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人G6PD在大腸埃希菌中的表達及體外抑制劑篩選模型的建立

2022-09-21 06:34:16金科華游云悠魏友煜柯志強
安徽醫科大學學報 2022年8期
關鍵詞:模型

金科華,游云悠,魏友煜,左 越,柯志強,堯 青,劉 潔

作者單位:湖北科技學院1糖尿病與血管病變湖北省重點實驗室、2醫學部基礎醫學院、3醫學部基礎醫學院2018級卓越醫師班、4醫學部健康醫學院,咸寧 437100

多數腫瘤細胞有兩大代謝特征,一是通過從頭合成途徑合成[1]核苷酸;二是脂肪酸合成旺盛。磷酸戊糖途徑(pentose phosphate pathway,PPP)的中間產物5-磷酸核糖和NADPH分別是核苷酸和脂肪酸合成的必須原料。抑制PPP可抑制腫瘤細胞DNA合成和脂肪酸合成,抑制腫瘤細胞的增殖。6-磷酸葡萄糖脫氫酶(glucose 6-phosphate dehydrogenase,G6PD)是PPP的限速酶,催化6-磷酸葡萄糖(glucose 6-phosphate,G6P)和NADP+轉化為6-磷酸葡萄糖酸內酯和NADPH(在340 nm波長處有特征吸收值)。高活性的G6PD與腫瘤發展和不良預后密切相關[2-3],G6PD缺失與腫瘤的生長呈負相關[4-5]。6-氨基煙酰胺通過抑制G6PD,誘導腫瘤細胞產生氧化性脅迫,提高腫瘤對抗癌藥物和放療的敏感性[6-8]。脫氫表雄酮(dehydroepiandrosterone,DHEA)通過抑制G6PD能有效抑制腫瘤增殖[9]。然而,DHEA治療非小細胞肺癌時,易導致患者產生嚴重的抑郁和疲倦[10],6-氨基煙酰胺有神經毒性[11],限制了它們在臨床上的應用,故發現更多靶向G6PD的抑制劑具有重要意義。為此,擬在原核生物中表達人G6PD,并建立其體外抑制劑篩選模型,為發現G6PD抑制劑奠定基礎。

1 材料與方法

1.1 主要材料大腸桿菌BL21(DE3)、質粒pET-28a為湖北科技學院基礎醫學院保存。G6PD cDNA(與Genebank中NM_001360016.2的G6PD序列一致)由廈門大學生命科學學院提供。DNA聚合酶、DNA連接試劑盒購自TaKaRa(大連)公司。大腸桿菌Top10感受態細胞購自北京全式金生物技術有限公司。引物、質粒抽提試劑盒、卡那霉素(Kana)、凝膠回收試劑盒、G6P、NADP購自上海生工生物工程有限公司。快速限制酶購自美國Fermentas公司,鎳離子親和層析柱購自美國GE公司。DHEA購自美國Sigma公司。兔抗人G6PD IgG單克隆抗體(一抗)購自杭州Epitomics公司,HRP標記的羊抗兔IgG抗體(簡稱二抗)購自北京中杉金橋公司。

1.2 主要儀器Eppendorf 5425 R微量離心機(美國eppendorf公司);HERMLE Labortechnik GmbH Z 32 HK離心機(德國HERMLE公司);TS-1000 PCR儀、蛋白質電泳及轉印系統(美國Bio-Rad公司);DYY-6C電泳儀電源、DYCP-31DN型瓊脂糖水平電泳儀(北京六一生物科技有限公司);JY92II DN型超聲波細胞粉碎機(寧波新芝生物科技股份有限公司)。

