









DOI:10.3969/j.issn.2095-1191.2025.01.027
摘要:【目的】克隆白斑狗魚(yú)(Esox lucius)LADD 2基因并分析其組織表達(dá)特征,為揭示LADD 2基因在白斑狗魚(yú)性腺發(fā)育中的作用提供理論依據(jù)。【方法】利用白斑狗魚(yú)性腺轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),篩選得到126日齡雌性白斑狗魚(yú)高表達(dá)基因LADD 2。克隆LADD 2基因編碼區(qū)(CDS)序列,利用DNAMAN 9.0、NCBI ORF finder、BLAST、ClustalX、ExPASy、ProtParam、PSORT II、SOMPA、SWISS-MODEL等在線軟件進(jìn)行生物信息學(xué)分析。基于魚(yú)類梯型凝集素同源物及C型凝集素受體的氨基酸序列,使用MEGA 5.1中的鄰接法(Neighbor-joining,NJ)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(shù)。采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)LADD 2基因在126日齡、188日齡和320日齡白斑狗魚(yú)性腺、腸道、肌肉、肝臟、鰓、腦、腎臟及頭腎中的相對(duì)表達(dá)量。【結(jié)果】成功克隆獲得白斑狗魚(yú)LADD 2基因CDS序列,全長(zhǎng)609 bp,編碼85個(gè)氨基酸殘基,蛋白分子量為9.78 kD,理論等電點(diǎn)(pI)為7.30,分子式為C8635H13504N2334O2404S115,為親水性蛋白。LDDA 2蛋白中亮氨酸(11.86%)含量最高,色氨酸(2.28%)含量最低。蛋白磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,LADD 2蛋白含有147個(gè)絲氨酸位點(diǎn),98個(gè)蘇氨酸位點(diǎn),44個(gè)酪氨酸位點(diǎn)。蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,LADD 2蛋白主要由β-轉(zhuǎn)角、α-螺旋和β-折疊構(gòu)成,存在2個(gè)保守的PRT1結(jié)構(gòu)域。氨基酸序列同源比對(duì)分析結(jié)果顯示,白斑狗魚(yú)與阿拉斯加黑魚(yú)(Dallia pectoralis)LADD 2蛋白的相似性最高為99%。系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(shù)顯示,白斑狗魚(yú)LADD 2蛋白與魚(yú)類梯型凝集素同源物聚為一支,與大西洋鮭(Salmo salar)、銀大麻哈魚(yú)(Oncorhynchuskisutch)及鯡形白鮭(Coregonus clupeaformis)的親緣關(guān)系較近。實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)果顯示,隨著發(fā)育時(shí)間延長(zhǎng),LADD 2基因在白斑狗魚(yú)卵巢中的相對(duì)表達(dá)量逐漸降低,與精巢中LADD 2基因相對(duì)表達(dá)量差異越來(lái)越小,且在鰓和腦中也有一定表達(dá)。【結(jié)論】LADD 2基因在進(jìn)化過(guò)程中具有一定的保守性和穩(wěn)定性,其在白斑狗魚(yú)早期卵巢發(fā)育過(guò)程中發(fā)揮重要作用。LADD 2蛋白可能在白斑狗魚(yú)發(fā)育后期鰓和腦中具有免疫活性。LADD 2蛋白可能具有免疫功能,進(jìn)而對(duì)白斑狗魚(yú)肝胰腺發(fā)育具有保護(hù)作用。
關(guān)鍵詞:白斑狗魚(yú);LADD 2基因;梯型凝集素;組織表達(dá)特征
中圖分類號(hào):S965.199文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A文章編號(hào):2095-1191(2025)01-0305-09
Cloning and tissue expression characteristics analysis of LADD 2 gene in Esox lucius
LIU Yi1,WANG Shun-zhe1,LIU Ying-hui2,YANG Qian1,WANG Yong-chang3,SUN Hao-ran1,LI Sheng-zhong1,ZHANG Jun-jie1*
