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鹽分對新平酸腌菜主發(fā)酵期細(xì)菌多樣性的影響

2021-05-07 09:54:38周藝萍李選文
中國釀造 2021年4期
關(guān)鍵詞:物種差異分析

周藝萍,熊 智,李選文,韓 龍*

(1.西南林業(yè)大學(xué) 生命科學(xué)學(xué)院西南地區(qū)生物多樣性保育國家林業(yè)和草原局重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,云南 昆明 650224;2.西南林業(yè)大學(xué) 繼續(xù)教育學(xué)院,云南 昆明 650224)

新平酸腌菜是以當(dāng)?shù)胤Q為青菜的葉用芥菜(Brassica juncea)加鹽及各種調(diào)料經(jīng)多種微生物發(fā)酵而成,滋味酸爽、香氣濃郁,是我國云南極具地方特色的一種傳統(tǒng)發(fā)酵蔬菜[1-3]。可直接食用,也可作為酸味調(diào)味品,風(fēng)味獨(dú)特,具有開胃、促食欲等功能[4-5]。目前,針對酸菜的主要研究集中在微生物的分離與鑒定、發(fā)酵過程中亞硝酸鹽的控制、發(fā)酵工藝的優(yōu)化以及酸菜中有機(jī)物動態(tài)變化等方面,而生產(chǎn)實(shí)踐中,生產(chǎn)者會經(jīng)驗(yàn)性地添加食鹽以保證酸菜的順利發(fā)酵,但對鹽分如何影響其中的微生物相關(guān)研究報(bào)道則相對較少[6-8]。因此,科學(xué)闡明食鹽與酸菜發(fā)酵微生物的關(guān)系將有助于生產(chǎn)工藝標(biāo)準(zhǔn)化、控制產(chǎn)品質(zhì)量穩(wěn)定性以及指導(dǎo)工藝改進(jìn),也有助于更好地利用和發(fā)展酸菜菌種資源。研究酸菜中的微生物多樣性主要有傳統(tǒng)培養(yǎng)法和非培養(yǎng)法。雖然傳統(tǒng)方法能對分離的菌種進(jìn)行鑒定并分析其多樣性,但步驟繁瑣、耗時(shí)費(fèi)力,無法分離大部分不可培養(yǎng)的微生物且檢出率及靈敏度不高,還易受到環(huán)境因素的影響,無法全面分析酸菜中微生物群落多樣性[9-11]。非培養(yǎng)法不依賴培養(yǎng)過程,大大縮短了樣品的分析時(shí)間,而且還能顯示環(huán)境樣品中不可培養(yǎng)的微生物的遺傳信息,有助于快速、準(zhǔn)確地對復(fù)雜微生物區(qū)系菌群結(jié)構(gòu)演替和多樣性進(jìn)行分析[12-13]。近年來,高通量測序以其速率快、準(zhǔn)確定量、實(shí)時(shí)檢測等特點(diǎn),已廣泛應(yīng)用到環(huán)境樣本的微生物多樣性分析中。

本實(shí)驗(yàn)采用高通量測序技術(shù)對無鹽和有鹽(鹽度10%)腌制的新平酸腌菜在主發(fā)酵期理化指標(biāo)波動較大的三個(gè)時(shí)間點(diǎn)的樣品細(xì)菌多樣性進(jìn)行測序分析,研究鹽分對新平酸腌菜細(xì)菌菌群結(jié)構(gòu)差異的影響,同時(shí)對無鹽和有鹽(鹽度10%)腌制的新平酸腌菜理化指標(biāo)進(jìn)行測定,建立理化指標(biāo)與細(xì)菌群落之間的相關(guān)性,為今后酸菜制作工藝改進(jìn)提供一定理論參考,并為深入機(jī)理研究奠定一定基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 材料與試劑

葉用芥菜:云南省玉溪市新平縣平甸鄉(xiāng)菜市場;食鹽及輔料等(均為食用級):云南昆明盤龍區(qū)東華家樂福超市;發(fā)酵壇子(5 L,容量、形狀及材質(zhì)統(tǒng)一):云南昆明華森試劑公司;食品中亞硝酸鹽含量測定試劑盒:蘇州科銘生物技術(shù)有限公司;樣品脫氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)提取,16S rRNA V3-V4區(qū)引物合成及測序建庫:委托北京諾禾致源科技股份有限公司完成。

