鼠傷寒沙門菌sRNA GcvB與靶基因的作用機理分析

潘 永，楊 陽，段世宇，楊 琦,3*

(1.貴州大學 動物科學學院，貴州 貴陽 550025；2.貴州大學 動物疫病研究所，貴州 貴陽 550025；3.貴州省動物疫病與獸醫公共衛生重點實驗室，貴州 貴陽 550025)

sRNA(small RNA)是長度為40～500 nt的主要調控基因轉錄后表達的短非編碼RNA，在原核生物中廣泛存在，此前相關研究主要集中于大腸桿菌和沙門菌[1]。多項研究結果表明，sRNA調控著多種基因，這些基因編碼與細菌生理、代謝、應激反應和群體感應等有關過程中涉及的蛋白質[2-5]。許多sRNA能夠調節多種靶mRNA，一種靶mRNA可受多個sRNA調節，從而形成了一個基于sRNA的復雜網絡，體現了它們在基因轉錄后調控中的重要作用。sRNA降低了細菌代謝所消耗的能量并提供了更緊密，更快速的基因調節，可幫助細菌適應新環境。sRNA GcvB是一段僅有206個核苷酸組成的短非編碼RNA分子，在細菌中比較保守，大腸桿菌和沙門菌gcvB基因RNA序列相似度高達95%。研究表明，GcvB主要調控沙門菌ABC轉運蛋白的表達[6]。GcvB通過3個特殊保守單鏈核苷酸序列R1、R2或R3與靶mRNA對應序列完全或部分堿基互補配對，從而抑制或促進mRNA的翻譯[7-9]。此前，僅探明GcvB直接調控30余種mRNA，相信還有大量GcvB靶基因未被挖掘。MIYAKOSHI等[10]最近在研究與鼠傷寒沙門菌(Salmonellatyphimurium LT2，STM LT2)sRNA GcvB產生拮抗作用的mRNA 海綿SroC時，通過微陣列分析篩選到部分受GcvB調控的基因，但這些基因是否受GcvB直接調控目前尚未驗證。

研究表明，GcvB在細菌對數期早期表達量最高，隨著生長周期往后的推移，表達量水平下降直至穩定期幾乎檢測不到，因此本研究僅分析各基因轉錄水平在STM LT2對數早期時的變化[11]。……