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基于網(wǎng)絡藥理學的梔子豉湯治療2型糖尿病的作用機制研究

2023-05-26 05:42:22張科楠張淑玲劉文文常文武何俊玲汪亞婭王錦超袁倩文
中國醫(yī)藥科學 2023年9期
關鍵詞:胰島素數(shù)據(jù)庫

張科楠 張淑玲 劉文文 常文武 何俊玲 汪亞婭 王錦超 袁倩文

1.北京中醫(yī)藥大學孫思邈醫(yī)院藥學部,陜西銅川 727100;2.銅川市中醫(yī)醫(yī)院針灸推拿科,陜西銅川 727100;3.北京中醫(yī)藥大學孫思邈醫(yī)院急診科,陜西銅川 727100

2 型糖尿病(type 2 diabeties mellitus,T2DM)是以胰島素抵抗或胰島β 細胞功能分泌障礙為主的代謝性疾病[1]。其已成為與腫瘤、心血管疾病并列的發(fā)病率和病死率最高的三大非傳染性疾病之一。目前西藥以口服二甲雙胍、α-葡萄糖苷酶抑制劑、噻唑烷二酮類等藥物治療為主,增加組織對葡萄糖的利用、減緩吸收、增加胰島素的敏感性[2],但長期應用易引起胃腸不適、肝臟毒性及耐藥性等。

梔子豉湯源于《傷寒論》,由梔子和淡豆豉組成。現(xiàn)代藥理學研究顯示梔子、淡豆豉均有降血糖、改善糖耐受的作用[3-4]。該方治療T2DM 的文獻已有報道[5]。但目前仍以單味藥為主,缺乏系統(tǒng)地探討該方作用機制的研究,因此本研究以網(wǎng)絡藥理學研究梔子豉湯中活性成分對T2DM 的改善機制,為該方臨床應用提供理論基礎。

1 材料與方法

1.1 梔子豉湯活性成分及靶點的收集

通過中藥系統(tǒng)藥理學數(shù)據(jù)庫與分析平臺(Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)收集梔子豉湯活性成分,查閱文獻[6-7]對相關成分進行補充,活性成分在Chembiodraw Ultra13.0 軟件中繪制出各自的結(jié)構(gòu)圖,以SDF 格式儲存。在PharmMapper 上傳SDF文件,獲得虛擬篩選結(jié)果。運用uniprot 數(shù)據(jù)庫將收集的靶點的蛋白名轉(zhuǎn)化為基因名。

1.2 T2DM靶點收集

利用GeneCards、OMIM、Drugbank、TTD 數(shù)據(jù)庫,以“Type 2 Diabeties Mellitus”為關鍵詞檢索T2DM 疾病靶點。

1.3 活性成分-疾病靶點網(wǎng)絡構(gòu)建

Venn 圖繪制活性成分靶點與T2DM 靶點的交集,將交集靶點在Cytoscape 3.7.2 軟件繪制“活性成分-疾病靶點”網(wǎng)絡圖。

1.4 蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)網(wǎng)絡構(gòu)建

將交集靶點導入String 數(shù)據(jù)庫及Cytoscape 3.7.2軟件中,構(gòu)建PPI 網(wǎng)絡。

1.5 分子對接

將PPI 中排名前10 位的靶點與其對應的化合物進行分子對接,利用PubChem 數(shù)據(jù)庫獲得化合物結(jié)構(gòu),通過PDB 數(shù)據(jù)庫獲取靶點結(jié)構(gòu),運用AutoDock 1.5.6 及Pymol 2.4 軟件進行制圖。

1.6 通路富集分析

將交集靶點導入Metascape 平臺,進行基因本體(gene ontology,GO)和基因組百科全書(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析。

2 結(jié)果

2.1 梔子豉湯活性成分及靶點的收集

共收集到梔子豉湯中27個活性成分,梔子18個、淡豆豉9 個。活性成分的作用靶點為303 個。

2.2 梔子豉湯治療T2DM的潛在作用靶點

整合各數(shù)據(jù)庫收集到的疾病靶點,去重后,共獲得942 個T2DM 的相關靶點,其與藥物有138 個潛在作用靶點。見圖1。

圖1 梔子豉湯治療T2DM 潛在作用靶點

2.3 活性成分-疾病靶點網(wǎng)絡的構(gòu)建

運用Cytoscape 3.7.2 構(gòu)建活性成分-疾病靶點網(wǎng)絡圖,結(jié)果顯示槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、大豆皂苷Ⅰ成分為治療T2DM 的主要活性成分。見圖2。

圖2 活性成分-疾病靶點網(wǎng)絡圖

2.4 PPI網(wǎng)絡分析

PPI 網(wǎng)絡中共有138 個節(jié)點、1092 條邊,平均節(jié)點度值為15.8。度值排名靠前的靶點為腫瘤壞死因子(TNF)、轉(zhuǎn)錄因子(JUN)、絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶AKT(AKT1)、白細胞介素-6(IL-6)、表皮生長因子受體(EGFR)等。見圖3。