1.2 儀器與設(shè)備

PHS-25型雷磁pH計(jì):上海梅穎浦儀器儀表制造有限公司;UV-1000紫外可見分光光度計(jì):上海躍進(jìn)醫(yī)療器械有限公司;YXQ-75G立式壓力蒸汽滅菌器:上海博訊實(shí)業(yè)有限公司;HH-2數(shù)顯電子恒溫水浴鍋:金壇市丹瑞電器廠;universial 32R高速冷凍離心機(jī):華粵企業(yè)集團(tuán)有限公司;CP64C電子天平:上海志榮電子科技有限公司。

1.3 實(shí)驗(yàn)方法

1.3.1 酸菜的制備

本實(shí)驗(yàn)的酸菜樣品均取于采用傳統(tǒng)方法自制的新平酸腌菜。發(fā)酵方法如下:挑選結(jié)實(shí)飽滿,無腐爛及病蟲害的葉用芥菜,將其在通風(fēng)且陽光充足的室外晾曬2 d后,去除老黃葉片并清洗干凈,將其切碎,加輔料,之后按無鹽、有鹽(鹽度10%)分別處理,反復(fù)揉搓,按同等體積比(1∶3)放入5 L的玻璃壇子,每個(gè)鹽濃度32罐,置于室內(nèi)密封常溫發(fā)酵30 d。從第1天開始取樣,之后每隔2 d取樣,進(jìn)行pH、總酸、亞硝酸鹽(nitrite,NIT)含量跟蹤檢測[14-15]。通過理化指標(biāo)的數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析,加之考慮亞硝酸鹽含量影響酸菜的食用安全性,從兩個(gè)鹽濃度腌制的酸菜系列樣品中,于pH值持續(xù)降低,總酸含量持續(xù)快速升高的主發(fā)酵期,分別選取亞硝酸鹽含量上升、頂峰、明顯降低三個(gè)時(shí)間拐點(diǎn)的樣品,進(jìn)行細(xì)菌多樣性分析。

1.3.2 發(fā)酵酸菜的指標(biāo)測定

發(fā)酵酸菜罐的多方位置混合取樣25 g,加250 mL無菌蒸餾水混勻,用研缽研磨成勻漿四層紗布過濾,分別對濾液進(jìn)行測定[16-18]:采用pH計(jì)測定對應(yīng)樣品的pH值;參考GB/T 12456—2016《食品中總酸的測定》對酸菜樣品的總酸進(jìn)行測定;亞硝酸鹽含量測定參照GB 5009.33—2016《食品安全國家標(biāo)準(zhǔn)食品中亞硝酸鹽和硝酸鹽的測定》中的鹽酸萘乙二胺法,采用食品中亞硝酸鹽含量測試盒測定,其標(biāo)準(zhǔn)曲線回歸方程為:y=0.234x+0.000 2,相關(guān)系數(shù)R2=0.999。

1.3.3 細(xì)菌總DNA提取及多樣性分析

選取對應(yīng)指標(biāo)變化明顯的3個(gè)時(shí)間點(diǎn)的無鹽和有鹽(鹽度10%)酸菜樣品各25 g,于250 mL裝有7~8 mm的玻璃珠的無菌水中搖床(180 r/min)振蕩1 h,用滅菌后的紗布進(jìn)行過濾處理,除去其中所含雜質(zhì),放入高速冷凍離心機(jī)之后4 ℃、10 000×g條件下離心5 min收集菌體沉淀,無鹽腌制的酸菜樣品編號為SCL1、SCL2、SCL3(SCL1對應(yīng)亞硝酸鹽含量上升時(shí)間點(diǎn),SCL2對應(yīng)亞硝酸鹽含量高峰點(diǎn),SCL3對應(yīng)亞硝酸鹽含量明顯降低時(shí)間點(diǎn));有鹽(鹽度10%)腌制的酸菜樣品編號為SCG1、SCG2、SCG3(SCG1對應(yīng)亞硝酸鹽含量上升時(shí)間點(diǎn),SCG2對應(yīng)亞硝酸鹽含量高峰點(diǎn),SCG3對應(yīng)亞硝酸鹽含量明顯降低時(shí)間點(diǎn)),冷藏保存。采用16SrRNA基因的V3-V4區(qū)[19-21]引物對338F(5'-ACTCCTACGGGAGGCAGCAG-3'),806R(5'-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3')委托北京諾禾致源科技股份有限公司進(jìn)行樣品DNA提取及Illumina NovaSeq測序平臺進(jìn)行測序,并使用Novomagic V2.0云平臺進(jìn)行多樣性分析。

