郜慶祖,陳亦揚,狄文玉,于 建,李勁松,尚 杰,張景航,趙衛星,蘇 蔚
結腸癌是最常見的惡性腫瘤之一,每年發病人數占所有惡性腫瘤的10%,其發病率在男性和女性惡性腫瘤中分別位列第三位和第二位。結腸癌患者5年生存率約為60%,生存時間在很大程度上取決于組織學分期,Ⅰ、Ⅱ期的生存率高于Ⅲ、Ⅳ期,伴有淋巴結或遠處轉移的患者生存率則急劇下降。為更好地控制結腸癌,延長患者的生存時間,有必要進一步探索結腸癌轉移的分子機制。該研究通過在線生物信息學網GEPIA分析了TCGA數據庫中結腸癌與正常結腸組織中差異表達的基因,從中篩選出在癌中表達升高的基因——E26轉錄因子變異體4(E26 transformation-specific variant 4,ETV4),并通過生物信息學網R2分析了GEO數據庫中結腸癌和正常組織中ETV4的表達情況和其相關基因。
ETV4是多瘤病毒增強子激活劑3(polyomavirus enhancer activator 3,PEA3)亞家族成員,在生理和病理過程中都起著重要作用。有研究發現,ETV4與肺癌不良預后有關。在卵巢癌細胞中PEA3過表達能夠促進癌細胞的侵襲能力。然而,ETV4在結腸癌中的生物學作用尚不完全清楚。該研究旨在通過觀察ETV4在結腸癌組織及細胞系中的表達情況及其生物學功能,探究其影響結腸癌轉移的分子機制。
1.1 材料
1.1.1
結腸癌組織標本 收集2015年1月—2018年12月新鄉醫學院第一附屬醫院病理科存檔的結腸腺癌石蠟包埋的標本,包括原發癌標本(n
=62)和配對的癌旁組織(距離腫瘤邊緣5 cm以內的正常組織),所有患者術前均未接受過放療或化療。病理診斷均由2位副高級以上病理醫師獨立閱片確診。病理分期采用TNM分期。該研究獲得新鄉醫學院第一附屬醫院倫理委員會批準。1.1.2
主要試劑與儀器 TRIzol和去基因組逆轉錄試劑盒(日本TAKARA公司);RPMI1640培養基和胎牛血清(美國Gibco公司);Transwell小室(孔徑8 μm)和基質膠(美國Corning公司);免疫組化相關試劑及試劑盒(北京中杉金橋生物技術有限公司);Lipofectamine 3000試劑(美國Invitrogen公司);ETV4一抗(美國Abcam公司);MMP7一抗(美國Proteintech公司);細胞裂解液、蛋白定量試劑盒、α-Tubulin一抗和過氧化物酶標記的山羊抗兔二抗(江蘇碧云天生物所);靶向ETV4小干擾RNA(si-ETV4)、靶向MMP7小干擾RNA(si-MMP7)、陰性對照siRNA(si-NC)和ETV4過表達(ETV4-OE)(上海吉瑪公司)。BX53顯微鏡(日本Olympus 公司);RTQ-960 Pro實時熒光定時PCR系統(杭州艾康生物技術有限公司);蛋白電泳電轉系統(美國Bio-Rad公司);Azure3000成像儀(美國Azure公司)。1.1.3
細胞 人結腸癌細胞系(HCT116、LS174T、SW480、LOVO、SW620和RKO細胞)以及人永生化結腸上皮細胞(FHC)購自美國ATCC細胞庫,所有細胞使用含10%胎牛血清的RPMI 1640培養基,在37 ℃、含5% CO的溫濕培養箱中培養。以上所有細胞系均已通過專業STR分析鑒定,支原體污染陰性。1.2 方法
1.2.1
生物信息學分析 通過生物信息網GEPIA(http://gepia.cancer-pku.cn/)分析了結腸腺癌(275例)和正常結腸組織(349例)中的差異表達基因。利用生物信息網R2(http://r2.amc.nl)在線預測了ETV4在結腸癌患者和正常結腸組織中的表達及其相關基因。1.2.2
免疫組織化學檢測ETV4在組織中的表達 采用免疫組化Envision二步法檢測石蠟包埋直結腸癌組織及癌旁組織中ETV4蛋白表達。ETV4陽性定位于細胞核,表達強度采用半定量法,根據染色的強度和陽性細胞所占的比例進行評分:A:根據染色強度分為0分(不著色),1分(淺黃色),2分(黃色),3分(棕黃色);B:根據陽性細胞比例分為1分(陽性細胞<1/3),2分(陽性細胞占1/3~2/3),3分(陽性細胞>2/3)。兩種評分的乘積包括0、1、2、3、4、6和9,將乘積≤3定義為低表達,乘積≥4定義為高表達。1.2.3
細胞轉染 按照實驗設計和轉染試劑說明書步驟,用Lipofectamine 3000試劑分別將si-ETV4、si-MMP7、si-NC和ETV4-OE轉染入LOVO細胞。簡要過程為,取對數生長期LOVO細胞再次接種在6孔板中,待細胞匯合度達60%~80%時進行轉染;并在轉染前20 min換用無血清培養液;然后分別將Lipofectamine 3000和上述質粒混合均勻的混合物滴加入細胞,繼續用無血清培養液培養6 h后將培養液換成含10%胎牛血清的培養基繼續培養48 h。收集細胞,用于后續實驗。1.2.4
