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TWIST1 mRNA和FSCN1 mRNA在非小細(xì)胞肺癌中的表達(dá)及意義

2020-06-11 04:35:54張久榮林勇徐春華胡慧娣呂亞軍
關(guān)鍵詞:分析

張久榮, 林勇, 徐春華, 胡慧娣, 呂亞軍

(1. 南京市胸科醫(yī)院呼吸內(nèi)科, 江蘇 南京210029; 2. 南京市胸科醫(yī)院病理科, 江蘇 南京210029; 3. 常州市武進(jìn)人民醫(yī)院胸心外科, 江蘇 常州 213017)

每年約有160萬人死于肺癌[1],其中非小細(xì)胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)是最常見的亞型,占80%~85%。超過一半的NSCLC患者在確診時已是Ⅳ期,無法行手術(shù)治療,導(dǎo)致患者預(yù)后差[2]。目前NSCLC患者的5年生存率不足15%,且復(fù)發(fā)率較高[3]。Twist蛋白由TWIST家族bHLH轉(zhuǎn)錄因子1(TWIST family bHLH transcription factor 1,TWIST1)編碼,是一種含有螺旋-環(huán)-螺旋結(jié)構(gòu)域的轉(zhuǎn)錄因子,在胚胎發(fā)育及腫瘤侵襲轉(zhuǎn)移中發(fā)揮重要作用[4]。,而Fascin蛋白由束蛋白結(jié)合蛋白1(Fascin actin-bundling protein 1,F(xiàn)SCN1)編碼,其在多種腫瘤中呈高表達(dá),廣泛參與癌細(xì)胞增殖、侵襲和遷移等,且是霍奇金淋巴瘤及EB病毒相關(guān)淋巴瘤的腫瘤標(biāo)志物[5]。目前,關(guān)于TWIST1 mRNA及FSCN1 mRNA在肺癌發(fā)生發(fā)展中的作用尚不清楚,本研究擬應(yīng)用生物信息學(xué)及臨床標(biāo)本分析TWIST1 mRNA和FSCN1 mRNA在NSCLC中的表達(dá)及意義。

1 資料與方法

1.1 生物信息學(xué)分析

TCGA可視化網(wǎng)站GEPIA(http://gepia.cancer-pku.cn/)包含多種腫瘤的表達(dá)譜數(shù)據(jù),在該網(wǎng)站首頁分別輸入“TWIST1”及“FSCN1”,點(diǎn)擊“GoPIA”之后網(wǎng)站會自動彈出mRNA相關(guān)信息以及在不同腫瘤中的表達(dá)情況。進(jìn)一步在該網(wǎng)站“Expression DIY”及“Survival Analysis”模塊下分析TWIST1 mRNA和FSCN1 mRNA在NSCLC兩種主要病理類型(肺腺癌和肺鱗癌)中的表達(dá)及臨床意義。此外,在“Correlation”模塊下分析TWIST1 mRNA與FSCN1 mRNA在肺腺癌及肺鱗癌中表達(dá)的相關(guān)性。

1.2 病例

本研究所有臨床標(biāo)本均從南京市胸科醫(yī)院胸外科獲取,從2015年1月至12月共搜集到69對NSCLC組織及癌旁組織(距離腫瘤邊緣5 cm以上),所有患者均接受根治性切除手術(shù)并且術(shù)前未進(jìn)行放療、化療。患者臨床資料(病理類型、性別、年齡、吸煙史、TNM分期等)從病歷記錄中獲取,病理類型由兩名經(jīng)驗豐富的病理醫(yī)師確定。69例腫瘤標(biāo)本中,肺腺癌39例,肺鱗癌30例;男36例,女33例;年齡38~78歲,中位年齡60歲,其中32例<60歲,37例≥60歲;吸煙者35例,非吸煙者34例;Ⅰ期24例,Ⅱ期29例,Ⅲ期16例;有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移38例,無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移31例。組織標(biāo)本浸泡在RNA保護(hù)液中,于-80 ℃保存。該研究經(jīng)南京市胸科醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會批準(zhǔn)并且獲得患者知情同意。

此外,對69例NSCLC中TWIST1 mRNA和FSCN1 mRNA的表達(dá)進(jìn)行排序,將前35例定義為高表達(dá)組,將后34例定義為低表達(dá)組,分析TWIST1及FSNC1與患者臨床病理特征的相關(guān)性。