1.3.4 數(shù)據(jù)處理

理化指標(biāo)數(shù)據(jù)均平行測定3 次,使用SPSS 22.0軟件對數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)處理,所有數(shù)據(jù)以平均值±標(biāo)準(zhǔn)差(xˉ±SD)表示。利用Cutadapt軟件對高通量初始數(shù)據(jù)進(jìn)行處理[22];然后用Usearch軟件和Uchime軟件進(jìn)行序列的質(zhì)量篩選和優(yōu)化[23],得到最終的原始數(shù)據(jù);利用Uparse軟件對所有樣品的有效序列以97%的一致性進(jìn)行操作分類單元(operational taxonomic unit,OTU)聚類[24];用Mothur結(jié)合SILVA的SSUr-RNA數(shù)據(jù)庫進(jìn)行物種注釋分析[25-26],獲得分類學(xué)信息并分別在各個(gè)分類水平統(tǒng)計(jì)各樣本的群落組成;使用Qiime軟件計(jì)算Shannon、Simpson、Chao1、Goods-coverage指數(shù),以及計(jì)算Unifrac距離、構(gòu)建UPGMA樣本聚類樹;使用R軟件繪制稀釋曲線,進(jìn)行Alpha和Beta多樣性指數(shù)組間差異分析以及環(huán)境因子關(guān)聯(lián)分析。

2 結(jié)果與分析

2.1 酸菜基本理化指標(biāo)

如表1所示,無鹽和有鹽(鹽度10%)酸菜樣品理化指標(biāo)變化明顯的起始點(diǎn)和平緩點(diǎn)時(shí)間一致,高峰點(diǎn)出現(xiàn)時(shí)間稍微不同。兩個(gè)鹽濃度處理的酸菜pH 值均介于5~6之間,有一定的變化趨勢,無鹽腌制的酸菜pH 值較有鹽腌制的降低得更快,而有鹽腌制的酸菜pH值起始就比無鹽的低;而無鹽腌制的酸菜總酸含量相對于有鹽腌制增加得更快;酸腌菜屬于發(fā)酵蔬菜制品,其亞硝酸鹽含量應(yīng)符合國標(biāo)限量(以NaNO2計(jì))為20 mg/kg[17-18],無鹽處理組的亞硝酸鹽含量高峰點(diǎn)(20.264 mg/kg)稍微超出國標(biāo)限量,而有鹽(鹽度10%)處理組整個(gè)發(fā)酵期間亞硝酸鹽含量均符合國標(biāo)限量。總酸是酸菜酸味的主要體現(xiàn)者,亞硝酸鹽含量多少影響著酸菜食用安全性,于pH值持續(xù)降低,總酸含量持續(xù)快速升高的主發(fā)酵期,分別選取亞硝酸鹽含量上升、頂峰、明顯降低三個(gè)時(shí)間拐點(diǎn)的樣品對后續(xù)分析其細(xì)菌多樣性具有重要意義。

表1 無鹽與有鹽腌制酸菜的理化性質(zhì)Table 1 Physical and chemical properties of salt-free and salt-treated pickle