(1Xinjiang Key Laboratory for Ecological Adaptation and Evolution of Extreme Environment Biology/College of Life Scien-ces,Xinjiang Agricultural University,Urumqi,Xinjiang 830000,China;2College of Animal Science,Xinjiang Agricul-tural University,Urumqi,Xinjiang 830052,China;3Pearl River Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences/Key Laboratory of Tropical and Subtropical Fishery Resources Application and Cultivation,Ministry of Agriculture and Rural Affairs,Guangzhou,Guangdong 510380,China)
Abstract:【Objective】To clone LADD 2 gene of Esox lucius and analyze its tissue expression characteristics,which could provide theoretical basis for revealing the role of LADD 2 gene in the gonadal development of E.lucius.【Method】Using the gonadal transcriptome data of E.lucius,the highly expressed gene LADD 2 in 126-day-old female E.lucius wasscreened.The coding region(CDS)sequence of LADD 2 gene was cloned,and bioinformatics analysis was performed using online tools such as DNAMAN 9.0,NCBI ORF finder,BLAST,ClustalX,ExPASy,ProtParam,PSORT II,SOMPA and SWISS-MODEL.Based on the amino acid sequences of fish ladder-type lectin homologs and C-type lectin re-ceptors,a phylogenetic tree was constructed using the neighbor-joining(NJ)method in MEGA 5.1.The relative expres-sion levels of LADD 2 gene in the gonads,intestines,muscles,liver,gills,brain,kidneys and head kidneys of E.lucius at 126,188,and 320 day-old were detected using real-time fluorescence quantitative PCR.【Result】The CDS sequence of LADD 2 gene in E.lucius was successfully cloned,with a total length of 609 bp,encoding 85 amino acids residues.The protein molecular weight was 9.78 kD,the theoretical isoelectric point(pI)was 7.30,and the molecular formula was C8635H13504N2334O2404S115,indicating a hydrophilic protein.The LADD 2 protein had the highest content of leucine(11.86%),and the lowest content of tryptophan(2.28%).Phosphorylation site prediction showed that LADD 2 protein contained 147 serine sites,98 threonine sites and 44 tyrosine sites.Protein structure prediction revealed that LADD 2 pro-tein mainly consisted of random coilsβ-turns,α-helices andβ-folds,with 2 conserved PRT1 domains.Amino acid se-quence homology analysis showed that the similarity between the LADD 2 protein of E.lucius and that of Dalliapectora-lis was the highest at 99%.The phylogenetic tree indicated that LADD 2 protein of E.lucius clustered with fish ladder-type lectin homologs and was closely related to Salmo salar,Oncorhynchus