1.3 PCR擴增G6PD cDNA根據G6PD cDNA序列,設計上游引物P1:5′-CGACATATGATGGCAGA-GCAGGTGGCCCTG-3′,下游引物P2:5′-ACGCTCG-AGTCAGAGCTTGTGGGGGTTCAC-3′。下劃線序列分別為NdeⅠ、XhoⅠ位點。PCR反應體系:H2O 40.5 μl,10× Pyrobest Buffer 5 μl,dNTP Mixture(2.5 mmol/L each)2 μl,P1(10 μmol/L)、P2(10 μmol/L)各1 μl,G6PD cDNA 0.25 μl(90 ng), Pyrobest DNA polymerase 0.25 μl。PCR循環條件:95 ℃預變性5 min;94 ℃變性30 s,65 ℃退火30 s,72 ℃延伸90 s,循環30次;72 ℃修復延伸10 min。將PCR產物進行電泳檢測,并按DNA凝膠回收試劑盒回收。

1.4 G6PD cDNA和pET-28a的酶切與回收G6PD cDNA酶切反應:H2O 16 μl,cDNA 25 μl,10× FD Buffer 5 μl,NdeⅠ和XhoⅠ 各2 μl,37 ℃保溫3 h。質粒酶切反應:H2O 42 μl,pET-28a 8 μl(800 ng),10× Buffer 6 μl,NdeⅠ和XhoⅠ 各2 μl,37 ℃保溫3 h。酶切的cDNA和質粒按凝膠回收試劑盒回收。

1.5 目的基因與載體的連接及轉化取1.4酶切的pET-28a 和G6PD 各2.5 μl、DNA連接試劑盒之Solution I 5 μl,混勻,16 ℃連接3 h。將100 μl Top10感受態細胞冰浴解凍,將5 μl連接產物加入感受態細胞,輕吸混勻,按冰浴30 min、-42 ℃ 60 s、-冰浴2 min的程序轉化,向轉化后的菌液中,加入500 μl LB培養基,200 r/min 37 ℃活化菌體1 h。取100 μl菌液,涂布于含50 μg/ml Kana的LB平板(抗性平板),篩選重組子。

1.6 重組質粒的酶切和測序鑒定取1.5篩選的單菌落兩個,分別接種于兩支4 ml 抗性(50 μg/ml Kana)LB,37 ℃ 、220 r/min培養10 h。取菌液1 ml,按質粒抽提試劑盒提取質粒,記為pG1、pG2。質粒雙酶切鑒定:pG1(或pG2,或pET-28a)8 μl,NdeⅠ、XhoⅠ各1 μl,10× FD Buffer 2 μl,H2O 8 μl,37 ℃酶切2 h。將酶切產物于1%的瓊脂糖進行電泳鑒定。委托廣州英濰捷基公司對酶切陽性的質粒測序。

1.7 IPTG誘導表達G6PD取pG1 10 ng,按1.5的方法轉化BL21(DE3)感受態細胞,篩選單菌落。取抗性菌落1個,記為BL21-pG1,接種于4 ml抗性LB,37 ℃ 、250 r/min培養10 h,作母液。將母液按1 ∶100平行接種2份于100 ml抗性LB中,37 ℃、250 r/min培養至A600為0.6。誘導組加入IPTG至終濃度0.4 mmol/L,對照組加等體積的無菌水。兩份菌液于37 ℃、 250 r/min培養5 h。10 000 r/min室溫離心1 min(下稱離心),去上清液,沉淀用PBS洗滌兩次。離心,去PBS上清液,沉淀用30 ml、100 mmol/L 、pH7.5 Tris-HCl重懸。按225 W功率、超聲2 s 、停4 s的程序,冰浴超聲重懸的沉淀30 min。以4 ℃、13 000 r/min離心超聲處理菌體10 min。取上清液600 μl,與200 μl 4× Loading Buffer混勻,100 ℃變性10 min,取20 μl變性蛋白進行SDS-PAGE檢測。

1.8 G6PD的純化取鎳離子層析珠0.5 ml,棄去保存液,用超純水洗滌2次。在4 ℃冰箱中,將層析珠與裂解液上清液混合30 min,流出未結合的蛋白。依次用含20、40、80 mmol/ L咪唑的100 mmol/ L 、pH7.5 Tris-HCl洗滌層析珠。加25 ml洗脫液(含200 mmol/L咪唑的100 mmol/L 、pH7.5 Tris-HCl)洗脫G6PD。取600 μl洗脫液,200 μl 4× Loading Buffer,混勻,100 ℃加熱變性10 min, 13 000 r/min室溫離心2 min,取上清液。按Millipore超濾管(截留分子量10 ku)說明書,將洗脫液超濾濃縮至約500 μl。用BCA法測定濃縮蛋白濃度。取450 μl濃縮蛋白與50 μl甘油混勻,分裝后-80 ℃保存。

