Lax和他的同事對一所新開的芝加哥大學醫(yī)院中病人、醫(yī)務人員和環(huán)境表面定植的微生物多樣性進行調查研究。在血液腫瘤科和外科的10間病房和2個護士站內,從地面、水嘴、床墊、鍵盤和尋呼機表面采集標本,并在病人的腋窩、腹股溝褶皺及鼻孔處進行取樣。
本次研究從醫(yī)院運營前2個月開始,持續(xù)12個月。所有的房間均允許來訪者進入。每天用季銨鹽類消毒劑和1∶1 000的漂白液對每間病房進行清潔。本研究共采集6 523個標本,每個標本至少擴增5 000份16S rRNA。
在醫(yī)院建設和正式運營前,環(huán)境中的微生物多樣性非常有限,但是卻有大量不動桿菌屬和假單胞菌屬細菌。然而醫(yī)院運營后,這兩者的數量急劇下降,并被正常皮膚微生物所取代,包括棒狀桿菌屬、葡萄球菌屬和鏈球菌屬細菌。此外,其他菌屬也逐漸增多,包括腸球菌屬、未分類的腸桿菌科細菌、大芬戈爾德菌屬、羅斯菌屬、普雷沃菌屬和鞘氨醇單胞菌屬。遺憾的是,本研究未能用引物可靠地檢測出丙酸桿菌屬細菌。
當每例新入院的病人住進一間病房,這間病房內微生物多樣性的變化遵循一個相對不變的順序:第1天,微生物菌群從醫(yī)院物體表面,如床欄桿,轉移到病人身上,但是第2天,菌群朝相反的方向移動,從病人身上轉到病房內的物體表面。結果,最初物體表面的菌群迅速被病人皮膚的菌群所覆蓋。另一個意外的發(fā)現是全身用抗生素對病人皮膚菌群有極微弱的影響甚至無影響。92份樣本經宏基因組學分析發(fā)現,病房內物體表面的菌群所攜帶的耐藥基因遠多于病人皮膚菌群。
室內的灰塵含有大量微生物,包括人類皮膚表面的微生物。據估計每人每天脫落5億個上皮細胞。這種擴散模式和直接接觸可以解釋本研究得出的闡明環(huán)境與病人皮膚間復雜的相互作用的現象。
In the Literature. The intimate and 2-way relationship between patient and hospital microbiomes. Clin Infect Dis, 2017,65 (1 September): iii.