kisutch and Coregonus clupeaformis.Real-time fluorescence quantitative PCR results showed that the relative expression of LADD 2 gene in the ovaries of E.lucius gradually decreased with developmental time,and the difference in relative expression between the ovaries and testes be-came smaller.Additionally,LADD 2 gene was expressed in the gills and brain.【Conclusion】The function of LADD 2 gene exhibits certain conservation and stability during evolution.LADD 2 protein may play an important role in the early ovarian development of E.lucius and may have immune activity in gills and brain during later developmental stages.LADD 2 protein may possess immune functions,thereby protecting the hepatopancreatic development of E.lucius.
Key words:Esox lucius;LADD 2 gene;ladder-type lectin;tissue expression characteristics
Foundation items:National Natural Science Foundation of China(32260915);Xinjiang Natural Science Foundation(2022D01A66)
0引言
【研究意義】白斑狗魚(yú)(Esox lucius)隸屬于鮭形目(Salmoniformes)狗魚(yú)科(Esocidae)狗魚(yú)屬(Esox),主要分布于北半球高緯度地區(qū),在我國(guó)僅見(jiàn)于新疆北部額爾齊斯河流域(李思發(fā)等,2004)。該物種體型較大(可達(dá)130 cm)、壽命較長(zhǎng)(約20年),為典型的兇猛肉食性魚(yú)類,是生態(tài)學(xué)與進(jìn)化生物學(xué)研究的重要生物(Forsman et al.,2015)。雌性白斑狗魚(yú)的生長(zhǎng)速度快于雄魚(yú),性成熟時(shí)間延后且體型更大,體現(xiàn)出明顯的性別二態(tài)性(Mei and Gui,2015)。在水產(chǎn)養(yǎng)殖中,利用性別控制技術(shù)實(shí)現(xiàn)單一性別養(yǎng)殖(全雄或全雌)已在全雄羅非魚(yú)(Oreochromis niloticus)(Beardmore etal.,2001)、全雄黃顙魚(yú)(Pelteobagrus fulvidraco)(Dan etal.,2013)、全雌翹嘴鱖(Siniperca chuatsi)(Liu et al.,2021)等魚(yú)種中獲得應(yīng)用。因此,深入解析白斑狗魚(yú)性別分化及調(diào)控機(jī)制,對(duì)提高其養(yǎng)殖效率及實(shí)現(xiàn)品種改良具有重要意義。【前人研究進(jìn)展】性別分化作為生物界普遍存在且多樣化的現(xiàn)象,其調(diào)控機(jī)制具有多樣性和復(fù)雜性(Hayes,1998)。Pan等(2019)利用轉(zhuǎn)錄組學(xué)、功能敲除和過(guò)表達(dá)等手段,在白斑狗魚(yú)24號(hào)染色體上鑒定出雄性決定基因Amhby;唐露等(2020)、李菁等(2021,2023)、張俊杰等(2021)對(duì)魚(yú)類Foxl2、Dmrta1、StAR和Wnt4等性別相關(guān)基因進(jìn)行了克隆及組織表達(dá)分析,為闡明性別決定及分化的分子機(jī)制提供了基礎(chǔ)。LADD 2蛋白是一種梯型凝集素,因在雌性中高表達(dá)而引起關(guān)注,梯型凝集素最早在虹鱒(Oncorhynchus mykiss)中被發(fā)現(xiàn),作為一種血漿蛋白,在非還原SDS-PAGE下呈現(xiàn)典型的階梯狀條帶(Jensen et al.,1997)。隨后,來(lái)自多種魚(yú)類的梯型凝集素同源物陸續(xù)被報(bào)道,其研究結(jié)果均表明該類蛋白在宿主免疫防御中發(fā)揮關(guān)鍵作用(Hoover et al.,1998;Russell et al.,2008;Magnadottir et al.,2019;Feng et al.,2022)。