1.9 Western blot檢測G6PD取1.6和1.7的變性蛋白樣品各10 μl,于10%的分離膠進行SDS-PAGE。將分離的蛋白濕法恒壓120 V×1 h電轉至PVDF膜。將PVDF膜浸于5 % BSA中,室溫處理1 h,將1 ∶1 000稀釋的G6PD一抗與PVDF膜4 ℃孵育過夜。取出PVDF膜,用TBST洗滌3次×10 min。加入1 ∶5 000稀釋的二抗,室溫孵育1 h,TBST洗滌3次×10 min。用ECL覆蓋PVDF膜,于Bio-Rad 公司的ChemiDoc XRS+成像中系統檢測條帶信號。

1.10 G6PD抑制劑體外篩選模型的建立確定G6PD最佳濃度。按文獻[8]配制G6PD反應緩沖液(G6PD buffer, GB)。用GB配置4 mmol/L G6P和2 mmol/L NADP,將適量的G6P和NADP等體積混勻,作為底物混合液,4 ℃避光待用。冰浴解凍-80 ℃保存的G6PD。向96孔板中的加入底物混合液190 μl,置Varioskan Flash微孔板度數儀(賽默飛世爾,美國),37 ℃預熱10 min。每孔分別加入10 μl不稀釋、稀釋5倍、稀釋25倍的G6PD(終濃度依次為22.5、4.5、0.9 μg/ml)或10 μl GB,混勻,每30 s測定一次A340,測定6 min,繪制Time-A340曲線,確定最佳G6PD濃度。

確定陽性對照DHEA的最佳濃度。向96孔板中加入:底物混合液180 μl,濃度分別為200、40、8 μmol/L的DHEA溶液(終濃度分別為10、2、0.4 μmol/L)或DMSO各10 μl,最適濃度G6PD 10 μl。按上述程序測定A340,繪制Time-A340曲線。按文獻[12]計算模型的可靠性因子—Z′因子,確定最佳DHEA濃度。以上實驗均為三次生物學重復。

1.11 統計學處理用EXCEL 2013計算重復測定的數據的平均值、標準差。

2 結果

2.1 pET-28a-G6PD的構建PCR產物分子量介于1 400 ~1 600 bp,與G6PD cDNA分子量(1 569 bp)一致(圖1A),對照組無擴增產物。雙酶切的pG1、pG2均產生兩條帶,小帶分子量介于1 000~2 000 bp,與G6PD cDNA分子量相符;大帶分子量與pET-28a(5 369 bp)酶切片段相符(圖1B)。測序結果與G6PD cDNA序列一致。可見G6PD cDNA正確插入pET-28a質粒。

圖1 pET-28a-G6PD的構建

2.2 表達產物的鑒定人G6PD分子量約58 ku,重組G6PD(recombinant G6PD, rG6PD)較之G6PD多出由載體翻譯產生的29個氨基酸(分子量約3 ku),故rG6PD分子量約61 ku。由圖2A可見,經IPTG誘導的BL21-pG1裂解液上清液及純化產物有61 ku左右蛋白條帶(箭頭示),與rG6PD分子量相符,未經IPTG誘導時無61 ku的條帶。經quantity one軟件分析,純化的G6PD總蛋白的84%。Western blot結果提示,經IPTG誘導后,BL21-pG1裂解液上清及純化產物均存在61 ku條帶(箭頭示),與rG6PD分子量相符(圖2B)。濃縮的rG6PD濃度為0.5 mg/ml,可知rG6PD總量為0.25 mg,故其表達量為2.5 mg/L。

