病人與醫(yī)院微生物群之間親密的雙向關(guān)系

Lax和他的同事對(duì)一所新開(kāi)的芝加哥大學(xué)醫(yī)院中病人、醫(yī)務(wù)人員和環(huán)境表面定植的微生物多樣性進(jìn)行調(diào)查研究。在血液腫瘤科和外科的10間病房和2個(gè)護(hù)士站內(nèi)，從地面、水嘴、床墊、鍵盤(pán)和尋呼機(jī)表面采集標(biāo)本，并在病人的腋窩、腹股溝褶皺及鼻孔處進(jìn)行取樣。

本次研究從醫(yī)院運(yùn)營(yíng)前2個(gè)月開(kāi)始，持續(xù)12個(gè)月。所有的房間均允許來(lái)訪者進(jìn)入。每天用季銨鹽類(lèi)消毒劑和1∶1 000的漂白液對(duì)每間病房進(jìn)行清潔。本研究共采集6 523個(gè)標(biāo)本，每個(gè)標(biāo)本至少擴(kuò)增5 000份16S rRNA。

在醫(yī)院建設(shè)和正式運(yùn)營(yíng)前，環(huán)境中的微生物多樣性非常有限，但是卻有大量不動(dòng)桿菌屬和假單胞菌屬細(xì)菌。然而醫(yī)院運(yùn)營(yíng)后，這兩者的數(shù)量急劇下降，并被正常皮膚微生物所取代，包括棒狀桿菌屬、葡萄球菌屬和鏈球菌屬細(xì)菌。此外，其他菌屬也逐漸增多，包括腸球菌屬、未分類(lèi)的腸桿菌科細(xì)菌、大芬戈?duì)柕戮鷮?、羅斯菌屬、普雷沃菌屬和鞘氨醇單胞菌屬。遺憾的是，本研究未能用引物可靠地檢測(cè)出丙酸桿菌屬細(xì)菌。

當(dāng)每例新入院的病人住進(jìn)一間病房，這間病房?jī)?nèi)微生物多樣性的變化遵循一個(gè)相對(duì)不變的順序：第1天，微生物菌群從醫(yī)院物體表面，如床欄桿，轉(zhuǎn)移到病人身上，但是第2天，菌群朝相反的方向移動(dòng)，從病人身上轉(zhuǎn)到病房?jī)?nèi)的物體表面。結(jié)果，最初物體表面的菌群迅速被病人皮膚的菌群所覆蓋。另一個(gè)意外的發(fā)現(xiàn)是全身用抗生素對(duì)病人皮膚菌群有極微弱的影響甚至無(wú)影響。92份樣本經(jīng)宏基因組學(xué)分析發(fā)現(xiàn)，病房?jī)?nèi)物體表面的菌群所攜帶的耐藥基因遠(yuǎn)多于病人皮膚菌群。

室內(nèi)的灰塵含有大量微生物，包括人類(lèi)皮膚表面的微生物。據(jù)估計(jì)每人每天脫落5億個(gè)上皮細(xì)胞。這種擴(kuò)散模式和直接接觸可以解釋本研究得出的闡明環(huán)境與病人皮膚間復(fù)雜的相互作用的現(xiàn)象。

In the Literature. The intimate and 2-way relationship between patient and hospital microbiomes. Clin Infect Dis, 2017，65 (1 September)： iii.