海南黑山羊與海×努雜交山羊腸道微生物組成的比較

DOI：10.3969/j.issn.2095-1191.2025.01.026

摘要：【目的】揭示雜交山羊擁有良好生長(zhǎng)性狀的內(nèi)在機(jī)理，為海南黑山羊的品種選育及海×努雜交山羊的飼養(yǎng)管理提供參考依據(jù)。【方法】選取出生4 d內(nèi)的海南黑山羊（HN組）和海×努雜交山羊（HY組）各6只，在統(tǒng)一的飼養(yǎng)管理標(biāo)準(zhǔn)下飼養(yǎng)至120日齡左右，采集糞便樣品進(jìn)行16S rRNA測(cè)序，分析2組山羊的腸道微生物群落組成差異，并對(duì)腸道微生物與山羊體重及平均日增重進(jìn)行Pearson相關(guān)分析。【結(jié)果】2組山羊的腸道微生物群落Alpha多樣性指數(shù)無(wú)顯著差異（Pgt;0.05），但基于布雷柯蒂斯（Bray-Curtis）距離的主坐標(biāo)分析（PCoA）發(fā)現(xiàn)2組山羊的腸道微生物組成存在一定差異。在門分類水平上，海南黑山羊與海×努雜交山羊腸道微生物均以厚壁菌門、擬桿菌門、疣微菌門、彎曲菌門、螺旋菌門及變形菌門等為優(yōu)勢(shì)菌門；在屬分類水平上，2組山羊腸道微生物組成相似，存在多種能發(fā)酵膳食纖維的菌屬；Metastats分析發(fā)現(xiàn)，海×努雜交山羊腸道中的Monoglobus相對(duì)豐度顯著高于海南黑山羊（Plt;0.05，下同）。海南黑山羊腸道微生物的生物標(biāo)志物有腸球菌科、腸球菌屬及Family_XIII_UCG_001等；海×努雜交山羊腸道微生物的生物標(biāo)志物為短促生乳桿菌屬和顫螺旋菌科未知菌屬。海×努雜交山羊腸道微生物中，厚壁菌門相對(duì)豐度與體重及平均日增重呈顯著正相關(guān)；海南黑山羊腸道微生物中，另枝菌屬相對(duì)豐度與體重呈極顯著正相關(guān)（Plt;0.01），與平均日增重呈顯著正相關(guān)；將2組山羊合并為一個(gè)群體進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)厚壁菌門相對(duì)豐度與山羊平均日增重呈顯著正相關(guān)，Monoglo-bus相對(duì)豐度與山羊體重呈顯著正相關(guān)。【結(jié)論】海南黑山羊與海×努雜交山羊的腸道微生物組成存在一定差異，其中Monoglobus在海×努雜交山羊中的相對(duì)豐度顯著高于海南黑山羊。此外，腸道微生物中的厚壁菌門、另枝菌屬和Monoglobus可能是調(diào)控山羊生長(zhǎng)性能的關(guān)鍵菌群，為育肥山羊靶向型飼料添加劑的選擇提供了新方向。

關(guān)鍵詞：海南黑山羊；海×努雜交山羊；腸道微生物；16S rRNA測(cè)序；體重增長(zhǎng)

中圖分類號(hào)：S827文獻(xiàn)標(biāo)志碼：A文章編號(hào)：2095-1191（2025）01-0295-10

Comparison of intestinal microbial composition of Hainan black goat and hybrid of Hainan black goat×Nubian goat

TANG Jia-yang，CHEN Tao-yu，LI Shi-yuan，MENG Yong，CHEN Qiao-ling，CHEN Si，GAO Hong-yan，DU Li，WANG Feng-yang，Manchuriga*

（College of Tropical Agriculture and Forestry，Hainan University/Key Laboratory of Tropical Animal Reproductionamp; Breeding and Epidemic Disease Research of Hainan，Haikou，Hainan 570228，China）

