曾婭莉,李明珍,蒲 琴,蔣正方,周 云,鄧建軍,蔣 奕,張 旭,楊 潔,陳孝剛,馬 驥
四川綿陽四0四醫院檢驗科,綿陽四川 621000
提高新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)患者的檢出率,積極檢出感染者,隔離傳染源,切斷傳播途徑是其最重要的防治措施[1-2]。 根據診療方案,采用實時熒光定量逆轉錄聚合酶鏈反應(qRT-PCR)檢測新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)核酸水平是COVID-19的實驗室確診方法,也用于判斷COVID-19患者是否可以出院。qRT-PCR技術被廣泛地應用,但其結果受標本影響大,其對COVID-19的檢出率不夠理想,給COVID-19的診治帶來很大困擾。SARS-CoV-2 IgM抗體是《新型冠狀病毒肺炎診療方案(試行第七版)》中的一般實驗室血清學檢測項目,它檢出率高,所測標本為血液,容易采集,技術要求比qRT-PCR低,目前已在臨床推廣并使用。本課題組連續3 d采集本院收治的15例確診COVID-19患者的血液、晨痰、咽拭子、唾液及晨尿5種標本;qRT-PCR檢測上述5種標本的SARS-CoV-2核酸水平;同時連續3 d檢測患者血漿SARS-CoV-2 IgM抗體;然后對以上試驗結果進行了分析,旨在提高COVID-19的檢出率,減少漏診或誤診。
1.1一般資料 將于本院治療的確診COVID-19患者15例納入研究作為患者組,診斷標準為《新型冠狀病毒感染的肺炎診療方案(試行第五版)》[3]。患者1號是危重性, 2號是重型,3~15號為普通型,住院時間1~15 d。另外,將排除其他疾病的體檢健康者15例納入研究作為對照組。
1.2儀器與試劑 EXDAN/RNA核酸提取試劑購自蘇州天隆生物科技有限公司;qRT-PCR法檢測SARS-CoV-2核酸的試劑盒有兩種,分別為上海之江生物科技股份有限公司的產品(以下簡稱之江試劑)和圣湘生物科技股份有限公司的產品(以下簡稱圣湘試劑);膠體金法檢測SARS-CoV-2 IgM抗體的試劑盒為珠海麗珠試劑股份有限公司產品。采用的實時熒光定量PCR儀為美國ABI公司的ABI7500Fast型和上海宏石醫療科技有限公司的SLAN-96P型。用天隆PANA9600S全自動核酸工作站(西安天隆科技有限公司產品)進行核酸提取操作。
1.3方法
1.3.1標本的采集 連續3 d,每天早晨7:00-8:00采集5種標本。血液標本:取患者空腹全血2~3 mL于乙二胺四乙酸(EDTA)抗凝管。 痰液標本:患者漱口后取晨痰于滅菌杯。 咽拭子標本:無菌拭子在患者雙咽側扁桃體及咽后壁擦拭3次,然后留取標本于病毒保存管。 尿液標本:取患者晨尿10 mL于一次性尿液采樣管。 唾液標本:患者晨起漱口,翹舌,取1~2 mL唾液于滅菌杯。以上標本均在2 h內送檢。
1.3.2qRT-PCR法測SARS-CoV-2核酸水平 (1)試劑準備:嚴格按照試劑盒說明書進行操作。(2)標本前處理:血漿,4 000 r/min離心10 min,分離血漿備用;痰液,56 ℃滅活40 min,加入1∶1或1∶2的病毒保存液,充分振蕩直至呈液滴狀,取上述液體500 μL, 3 500 r/min離心3 min,留取上清液備用;咽拭子,56 ℃滅活40 min,充分振蕩混勻后,吸取800 μL標本,12 000 r/min離心5 min,去除上清液500 μL,振蕩混勻下層液體備用;尿液,取5 mL,56 ℃滅活40 min,4 000 r/min離心5 min,去除上清液,留取下層尿液300 μL,加入1 mL生理鹽水混勻,12 000 r/min離心5 min,去除上清液,留取下層液體約300 μL備用;唾液,56 ℃滅活40 min,加入1∶1的病毒保存液,充分振蕩直至呈液滴狀備用。(3)提取核酸:吸取上述處理好的標本300 μL于1.5 mL離心管中,用天隆PANA9600S全自動核酸工作站提取核酸。