張蕭蕭 劉若凡 劉麗艷 黃寧 陳軍利
(四川大學(xué)華西基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與法醫(yī)學(xué)院病理生理學(xué)教研室,四川 成都 610041)
α2腎上腺素受體(α2-adrenergic receptor,α2-AR)是G蛋白偶聯(lián)受體(G-protein coupled receptors,GPCRs)超家族成員,屬于A類(視紫紅質(zhì)類)GPCR受體,有α2A、α2B、α2C三種亞型[1,2],主要在內(nèi)源性兒茶酚胺、腎上腺素和去甲腎上腺素發(fā)生內(nèi)源性生物學(xué)效應(yīng)方面具有重要作用。其中α2C-AR主要參與一些神經(jīng)系統(tǒng)障礙性疾病(如抑郁癥、精神分裂癥以及認(rèn)知障礙等)的發(fā)生發(fā)展的過程[3,4]。因此,α2C-AR可能是治療上述疾病的潛在藥物靶點(diǎn)。
與傳統(tǒng)的正性藥物相比,別構(gòu)調(diào)節(jié)劑具有副作用小、選擇性高以及不影響內(nèi)源性受體的正常生理學(xué)信號傳導(dǎo)模式等優(yōu)點(diǎn),具有良好的潛在藥物開發(fā)前景[5,6]。研究顯示,阿米洛利及其類似物(如Benzamil)是多種GPCR家族受體的別構(gòu)調(diào)節(jié)劑[7,8],但是否對α2C-AR具有別構(gòu)調(diào)節(jié)效應(yīng),目前尚未見報道。
本文主要是利用計算機(jī)輔助藥物設(shè)計手段和藥理學(xué)實(shí)驗(yàn)來檢測阿米洛利和Benzamil與α2C-AR的潛在結(jié)合位點(diǎn)及其別構(gòu)調(diào)節(jié)作用,為研發(fā)新型α2C-AR別構(gòu)調(diào)節(jié)劑打下結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。
COS-7細(xì)胞(ATCC),DMEM高糖培養(yǎng)基(HyClone),F(xiàn)BS(Gibco),青霉素-鏈霉素溶液(Biosharp),PBS(HyClone),3H-RX821002(PerkinElmer),PEI40000(Polysciences),BCA試劑盒(碧云天),15 cm培養(yǎng)皿(NEST)。
1.2.1 α2C-AR晶體結(jié)構(gòu)補(bǔ)全
應(yīng)用Accelrys Discovery Studio Client version 3.1 (Accelrys Software Inc.USA),打開所需補(bǔ)全的α2C-AR的晶體結(jié)構(gòu)(PDB ID:6KUW),在Protein Report中顯示所缺失的氨基酸序列,在Hierarchy View中選中所缺失的序列,并填入缺失氨基酸的序列。
1.2.2 分子對接
在Discovery Studio 3.1軟件中,對α2C-AR進(jìn)行加氫,從“from receptor cavity” 定義結(jié)合口袋。應(yīng)用CDOCKER對配體和受體進(jìn)行分子對接,Tophit設(shè)置為10,Pose Cluster Radius為0.5,其他參數(shù)為默認(rèn)值。
1.2.3 質(zhì)粒瞬時轉(zhuǎn)染
轉(zhuǎn)染前1 d進(jìn)行細(xì)胞鋪板,以保證轉(zhuǎn)染前細(xì)胞密度為60%-70%。轉(zhuǎn)染前1 h,將細(xì)胞培養(yǎng)液換為不含血清、雙抗的DMEM培養(yǎng)基。將質(zhì)粒DNA和PEI40000按1:3比例分別加入不含血清、雙抗的DMEM培養(yǎng)基中,混勻室溫放置5 min,再將質(zhì)粒和PEI混合并混勻,室溫孵育15 min。向培養(yǎng)皿中加入混合后的轉(zhuǎn)染試劑,37℃孵育4 h,棄去培養(yǎng)液,加入含血清、雙抗的DMEM培養(yǎng)基繼續(xù)培養(yǎng)48-72 h后提取膜蛋白。
1.2.4 膜蛋白提取
將轉(zhuǎn)染后的細(xì)胞用10 ml的4℃PBS清洗兩次,加入10 ml PBS刮下細(xì)胞,4℃,800g離心5 min,棄上清。加入20 ml HEPES buffer,用勻漿機(jī)進(jìn)行勻漿,24000 rpm離心10 s,反復(fù)進(jìn)行3次,每次間隔10 s,4℃1300 g離心10 min。吸取上清液至超高速離心管中,4℃100000 g離心1 h,棄上清。加入含10%甘油的HEM溶液,并用1 ml胰島素注射器反復(fù)吹打15-20次,充分混勻后,每管50 μl分裝,置于-80℃保存待用。應(yīng)用BCA法對蛋白濃度進(jìn)行測定。
1.2.5 受體表達(dá)實(shí)驗(yàn)
將不同濃度的膜蛋白與3.5 nM的3HRX821002共孵育1 h,加入4℃PBS終止反應(yīng),GF/B濾膜過濾,通過液體閃爍儀對樣品放射性進(jìn)行測定。加入100 μM酚妥拉明來檢測非特異性結(jié)合。
1.2.6 解離動力學(xué)實(shí)驗(yàn)
在不同時間點(diǎn),將含有α2C-AR的膜蛋白加入到含有3.5 nM3H-RX821002的HEM 緩沖液中,室溫孵育1 h,在不同時間點(diǎn)加入100 μM酚妥拉明10 μL和Amiloride/Benzamil 10 μL(實(shí)驗(yàn)組),或100 μM 酚妥拉明10 μL(對照組)。加入4℃PBS終止反應(yīng),GF/B濾膜過濾,通過液體閃爍儀對樣品放射性進(jìn)行測定。
在Discovery Studio3.1軟件中打開α2C-AR的晶體結(jié)構(gòu)(PDB ID:6KUW),可查見該蛋白Leu190到Ala197位氨基酸缺失,見圖1A,插入缺失的氨基酸之后的結(jié)構(gòu)如1B所示。酚妥拉明是α2-AR的阻滯劑,去甲腎上腺素是α2-AR的激動劑,我們采用CDOCKER將這兩種化合物分別與α2C-AR進(jìn)行分子對接,然后從對接模式最集中的簇中,選評分最高的對接模式進(jìn)行分析。結(jié)果顯示,這兩種化合物均位于α2C-AR的胞內(nèi)端,且均與Val236和Thr241形成氫鍵,提示Val236和Thr241可能是該兩種化合物與α2C-AR的結(jié)合位點(diǎn),見圖1C和圖1D。
為預(yù)測阿米洛利和Benzamil與α2C-AR的作用位點(diǎn),我們采用CDOCKER將阿米洛利和Benzamil與α2C-AR進(jìn)行分子對接。分子對接后產(chǎn)生10個對接模式,從對接模式最集中的簇中,選評分最高的對接模式分析。結(jié)果顯示,與酚妥拉明和去甲腎上腺素相似,阿米洛利和Benzamil均位于α2C-AR的胞內(nèi)端,其中阿米洛利與Glu377和Phe380形成氫鍵,見圖2A,Benzamil與Asn160和Thr241形成氫鍵,見圖2B。