Abstract：【Objective】To reveal the internal mechanism of hybrid goats with good growth traits，which could provide reference basis for breedselection of Hainan black goat and feeding management of hybrid of Hainan black goat×Nubian goat.【Method】Six Hainan black goats（HN group）and six hybrids of Hainan black goat×Nubian goat（HY group）born within 4 d were selected and raised under uniform feeding management standards until about 120 days old.Fecal samples were collected for 16S rRNA sequencing to analyze the differences in composition of the intestinal microbial community between the 2 groups of goats，and Pearson correlation analysis was performed to assess relationships between intestinal microbe community and body weight and daily weight gain.【Result】There was no significant difference in the Alpha di-versity index of the intestinal microbe between the 2 groups of goats（Pgt;0.05）.However，principal coordinate analysis（PCoA）based on Bray-Curtis distances revealed distinct microbial community structures between the 2 groups of goats.At phylum level，Hainan black goat and hybrid of Hainan black goat×Nubian goat exhibited dominant phyla including Firmicutes，Bacteroidota，Verrucomicrobiota，Campylobacterota，Spirochaetota and Proteobacteria.At the genus level，the intestinal microbial composition was similar in the 2 groups，with a variety of fiber-fermenting genera.Metastats analysis identified significantly higher relative abundance of Monoglobus in hybrid of Hainan black goat×Nubian goat compared to Hainan black goat（Plt;0.05，the same below）.The biomarkers of intestinal microbes in Hainan black goat in-cluded Enterococcaceae，Enterococcus，F(xiàn)amily_XIII_UCG_001，etc.The biomarkers of intestinal microbes in hybrid of Hainan black goat×Nubian goat were Levilactobacillus and unclassified_Oscillospiraceae.The relative abundance of Fir-micutes among the intestinal microbes of hybrid of Hainan black goat×Nubian goat was significantly and positively corre-lated with body weight and daily weight gain.In the intestinal microbes of Hainan black goat，there was extremely signifi-cant positive correlation（Plt;0.01）between the relative abundance of Alistipes and body weight，as well as a significant positive correlation with daily weight average gain.Combining 2 groups of goats into a population for analysis，it wasfound that the relative abundance of Firmicutes was significantly and positively correlated with average daily weight gain of goats，and the relative abundance of Monolobus was significantly and positively correlated with body weight of goats.【Conclusion】There are certain differences in the intestinal microbial composition between Hainan black goat and hybrid of Hainan black goat and Nubian goat，among which Monolobus has significantly higher relative abundance in Hainan black goat compared to hybrid of Hainan black goat×Nubian goat.In addition，F(xiàn)irmicutes，Alistipes and Monolobus inintestinal microbes might be key microbial communities that may regulate goat growth performance，which provides new directions for selection of targeted feed additives for goat fattening.

Key words：Hainan black goat；hybrid of Hainan black goat×Nubian goat；intestinal microbes；16S rRNA sequen-cing；body weight gain

Foundation items：China Agriculture Research System（CARS-38）；Hainan Academician Innovation Platform Pro-ject（YSPTZX202153）

0引言

【研究意義】海南黑山羊是我國(guó)海南省重要的地方畜牧品種資源，具有耐粗飼、耐高溫高濕、抗病力強(qiáng)、性成熟早及肉質(zhì)鮮美等優(yōu)勢(shì)（葉玉秀等，2016），但也存在體重偏小、生長(zhǎng)速度緩慢等缺點(diǎn)（孫瑞萍等，2015）。努比亞山羊?qū)儆谌槿饧嬗眯蜕窖颍蚱浼∪庳S滿、體格較大、抗病力好、繁殖力強(qiáng)，已廣泛應(yīng)用于山羊雜交育種（Stemmer et al.，2009；胡艷等，2021），以海南黑山羊?yàn)槟副尽⑴葋喩窖驗(yàn)楦副镜碾s交后代——海×努雜交山羊具有生長(zhǎng)迅速、體型較大、產(chǎn)肉量高等特點(diǎn)。腸道微生物是指動(dòng)物胃腸道內(nèi)數(shù)量龐大的微生物群（李世杰等，2024；徐蘭夢(mèng)等，2024），雜交引起的腸道微生物區(qū)系改變可通過(guò)調(diào)節(jié)宿主代謝方式，而對(duì)宿主的生長(zhǎng)性狀產(chǎn)生影響（Ber-gamaschietal.，2020）。因此，從腸道微生物層面入手分析雜交后海南黑山羊腸道微生物組成的變化，有利于揭示海×努雜交山羊擁有良好生長(zhǎng)性狀的內(nèi)在機(jī)理，為海南黑山羊的品種選育及飼養(yǎng)管理提供參考依據(jù)。【前人研究進(jìn)展】動(dòng)物腸道微生物主要由細(xì)菌、真菌、古細(xì)菌及病毒等組成（Mabwi et al.，2021）。據(jù)報(bào)道，人體內(nèi)擁有數(shù)萬(wàn)億的腸道微生物（Sender et al.，2016），且這些腸道微生物在機(jī)體代謝及免疫調(diào)節(jié)等方面發(fā)揮著至關(guān)重要的作用（Zhang et al.，2019；Aron-Wisnewsky et al.，2021）。除了飲食和生活環(huán)境是影響腸道微生物群落結(jié)構(gòu)的重要因素外（Singhetal.，2017；Trinhetal.，2018），遺傳因素對(duì)于腸道微生物組成也有影響。Doms等（2022）通過(guò)研究小鼠基因組與腸道黏膜微生物組成，并繪制高分辨率遺傳圖譜，結(jié)果發(fā)現(xiàn)存在一些具有高度遺傳性的腸道微生物；He等（2023）研究證實(shí)，與屯昌豬相比，巴克夏豬與屯昌豬雜交子代的腸道微生物組成已發(fā)生變化，其中，乳酸菌屬（Lactobacillus）相對(duì)豐度的降低可能會(huì)導(dǎo)致雜交子代腸道免疫能力變?nèi)酰绽孜质暇鷮伲≒revotella）相對(duì)豐度的增加賦予雜交子代更好的營(yíng)養(yǎng)代謝和吸收功能。但也有研究表明，宿主的基因差異對(duì)腸道微生物組成幾乎沒(méi)有影響。Jiang等（2020）研究發(fā)現(xiàn)，在相同的環(huán)境和飼養(yǎng)條件下，海南黑山羊與薩嫩山羊雜交F1代中黑山羊和白山羊的腸道微生物組成差異不明顯；楊蓮等（2021）研究證實(shí)，純種柯樂(lè)豬和巴×柯雜交豬的腸道微生物組成相似。此外，Qi等（2021）研究發(fā)現(xiàn)，無(wú)菌仔豬的體重和去脂體重較正常仔豬約降低40%，且伴隨著肌肉發(fā)育不良；Cheng等（2022）將高體重綿羊和低體重綿羊的腸道微生物分別移植到小鼠體內(nèi)，結(jié)果表明，接受高體重綿羊腸道微生物移植的小鼠擁有更高的體重及日增重，可能與腸道中Prevotellaceae_UCG-001和Lachnospiraceae_NK4A1 36_group的相對(duì)豐度更高有關(guān)；同時(shí)有諸多研究證實(shí)，豬腸道微生物中的消化球菌屬（Peptococcus）、真桿菌屬（Eubacterium）、月單胞菌屬（Selenomo-nas）、莫拉氏菌屬（Moraxella）、柯林斯菌屬（Collin-sella）、Ruminococcaceae_UCG_014和Ruminococca-ceae_UCG_008等與其體重增長(zhǎng)呈正相關(guān)（Ding et al.，2019；Oh etal.，2020；姜長(zhǎng)津等，2022）。可見(jiàn)，腸道微生物組成與宿主的生長(zhǎng)性狀密切相關(guān)。【本研究切入點(diǎn)】至今，針對(duì)山羊雜交后代腸道微生物組成變化的相關(guān)研究鮮見(jiàn)報(bào)道，腸道微生物組成變化對(duì)山羊生長(zhǎng)性狀的影響機(jī)制也尚未明確。【擬解決的關(guān)鍵問(wèn)題】采集海南黑山羊和海×努雜交山羊的糞便樣本，通過(guò)16S rRNA測(cè)序分析雜交后山羊腸道微生物組成的變化，并探究腸道微生物與山羊體重及日增重的相關(guān)性，旨在揭示雜交山羊擁有良好生長(zhǎng)性狀的內(nèi)在機(jī)理，為海南黑山羊的品種選育及海×努雜交山羊的飼養(yǎng)管理提供參考依據(jù)。