2.2 細(xì)菌多樣性

2.2.1 樣本16S rRNA基因序列質(zhì)量評估

稀釋曲線可直接反映測序數(shù)據(jù)量的合理性,并間接反映樣本中物種的豐富程度[25-27]。如圖1所示,稀釋曲線在序列數(shù)達(dá)到30 000條左右后趨向平坦,再增加測序量對于發(fā)現(xiàn)新物種的邊際貢獻(xiàn)很小。說明測序數(shù)據(jù)量合理,所含菌種數(shù)較多,現(xiàn)有測序量已經(jīng)可以反映樣品中細(xì)菌豐度信息。

圖1 酸菜樣品的細(xì)菌稀釋曲線圖Fig.1 Rarefaction curves for bacteria in pickle samples

2.2.2 Alpha多樣性分析

Alpha多樣性用于分析樣品內(nèi)部微生物群落的物種豐富度[27]。對Illumina NovaSeq 測序得到的下機(jī)數(shù)據(jù)(Raw PE)進(jìn)行拼接和質(zhì)控,得到Clean Tags,再進(jìn)行嵌合體過濾,得到可用于后續(xù)分析的有效數(shù)據(jù)(Effective Tags)。對所有樣品的Effective Tags進(jìn)行聚類,以97%的一致性將序列聚類成為操作分類單元(operational taxonomic units,OTU),基于OTU對6個(gè)酸菜樣品中細(xì)菌的Alpha多樣性進(jìn)行分析評估,其中Shannon指數(shù)反映樣本的各物種均勻度,指數(shù)越高,物種分布越均勻;Simpson指數(shù)反映物種的多樣性,指數(shù)越小,多樣性越高;Chao1指數(shù)常用來估計(jì)物種總數(shù),反映物種豐富度。Alpha多樣性指數(shù)結(jié)果見表2。

表2 酸菜樣品中細(xì)菌Alpha多樣性Table 2 Alpha diversity of bacteria in pickle samples

由表2可知,共獲得細(xì)菌群落3 界、22 門、36 綱、87目、166 科、339屬,902個(gè)OTU。通過高通量測序,從6個(gè)酸菜樣本中共獲得397 292條有效序列,其中SCL3獲得的OTU數(shù)最多,SCG3獲得的OTU數(shù)最少,而SCG1獲得的OTU數(shù)高于SCL1,SCL2和SCL3獲得的OTU數(shù)則相對高于SCG2和SCG3;無鹽腌制組的樣品發(fā)酵后期均勻度高,而有鹽腌制均勻度相對變化不大,且無鹽腌制組的均勻度高于有鹽腌制組;無鹽和有鹽(鹽度10%)腌制的樣品發(fā)酵前期物種多樣性均高于后期,且有鹽(鹽度10%)腌制組的物種多樣性均高于無鹽腌制組;無鹽腌制組的樣品發(fā)酵后期物種豐富度高,有鹽(鹽度10%)腌制組的樣品發(fā)酵前期物種豐富度高,且SCG1物種豐富度高于SCL1,SCL3物種豐富度最高,SCG3物種豐富度最低。說明鹽分的存在會抑制某些細(xì)菌,從而導(dǎo)致物種豐富度降低。所有樣品的覆蓋率(Coverage)指數(shù)均>0.9,說明樣品文庫中序列的覆蓋率高,可反映樣品測序的真實(shí)情況。

2.2.3 Venn圖分析

Venn 圖分析可以展示多樣品(或分組)共有和各自特有OTU數(shù)目,直觀的表現(xiàn)環(huán)境樣本間(或分組)的組成相似性及重疊情況[27-28],基于OTU的花瓣圖和Venn圖結(jié)果見圖2。由圖2a可知,6個(gè)酸菜樣品共產(chǎn)生了902個(gè)OTU,6個(gè)酸菜樣品共同擁有的OTU數(shù)達(dá)152個(gè),約占各樣品OTU數(shù)量的28.82%~33.19%,說明各樣品間有較多相似物種,而各樣品又含獨(dú)有OTU,SCL3獨(dú)有OTU數(shù)量最多,達(dá)100個(gè),SCG3最少,只有22個(gè)。由圖2b可知,無鹽處理的酸菜樣品與有鹽處理組共有的OTU數(shù)達(dá)487個(gè),約占總數(shù)的54.00%,說明兩組酸菜樣品微生物群落組成結(jié)構(gòu)相似,而無鹽處理組獨(dú)有的OTU數(shù)262個(gè),有鹽處理組獨(dú)有OTU數(shù)133個(gè),說明加鹽壞境會造成獨(dú)特的微生物群落。