Russell(2008)研究表明,虹鱒中梯型凝集素被鑒定為VII組C型血漿蛋白,除存在于血漿中外,還表現(xiàn)出甘露糖特異性和鈣依賴性結(jié)合病原菌的能力;Magnadot-tir等(2019)研究表明,大西洋大比目魚(yú)(Hippoglos-sushippoglossus)中梯型凝集素同源物主要在參與黏膜免疫的組織中表達(dá),與Feng等(2022)在雜交鯽魚(yú)(Carassius auratus)中發(fā)現(xiàn)的梯型凝集素在保護(hù)腸道完整性及增強(qiáng)抗菌感染中的作用相符。【本研究切入點(diǎn)】對(duì)雌性和雄性白斑狗魚(yú)性腺轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,篩選差異表達(dá)基因(DEGs),其中LADD 2基因是雌性和雄性白斑狗魚(yú)間高度差異表達(dá)的基因,但關(guān)于LADD 2基因在白斑狗魚(yú)性別分化及發(fā)育過(guò)程中的功能鮮見(jiàn)報(bào)道。【擬解決的關(guān)鍵問(wèn)題】克隆白斑狗魚(yú)LADD 2基因cDNA序列,分析其序列同源性,預(yù)測(cè)其開(kāi)放閱讀框(ORF)及氨基酸序列,并構(gòu)建蛋白三維結(jié)構(gòu)模型。采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)LADD 2基因在白斑狗魚(yú)不同組織中的表達(dá)分布。為揭示LADD 2基因在雌性白斑狗魚(yú)性腺發(fā)育中的潛在功能及應(yīng)用基因編輯技術(shù)實(shí)現(xiàn)性別控制提供理論依據(jù)。
1材料與方法
1.1試驗(yàn)材料
供試白斑狗魚(yú)仔魚(yú)購(gòu)自新疆北屯額爾齊斯河特種魚(yú)開(kāi)發(fā)有限責(zé)任公司,飼養(yǎng)于新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院水產(chǎn)實(shí)驗(yàn)室。選取126日齡、188日齡和320日齡雌性和雄性個(gè)體各3尾,取性腺、腸道、肌肉、肝臟、鰓、腦、腎臟及頭腎等組織,立即置于無(wú)菌凍存管中,液氮速凍后置于-80℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2主要試劑
TRIzol試劑和實(shí)時(shí)熒光定量PCR試劑盒購(gòu)自天根生化科技(北京)有限公司;PrimeScriptTM RT reagent Kit with gDNA Eraser(Perfect Real Time)試劑盒購(gòu)自寶生物工程(大連)有限公司。
1.3引物設(shè)計(jì)與合成
利用白斑狗魚(yú)性腺轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),篩選得到126日齡雌性白斑狗魚(yú)高表達(dá)基因LADD 2。采用Primer Premier 5.0設(shè)計(jì)特異性引物(表1),委托生工生物工程(上海)股份有限公司合成。
1.4 RNA提取及cDNA合成
各組織樣本在液氮中使用研缽充分研磨后溶解于DEPC水中,采用TRIzol法提取總RNA。利用Infinite?200 PRO酶標(biāo)儀檢測(cè)RNA濃度,并采用1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)RNA完整性。使用PrimeScriptTM RT reagent Kit with gDNA Eraser(Per‐fect Real Time)反轉(zhuǎn)錄試劑盒反轉(zhuǎn)錄合成cDNA,于-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.5 LADD 2基因克隆
以雌性白斑狗魚(yú)性腺(卵巢)cDNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增。反應(yīng)體系25.0μL:cDNA模板3.0μL,2×SanTaq PCR Master Mix 12.5μL,上、下游引物各1.0μL,ddH?O補(bǔ)足至25.0μL。擴(kuò)增程序:95℃預(yù)變性5 min;95℃30 s,58℃30 s,72℃1 min,進(jìn)行35個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)后,送至生工生物工程(上海)股份有限公司進(jìn)行測(cè)序。
1.6 LADD 2基因生物信息學(xué)分析