1.3 組織RNA提取

切取組織,磨成碎片,加入Trizol 試劑(美國Thermo公司)裂解組織,并于4 ℃行12 000×g離心15 min;取上清液加入氯仿,室溫靜置5 min,并如上述操作離心;吸取上層水相至新EP管,加入異丙醇,于4 ℃行12 000×g離心10 min;取沉淀加入75%乙醇,于4 ℃行7 500×g離心5 min,獲得RNA沉淀。根據(jù)沉淀的量,加入適當(dāng)體積的無RNA酶水溶解RNA產(chǎn)物,并利用分光光度計(北京普析公司)檢測其濃度。

1.4 RNA反轉(zhuǎn)錄

使用反轉(zhuǎn)錄試劑盒(大連TaKaRa公司)進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)。在EP管中加入4 μL 5×反轉(zhuǎn)錄試劑混合液,1 μg RNA(根據(jù)濃度加入適當(dāng)體積),并用無酶水定容至20 μL。混勻反應(yīng)體系后,PCR儀(美國Stratagene公司)中設(shè)置反應(yīng)體系:37 ℃ 15 min;85 ℃ 5 s;4 ℃保持。獲取目標(biāo)cDNA后進(jìn)行實時定量PCR檢測。

1.5 實時定量PCR檢測TWIST1 mRNA和FSCN1 mRNA的表達(dá)

引物由南京金斯瑞生物工程公司合成。TWIST1上游引物為5′-GTCCGCAGTCTTACGAGGAG-3′,下游引物為5′-GCTTGAGGGTCTGAATCTTGCT-3′,擴(kuò)增長度156 bp;FSCN1上游引物為5′-CCAGGGTATGGACCTGTCTG-3′,下游引物為5′-GTGTGGGTACGGAAG GCAC-3′,擴(kuò)增長度105 bp;GAPDH上游引物為5′-GGAGCGAGATCCCTCCAAAAT-3′,下游引物為5′-GGCTGTTGTCATACTTCTCATGG-3′,擴(kuò)增長度197 bp。在96孔板中,每個反應(yīng)中加入10 μL 發(fā)光反應(yīng)液,0.4 μL正向引物,0.4 μL反向引物,0.4 μL 熒光標(biāo)準(zhǔn)液,5 μL cDNA模板以及3.8 μL蒸餾水,共20 μL體系。行PCR擴(kuò)增:95 ℃預(yù)變性 30 s;5 ℃ 5 s,60 ℃ 34 s,40個循環(huán)。使用管家GAPDH mRNA作為內(nèi)參,以癌旁組織為對照組,使用2-ΔΔCT方法分別計算TWIST1 mRNA及FSCN1 mRNA在NSCLC中的表達(dá)。

1.6 統(tǒng)計學(xué)分析

2 結(jié)果

2.1 GEPIA生物信息學(xué)分析結(jié)果

2.1.1 TWIST1 mRNA及FSCN1 mRNA在NSCLC中表達(dá)及臨床相關(guān)性 GEPIA網(wǎng)站分析顯示,與癌旁組織相比,TWSIT1 mRNA和FSCN1 mRNA在肺腺癌和肺鱗癌組織中表達(dá)明顯升高(P均<0.05),其中肺鱗癌更明顯。生存分析顯示,TWIST1 mRNA 與患者的總體生存期無明顯相關(guān)(P=0.160);而FSCN1 mRNA與患者預(yù)后相關(guān),F(xiàn)SCN1 mRNA低表達(dá)者總體生存期較高表達(dá)者更長(P=0.007)。見圖1。

圖1 GEPIA網(wǎng)站中TWIST1 mRNA及FSCN1 mRNA 在NSCLC中的表達(dá)及與總體生存期的關(guān)系

2.1.2 TWIST1 mRNA和FSCN1 mRNA的表達(dá)在肺腺癌和肺鱗癌中的相關(guān)性 進(jìn)一步分析GEPIA發(fā)現(xiàn),在肺腺癌中TWIST1 mRNA和FSCN1 mRNA表達(dá)呈中等程度正相關(guān)(r=0.41,P<0.01),在肺鱗癌中兩者表達(dá)呈弱相關(guān)(r=0.17,P<0.01)。見圖2。

