(fā)現(xiàn)12密碼子高、中分化時(shí)突變率高,(71.0%,49/69),而13密碼子則在低分化時(shí)突變率較高(66.7%,8/12)。Ⅲ+Ⅳ期時(shí)12密碼子突變率較高(53.6%,37/69),但是13密碼子在Ⅰ+Ⅱ期時(shí)突變率較高(83.3%,10/12)。有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移時(shí)12密碼子突變率較高(50.7%,35/69),但是無(wú)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移時(shí)13密碼子突變率較高,占13密碼子突變的83.3%(10/12)(表1)。

2.3 KRAS基因狀態(tài)在CRC原發(fā)灶及轉(zhuǎn)移灶中的比較 在52例配對(duì)的原發(fā)灶及轉(zhuǎn)移灶CRC中,KRAS基因狀態(tài)并不一致,原發(fā)灶突變型26例、野生型26例,在與之配對(duì)的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移灶中突變型17例、野生型35例,有9例原發(fā)灶為突變型轉(zhuǎn)移灶為野生型,并未出現(xiàn)原發(fā)灶野生型轉(zhuǎn)移灶突變型的情況,經(jīng)統(tǒng)計(jì)原發(fā)灶的突變率明顯高于轉(zhuǎn)移灶(P<0.001),發(fā)生突變的轉(zhuǎn)移灶與原發(fā)灶突變類(lèi)型一致(表3)。

應(yīng)用配對(duì)χ2檢驗(yàn)CRC原發(fā)灶與轉(zhuǎn)移灶之間KRAS基因狀態(tài)是否有差異,原發(fā)灶突變型26例,野生型26例,在與之配對(duì)的轉(zhuǎn)移灶中突變型17例,野生型35例,有9例原發(fā)灶為突變型,轉(zhuǎn)移灶為野生型,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

3 討論

近年來(lái)很多學(xué)者對(duì)KRAS基因與CRC的相關(guān)性進(jìn)行了研究,發(fā)現(xiàn)KRAS基因在CRC中的突變率達(dá)35%~40%,突變主要發(fā)生在12、13密碼子,其中以12密碼子為主[8]。本組實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示KRAS基因在CRC原發(fā)灶中的總突變率為42.3%,與文獻(xiàn)報(bào)道結(jié)果接近,但在轉(zhuǎn)移灶中的突變率僅為32.7%,比文獻(xiàn)報(bào)道數(shù)據(jù)偏低,因此討論原發(fā)灶、轉(zhuǎn)移灶KRAS基因異質(zhì)性很有意義。

表1 CRC原發(fā)灶KRAS基因及其12、13密碼子基因狀態(tài)及與之間的關(guān)系[n(%)]

Yamauchi等[9]的實(shí)驗(yàn)結(jié)果發(fā)現(xiàn)直腸癌更易發(fā)生KRAS基因突變,但本組實(shí)驗(yàn)卻未發(fā)現(xiàn)結(jié)腸、直腸KRAS基因狀態(tài)存在差異。關(guān)于結(jié)腸KRAS基因突變率,文獻(xiàn)報(bào)道存在不一致性,如Bleekr等發(fā)現(xiàn)右半側(cè)結(jié)腸癌突變率較高,Zulhabr等發(fā)現(xiàn)左側(cè)突變率較高,本組實(shí)驗(yàn)結(jié)果發(fā)現(xiàn)左側(cè)、右側(cè)及橫結(jié)腸KRAS基因突變率差異無(wú)顯著性。針對(duì)收集的結(jié)腸癌樣本量分析,Bleeker等[10]收集了55例,Zulhabri等[11]收集了70例,本實(shí)驗(yàn)共有100例結(jié)腸癌標(biāo)本。以上研究樣本量均不大,而且來(lái)自不同地域,有待于擴(kuò)大樣本,大樣本多因素分析,明確KRAS基因突變與結(jié)腸癌部位的相關(guān)性。

有很多學(xué)者研究了KRAS基因的狀態(tài)與CRC患者臨床病理特征的相關(guān)性。本組實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,KRAS基因在有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、浸潤(rùn)程度較深的CRC病例中突變率較高,也有學(xué)者得到相似的結(jié)果[12],這恰好反應(yīng)了腫瘤惡性程度與KRAS基因突變呈正相關(guān)。本組實(shí)驗(yàn)結(jié)果發(fā)現(xiàn)在CRC轉(zhuǎn)移灶中KRAS基因在≥65歲者中突變率高,Kadowaki等[13]研究發(fā)現(xiàn)65歲以上的CRC患者生存率更低,這與KRAS基因突變導(dǎo)致高齡患者不良預(yù)后密切相關(guān)。本組實(shí)驗(yàn)結(jié)果發(fā)現(xiàn)KRAS基因狀態(tài)在漢族與維吾爾族CRC患者之間無(wú)差異,馬玲等[14]發(fā)現(xiàn)維吾爾族肺癌患者KRAS基因突變率高于漢族患者,但是目前并未發(fā)現(xiàn)KRAS基因在不同民族或種族CRC患者間有差異[15-16],這提示KRAS基因狀態(tài)在同一地區(qū)不同民族CRC患者間可能無(wú)差異,也有待于大樣本進(jìn)一步驗(yàn)證。