利用DNAMAN 9.0對(duì)測(cè)序獲得的cDNA序列進(jìn)行剪接;采用NCBI ORF finder(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/)預(yù)測(cè)LADD 2基因ORF;使用BLAST進(jìn)行氨基酸序列同源比對(duì)分析,并利用ClustalX進(jìn)行多重序列比對(duì)分析;利用ExPASy(https://www.expasy.org)分析LADD 2蛋白結(jié)構(gòu)與功能;使用ProtParam(https://web.expasy.org/protparam/)預(yù)測(cè)蛋白理化性質(zhì);采用PSORT II(https://psort.hgc.jp/form2.html)預(yù)測(cè)蛋白潛在的磷酸化位點(diǎn);通過(guò)SOMPA和SWISS-MODEL預(yù)測(cè)LADD 2蛋白二、三級(jí)結(jié)構(gòu);利用DNAMAN 9.0進(jìn)行白斑狗魚(yú)與其他11種魚(yú)類[阿拉斯加黑魚(yú)(Dallia pectoralis)、美洲紅點(diǎn)鮭(Salvelinus fontinalis)、虹鱒、大西洋鮭(Salmo salar)、鯡形白鮭(Coregonus clupeaformis)、駝背大麻哈魚(yú)(Oncorhynchusgorbuscha)、紅大麻哈魚(yú)(On-corhynchus nerka)、大馬哈魚(yú)(Oncorhynchusketa)、北極嘉魚(yú)(Salvelinus alpinus)、銀大麻哈魚(yú)(Onco-rhynchuskisutch)]LADD 2蛋白氨基酸序列同源比對(duì)分析;基于魚(yú)類梯型凝集素同源物及C型凝集素受體(外群)的氨基酸序列,采用MEGA 5.1中的鄰接法(Neighbor-joining,NJ)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(shù),以大西洋鮭魚(yú)、虹鱒和白斑狗魚(yú)C型凝集素受體序列為外群,通過(guò)自舉法進(jìn)行檢驗(yàn),重復(fù)取樣值設(shè)為1000。
1.7不同組織中LADD 2基因表達(dá)分析
利用Bio-Rad CFX96實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀和SYBR Green I染料檢測(cè)LADD 2基因在126日齡、188日齡和320日齡雌性和雄性白斑狗魚(yú)腦、肌肉、腎臟、性腺、頭腎、鰓、腸道和肝臟中的相對(duì)表達(dá)量。實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng)體系20.0μL:cDNA模板1.0μL,2×SuperReal PreMix Plus 10.0μL,上、下游引物各0.8μL,ddH?O 7.4μL。擴(kuò)增程序:95℃預(yù)變性5 min;95℃30 s,59℃30 s,72℃30 s,進(jìn)行39個(gè)循環(huán);95℃延伸30 s。每個(gè)樣品設(shè)置3個(gè)生物學(xué)重復(fù),以β-Actin為內(nèi)參基因,采用2-ΔΔCt法計(jì)算目的基因相對(duì)表達(dá)量。
1.8統(tǒng)計(jì)分析
試驗(yàn)數(shù)據(jù)使用SPSS 21.0進(jìn)行單因素方差分析(One-way ANOVA),并以LSD多重比較進(jìn)行組間差異分析。
2結(jié)果與分析
2.1白斑狗魚(yú)LADD 2基因克隆及序列特征分析結(jié)果克隆獲得白斑狗魚(yú)LADD 2基因編碼區(qū)(CDS)序列,全長(zhǎng)609 bp,編碼85個(gè)氨基酸殘基(圖1),蛋白分子量為9.78 kD,理論等電點(diǎn)(pI)為7.30。
2.2白斑狗魚(yú)LADD 2蛋白理化性質(zhì)、互作網(wǎng)絡(luò)及磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)結(jié)果
蛋白氨基酸組成預(yù)測(cè)結(jié)果(圖2)顯示,LADD 2蛋白中亮氨酸(11.86%)含量最高,色氨酸(2.28%)含量最低,親水性氨基酸占52.10%,疏水性氨基酸占47.90%,分子式為C8635H13504N2334O2404S115。蛋白親/疏水性預(yù)測(cè)結(jié)果(圖3)顯示,LADD 2蛋白第0~10位氨基酸處有最大疏水值(3.70),第130~140位氨基酸處有最大親水值(-3.00),平均親水性指數(shù)為-0.15,為親水性蛋白。蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析結(jié)果(圖4)表明,與LADD 2(LOC105007138)相似度達(dá)91.3的蛋白LOC105007136與LOC105026773、LOC105030280、LOC105008204、LOC105007111、LOC105006821、LOC105007110、LOC105026769、LOC105008205、ENSELUP00000036623和ENSELUP00000025954構(gòu)成了復(fù)雜的互作網(wǎng)絡(luò)。蛋白磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)結(jié)果(圖5)顯示,LADD 2蛋白含有147個(gè)絲氨酸位點(diǎn)、98個(gè)蘇氨酸位點(diǎn)和44個(gè)酪氨酸位點(diǎn)。
