2023年11月,中國農業科學院作物病原生物功能基因組研究創新團隊在《Trends in Plant Science》上發表了題為“Plant-virus arms race beyond RNA interference”的綜述。該論文介紹了該研究團隊及國際同行在植物與病毒之間通過RNA介導的多層次博弈,并提出RNA識別機制是植物抵抗RNA病毒侵染的重要防線的科學新觀點。作者呼吁科研人員關注RNA層面對病毒侵染的調控作用,為探索更為有效的植物病毒防治方法提供新的科學依據。
RNA干擾(RNAi)是植物抵抗病毒侵染的最主要的防御手段。通過RNAi,植物可以識別并降解病毒RNA,從而抑制病毒侵染;同時,病毒通過編碼RNA沉默抑制子(VSRs)來對抗寄主植物的RNAi防御防御手段。近年來,研究人員發現,在植物中除了RNAi以外,RNA降解(RNA decay),RNA質量控制(RQC)以及RNA N-6甲基化修飾(m6A)等機制也參與了植物抵抗病毒的防御過程。
RQC是真核生物中保守的RNA檢測機制,在RNA翻譯過程中識別異常RNA產生的特殊狀態,進而啟動RNA decay機制降解異常RNA。病毒編碼RNA往往產生區別于寄主RNA的特殊結構和編碼特征,在核糖體翻譯過程中能夠被RQC機制識別。m6A是真核生物中最常見和廣泛研究的RNA化學修飾,可以通過作用于病毒RNA以影響病毒侵染。研究人員發現,m6A修飾的病毒RNA可以被特定的無義介導的RNA降解因子(NMD)識別并激活RNA decay途徑降解,從而抑制病毒侵染;然而,病毒編碼的VSRs不僅可以干擾RNAi的功能,還可以干擾RNA降解功能。此外,病毒RNA上的特殊莖環結構在逃避RQC識別機制中也發揮重要作用。該論文為解析植物與病毒在RNA層面的相互作用提出了新的研究方向,對這些機制的深入解析將有助于揭示植物抵御病毒侵染的整體機制,并為開發新的抗病毒策略提供理論基礎。