圖2 基于OTU的花瓣圖(a)和Venn圖(b)Fig.2 Petal graph (a) and Venn graph (b) based on OTU

2.2.4 酸菜樣品的優(yōu)勢菌群分析

如圖3a所示,酸菜樣品中細(xì)菌群落在門分類水平上具有較高的多樣性,其中平均相對豐度占比排名前10的依次為變形菌門(Proteobacteria,57.46%)、藍(lán)細(xì)菌門(Cyanobacteria,29.70%)、厚壁菌門(Firmicutes,10.27%)、擬桿菌門(Bacteroidetes,1.56%)、放線細(xì)菌門(Actinobacteria,0.54%)、酸桿菌門(Acidobacteria,0.38%)、梭桿菌門(Fusobacteria,0.13%)、綠彎菌門(Chloroflexi,0.03%)、疣微菌門(Verrucomicrobia,0.02%)、硝化螺旋菌門(Nitrospirae,0.01%)。本實(shí)驗(yàn)自定義相對豐度>10%的為優(yōu)勢菌群。據(jù)此,變形菌門占絕對優(yōu)勢,相對豐度占各樣品比例為44.39%~79.05%,由低到高依次為SCG1、SCG2、SCL2、SCG3、SCL3、SCL1。說明在門水平下,兩個(gè)鹽濃度處理的酸菜樣品中細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)組成相近,僅組成比例存在一定差異。

如圖3b所示,在屬水平下,6個(gè)酸菜樣品共檢測出339個(gè)細(xì)菌屬,相對豐度前10的物種分別是未分類的藍(lán)細(xì)菌屬(unidentified-Cyanobacteria,30.02%)、水桿菌屬(Aquabacterium,17.65%)、未分類的根瘤菌屬(unidentified-Rhizobiaceae,11.44%)、未分類的立克氏體屬(unidentified-Rickettsiales,2.41%)、明串珠菌屬(Leuconostoc,19.56%)、代爾夫特菌屬(Delftia,6.34%)、假單胞菌屬(Pseudomonas,3.06%)、甲基桿菌屬(Methylobacterium,2.44%)、假紅育菌屬(Pseudorhod oferax,3.19%)、魏斯氏菌屬(Weissella,1.16%)。本實(shí)驗(yàn)定義相對豐度>10%的為優(yōu)勢菌群。其中無鹽腌制組的優(yōu)勢細(xì)菌屬為未分類的藍(lán)細(xì)菌屬、明串珠菌屬、水桿菌屬、未分類的根瘤菌屬,分別占15.13%、16.17%、21.05%、14.26%;有鹽腌制組的優(yōu)勢細(xì)菌屬為未分類的藍(lán)細(xì)菌屬、水桿菌屬、明串珠菌屬,分別占46.20%、14.25%、11.62%。說明在屬水平下兩個(gè)鹽濃度腌制的酸菜樣品中細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和組成比例存在差異,鹽分的存在會抑制某些細(xì)菌屬。

圖3 酸菜樣品在門(a)和屬(b)分類水平的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)構(gòu)成Fig.3 Bacterial community structure at phylum (a) and genus (b) level in pickle samples