2.3白斑狗魚(yú)LADD 2蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果
蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果(圖6)顯示,LADD 2蛋白主要由β-轉(zhuǎn)角(23%)、α-螺旋(14%)、β-折疊(12%)構(gòu)成。蛋白結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)結(jié)果(圖7)顯示,LADD 2蛋白存在2個(gè)保守的PRT1結(jié)構(gòu)域。LADD 2蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果如圖8所示,藍(lán)色表示一致性大于70%,置信度高;紅色表示一致性小于50%,置信度低;紫色表示一致性為60%~70%,置信度適中。
2.4白斑狗魚(yú)LADD 2蛋白氨基酸序列同源比對(duì)分析與系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建
BLAST查詢白斑狗魚(yú)LADD 2基因編碼蛋白的同源序列,發(fā)現(xiàn)LADD 2基因僅存在于魚(yú)類中。蛋白氨基酸序列同源比對(duì)分析結(jié)果(圖9)顯示,白斑狗魚(yú)LADD 2蛋白與阿拉斯加黑魚(yú)、美洲紅點(diǎn)鮭、虹鱒、大西洋鮭、鯡形白鮭、駝背大麻哈魚(yú)、紅大麻哈魚(yú)、大馬哈魚(yú)、北極嘉魚(yú)、銀大麻哈魚(yú)LADD 2蛋白的同源性均較高,且都含有梯型凝集素同源物的特征,其中與阿拉斯加黑魚(yú)的相似性最高,為99%,提示LADD 2基因功能在進(jìn)化過(guò)程中具有一定的保守性和穩(wěn)定性。基于魚(yú)類梯型凝集素同源物及C型凝集素受體的氨基酸序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),結(jié)果如圖10所示,魚(yú)類梯型凝集素同源物聚為一支,白斑狗魚(yú)LADD 2蛋白也歸于此支,且與大西洋鮭、銀大麻哈魚(yú)及鯡形白鮭的親緣關(guān)系較近。
2.5白斑狗魚(yú)LADD 2基因組織表達(dá)分析結(jié)果
實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)果顯示,在126日齡,LADD 2基因在雌性白斑狗魚(yú)肌肉中有少量表達(dá),雌性白斑狗魚(yú)性腺(卵巢)LADD 2基因相對(duì)表達(dá)量極顯著高于雄性性腺(精巢)(Plt;0.01)(圖11)。在188日齡,LADD 2基因在雌性白斑狗魚(yú)鰓中有少量表達(dá),卵巢LADD 2基因相對(duì)表達(dá)量顯著高于精巢(Plt;0.05)(圖12)。在320日齡,LADD 2基因在雄性白斑狗魚(yú)腦中有表達(dá),卵巢LADD 2基因相對(duì)表達(dá)量和精巢無(wú)顯著差異(Pgt;0.05)(圖13)。提示白斑狗魚(yú)卵巢中的LADD 2基因相對(duì)表達(dá)量隨著生長(zhǎng)時(shí)間的延長(zhǎng)而逐漸降低。
3討論
凝集素是一類結(jié)構(gòu)多樣的蛋白或蛋白結(jié)構(gòu)域,能特異性結(jié)合寡糖,參與多種生物識(shí)別過(guò)程(Sharon and Lis,1989)。盡管植物和微生物中的凝集素早已被發(fā)現(xiàn),但直到1995年,動(dòng)物凝集素的普遍存在才被廣泛報(bào)道(Lis and Sharon,1991;Hughes,1992;Hirabayashi and Kasai,1993;Barondes et al.,1994a;Goldstein and Poretz,2012)。動(dòng)物凝集素家族包括C型凝集素、S型凝集素和P型凝集素(Drickamer,1988;Drickamer and Taylor,1993;Barondes et al.,1994b)。梯型凝集素是一種獨(dú)特的C型凝集素,迄今僅在硬骨魚(yú)中發(fā)現(xiàn)(Wang et al.,2022)。梯型凝集素在孵化后119~1050日齡的大西洋庸鰈(Atlantic Halibut)皮膚、鰓和腸道黏膜細(xì)胞中高表達(dá),提示其可能在黏膜免疫防御中發(fā)揮作用,同時(shí)在肝臟、腎臟、骨髓和大腦中也有一定表達(dá),表明其可能具有更廣泛的功能(Magnadottiretal.,2019;Junkunlo etal.,2020)。香魚(yú)(Plecoglossus altivelis)梯型凝集素樣基因(PaLL-like)具有免疫調(diào)節(jié)活性,是先天免疫的重要組成部分,具有預(yù)防細(xì)菌感染的作用(Wang et al.,2022)。大黃魚(yú)(Larimichthys crocea)梯型凝集素基因在頭部、腎臟和鰓中表達(dá)量最高,具有先天性免疫功能,提示其可能在水蛭對(duì)細(xì)菌和寄生蟲(chóng)攻擊的先天免疫中發(fā)揮了重要作用(Tang et al.,2023)。