基于生物信息學分析細胞周期蛋白依賴蛋白激酶5表達與胃癌免疫浸潤細胞的相關性△

曹龍龍，謝建偉，李平，鄭朝輝，黃昌明

福建醫科大學附屬協和醫院胃外科，福州 350001

胃癌是一種嚴重的公共健康問題。據報道，全世界每年胃癌發病數量超過951 600例，現已成為第三大腫瘤相關死亡病因。胃癌的發病機制復雜，預后差，病死率高。盡管胃癌的綜合治療措施不斷完善，但仍未能獲得滿意效果。近年來，對免疫檢查點的阻斷已進行了積極研究，并已為多種惡性腫瘤（如轉移性黑色素瘤和非小細胞肺癌）帶來了巨大的臨床獲益。但是，研究發現多種腫瘤類型中只有不到40%的病例對程序性死亡受體1（programmed cell death 1，PDCD1，也稱PD-1）/程序性死亡受體配體1（programmed cell death 1 ligand 1，PDCD1LG1，也稱PD-L1）阻斷有反應，并且據報道腫瘤對免疫療法有主要或次要抵抗力。細胞周期蛋白依賴蛋白激酶5（cyclin-dependent protein kinase 5，CDK5）屬于周期蛋白依賴蛋白激酶（CDK）家族成員。既往研究顯示，CDK5除了參與神經細胞的調控外，還參與了多種腫瘤的發生發展及凋亡過程。最近研究顯示，CDK5的缺失可通過干擾PD-L1的表達而參與腫瘤免疫逃逸。然而，關于CDK5是否影響腫瘤免疫浸潤細胞的類型和數目尚不清楚。本研究收集36例胃癌患者的胃癌石蠟組織，并通過生物信息學分析，探討CDK5表達是否影響胃癌免疫細胞浸潤，現報道如下。

1 對象與方法

1.1 研究對象

從公共數據庫癌癥基因組圖譜（The Cancer Genome Atlas，TCGA；https://portal.gdc.cancer.gov/）及基因表達數據庫（Gene Expression Omnibus，GEO；https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds/）中獲取胃癌患者高通量測序數據集。TCGA數據集中納入包含完整臨床資料的358例胃癌組織（T）及22例癌旁組織（N）。GEO數據庫中選取包含胃癌組織和癌旁組織或健康者胃黏膜組織……