2.2 臨床標(biāo)本驗證結(jié)果

2.2.1 TWIST1 mRNA及FSCN1 mRNA 在NSCLC中表達(dá)及相關(guān)性 結(jié)果表明,TWIST1 mRNA和FSCN1 mRNA在69對NSCLC組織中表達(dá)明顯高于對應(yīng)的癌旁組織(t=7.452,15.12,P<0.01)。

相關(guān)性分析結(jié)果顯示,TWIST1 mRNA和FSCN1 mRNA表達(dá)呈正相關(guān)(r=0.630,P<0.01)。見圖3。

圖2 NSCLC中TWIST1 mRNA及FSCN1 mRNA表達(dá)相關(guān)性

圖3 TWIST1 mRNA和FSCN1 mRNA在NSCLC中表達(dá)及相關(guān)性

2.2.2 TWIST1 mRNA及FSCN1 mRNA 表達(dá)與NSCLC患者臨床病理特征的關(guān)系 分析結(jié)果表明,TWIST1 mRNA和FSCN1 mRNA表達(dá)與患者TNM分期以及有無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移相關(guān)(P<0.05),但與患者的性別、年齡、吸煙史以及病理類型均無關(guān)(P>0.05)。見表1。

表1 TWIST1 mRNA及FSCN1 mRNA的表達(dá)與NSCLC臨床病理特征的關(guān)系

3 討論

TWIST1 mRNA在人類胚胎發(fā)育的過程中起重要作用,常通過與特定的DNA序列結(jié)合調(diào)控mRNA的轉(zhuǎn)錄從而發(fā)揮功能[6-8]。以往研究發(fā)現(xiàn),TWIST1在胃癌中促進(jìn)腫瘤細(xì)胞的上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化[9];也有研究表明TWIST1在頭頸癌的遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移[10]以及胃癌的腫瘤耐藥中發(fā)揮促癌作用[11]。本研究顯示,TWIST1在NSCLC中異常高表達(dá),且表達(dá)與患者的臨床病理分期及有無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移存在相關(guān)性,提示TWIST1可能與腫瘤的惡性生物學(xué)行為有關(guān)。此外,TWIST1與患者性別、年齡、吸煙史均無關(guān),表明TWITST1在NSCLC中表達(dá)相對穩(wěn)定,不受外界因素影響。而生存分析顯示TWIST1與患者的總體生存期無明顯相關(guān),因此,TWIST1是否參與NSCLC遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移、上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化及相關(guān)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路激活等還需進(jìn)一步研究。

FSCN1在調(diào)節(jié)細(xì)胞骨架結(jié)構(gòu),維持細(xì)胞黏附,協(xié)調(diào)運(yùn)動和侵襲等生物學(xué)途徑中發(fā)揮重要作用[12]。近年來研究證實FSCN1在多種腫瘤中表達(dá)上調(diào)[13-14],并且在霍奇金淋巴瘤及EB病毒相關(guān)淋巴瘤中可作為腫瘤標(biāo)志物[15],可作為胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)后和復(fù)發(fā)時間的預(yù)測指標(biāo)[16],能促進(jìn)腫瘤細(xì)胞的免疫逃逸[17]。本研究發(fā)現(xiàn)FSCN1 mRNA在NSCLC中高表達(dá)并且與患者的預(yù)后相關(guān),F(xiàn)SCN1 mRNA高表達(dá)患者其總體生存期低于低表達(dá)者。由此表明,F(xiàn)SCN1 mRNA可能在NSCLC的發(fā)生發(fā)展中起促癌作用,且能進(jìn)一步影響患者預(yù)后。此外,相關(guān)性分析顯示,TWIST1 mRNA與FSCN1 mRNA在NSCLC中表達(dá)呈正相關(guān),提示TWIST1 mRNA和FSCN1 mRNA的功能可能存在交叉協(xié)同作用。但兩者相關(guān)性較弱,其原因可能是TWIST1 mRNA和FSCN1 mRNA表達(dá)受到多種不同信號通路的調(diào)控。

綜上所述,本研究發(fā)現(xiàn)TWIST1 mRNA和FSCN1 mRNA在肺腺癌中高表達(dá)并且與患者的臨床病理分期及預(yù)后密切相關(guān),二者呈弱相關(guān)。本研究未闡明TWIST1和FSCN1在NSCLC中的生物學(xué)作用及作用機(jī)制,有待進(jìn)一步研究。

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