(4)加樣:圣湘試劑,吸取20 μL待測核酸加入30 μL PCR-混合液的擴增管中,蓋上管蓋,振蕩混勻,瞬時離心,準備上機擴增;之江試劑,吸取5 μL核酸加入20 μL PCR-混合液的擴增管中,蓋上管蓋,振蕩混勻,瞬時離心,準備上機擴增。(5)PCR擴增:按圣湘試劑說明書設置擴增條件,選擇VIC 通道檢測內標物,選擇FAM通道檢測ORF-1ab閱讀框,ROX通道檢測N基因;50 ℃ 30 min,95 ℃ 1 min,95 ℃ 15 s,60 ℃ 30 s,循環數45;25 ℃ 10 s;運行反應。按之江試劑說明書設置擴增條件,選擇CY5通道檢測內標物,選擇FAM通道檢測ORF-1ab閱讀框,VIC通道檢測N基因,TEXAS RED通道檢測E基因;45 ℃ 10 min,95 ℃ 3 min;95 ℃ 15 s,58 ℃ 30 s,循環數45;40 ℃,10 s;運行反應。(6)結果判斷:圣湘試劑,FAM 和ROX通道檢測到典型的S型擴增曲線且Ct≤40的標本為SARS-CoV-2陽性, Ct>40的標本為SARS-CoV-2陰性;上海之江試劑,FAM、VIC、TEXAS RED通道檢測到典型的S型擴增曲線且Ct≤43的標本為SARS-CoV-2陽性,Ct>43或無數值的標本為SARS-CoV-2陰性。若患者某一種標本的核酸檢測陽性次數≥1,則判定該患者可被這種標本的SARS-CoV-2核酸檢測檢出。某一種標本的核酸陽性檢出率=該標本的核酸陽性例數/確診COVID-19患者例數×100%。
1.3.3膠體金法檢測血漿SARS-CoV-2 IgM抗體 平衡試劑盒至室溫,采集2~3 mL全血于EDTA抗凝試管,4 000 r/min,離心10 min,分離血漿。生物安全柜內取血漿10 μL滴于加樣孔,滴加2~3滴標本稀釋液,室溫放置15 min,肉眼觀察結果。質控線和檢測線同時出現即可判為結果陽性;僅出現一條質控線,不出現檢測線,則結果為陰性。患者血清IgM抗體檢測結果≥1次陽性,判定該患者SARS-CoV-2 IgM抗體陽性。IgM抗體陽性檢出率=IgM抗體陽性例數/確診COVID-19患者例數×100%。
1.4統計學處理 使用Excel和SPSS23.0軟件進行計算和統計分析,計數資料以頻數或百分率表示,組間比較采用χ2檢驗,P<0.05為差異有統計學意義。
2.1患者1次檢測5種標本的SARS-CoV-2核酸陽性檢出率 1次檢測5種標本對患者SARS-CoV-2核酸的陽性檢出率:痰46.66%,咽拭子40.00%,血液13.33%,唾液33.33%,晨尿0,除晨尿外COVID-19患者的痰、咽拭子、唾液和血液標本均可檢出SARS-CoV-2核酸,痰標本的陽性檢出率最高,血液標本最低。1次采集1號重型和2號危重型患者的5種標本的SARS-CoV-2核酸陽性檢出率均為80.00%,普通型患者為20.00%或0,見表1。危重型或重型患者標本的SARS-CoV-2核酸陽性檢出率高于普通型患者(P<0.05)。

表1 1次采集15例COVID-19患者的5種標本的SARS-CoV-2核酸檢測情況
2.2患者1次檢測SARS-CoV-2 IgM抗體的陽性率 對照組血漿SARS-CoV-2 IgM抗體的陽性率為0,患者組陽性率為93.33%,兩組間陽性率比較差異有統計學意義(P<0.01),見表2。

表2 兩組人群1次檢測血漿SARS-CoV-2 IgM抗體的結果[n(%),n=15]
2.3連續3次檢測的陽性檢出率 連續3次(每天1次)采集5種標本進行SARS-CoV-2核酸檢測,各標本的SARS-CoV-2核酸陽性檢出率:痰80.00%,咽拭子66.66%,血液13.33%,唾液60.00%,晨尿0。痰、咽拭子和唾液的SARS-CoV-2核酸陽性檢出率均較1次檢測提高。連續3次與1次檢測確診患者的血漿SARS-CoV-2 IgM抗體陽性率相同,除9號患者外,其余患者均檢測出IgM抗體,陽性率93.33%(14/15),見表3。SARS-CoV-2 IgM抗體陽性檢出率高于SARS-CoV-2核酸陽性檢出率(P<0.05)。9號患者SARS-CoV-2 IgM抗體呈陰性,但該患者痰標本SARS-CoV-2核酸陽性。若SARS-CoV-2核酸與IgM檢測聯合,多次多部分采集SARS-CoV-2核酸標本,15例COVID-19患者的檢出率為100.00%,高于兩種方法單獨使用(P<0.05)。

