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熒光定量PCR技術在臨床微生物檢測中的應用價值

2020-04-11 13:55:04蔣雪紛
臨床檢驗雜志(電子版) 2020年3期
關鍵詞:檢測方法

蔣雪紛

(新疆伊犁州友誼醫院檢驗科,新疆 伊犁 835000)

熒光定量PCR技術是一種在PCR反應體系中加入熒光基因,使熒光信號通過累積,實現對整個PCR過程的實時監測,達到增強靈敏度,提高監測效率,精準定量檢測的效果[1-2]。為探究熒光定量PCR,技術在臨床微生物檢測中的應用效果,本次研究回顧性分析我院門診收治的90例患者的臨床標本,對其熒光定量PCR技術微生物檢測結果進行分析,詳見下文描述。

1 資料與方法

1.1 一般資料 回顧性分析2017年1月-2019年1月間我院門診收治的90例患者的臨床標本,患者中有男45例,女35例,年齡20-75歲,平均(44.28±5.36)歲;病情:泌尿系統感染患者10例,細菌性食物中毒患者6例,上呼吸道感染患者37例,流行性感冒患者27例,腎盂腎炎患者7例,慢性阻塞性肺病患者3例;90份臨床標本中糞便標本51份,尿液標本39份。

1.2 方法 患者標本均采用熒光定量PCR技術檢測,將樣本增菌液(1.5 mL)滴入滅菌Epp管中,震蕩均勻,置入高速離心機內進行2 min離心操作,再徹底分離上層清液,加入μL DNA提取液于余下沉淀中,充分搖勻,沸水浴10 min,再置入高速離心機離心操作5 min,去除4 μg上層清液,完成PCR反應,結束后對標本進行擴增檢測,操作與檢測均嚴格按照試劑盒說明書進行。

2 結果

2.1 糞便標本與尿液標本中微生物檢測結果 糞便標本共51份,其中有15株沙門氏菌被檢出,陽性率33.33%,有2株腸出血性大腸桿菌0157:H7被檢出,陽性率3.92%,10株副溶血性弧菌被檢出,陽性率19.61%;尿液標本共39份,其中有4份金黃色葡萄球菌被檢出,陽性率10.26%,見表1。

表1 糞便標本與尿液標本中微生物檢測結果

2.2 糞便標本與尿液標本中微生物特異性檢測結果 各取2株沙門氏菌、腸出血性大腸桿菌0157:H7、副溶血性弧菌及黃色葡萄球菌進行試劑盒特異性檢測,結果未出現假陽性或假陰性情況,特異性100%;同時對所取菌株進行10倍系列系數PCR技術靈敏度檢測,結果表明102拷貝/mL核酸樣本能夠進行最低核酸檢測限度。

3 討論

熒光定量PCR(fluorescent quantitative PCR)技術,是指利用熒光基團加入PCR反應體系中,通過熒光信號的累積對整個PCR的進程進行實時監測,最后通過標準曲線對未知模板進行定量分析的檢測方法[3]。該技術最早出現于上個世紀90年代的美國,其研究人員通過實時監控整個PCR過程,對起始模板濃度進行了專一、快速、靈敏以及可重復性的精確定量檢測,從而開始PCR技術的高速發展時期,隨著PCR技術在臨床中的應用越來越廣泛[4],其獨特的優勢得到了廣大研究人員的認可與青睞,其中,PCR技術在臨床檢測與鑒定中的應用主要包括以下幾塊:

3.1 PCR技術在病毒檢測中的應用 目前,PCR技術在多種病毒的臨床檢測中得到了應用,例如有研究人員通過四重TaqMan熒光定量PCR技術對185份不同基因混合到一起的B型肝炎樣本進行檢測,結果顯示該方法能夠對所有基因型進行檢測,從而對PCR技術的高精準度進行的驗證[5];此外,還有研究人員收集了臨床172份手足口病患者的324份標本,針對人腸道病毒、柯薩奇病毒A組16型病毒以及腸道病毒EV71型核酸特異性的反轉錄檢測,同時再對上述標本進行熒光定量PCR以及ELISA法檢測,結果顯示,與反轉錄檢測相比,只有反轉錄檢測方法檢測結果與其相近,同時反轉錄檢測與反轉錄檢測靈敏度均高于ELISA檢測,由此可以印證熒光定量PCR檢測具有高效快捷、特異性強、靈敏度高的優勢。

3.2 PCR技術在細菌檢測中的應用 近年來,隨著傳統檢測方法對細菌檢測與鑒別的缺陷逐漸顯露,PCR技術用于臨床細菌檢測的優勢也在逐漸顯現。有研究人員利用PCR技術創新了一種分枝桿菌的結合檢測方法,并利用該方法對細菌進行了檢測測試,與傳統涂片染色法及培養法相比,其靈敏度與與特異性分別達到了97.2%與100%,明顯超過了傳統方法。此外還有研究人員利用雙重PCR技術對鼠傷韓沙門菌與腸炎門菌進行檢測,結果顯示,雙重PCR技術檢測靈敏度與特異性均為100%,而檢測時間較傳統檢測方法的4-5 d大大縮短,約為8h即可完成檢測,大大提高了臨床檢測的效率,有助于患者的早期治療,該方法可期待其在未來臨床檢測中的推廣應用;還有研究人員采用分組法將230例無癥狀者咽拭子標本進行TaqManMGB探針熒光定量PCR法、常規PCR法與常規分離培養法進行檢測,檢測細菌為腦膜炎奈瑟球菌,結果顯示,上述三種方法的陽性檢出率分別為10.43%、6.52%以及3.48%,也驗證了TaqManMGB探針熒光定量PCR法對于細菌的檢出率均高于常規PCR法與常規分離培養法。

3.3 PCR技術在真菌檢測中的應用 臨床中關于熒光定量PCR檢測方法在真菌檢測中的應用均有報道。其中有研究人員通過對曲霉菌的18SRNA序列設計引物及探針對臨床疑似標本進行檢測,結果顯示特異性高達100%;有研究人員通過熒光定量PCR方法對異基因造血干細胞移植后侵襲性曲霉菌感染(IA)進行了早期診斷中的評價,結果顯示該檢測方法敏感性與特異性高達94.4%與100%。

結合本次研究結果:各取2株沙門氏菌、腸出血性大腸桿菌0157:H7、副溶血性弧菌及黃色葡萄球菌進行試劑盒特異性檢測,結果未出現假陽性或假陰性情況,特異性100%;同時對所取菌株進行10倍系列系數PCR技術靈敏度檢測,結果表明102拷貝/mL核酸樣本能夠進行最低核酸檢測限度。

綜上,在微生物的臨床檢測中,熒光定量PCR技術靈敏度強,特異性好,檢測效率高,還具有精準缺量的特點,值得推廣應用。

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