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2017
——2019年廣西豬重要病毒性腹瀉病原流行病學調(diào)查

2021-01-14 07:25:12嚴瑾施開創(chuàng)劉宏梅謝守玉覃勇黎宗強尹彥文
廣西農(nóng)學報 2020年4期
關(guān)鍵詞:差異檢測

嚴瑾 施開創(chuàng) 劉宏梅 謝守玉 覃勇 黎宗強 尹彥文

(1.廣西大學動物科學技術(shù)學院,廣西 南寧530005;2.廣西動物疫病預(yù)防控制中心,廣西 南寧530001;3.百色市動物疫病預(yù)防控制中心,廣西 百色市533000)

病毒性腹瀉是嚴重危害養(yǎng)豬業(yè)的一類重要疫病,豬德爾塔冠狀病毒(PDCoV)、豬流行性腹瀉病毒(PEDV)、豬傳染性胃腸炎病毒(TGEV)、豬輪狀病毒(PRoV)是其中4種主要病原。PEDV可以感染各個年齡段豬群,發(fā)病豬以厭食、水樣腹瀉、嘔吐以及脫水為主要癥狀。該病毒在1971年首次被英國學者報道,中國1980年首次報道該病,目前世界上主要養(yǎng)豬國家均有該病流行[1]。PDCoV是2014年新發(fā)現(xiàn)的一種豬腸道致病性冠狀病毒,可致各個年齡豬尤其是仔豬的嘔吐、腹瀉、脫水甚至死亡,臨床癥狀與PED相似[2]。TGEV于1946年美國首次分離得到,可以導(dǎo)致各種年齡豬的急性胃腸道傳染病,臨床癥狀與PDCoV極其相似,仔豬死亡率可達100%,成年豬極少死亡[3]。PRoV在1968年首次分離得到,臨床癥狀與PEDV相似,各種年齡豬均易感,成年豬多呈隱性感染,仔豬發(fā)病率和死亡率較高[4]。PDCoV、PEDV、TGEV和PRoV所致疫病不僅臨床癥狀相似,還經(jīng)常存在混合感染、繼發(fā)感染,增加豬群的發(fā)病率和死亡率,是目前危害養(yǎng)豬業(yè)的重要病原。加強上述四種病原的流行病學調(diào)查,是做好病毒性腹瀉防控的重要基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 樣品來源

2017-2019年來自廣西各地規(guī)模化豬場送檢的因腹瀉死亡豬的腸道及其內(nèi)容物、病豬的肛門拭子等腹瀉樣品,共1463份,置于-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.2 主要試劑

MiniBEST Viral RNA/DNA Extraction Kit Ver.5.0核酸抽提試劑盒、PrimeScriptⅡ1st strand cDNA Synthesis Kit反轉(zhuǎn)錄試劑盒、2×Taq PCR Master Mix試劑盒、DL2000 DNA Marker等均購自寶生物工程(大連)有限公司。

1.3 病料處理

肛門拭子的處理:將肛門棉拭子置于1.5 mL離心管中,按1∶3(W/V)加入滅菌生理鹽水,震蕩后離心,取200μL上清液,進行RNA抽提。

糞便的處理:將糞便加入1.5 mL離心管中,按1∶3(W/V)加入滅菌生理鹽水,震蕩離心,取200μL上清液,進行RNA抽提。

腸組織及內(nèi)容物的處理:選取腸組織及內(nèi)容物,剪碎,置于滅菌1.5 mL離心管中,按1∶3(W/V)加入滅菌生理鹽水,再加入兩顆研磨鋼珠,經(jīng)組織搗碎機搗碎,反復(fù)凍融3次,12 000 r/min離心5 min,取200μL上清液,進行RNA抽提。

按照核酸抽提試劑盒說明書,提取樣品RNA后,按照反轉(zhuǎn)錄試劑盒反轉(zhuǎn)錄成cDNA,將其置于-80℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.4 PDCoV、PEDV、TGEV及PRoV的檢測

參照本實驗室建立的PDCoV、PEDV、TGEV及PRoV多重RT-PCR檢測方法[5],以cDNA為模板,進行PCR擴增。PDCoV、PEDV、TGEV、PRoV擴增片段大小分別為183 bp、750 bp、544 bp、329 bp。在陰、陽性對照成立前提下,當出現(xiàn)擴增的目的條帶時,判定為陽性;否則為陰性。

1.5 數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析

對不同年度、季節(jié)、地區(qū)和病種的檢測結(jié)果進行分析,利用卡方檢驗計算器V1.70發(fā)生數(shù)格式、確切概率計算卡方進行差異性分析,當P≤0.05為差異顯著,P>0.05為差異不顯著。