表3 COVID-19患者連續3次檢測IgM抗體和5種標本SARS-CoV-2核酸的情況
COVID-19的實驗室特異性檢測方法主要有兩種,一種是SARS-CoV-2核酸檢測,另一種是SARS-CoV-2 IgM抗體檢測[5]。核酸檢測具有特異性強、靈敏度高,感染早期即可檢出,無窗口期等優點[6], 因此核酸結果對COVID-19的診斷和療效判斷至關重要[4-5]。但SARS-CoV-2核酸檢測結果受標本采集影響大,容易出現假陰性,而且目前實驗室對檢測標本的類型要求不統一,有痰、咽拭子、鼻咽拭子、糞便或血液等標本類型,標本類型對核酸檢測結果的影響尚不清楚。SARS-CoV-2 IgM抗體是SARS-CoV-2感染的早期指標,當患者感染SARS-CoV-2的 3~5 d后可出現IgM抗體[7]。SARS-CoV-2 IgM抗體檢測的優點是方便、快捷,標本容易采集,結果相對穩定,陽性率高,但IgM抗體產生有窗口期,易受其他免疫性疾病的干擾。本研究選取了15例確診COVID-19患者,同時采集了患者的5種標本,1次和連續3次檢測患者的SARS-CoV-2核酸、SARS-CoV-2 IgM抗體,分析了不同標本、檢測次數對核酸檢測結果的影響,比較了兩種方法對COVID-19患者的檢出效果,探討了提高COVID-19實驗室檢出率的方法。
本研究中,1次檢測患者5種標本SARS-CoV-2核酸的檢出率均小于50%。患者5種標本的SARS-CoV-2核酸檢測陽性檢出率由高到低依次為痰、咽拭子、唾液、血漿、晨尿,其中痰標本的陽性檢出率最高。因此,如果沒有肺泡灌洗液,COVID-19患者核酸檢測標本應優先選用深部痰液,這與COVID-19相關診療方案推薦的核酸檢測標本一致[7-8]。15例COVID-19患者中,僅危重型與重型患者的血漿標本檢出SARS-CoV-2核酸,普通型患者的血液標本未檢出,可見血液標本用于核酸檢測僅適用于重型或危重型患者。另外,本研究檢測到患者唾液標本SARS-CoV-2核酸陽性,說明SARS-CoV-2可通過飛沫進行傳播。
SARS-CoV-2IgM抗體檢測的陽性率高,特異性強,但IgM抗體是疾病感染的早期指標,有窗口期,在體內時間短,容易消失,容易被其他免疫性疾病干擾[9-11]。本研究僅1例患者未檢出SARS-CoV-2IgM抗體,經調查該患者為發病時間2d的老年患者。本研究的15例COVID-19患者的SARS-CoV-2IgM抗體陽性檢出率高達93.33%,明顯高于SARS-CoV-2核酸的陽性檢出率。連續3次檢測患者SARS-CoV-2IgM抗體陽性率無變化,結果穩定。若只以SARS-CoV-2IgM抗體作為COVID-19的篩查指標,會發生漏檢的風險,或因其他免疫疾病的干擾而出現假陽性。連續3次取患者5種標本檢測SARS-CoV-2核酸,痰、咽拭子和唾液標本的陽性檢出率明顯提高,但仍有漏檢的情況。本研究中,連續3次采集5種標本檢測SARS-CoV-2核酸的同時檢測患者血漿SARS-CoV-2IgM抗體,對COVID-19患者的檢出率能達到100.00%。因此,多次多部位采集標本,兩種方法聯合檢測用于COVID-19診斷的效果最佳。
綜上所述,如無法采集肺部灌洗液,檢測SARS-CoV-2核酸的最佳標本為患者深部的痰液,咽拭子和唾液標本作為補充,血液標本僅適用于重型或危重型患者。多次多部位采樣患者標本進行SARS-CoV-2核酸檢測,聯合SARS-CoV-2 IgM抗體檢測,可大大降低COVID-19患者漏檢率。