本組實(shí)驗(yàn)結(jié)果發(fā)現(xiàn)KRAS基因在配對(duì)的原發(fā)灶、轉(zhuǎn)移灶樣本中突變率有差異,原發(fā)灶的突變率高于轉(zhuǎn)移灶,并且轉(zhuǎn)移灶突變型的病例原發(fā)灶必定為突變型,但是原發(fā)灶為突變型的樣本轉(zhuǎn)移灶可能為野生型。目前關(guān)于CRC中KRAS基因原發(fā)灶、轉(zhuǎn)移灶之間的異質(zhì)性研究很多,結(jié)果也大相徑庭, Kleist等[17-18]研究發(fā)現(xiàn)KRAS基因在發(fā)生肝/肺轉(zhuǎn)移的原發(fā)灶及轉(zhuǎn)移灶中突變率不一致,既有原發(fā)灶野生型轉(zhuǎn)移灶突變型也有原發(fā)灶突變型轉(zhuǎn)移灶野生型,但是也有學(xué)者發(fā)現(xiàn)KRAS基因在原發(fā)灶及轉(zhuǎn)移灶之間存在一致性,尤其是非淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移灶一致性較高[19]。本組實(shí)驗(yàn)結(jié)果發(fā)現(xiàn)KRAS基因狀態(tài)在原發(fā)灶與肝/肺轉(zhuǎn)移灶一致,但是原發(fā)灶與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移灶之間不一致,前者高于后者。腫瘤細(xì)胞極易發(fā)生突變,在腫瘤形成和發(fā)育的不同階段,具有不同的基因突變和表達(dá)譜;腫瘤組織存在異克隆生長(zhǎng)現(xiàn)象,因此轉(zhuǎn)移病灶和原發(fā)灶之間可能具有不同的生物學(xué)特性和特異性基因表達(dá)特點(diǎn);淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移灶通常樣本量較小或腫瘤細(xì)胞比例低,可能發(fā)生假陰性結(jié)果,但是本組實(shí)驗(yàn)納入樣本的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移灶標(biāo)本均是通過(guò)嚴(yán)格篩查,腫瘤細(xì)胞比例不足者予以剔除,所以假陰性可能性小。淋巴細(xì)胞因子可以作用于RAS信號(hào)通路影響KRAS基因的表達(dá)[20],因此推測(cè)淋巴細(xì)胞的自身免疫抑制了KRAS基因發(fā)生突變。

表2 CRC轉(zhuǎn)移灶KRAS基因狀態(tài)與臨床病理特征之間的關(guān)系[n(%)]

表3 KRAS基因突變狀態(tài)在CRC原發(fā)灶與轉(zhuǎn)移灶之間的比較[n(%)]

KRAS基因在原發(fā)灶及轉(zhuǎn)移灶之間的異質(zhì)性對(duì)指導(dǎo)臨床治療具有重要意義,尤其是對(duì)于只能獲取轉(zhuǎn)移灶標(biāo)本的晚期腫瘤患者具有重要指導(dǎo)意義,選取肝肺轉(zhuǎn)移灶比選取淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移灶與原發(fā)灶的一致性更高。

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時(shí)間:2017-2-27 10:14

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國(guó)家自然科學(xué)基金(81360352)、國(guó)家自然科學(xué)基金地區(qū)基金(81560035)、新疆維吾爾自治區(qū)自然科學(xué)基金(2014211C032)、科技支撐計(jì)劃(14495800300)、自治區(qū)青年科技創(chuàng)新人才培養(yǎng)工程(qn2015bs011)

新疆醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院病理科,烏魯木齊 830054

龐雪蓮,女,碩士,醫(yī)師。Tel: (0991)4362806,E-mail: 448665867@qq.com 崔文麗,女,博士,副主任醫(yī)師,通訊作者。E-mail: cwl860@163.com

R 735.3

A

1001-7399(2017)02-0195-05

10.13315/j.cnki.cjcep.2017.02.019

接受日期:2016-09-21

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