2.3 組間群落差異分析

2.3.1 UPGMA分析

為了研究不同樣本間的相似性,還可以通過對樣本進(jìn)行聚類分析,構(gòu)建樣本的聚類樹。在環(huán)境生物學(xué)中,非加權(quán)組平均法(unweighted pair-group method with arithmetic mean,UPGMA)是一種較為常用的聚類分析方法[28-29]。由圖4a可知,在不同時(shí)考察物種有無及豐度時(shí),有鹽處理組SCG1和SCG2細(xì)菌物種相似,SCG3細(xì)菌物種類型相似性相對發(fā)生了變化,說明有鹽(鹽度10%)腌制會影響發(fā)酵后期的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu);無鹽處理組的三個(gè)樣品細(xì)菌物種類型均在發(fā)生改變,說明無鹽處理細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)變化更明顯。由圖4b可知,在同時(shí)考察物種數(shù)量和豐度時(shí),無鹽腌制組與有鹽(鹽度10%)腌制組的樣品能各自聚為一類,無鹽腌制組內(nèi)SCL2和SCL3聚為一類,有鹽(鹽度10%)腌制組內(nèi)SCG1和SCG2聚為一類,但樣品物種類型及豐度依然有差異。說明鹽分的存在會明顯影響細(xì)菌群落的差異,且在發(fā)酵后期會抑制某些細(xì)菌物種。

圖4 酸菜樣品非加權(quán)組(a)與加權(quán)組(b)的UPGMA聚類樹Fig.4 UPGMA cluster tree of unweighted group (a) and weighted group (b) in pickle samples

2.3.2 Anosim分析

Anosim分析[26]是一種非參數(shù)檢驗(yàn),用來檢驗(yàn)組間的差異是否顯著大于組內(nèi)差異,從而判斷分組是否有意義。基于Bray-Curtis距離值的秩次進(jìn)行組間差異顯著性檢驗(yàn),對Anosim的分析結(jié)果,基于兩兩樣本之間的距離值排序獲得的秩(組間的為between,組內(nèi)的為within),這樣任一兩兩組的比較可以獲得三個(gè)分類的數(shù)據(jù),并進(jìn)行箱線圖的展示(若兩個(gè)箱的凹槽互不重疊,則表明它們的中位數(shù)有顯著差異),結(jié)果見圖5。

圖5 Anosim組間差異分析Fig.5 Difference analysis of Anosim group

結(jié)果表明,無鹽組和有鹽(鹽度10%)組細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)差異顯著(P<0.05),且R值為0.852>0,統(tǒng)計(jì)分析有意義。由圖5可知,無鹽腌制組與有鹽腌制組各自組內(nèi)和相互比較的箱圖有凹槽且互不重疊,說明鹽分的有無會影響細(xì)菌群落結(jié)構(gòu),導(dǎo)致的差異顯著(P<0.05)。

2.4 組間差異物種分析

2.4.1 物種豐度聚類熱圖分析

根據(jù)OTU的豐度數(shù)據(jù),選取豐度排名前35的屬,從物種和樣本兩個(gè)層面進(jìn)行聚類,繪制成熱圖,并根據(jù)顏色梯度反映不同樣品中細(xì)菌群落相似性、差異性及物種聚類關(guān)系[26-27]。由圖6可知,每份樣品均含有相對于其他樣品含量更高的菌屬,且各個(gè)樣品中優(yōu)勢菌屬各不相同。無鹽處理組中SCL3中優(yōu)勢細(xì)菌屬最多,且三個(gè)樣品是隨時(shí)間的變化而變化;鹽度10%處理組中三個(gè)樣品中優(yōu)勢細(xì)菌屬數(shù)目相似,種類卻相對于無鹽處理組要少,說明加鹽處理會導(dǎo)致酸菜中的優(yōu)勢細(xì)菌屬產(chǎn)生明顯組成差異。

圖6 酸菜樣品屬水平物種豐度聚類熱圖Fig.6 Heat map of species richness of pickle samples at the genus level

2.4.2 組間差異物種檢驗(yàn)

LEfSe(linear discriminant analysis Effect Size)法適合物種豐度差異檢驗(yàn),LDA值豐度柱狀圖可清楚展示不同組中豐度差異的物種,柱狀圖的長度代表差異物種的影響大小[22-23]。由圖7可知,有鹽(鹽度10%)腌制組的酸菜樣品中,硫堿螺旋菌屬(Thioalkalispira)、unidentified-Rickettsiales、unidentified-Cyanobacteria等菌群具有特異性;無鹽腌制組SCL樣品中,代爾夫特菌屬(Delftia)、甲基桿菌屬(Methylobacterium)具有特異性。說明鹽分會造成菌群的相對豐度差異,導(dǎo)致差異的細(xì)菌物種可能更利于產(chǎn)品風(fēng)味。