RT-qPCR 使用TRIzol試劑從培養細胞中提取總RNA。使用去基因組逆轉錄試劑盒從1 μg RNA中合成互補DNA(cDNA),實時定量PCR(q-PCR)使用TB Green試劑進行,GAPDH作為內參。反應條件為94 ℃ 20 s,58 ℃ 20 s,72 ℃ 34 s,循環數40。使用2方法計算目的基因的相對表達量。每個樣本設3個復孔。引物序列ETV4:F:5′-GCTCGCTGAAGCTCAGGT-3′;R:5′-TCCTTCTTGATC CTGGTGGT-3′。1.2.5
Transwell侵襲實驗檢測細胞侵襲 預先用基質膠包被Transwell小室的底膜并放入24孔Transwell專用板中。將轉染后的細胞分散在300 μl無血清的培養基中并加入小室內;向小室下部的孔中加入700 μl含20% FBS的培養基。孵育48 h后,將穿出到膜下表面的細胞用甲醇固定,Giemsa染色,并在顯微鏡下拍照,在光學顯微鏡下以×400放大倍數計數細胞。實驗至少重復3次。1.2.6
Western blot實驗 用細胞裂解液提取上述收集的細胞的蛋白,蛋白經定量后,取等量蛋白進行十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳,然后將電泳分離蛋白轉移至硝酸纖維素膜上,用5%脫脂牛奶封閉1 h。分別在ETV4(1 ∶1 000稀釋)、MMP7(1 ∶2 000稀釋)或α-Tubulin(1 ∶10 000稀釋)一抗反應液中4 ℃孵育過夜。洗膜后,將膜在1 ∶1 000稀釋的過氧化物酶標記的山羊抗兔二抗反應液孵育1 h。再次洗膜后,通過ECL化學發光顯像,使用Azure 3000成像儀進行掃描目的條帶光密度值。
2.1 ETV4在結腸癌組織及細胞系中表達顯著升高
通過生物信息網GEPIA比較了結腸腺癌(n
=275)與正常組織(n
=349)中的差異基因,發現在結腸腺癌中表達升高的前10位基因中,ETV4處于第7位。利用生物信息學網R2在線比較了GEO數據庫中正常結腸基因芯片數據(GSE8671,n
=33)和結腸癌基因芯片數據(GSE4554,n
=84)中ETV4的表達,發現與正常組織比較,ETV4在結腸癌中表達升高(t
=15.296,P
<0.001,圖1A)。采用免疫組化檢測了62例結腸癌組織和配對癌旁黏膜組織中ETV4蛋白表達,結果(圖1B)顯示,ETV4在結腸癌組織中呈強陽性,而在正常黏膜中呈陰性或弱陽性;將ETV4表達強度分為高表達和低表達組,并與臨床病理參數進行關聯性分析發現,ETV4的表達強度和結腸癌的組織分級以及T、N、M分期呈正相關,而與患者年齡、性別以及腫瘤部位無關(表1)。RT-qPCR結果顯示,與人永生化結腸上皮細胞FHC比較,結腸癌細胞系HCT116、LS174T、SW480、LOVO、SW620和RKO中ETV4的mRNA水平均升高(F
=89.736,P
<0.001,圖1C)。
圖1 ETV4在結腸腺癌中表達升高A:利用R2獲取GEO數據中ETV4在結腸癌與正常組織中的表達;B:免疫組化染色顯示ETV4在結腸癌與正常組織中的表達,比例尺:50 μm;C:RT-qPCR結果顯示結腸癌細胞中ETV4 mRNA表達情況;與PHC細胞比較:***P<0.001

表1 ETV4表達與臨床病理參數的關系(n)
2.2 ETV4促進結腸癌的侵襲能力
實驗通過轉染過表達質粒和小干擾RNA對ETV4進行過表達和沉默,RT-qPCR檢測發現,與對照組(1.00±0.15)比較,ETV4過表達組(轉染ETV4-OE質粒)ETV4 mRNA表達水平(51.18±5.26)升高(圖2A,t
=17.228,P
<0.001);與si-NC組(1.03±0.12)比較,ETV4沉默組(轉染si-ETV4)ETV4 mRNA表達水平(0.18±0.03)降低(圖2B,t
=13.502,P
<0.001)。Transwell侵襲實驗結果顯示,ETV4過表達組穿出小室的細胞數量(118.25±6.78)相對于對照組(56.72±4.52)增多(圖2 C、D;t
=7.173,P
<0.001);ETV4沉默組穿出小室細胞數量(39.26±4.29)較對照組(61.45±7.34)減少(圖2E、F,t
=6.385,P
=0.005)。
