黃海水產研究所研制出基因芯“黃海芯1號”助力對蝦育種

基因芯片是提升育種效率、培育抗病、抗逆及優質等新品種的重要分子工具。近年來，針對對蝦基因組育種缺乏低成本、高通量的基因芯片現狀，中國水產科學研究院黃海水產研究所孔杰研究員團隊研制出40K SNP基因芯片“黃海芯1號”。依據多代系譜，采用一步法基因組選擇技術，“黃海芯1號”已經應用于對蝦的商業化育種中，在提高致急性肝胰腺壞死病副溶血弧菌(VpAHPND)、白斑綜合征病毒(WSSV)抗性和生長速度等方面取得顯著進展。

研究團隊對世界上重要的對蝦養殖群體和品系進行了全基因組重測序，獲得6百萬個有效SNP標記，經過整合WSSV抗性、氨氮耐受性、飼料轉化效率等相關SNP位點，選留45 815個標記并構建了液相芯片。利用該芯片的基因型檢測結果，對VpAHPND和WSSV侵染的抗性開展一步法基因組選擇，準確性比傳統的BLUP方法高29%～91%。該團隊已經與石家莊博瑞迪生物技術有限公司簽約，聯合開展育種技術服務與SNP基因型檢測服務。目前，“黃海芯1號”已推廣應用于4個凡納濱對蝦的遺傳育種項目，分型個體數量超過2 000尾。

對蝦40K SNP育種芯片“黃海芯1號”的研發，為凡納濱對蝦基因組親緣關系鑒定、遺傳結構與遺傳多樣性分析、多性狀基因組選擇等提供了重要工具，對進一步推動對蝦種業的快速發展起到至關重要的作用。