圖1 α2C-AR晶體結(jié)構(gòu)及酚妥拉明和去甲腎上腺素分子對接

圖2 阿米洛利、Benzamil與α2C-AR 分子對接
通過測定α2C-AR表達(dá)量發(fā)現(xiàn),α2C-AR表達(dá)呈劑量依賴性,見圖3,后續(xù)將選取5-10 μg的含有α2C-AR的膜蛋白進(jìn)行解離實(shí)驗(yàn)。

圖3 α2C-AR 表達(dá)
阿米洛利與對照組的HalfLife值分別為0.8710和0.9314,見圖4A;Benzamil與對照組的HalfLife值為1.003和1.206,見圖4B,阿米洛利與Benzamil對3H-RX821002的解離速度均無影響。

圖4 阿米洛利(A)和Benzamil(B)對3H-RX821002解離速度的影響
α2C-AR是GPCR超家族一員,參與了多種神經(jīng)系統(tǒng)疾病的發(fā)生發(fā)展過程,提示α2C-AR可能是這些疾病的潛在藥物靶點(diǎn)。與作用于正性結(jié)合位點(diǎn)的化合物相比,別構(gòu)調(diào)節(jié)劑具有副作用小、選擇性高,且不影響受體信號傳導(dǎo)模式等一系列優(yōu)點(diǎn)。目前,多種GPCRs別構(gòu)調(diào)節(jié)劑已被發(fā)現(xiàn),并在疾病的治療上取得了一定的療效。例如,毒蕈堿型受體M1 和/或 M4的正性別構(gòu)調(diào)節(jié)劑、多巴胺受體D2的負(fù)性別構(gòu)調(diào)節(jié)劑(SB269652)治療精神性疾病等[9]。
研究報道,阿米洛利及其類似物(如Benzamil)對多種GPCR家族受體具有別構(gòu)調(diào)節(jié)作用[7,8],因此,我們對其是否對α2C-AR具有別構(gòu)調(diào)節(jié)效應(yīng)進(jìn)行了檢測。首先,我們通過分子對接手段預(yù)測了此兩種化合物與α2C-AR的結(jié)合位點(diǎn)。 發(fā)現(xiàn),阿米洛利與α2C-AR的潛在結(jié)合位點(diǎn)包括Glu377和Phe380,Benzamil與α2C-AR的潛在結(jié)合位點(diǎn)包括Asn160和Thr241。
與設(shè)想不一樣的是,這些位點(diǎn)與酚妥拉明和去甲腎上腺素的結(jié)合位點(diǎn)相近,提示,阿米洛利和Benzamil可能作用在α2C-AR的正性位點(diǎn),而沒有作用在其別構(gòu)調(diào)節(jié)位點(diǎn)。然而,作為分子對接的眾多軟件之一,CDOCKER有其自身的局限性,比如不能進(jìn)行柔性對接。因此,后續(xù)還需要采用其他的分子對接方法,比如flexible docking,或者分子動力學(xué)模擬,來進(jìn)一步探討阿米洛利和Benzamil與α2C-AR的作用模式。
配體受體解離動力學(xué)實(shí)驗(yàn)是檢測化合物是否是別構(gòu)調(diào)節(jié)劑的一種有效方法。我們的解離動力學(xué)實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,阿米洛利和Benzamil對3H-RX821002從α2C-AR上的解離速度沒有影響,表明阿米洛利和Benzamil對3H-RX821002不存在別構(gòu)調(diào)節(jié)作用。但是,別構(gòu)調(diào)節(jié)劑具有配體依賴性,因此,將來,我們還需檢測阿米洛利和Benzamil對其他配體的別構(gòu)調(diào)節(jié)作用。