圖7 有鹽與無鹽樣品細(xì)菌菌群LEfSe法比較分析Fig.7 Comparison and analysis of the bacterial flora of saline and non-saline samples by LEfSe method

2.5 樣品理化指標(biāo)與微生物菌群相關(guān)性分析

典型相關(guān)分析(canonical correlation analysis,CCA)主要反映菌群與理化指標(biāo)之間的關(guān)系,可以檢測樣品理化指標(biāo)與菌群之間的關(guān)系,可得到影響樣品群落分布的重要理化指標(biāo)[28-30]。在細(xì)菌屬水平下分析6個(gè)酸菜樣品與pH值、總酸值(total acid number,TAN)、亞硝酸鹽(NIT)的相關(guān)性,結(jié)果見圖8。

圖8 樣品與環(huán)境因子間典型相關(guān)分析散點(diǎn)圖Fig.8 Scatter plot of canonical correlation analysis between samples and environmental factors

由圖8可知,排序軸CCA1貢獻(xiàn)率80.02%,排序軸CCA2貢獻(xiàn)率為13.23%。箭頭連線的長度代表某個(gè)理化指標(biāo)與群落分布和種類分布之間相關(guān)程度的大小,箭頭越長,說明相關(guān)性越大,反之越小。由此可知,理化指標(biāo)與群落分布的相關(guān)性大小依次為TAN、NIT、pH值,理化指標(biāo)之間的夾角代表兩個(gè)理化指標(biāo)之間相關(guān)關(guān)系,pH與NIT、TAN與NIT之間的夾角為銳角,相互呈正相關(guān)關(guān)系,pH與TAN之間的夾角為鈍角,呈負(fù)相關(guān)。由表3可知,理化因子對物種分布影響顯著相關(guān)的為TAN(P<0.05),說明三個(gè)理化因子均會影響酸菜菌群變化,且總酸值對細(xì)菌物種影響顯著。

表3 樣品與環(huán)境因子間典型相關(guān)分析結(jié)果Table 3 Results of canonical correlation analysis between samples and environmental factors

3 結(jié)論

以無鹽、有鹽(鹽度10%)兩個(gè)鹽濃度處理的6個(gè)對應(yīng)指標(biāo)變化關(guān)鍵點(diǎn)的新平酸腌菜為研究對象,通過Illumina NovaSeq測序分析酸菜樣品中細(xì)菌多樣性,結(jié)果表明,有鹽處理組的三個(gè)酸菜樣品較無鹽處理組均具有較高的細(xì)菌多樣性;在門水平下各酸菜樣品菌群結(jié)構(gòu)組成相似,變形菌門占主導(dǎo)地位;屬水平下各酸菜樣品中共有相對豐度較高的菌屬為未分類的藍(lán)細(xì)菌屬(unidentified-Cyanobacteria),水生桿菌屬(Aquabacterium),明串珠菌屬(Leuconostoc);兩個(gè)鹽濃度腌制的酸菜樣品優(yōu)勢細(xì)菌屬各有差異,例如有鹽腌制的酸菜樣品中乳酸桿菌屬(Lactobacillus)等發(fā)酵相關(guān)菌屬更占優(yōu)勢;且有鹽腌制組的特異菌屬較無鹽腌制組多;理化指標(biāo)對菌群分布影響大小順序依次為總酸值>亞硝酸鹽含量>pH值。本研究系統(tǒng)解析無鹽、有鹽兩個(gè)鹽濃度腌制下新平酸腌菜中細(xì)菌結(jié)構(gòu)差異,發(fā)現(xiàn)鹽分會造成細(xì)菌物種差異,后續(xù)發(fā)酵過程中鹽分的存在會引起某些特異細(xì)菌物種的繁盛從而導(dǎo)致其他一些細(xì)菌物種的消減,進(jìn)而影響酸菜的風(fēng)味口感與貯存時(shí)間。

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