生鮮畜禽肉中沙門氏菌全基因組分析與分子溯源

宋 晟 高 晗 嚴(yán) 禮 郭焜鵬 張海韻 王芳斌

(1. 食品安全監(jiān)測(cè)與預(yù)警湖南省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，湖南 長(zhǎng)沙 410117；2. 湖南省食品質(zhì)量監(jiān)督檢驗(yàn)研究院，湖南 長(zhǎng)沙 410117)

沙門氏菌廣泛分布于自然界，是一種屬于腸桿菌科的革蘭氏陰性桿菌，就邦戈?duì)柹抽T氏菌和腸道沙門氏菌這兩個(gè)物種而言，迄今就已發(fā)現(xiàn)2 500余種血清型。作為一種人畜共患的主要病原菌，沙門氏菌通常會(huì)引起發(fā)熱、嘔吐等不良反應(yīng)，是腹瀉病全球四大病因之一[1-2]。某種情況下，沙門氏菌甚至可以進(jìn)入血液，引發(fā)腦膜炎。為治療沙門氏菌病，通常采用抗微生物藥物，但大量抗生素的濫用，導(dǎo)致部分菌株產(chǎn)生耐藥性，使藥物失效[3-4]。人類患沙門氏菌病有可能是食用了被沙門氏菌污染的動(dòng)物源性食品，如蛋、肉、禽和奶等。對(duì)于沙門氏菌以及其他食源性致病菌的溯源研究，主要有傳統(tǒng)的沙門氏菌分離鑒定技術(shù)、多位點(diǎn)序列分型(Multi locus sequence typing，MLST)技術(shù)以及脈沖場(chǎng)凝膠電泳(Pulsed field gel electrophoresis，PFGE)，近年來，隨著新一代基因組測(cè)序技術(shù)的發(fā)展，基于全基因組測(cè)序分子分型技術(shù)廣泛應(yīng)用于食源性致病菌溯源中，具有快速精準(zhǔn)等技術(shù)優(yōu)勢(shì)[5-7]。

實(shí)驗(yàn)室對(duì)長(zhǎng)沙市銷售的生鮮雞肉、生鮮豬肉進(jìn)行了隨機(jī)取樣調(diào)查，依據(jù)GB 4789.4—2016分離、鑒定樣品中的沙門氏菌，以充分了解長(zhǎng)沙市銷售的生鮮雞肉、生鮮豬肉的污染狀況，為防治沙門氏菌所引起的食源性疾病提供參考依據(jù)，并對(duì)分離鑒定出的40株沙門氏菌，進(jìn)行全基因測(cè)序與分子溯源分析，研究其溯源關(guān)系、致病機(jī)理、耐藥機(jī)理，為沙門氏菌基因?qū)用娴纳钊胙芯刻峁┮欢ǖ脑囼?yàn)依據(jù)?！?br>