圖2 鑒定G6PD表達產物

2.3 G6PD抑制劑體外篩選模型的建立

2.3.1G6PD最佳濃度的確定 不同G6PD濃度的時間-A340曲線見圖3。不加G6PD時,保溫過程中A340無變化。隨G6PD濃度增大,A340升高速度加快。在測定起點,22.5、4.5、0.9 μg/ml G6PD組A340相同。反應0.5 min,三種G6PD濃度的A340升高值(ΔA340)依次為0.202、0.015、0.010;反應0.5~1 min,ΔA340依次為0.076、0.015、0.01;反應1~1.5 min,ΔA340依次為0.028、0.015、0.01。可見22.5 μg/ml G6PD濃度過大,最大反應速度發生在加入酶液后的30 s(甚至更短時間)內,因G6P被大量氧化,其濃度急劇降低,產物6-磷酸葡萄糖酸內酯急劇升高,導致反應速度快速下降。反應前3 min內,4.5、0.9 μg/ml G6PD組ΔA340分別恒定為0.015、0.010;反應3~6 min,4.5 μg/ml G6PD組每30 s內ΔA340逐步下降,0.9 μg/ml G6PD組ΔA340仍恒定為0.010。22.5 μg/ml G6PD組無法通過ΔA340來觀測酶活力,不適合抑制劑的篩選; 4.5、0.9 μg/ml G6PD組前3 min均能通過ΔA340的變化來觀測G6PD酶活力,但0.9 μg/ml G6PD組ΔA340恒定時間更長,便于操作,故稀釋25倍是G6PD的最佳濃度(900 μg/L)。

2.3.2最佳DHEA濃度的確定 不同DHEA濃度的時間-A340曲線如圖4,隨DHEA濃度增大,A340升高速度逐步變慢。20、2、0.2 μmol/L的DHEA對G6PD的抑制率分別為(80.7±0.2)%,(40.1±1.7)%,(19.6±1.0)%;模型的Z′因子分別為0.88、0.74、0.18。Z′因子低于0.5時,模型不可靠;Z′因子越大,模型可靠性越高。可見,當DHEA為20 μmol/L時,Z′因子最符合高通量篩選要求。故DHEA最佳濃度為20 μmol/L。

圖3 不同G6PD濃度的時間-A340曲線

圖4 不同DHEA濃度的時間-A340曲線

3 討論

本研究構建了大腸桿菌表達載體pET-28a-G6PD,重組菌BL21-pG1經0.4 mmol/L IPTG誘導表達、鎳離子親和純化,獲得可溶性的G6PD,產量為2.5 mg/L。以G6P為底物、NADP為輔因子、900 μg/L G6PD為最佳酶濃度、20 μmol/L DHEA為陽性對照,建立了高可信度的G6PD體外抑制篩選模型,為發現G6PD的抑制劑奠定了基礎。

BL21-GPG6PD經IPTG誘導后在大腸桿菌中獲得了高水平表達,但主要以包涵體形式存在(SDS-PAGE檢測圖未列出),可溶性蛋白產量偏低。汪自然 等[13]構建Luk S-PV與GFP融合蛋白表達載體在大腸桿菌中獲得了較高水平的可溶性表達。后續擬將嘗試G6PD與標簽蛋白融合表達、延長誘導時間等措施提高可溶性G6PD的產量,以滿足大規模抑制劑篩選對酶的需求。

G6PD純度為84%,表明還存在少量雜質蛋白。雜質蛋白可能對酶促反應有一定干擾,為此擬在提高G6PD產量的基礎上,進一步采用增加分子篩等純化手段提高G6PD的純度,盡可能降低雜質的干擾。

當底物濃度遠大于酶濃度時,酶促反應速度與酶濃度成正比。理論上,22.5、4.5、0.9 μg/ml 的G6PD在最大反應速度階段,ΔA340的比例應為25 ∶5 ∶1,而實際ΔA340比例約為202 ∶15 ∶10,具體原因需進一步研究。

基于體外篩選模型篩選的抑制劑,尚不能判斷其在體內的毒副作用。G6PD抑制劑篩選模型亦如此,故采用本模型篩選所得的G6PD抑制劑,需要進一步觀測其體內的毒副作用。

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