張際峰,崔家昌
(淮南師范學院生物工程學院,安徽 淮南 232038)
化學研究
miRNA
——一種新的分子系統學研究標記
張際峰,崔家昌
(淮南師范學院生物工程學院,安徽 淮南 232038)
microRNAs(miRNA)是真核生物中長度約為21~25個核苷酸的非編碼小分子,作為動植物轉錄后基因表達的重要調控因子是近年來分子生物學研究的前沿和熱點之一,然而利用miRNA作為分子標記進行分子系統學研究的報道甚為少見。利用miRBase數據庫,本研究收集并拼接了多數物種均共同存在的miRNA堿基序列,利用Clustal X 2.0和MEGA 5.0軟件嘗試構建了它們的分子系統樹。分子系統樹獲得結果與傳統的系統分類學相一致。為從基因調控的角度探究生物的分子進化提供了新的研究思路。
miRNA;分子系統學;進化分析
miRNA全稱是microRNA,是一段長度為20到25個核苷酸的小RNA分子①徐源,孫鐵成,張愛玲等:《卵巢miRNA研究進展》,《畜牧獸醫學報》2014年第4期,第509-516頁。。它最早是Lee在秀麗隱桿線蟲中發現的②Aung K,Lin SI,Wu CC,et al."pho2,a phosphate overaccumulator,is caused by a nonsense mutation in a microRNA399 target gene",Plant Physiology,Vol.141,2006,pp.1000-1011.,miRNAs與RNA誘導沉默復合體(RISC)③Brinkley BR."Managing the centrosome numbers game:from chaos to stability in cancer cell division", Trends in Cell Biology,Vol.11,2001,pp.18-21.一起互補性地結合于靶基因轉錄體的序列,從而降低或是抑制靶基因的轉錄和翻譯。細胞中的miRNA具有多種重要的調節功能,據報道,人類有1/3的基因可能都受到miRNA的調控。它們與靶基因的調節關系往往是多對多的。近年來,miRNA的研究廣受關注,特別是發表與miRNA相關的論文數量增長很快。根據miRBase的數據庫(www.mirbase.org)記錄顯示:目前一共發現miRNA前體序列約28000條,成熟序列總共30000多條,這為研究miRNA的進化提供了大量的資源。
在高等動物的miRNA的研究中發現,miRNA位置在不同的物種中是高度保守的,且miRNA在序列上也呈現出高度的同源性。……