2 結(jié)果與分析

2.1 病原檢測結(jié)果

2017-2019年從廣西各地養(yǎng)豬場采集的1463份腹瀉病料進行多重RT-PCR,檢測PDCoV、PEDV、TGEV、PRoV如表1所示。由表1可見,PDCoV、PEDV、TGEV和PRoV的檢出陽性率分別為5.67%、10.12%、1.30%和5.95%。2017-2019年,廣西部分地區(qū)PDCoV陽性率分別為8.33%、5.81%和3.82%,陽性率呈逐年下降,2019年同比2017年下降差異顯著(P≤0.05);PEDV陽 性 率 分別為12.70%、9.72%和9.31%,各年差異不顯著(P>0.05);TGEV陽性率分別為0%、1.77%和1.19%,2018年和2019年差異不顯著(P>0.05);PRoV陽性率分別為0.40%、6.31%和8.59%,2019年同比2017年顯著上升(P≤0.05)。結(jié)果表明,2017-2019年間廣西部分地區(qū)PDCoV、PEDV陽性率不斷下降,而PRoV陽性率則在逐年上升。

表1 2017-2019廣西各地臨床腹瀉樣品檢測結(jié)果

2.2 病原時間分布

對1463份病料的檢測結(jié)果按季節(jié)進行統(tǒng)計分析(見表2),2017-2019年四個季度中,PDCoV陽性率最高為第二季度,達10.14%,與第一、四季度差異顯著(P≤0.05),與第三季度差異不顯著(P>0.05);PEDV陽性率最低為第二季度4.06%,并與其他季度差異顯著(P≤0.05),第一、三、四季度間差異不顯著(P>0.05);TGEV陽性率最高為第三季度5.50%,并與其它季度差異顯著(P≤0.05),第一、三、四季度間差異不顯著(P>0.05);PRoV陽性率最低為第二季度1.45%,并與其他季度差異顯著(P≤0.05),第一、三、四季度間差異不顯著(P>0.05)。結(jié)果表明,PEDV全年均可發(fā)病,高峰期在第二、三季度,第一、四季度發(fā)病率相對較低;PDCoV主要在冬春季節(jié)發(fā)生,但感染豬場全年都可發(fā)病;TGEV主要集中在第三季發(fā)生,第二季度未檢測出陽性;PRoV一年四季均可檢測出陽性,第二季度陽性率相對比較低。

表2 2017-2019廣西各地腹瀉樣品檢測結(jié)果季度統(tǒng)計表

2.3 病原地區(qū)分布

2017-2019年從廣西9個地級市采集的1463份腹瀉病料PDCoV、PEDV、TGEV、PRoV檢測結(jié)果如表3所示。由表3可知,根據(jù)相同病原在不同地區(qū)的平均陽性率統(tǒng)計顯示,PDCoV陽性率在百色市最高,為9.25%,與其他地區(qū)差異顯著(P≤0.05);PEDV陽性率在玉林市最高,陽性率為50.00%,但由于樣本數(shù)比較少,與多數(shù)地區(qū)差異不顯著(P>0.05);TGEV陽性率在桂林市最高,為33.32%,除與南寧市差異不顯著外,與其他地區(qū)差異顯著(P≤0.05);PRoV陽性率在賀州市最高,為50.00%,與其他地區(qū)差異顯著(P≤0.05)。結(jié)果表明,PDCoV、PEDV、TGEV、PRoV的發(fā)生具有地域差異性。

表3 2017-2019廣西各地腹瀉樣品檢測結(jié)果地區(qū)分布統(tǒng)計表

2.4 PDCoV與PEDV、TGEV、PRoV混合感染情況

PDCoV與PEDV、TGEV、PRoV混合感染情況如表4所示。由表4可知,在所檢測的1463份病料中,2種病原混合感染的陽性率為5.26%,3種病原混合感染的陽性率為1.64%。PEDV+PDCoV、PEDV+TGEV、PEDV+PRoV陽性率分別為2.32%、0.21%、2.19%;PDCoV+TGEV、PDCoV+PRoV陽 性 率 為0.27%、0.27%;TGEV+PRoV陽性率為0.14%;PDCoV+PEDV+PRoV三重感染陽性率為1.64%。

