世界首個(gè)番茄超泛基因組構(gòu)建完成

4月6日，由新疆農(nóng)業(yè)科學(xué)院加工番茄生物育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)牽頭，聯(lián)合中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院等多家單位，在國際學(xué)術(shù)期刊《自然·遺傳》在線發(fā)表了題為《超泛基因組研究揭示野生和栽培番茄物種基因組和結(jié)構(gòu)變異多樣性》的科研成果。

該團(tuán)隊(duì)研究收集了8個(gè)野生番茄種、1個(gè)番茄近源野生種和2個(gè)栽培番茄代表性品種，利用PacBio（第三代單分子實(shí)時(shí)測序技術(shù)）、Bionano（全基因組光學(xué)圖譜技術(shù)）和Hi-C（高通量染色體構(gòu)象捕獲技術(shù)）測序技術(shù)，組裝了11個(gè)染色體水平高質(zhì)量基因組，解析了番茄屬基因組特征，重構(gòu)了番茄屬系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系，構(gòu)建了國際首個(gè)番茄超泛基因組，為群體水平SV基因分型提供了強(qiáng)大的平臺(tái)，這將有助于開發(fā)風(fēng)味改良番茄品種育種的標(biāo)記。