申安平 王炳森 李 桓 李松偉
(河南中醫藥大學2019級碩士研究生,河南 鄭州 450000)
類風濕關節炎(rheumatoid arthritis,RA)是一種以累及四肢小關節為主的自身免疫性關節疾病,發病率高,致殘性較大,易合并多種疾病(如肺間質纖維化、干燥綜合征等)[1-2]。現代醫學治療RA主要以改善臨床癥狀,延緩病情進展為主,然而其骨髓抑制及胃腸道不適等副作用導致患者依從性不高。
RA屬中醫學“痹證”范疇,《素問·痹論》將其分為“痛痹”“行痹”“著痹”。隨著對痹證認識的不斷發展,人們已逐漸完善其病因病機,形成了活血為主兼健脾化痰、滋補肝腎等療法[3-5]。隨著現代化的不斷發展,中醫藥的研究也逐漸與當今主流信息技術相結合,并在用藥規律、名老中醫經驗傳承及藥理研究開發等方面取得了重要的成果[6-8]。基于此,本研究運用現代信息技術對古代中醫痹證用藥規律進行研究總結,以期發現其用藥規律和配伍特點,并通過構建“藥物-成分-靶點-通路-疾病”網絡模型,闡釋其治療RA的具體機制,為臨床中藥治療RA提供理論依據。
1.1 數據收集 在《中華醫典》中搜索“痹證”“痹病”“痹痛”“痛痹”“歷節”“鶴膝風”等關鍵詞,共檢索到1456首方劑。
1.2 納入標準 治療上具有完整的功能主治,并且組方完整的方劑。
1.3 排除標準 ①具體組方藥物相同,但方劑名稱不同;②摘選同一方書,方劑名稱相同、主治相同,但藥味較少的方劑;③明確用于外敷的方劑。
1.4 數據預處理 共收集585首方劑,將上述方劑以0和1的方式輸入Excel表中,建立中藥數據庫。對藥物的名稱和分類按照《中華人民共和國藥典》2015年版進行規范統一。
1.5 數據分析 使用SPSS Statistics 26軟件對納入的藥物進行統計描述及系統聚類,采用SPSS Modeler 18.0中的Apriori建模進行關聯規則分析。
1.6 成分及靶點的收集 通過中藥系統藥理學數據庫與分析平臺(TCMSP)數據庫篩選得到當歸-川芎的活性成分[9],整理TCMSP、瑞士靶點預測數據庫(Swiss Target Prediction)、人類基因和網絡功能分析數據庫(GenCLiP 3.0)中的藥物疾病靶點[10],用Venny平臺進行藥物和疾病靶點映射,獲得當歸-川芎治療RA的作用靶點。
1.7 通路富集分析及模型構建 將上述作用靶點導入注釋、可視化和集成發現數據庫(DAVID)中[11],獲得富集通路,運用功能蛋白協作網絡(STRING)數據庫和Cytoscape軟件構建“藥物-成分-靶點-通路”模型和蛋白互作模型[12]。
1.8 京都基因與基因組百科全書(KEGG)通路可視化 將作用靶點導入DAVID數據庫KEGG模塊中,選擇Search&Color Pathway功能,導出整合并可視化相關通路。
2.1 藥物使用情況 將585首方劑中出現的中藥進行排序,共出現中藥156味,累計出現6165次。其中出現頻數≥50次的藥物共34種(總頻數3656次),排名靠前的為當歸263次(7.19%)、防風203次(5.55%)、羌活179次(4.90%)、川芎175次(4.79%)。依據《中華人民共和國藥典》2015版將藥物規范化后,將高頻藥物(≥50次)進行分類,使用較多的為解表和活血化瘀藥。使用頻數≥50次的藥物見表1,藥物分類見圖1。

圖1 藥物分類

表1 使用頻數≥50次藥物
2.2 高頻藥物系統聚類分析 采用SPSS Statistics 26軟件對高頻藥物(≥50次)進行系統聚類,由圖可知,其中1類為當歸-川芎,2類為防風-羌活,聚類分析樹狀圖見圖2。

圖2 聚類分析樹狀圖
2.3 高頻藥物關聯分析 采用SPSS Modeler 18.0軟件對高頻藥物(≥50次)進行關聯規則分析,選擇Apriori建模得出藥物之間的配伍關系,設定支持度>10%,置信度>70%,獲得核心藥對10個,有當歸-川芎、牛膝-杜仲等。見表2。

表2 高頻藥物的關聯表
2.4 成分及靶點的收集 在TCMSP數據庫中設定口服生物利用度(OB)≥30%,類藥性(DL)≥0.18篩選得到當歸-川芎的活性成分9個。整理TCMSP、Swiss Target Prediction、GenCLiP 3.0數據庫中靶點后獲得9個治療RA的作用靶點,具體成分見表3。

表3 當歸-川芎的主要活性成分及其OB和DL值
2.5 蛋白互作模型構建 將當歸-川芎治療RA的9個作用靶點導入String數據庫中獲得蛋白互作網絡,并在Cytoscape軟件中可視化。圖中前3位的靶點蛋白主要為STAT3、JUN、MAPK14,該網絡提示當歸-川芎的作用靶點在治療RA過程中存在著相互協同,而靶點的相互協同恰恰可能是當歸-川芎增強治療的作用機制。見圖3。
2.6 富集通路分析 KEGG結果顯示當歸-川芎的富集通路主要在腫瘤壞死因子(TNF)信號通路、Janus激酶/信號轉導和轉錄激活因子(JAK-STAT)信號通路、血管內皮生長因子(VEGF)信號通路、B細胞受體信號等通路上,結果表明當歸-川芎的作用靶點富集在多個通路內,并可通過協調多條通路來發揮治療RA的作用。見圖4。