提示梯型凝集素在魚(yú)類免疫防御中具有多重功能,可能通過(guò)不同的組織特異性表達(dá)來(lái)實(shí)現(xiàn)其生物學(xué)功能。本研究發(fā)現(xiàn),隨著發(fā)育時(shí)間延長(zhǎng),LADD 2基因在白斑狗魚(yú)卵巢中的相對(duì)表達(dá)量逐漸降低,與精巢中LADD 2基因相對(duì)表達(dá)量差異越來(lái)越小,且在鰓和腦中也有一定表達(dá),提示LADD 2基因在白斑狗魚(yú)早期卵巢發(fā)育過(guò)程中發(fā)揮重要作用,并可能在白斑狗魚(yú)發(fā)育后期鰓和腦中具有免疫活性。與魚(yú)類性別分化和免疫系統(tǒng)發(fā)育的研究相符,此外,魚(yú)類腦和鰓作為重要的免疫器官,其免疫相關(guān)基因表達(dá)的變化可能反映了魚(yú)類在不同發(fā)育階段對(duì)環(huán)境壓力的適應(yīng)性(Fjelldalet al.,2007)。
魚(yú)類凝集素可通過(guò)糖脂、糖蛋白和蛋白聚糖識(shí)別并發(fā)揮調(diào)節(jié)作用,實(shí)現(xiàn)宿主—病原體互作和細(xì)胞間通訊(Ogawa et al.,2011)。Vasta等(2011)研究表明,硬骨魚(yú)類凝集素具有識(shí)別外源配體的功能,同時(shí)可能還具有其他功能,如作為抗凍蛋白和預(yù)防多精癥;Huang等(2013)研究表明,魚(yú)皮膚與病原體接觸時(shí),會(huì)分泌黏液,作為保護(hù)性的機(jī)械和生化屏障,進(jìn)一步證實(shí)了凝集素在魚(yú)類黏膜免疫中的重要作用;Kumar等(2018)研究表明,魚(yú)類凝集素能識(shí)別病毒表面的糖蛋白,抑制病毒的感染,揭示了魚(yú)類凝集素在抗病毒免疫中的作用。
蘇氨酸是魚(yú)類生長(zhǎng)不可或缺的氨基酸,其在免疫反應(yīng)中的作用也與蘇氨酸缺陷病中所報(bào)道的一致(Li etal.,1999)。蘇氨酸能通過(guò)增加酶的抗氧化能力來(lái)改善鈍吻鯛(Bluntnose snapper)的抗氧化防御系統(tǒng),從而保護(hù)肝胰腺的結(jié)構(gòu)和功能(Habte-Tsionet al.,2016)。磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,LADD 2蛋白具有98個(gè)蘇氨酸位點(diǎn),推測(cè)LADD 2蛋白可能具有免疫功能,或?qū)Π装吖肤~(yú)肝胰腺發(fā)育具有一定保護(hù)作用。與近年來(lái)對(duì)氨基酸代謝與免疫系統(tǒng)關(guān)系的研究趨勢(shì)一致,蘇氨酸不僅是蛋白質(zhì)合成的必需氨基酸,還通過(guò)其代謝產(chǎn)物參與免疫調(diào)節(jié)(Koo and Noh,2007)。因此,LADD 2蛋白的蘇氨酸磷酸化位點(diǎn)可能為其免疫功能提供了分子基礎(chǔ)。
同一基因在不同生物體、不同組織和不同發(fā)育時(shí)期可能具有不同功能,這種多功能性為魚(yú)類提供了更強(qiáng)的適應(yīng)能力,使其能在復(fù)雜的自然環(huán)境中生存繁衍(Epstein and Beckwith,1968)。在丁鱥(Tincatinca)中,凝集素在其早期卵黃前卵母細(xì)胞的外周細(xì)胞質(zhì)中第一個(gè)皮質(zhì)囊泡出現(xiàn)后不久被檢測(cè)到,而在其血清中的凝集素也為先天免疫的C型凝集素補(bǔ)體提供了途徑(Nosek et al.,1983),提示凝集素在魚(yú)類生殖和免疫系統(tǒng)中具有雙重功能。虹鱒中STL2和STL3凝集素僅在卵巢中發(fā)現(xiàn),且其含量在孵化后立即急劇下降,并在魚(yú)卵中具有不同功能(Tateno et al.,2001),表明凝集素在魚(yú)類生殖和免疫系統(tǒng)中具有多功能性。本研究結(jié)果表明,LADD 2基因可能對(duì)白斑狗魚(yú)早期性別分化起一定作用,并在腦、鰓中具有一定功能,后續(xù)可結(jié)合轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)深入探究LADD 2基因在魚(yú)類性別分化和免疫應(yīng)答中的分子機(jī)制,或通過(guò)比較不同魚(yú)類凝集素的功能差異,揭示其在進(jìn)化過(guò)程中的適應(yīng)性變化。
4結(jié)論
LADD 2基因在進(jìn)化過(guò)程中具有一定的保守性和穩(wěn)定性,其在白斑狗魚(yú)早期卵巢發(fā)育過(guò)程中發(fā)揮重要作用。LADD 2蛋白可能在白斑狗魚(yú)發(fā)育后期鰓和腦中具有免疫活性。LADD 2蛋白可能具有免疫功能,進(jìn)而對(duì)白斑狗魚(yú)肝胰腺發(fā)育具有保護(hù)作用。
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(責(zé)任編輯:蘭宗寶,張博)