圖3 PPI 網(wǎng)絡的構(gòu)建

2.5 分子對接

將PPI 中排名前10 位的靶點與及其對應的化合物進行分子對接驗證。對接結(jié)果見表1,部分對接圖見圖4。

表1 梔子豉湯活性成分分子對接結(jié)果

圖4 活性成分與靶點的分子對接模式圖

2.6 GO及KEGG富集分析

GO 功能分析共涉及生物過程2546 項,細胞組成60 項,分子功能181 條,取前10 條展示結(jié)果見圖5。KEGG 共富集到175 條信號通路,取前20 條展示(圖6)。結(jié)果表明梔子豉湯治療T2DM 與糖尿病并發(fā)癥的AGE-RAGE、IL-17、TNF 等通路有關。選取AGE-RAGE 信號通路展示見圖7。

圖5 GO 富集分析柱狀圖

圖6 KEGG 富集分析氣泡圖

圖7 糖尿病并發(fā)癥的AGE-RAGE 信號通路

3 討論

“消渴”最早見于《黃帝內(nèi)經(jīng)》,后世醫(yī)家在黃帝內(nèi)經(jīng)的基礎上認識到消渴與臟腑氣血功能失調(diào)有關,陰虛燥熱是消渴的主要病機[8],因此消渴以清熱潤燥、養(yǎng)陰生津為主要治則。梔子豉湯中梔子為君藥,清內(nèi)熱,解消渴,通小便,解火郁,可引導心火下行;淡豆豉為臣藥,可宣熱滋陰,降利胃氣,兩藥配伍,一升一降,滋陰降火,活血化瘀,達到標本兼治之功效。

網(wǎng)絡藥理學結(jié)果顯示槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇為治療T2DM 的主要活性成分。槲皮素可通過調(diào)節(jié)氧化應激水平、增強胰島素敏感性、改善胰島素抵抗發(fā)揮治療T2DM 的作用[9-10]。同時可消除氧化應激以降低T2DM 鐵死亡來實現(xiàn)胰島β 細胞正常功能[11]。山柰酚具有改善組織對胰島素的敏感性、顯著降低血糖、抑制胰島β 細胞凋亡、調(diào)節(jié)糖脂代謝紊亂的作用[12-13]。有研究顯示,β-谷甾醇可使腸道葡萄糖吸收減少、糖異生途徑及糖原分解減少,從而使血糖水平降低[14]。

PPI 結(jié)果顯示TNF、JUN、AKT1 等為梔子豉湯治療T2DM 的關鍵靶點。有研究表明TNF-α 與胰島素抵抗和胰島β 細胞損傷直接相關[15]。TNF 直接作用于胰島β 細胞,產(chǎn)生NO,從而導致胰島素分泌不足[16]。JUN 的激活與胰島素抵抗和代償性胰島素分泌有關,T2DM 中血漿葡萄糖水平增高,有助于JUN 的活化。JUN 的激活也與糖尿病并發(fā)癥有關[17]。AKT1 作為胰島素信號通路的關鍵節(jié)點,它可作用于胰島素的生理代謝,AKT1 磷酸化可促進糖原合成、葡萄糖轉(zhuǎn)運和攝取、蛋白質(zhì)生物合成等[18]。AKT1 被磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)激活后,通過正反饋調(diào)節(jié)刺激胰島β 細胞分泌胰島素,參與調(diào)節(jié)體內(nèi)葡萄糖穩(wěn)態(tài)平衡。研究顯示,敲除小鼠AKT 基因后,表現(xiàn)為T2DM 表型[19]。

KEGG 通路顯示,梔子豉湯治療T2DM 主要涉及糖尿病并發(fā)癥的AGE-RAGE、IL-17 等信號通路等。AGE-RAGE 信號通路可引發(fā)一系列炎癥反應,導致胰島細胞受損和胰島素抵抗[20]。RAGE 可引起PI3K/AKT、核因子-κB(NF-κB)等細胞轉(zhuǎn)導通路的激活(如圖7 所示),PI3K/AKT 作為胰島素下游主要分子通路,具有調(diào)控葡萄糖和脂質(zhì)分子代謝,促進肌肉和肝臟中糖原合成,維持血糖穩(wěn)態(tài)水平的作用[21]。NF-κB p65 決定炎癥因子釋放,當NF-κB 被激活,大量炎癥因子增多,損傷胰島細胞,導致機體糖代謝紊亂[22-23]。研究表明槲皮素可抑制AGEs 下調(diào)RAGE 的表達以延緩糖尿病的進展[24]。IL-17 作為促炎細胞因子,參與炎癥信號通路激活。研究表明,IL-17 可激活NF-κB 信號通路,刺激促炎因子[IL-1、IL-6、TNF、基質(zhì)金屬蛋白酶(MMP)]的釋放,共同抑制胰島素信號通路、誘導胰島素抵抗、從而導致T2DM 的發(fā)展[25]。

本研究采用網(wǎng)絡藥理學對梔子豉湯的成分、靶點及治療T2DM 的途徑進行探索性研究,結(jié)果顯示該方可通過多成分-多靶點-多通路共同影響T2DM 的進程,為梔子豉湯改善T2DM 的后續(xù)臨床研究提供一定的理論基礎。

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