圖4 KEGG富集通路圖
2.7 “藥物-成分-靶點-通路-疾病”網絡模型構建 將上述數據導入Cytoscape軟件中進行可視化,結果表明當歸-川芎的9個活性成分與作用靶點有關聯的共7個,活性成分排名較前的為β-谷甾醇、楊梅酮,靶點排名較前的為PTGS2、PIK3D、MAPK14,主要的通路為TNF信號通路、JAK-STAT信號通路、VEGF信號通路。見圖5。

圖5 藥物-成分-靶點-通路-疾病圖
2.8 通路的可視化 將當歸-川芎的9個作用靶點導入KEGG數據庫中進行通路可視化,圖中描述了TNF信號通路、JAK-STAT信號通路、VEGF等信號通路分布情況,結果表明作用靶點大多集中在發揮功效的關鍵之處。見圖6。

圖6 部分KEGG通路富集結果
RA早期的病理改變主要為滑膜炎及血管翳的形成,晚期常會導致四肢關節的腫脹、侵蝕[13]。RA屬中醫學“痹證”范疇,痹者,閉塞不通也,其病名最早可追溯至《內經》[14]。中醫學認為,痹證為感受淫毒邪氣, 或勞倦、情志失調導致臟腑、氣血、陰陽失衡所致。痹證日久則形成瘀滯痰停、肝腎虧虛之證,治法常以活血化瘀兼補肝腎為主。中醫在痹證治療方面經驗豐富,對RA的認識和治療也具有其獨特的優勢,然而目前傳統中醫藥治療RA的用藥規律和具體機制尚不清楚。現代信息技術具有大數據分析處理和藥物分子對接能力,因此借助這一特性可以系統了解其治療RA的用藥規律和作用機制。
本研究統計發現古代痹證的治療中使用頻數較多的藥物為當歸、防風、羌活、川芎等,運用最多的藥物類別是解表藥、活血化瘀藥和補虛藥,聚類分析樹狀圖可以分為當歸-川芎、防風-羌活等幾類。提示在RA的辨證中要考慮是否合并血瘀證和風寒表證,治療中可適當多選用當歸-川芎、防風-羌活等藥對。其次,本研究還發現在臨床用藥選擇方面,除祛風解表、活血化瘀藥外,多隨證配伍祛風濕、補虛類藥物,提示RA治法著重祛風解表、活血化瘀,兼顧祛風濕、補肝腎。
Modeler關聯分析發現古方關聯度較強的藥對有10對,提示臨床用藥時應注重當歸、川芎、羌活、防風等藥物之間的配伍。從關聯度較強的藥對組合當歸-牛膝-川芎(活血化瘀藥-活血化瘀藥-活血化瘀藥)、牛膝-杜仲-當歸(活血化瘀藥-補虛藥-活血化瘀藥)可以看出,對于RA的研究未來應注重從活血化瘀和補肝腎等相互配伍進行研究。
本研究通過設定OB和DL值篩選得到當歸-川芎9個活性成分,在與藥物疾病靶點映射后共獲得9個治療靶點,最終富集分析當歸-川芎中治療RA的通路機制主要有9條。RA作為免疫炎性疾病,主要致病炎癥因子為TNF因子,通過阻斷TNF信號通路,可以減輕TNF炎癥因子引起的血管和關節的損害[15],臨床TNF拮抗劑證實有效[16-17]。JAK-STAT信號通路是人體內為數不多的炎癥調節通路,在免疫和炎癥過程中具有重要意義[18-19],該通路主要通過提高基質金屬蛋白酶的表達從而造成RA的持續滑膜炎,因此調節該通路可能達到治療RA 的作用[20],當歸、川芎很可能通過靶點JAK1、JAK2干預JAK-STAT信號通路進而治療RA。VEGF信號通路與滑膜血管生成有關,成為近年來治療RA的熱點通路[21-22],眾多的基礎實驗表明通過調節VEGF信號通路治療RA是一個可行之法[23-24],當歸-川芎靶點在本通路的富集,表明其通過調節VEGF信號通路治療RA的潛力。此外,當歸-川芎還可能通過調節B細胞受體信號通路、絲裂原活化蛋白激酶(MAPK)信號通路等發揮治療作用。上述結果表明,中藥治療RA是多成分、多靶點、多通路過程,在生物制劑時代仍具有不可忽視的治療前景。
本研究通過分析古代中醫治療痹證的方劑,總結了傳統中藥治療RA用藥規律及其潛在藥理機制,為RA臨床辨證治療提供了思路和依據,為開發治療RA的藥物提供了一些新的啟發。但本研究藥理分析部分主要基于信息技術來進行數據的挖掘預測,因此結果具有一定的局限性,下一步我們就網絡藥理學的預測結果開展相關實驗研究,進一步明確當歸-川芎治療RA的機制。