圖2 ETV4對LOVO細胞侵襲能力的影響A、B:RT-qPCR驗證在LOVO中過表達和沉默ETV4效果,與對照組比較:***P<0.001,與si-NC組比較:###P<0.001;C:Transwell實驗觀察過表達ETV4對LOVO細胞侵襲能力的影響,比例尺:50 μm;D:對圖C的定量圖,與對照組比較:**P<0.01;E:Transwell觀察敲除ETV4對LOVO細胞侵襲能力的影響,比例尺:50 μm;F:對E的定量圖,與si-NC組比較:##P<0.01
2.3 MMP7是ETV4的下游基因
R2生物信息網在線分析了TCGA數據庫中286例結腸癌的基因表達數據的結果顯示,在mRNA水平,MMP7和ETV4表達呈正相關(R
=0.527,P
<0.001,圖3A)。Western blot結果(圖3B)顯示,與si-NC組(1.00±0.06)比較,ETV4沉默組MMP7蛋白相對表達量(0.58±0.78)減少(t
=5.538,P
=0.012);與對照組(1.00±0.13)比較,ETV4過表達組MMP7蛋白相對表達量(2.25±0.43)增多(t
=8.215,P
<0.001)。
圖3 MMP7是ETV4的下游基因A:TCGA結腸癌基因表達數據分析ETV4和MMP7表達相關性; B:Western blot檢測ETV4對MMP7蛋白表達的影響
2.4 ETV4通過MMP7促進結腸癌的侵襲能力
為驗證ETV4是否通過MMP7促進LOVO細胞的侵襲能力,本研究采用了功能恢復實驗。Western blot實驗結果(圖4A、B)顯示,與ETV4過表達組比較,ETV4過表達聯合MMP7沉默組ETV4蛋白表達無明顯改變,而MMP7蛋白表達明顯下降(F
=84.192,P
<0.001);Transwell侵襲實驗結果(圖4C、D)顯示,與對照組(52.33±4.28)比較,ETV4過表達組穿出膜的細胞數量(121.67±18.61)增多(F
=24.326,P
=0.005);過表達ETV4 聯合MMP7沉默組穿出小室的細胞數量(58.06±6.37)較ETV4過表達組減少(P
=0.006)。本部分實驗結果說明,ETV4至少部分通過MMP7促進結腸癌細胞的侵襲能力。
圖4 ETV4通過 MMP7促進結腸癌LOVO細胞的侵襲能力A:Western blot顯示不同處理細胞中ETV4和MMP7蛋白表達;B :對A圖的定量;C:Transwell檢測不同處理組細胞的侵襲能力實驗結果統計圖;D:Transwell檢測不同處理組細胞的侵襲能力示意圖(標尺50 μm);1:對照組;2:ETV4過表達組;3:ETV4過表達聯合MMP7沉默組;與對照組比較:**P<0.01,***P<0.001;與ETV4過表達組比較:##P<0.01
人類ETS家族有28個成員,根據其相對序列分為4個不同的類別,或者根據其結構的相似程度分為12個亞家族。同源的ETV1、ETV4和ETV5蛋白形成PEA3亞家族,但它們在某些組織中的表達模式可能完全不同,這表明這些PEA3家族成員具有不同的調控方式。在尤文肉瘤中,ETV1或ETV4的染色體易位是腫瘤發生的根本原因;同樣,在大多數前列腺癌中觀察到ERG和ETV1/4/5亞家族的染色體重排。據報道,在胃癌患者中,ETV4 mRNA高表達者占64%,而ETV1和ETV5 mRNA高表達僅分別占31%和26%。ETV4在食管鱗狀細胞癌中明顯升高,并且過表達預示著較短的生存時間。然而,ETV4在結腸癌中的表達和功能尚不清楚。本研究通過生物信息網GEPIA分析發現ETV4在結腸癌中表達升高,并通過免疫組化證實了這一結果,同時發現結腸癌中ETV4高表達可能預示著高的組織學和TNM分期,說明ETV4在結腸癌進展中可能起重要作用。
功能研究發現,ETV4能夠促進結腸癌的侵襲能力。為探索ETV4在腫瘤細胞中的分子機制,本研究使用生物信息網R2預測了ETV4表達相關基因,發現MMP7與ETV4表達呈正相關。MMP7是基質金屬蛋白酶(matrix metalloproteinases,MMPs)家族中的一員。MMPs能夠降解基底膜,促進腫瘤微血管生成,從而有利于惡性腫瘤侵襲和轉移。有文獻報道,結腸癌患者血清中MMP7過表達,并與預后不良有關。本研究結果顯示,ETV4能夠促進結腸癌細胞MMP7表達從而促進細胞侵襲能力,沉默MMP7消除了ETV4過表達對結腸癌細胞侵襲的促進作用,由此推測,MMP7可能是ETV4下游功能基因并介導了ETV4對結腸癌的侵襲促進功能。
綜上所述,ETV4在結腸癌中高表達,并促進結腸癌細胞的侵襲能力,進一步發現MMP7是ETV4的下游功能基因。本研究拓展了對結腸癌轉移機制的認識,為預防和治療結腸癌提供了重要的理論依據。