表4 2017-2019廣西各地臨床腹瀉樣品混合感染情況

3 小結(jié)與討論

近年來,由各種豬腹瀉病毒感染所造成的豬群發(fā)病率和死亡率不斷升高,給養(yǎng)豬業(yè)造成了嚴重損失。徐麗華等[6]調(diào)查2011-2017年浙江省部分豬群,發(fā)現(xiàn)PEDV、PDCoV、TGEV和PRoV陽性率分別為71.25%、8.75%、3.05%和17.67%;混合感染中,PEDV+PDCoV、PEDV+TGEV、PEDV+PRoV、PDCoV+PRoV陽性率分別為2.80%、2.40%、15.10%、0.50%。王顥然等[7]對2008-2018年我國PEDV混合感染病例進行統(tǒng)計,發(fā)現(xiàn)全國18個省市6951份樣本中,PEDV陽性3345份,陽性率為48.12%、混合感染1325份,陽性率為19.06%,混合感染主要以二重為主陽性率為15.41%,三重、四重混合感染分別為3.25%和0.40%。田云等[8]對廣東省19個地市236份腹瀉樣品進行檢測,PEDV陽性率為33.05%,PRoV陽性率為17.8%,未檢出TGEV。李炳曉等[9]對2017-2018年河南省部分地區(qū)仔豬腹瀉病料進行檢測,結(jié)果表明,PEDV、PDCoV陽性率分別為35.06%、51.92%,二者混合感染陽性率為24.03%。何穎等[10]對2013-2018年廣西各地1574份腹瀉樣品進行檢測,結(jié)果表明,PEDV、PDCoV、TGEV和PRoV陽性率分別為54.94%、4.52%、4.40%和0%,混合感染中以PEDV+PDCoV和PEDV+PRoV混合感染較多,三重感染情況較少;PEDV四季的感染率分別為50.43%、45.19%、60.49%和63.19%,PDCoV四季的感染率分別為8.12%、1.56%、0.49%和5.11%,PRoV四季的感染率分別為5.34%、8.05%、3.41%和1.02%。段群棚等[11]對廣西2016-2019年914份病料進行監(jiān)測,發(fā)現(xiàn)PEDV無明顯的發(fā)病季節(jié),夏季豬群也會持續(xù)感染,這與本實驗的結(jié)果一致。以上結(jié)果表明,PDCoV、PEDV、TGEV和PRoV等是引起仔豬腹瀉的重要病原,而且存在混合感染、繼發(fā)感染情況。

本研究對2017-2019年廣西各地的腹瀉病料進行檢測發(fā)現(xiàn),PDCoV、PEDV、TGEV、PRoV的陽性率分別為5.67%、10.12%、1.30%和5.95%;2種病原混合感染的陽性率達到5.26%,三種病原混合感染的陽性率達到1.64%。結(jié)果表明,PEDV是導(dǎo)致豬腹瀉的主要病原,PDCoV、TGEV和PRoV也有感染,而且混合感染較為嚴重。在不同地區(qū)、不同季度可能會感染不同的病原,病原之間可能存在相互作用,導(dǎo)致不同的發(fā)病率和死亡率[12]。與其他省份相比,廣西豬群TGEV、PEDV以及PRoV的陽性率普遍低于其他省份,這可能與廣西部分豬群接種PEDV-TGEVPRoV三聯(lián)弱毒苗有關(guān),疫苗的接種能夠有效的預(yù)防腹瀉的發(fā)生,降低發(fā)病率和死亡率。但目前尚未有PDCoV商品化疫苗,對該病的防控,可以通過對環(huán)境的控制來降低豬群的感染率和發(fā)病率[13]。廣西豬群的腹瀉主要發(fā)生在冬春季節(jié),可能是由于廣西屬于亞熱帶地區(qū),每年冬春季節(jié),廣西地區(qū)陰雨連綿,氣候潮濕陰冷,晝夜溫差大,容易引起豬群的應(yīng)激反應(yīng),導(dǎo)致豬群的免疫力下降,誘發(fā)腹瀉。因此,要在冬春季節(jié),在免疫相應(yīng)疫苗的基礎(chǔ)上,應(yīng)注意豬群的防寒保暖,保持豬圈通風干燥,堅持定期消毒,增加飼料營養(yǎng),通過加強生物安全管理和飼養(yǎng)管理來降低豬群的發(fā)病率和死亡率。

總之,PDCoV、PEDV、TGEV和PRoV已成為當前豬群病毒性腹瀉的主要病原,嚴重危害養(yǎng)豬業(yè)的健康發(fā)展,應(yīng)進一步加強病原監(jiān)測,做好疫苗免疫、飼養(yǎng)管理、生物安全等綜合防控,持續(xù)降低豬群病毒性腹瀉的發(fā)病率和死亡率。

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