1材料與方法

1.1試驗(yàn)動(dòng)物及飼養(yǎng)管理

選取出生4 d內(nèi)的海南黑山羊和海×努雜交山羊各6只（4只公羊和2只母羊），海南黑山羊設(shè)為HN組，海×努雜交山羊設(shè)為HY組（表1）。所有山羊打耳標(biāo)標(biāo)記，采用常規(guī)免疫程序進(jìn)行免疫，并按相同的標(biāo)準(zhǔn)統(tǒng)一飼養(yǎng)管理，每天8：00、14：00和20：00投喂3次，自由飲水。每天觀察山羊健康情況。

1.2體重及日增重測(cè)定

記錄好每只山羊的出生重，至山羊約120日齡后禁食12 h，測(cè)量其空腹體重，然后計(jì)算平均日增重（表1）。

1.3糞便樣本收集

在120日齡左右，收集12只山羊的糞便樣本，裝入做好標(biāo)記的15 mL離心管中，立即投入液氮中保存，運(yùn)回實(shí)驗(yàn)室后轉(zhuǎn)移至-80℃冰箱保存。HN組山羊及其糞便樣本編號(hào)分別為HN1、HN2、HN3、HN4、HN5和HN6，HY組山羊及其糞便樣本編號(hào)分別為HY1、HY2、HY3、HY4、HY5和HY6。

1.4腸道微生物16S rRNA測(cè)序及數(shù)據(jù)處理

采用TGuide S96磁珠法土壤/糞便基因組DNA提取試劑盒提取山羊糞便DNA，根據(jù)全長(zhǎng)引物序列合成攜帶Barcode的特異引物27F（5'-AGRGTTTGA TYNTGGCTCAG-3'）和1492R（5'-TASGGHTACCTT GTTASGACTT-3'）并進(jìn)行PCR擴(kuò)增。PCR反應(yīng)體系30.0μL：DNA模板1.5μL，KOD OneTM PCR Master Mix 15.0μL，上、下游引物各1.5μL，Nuclease-free Water 10.5μL。擴(kuò)增程序：95℃預(yù)變性2 min；98℃10 s，55℃30 s，72℃1 min 30 s，進(jìn)行25個(gè)循環(huán)；72℃延伸2 min。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)Qubit定量分析及1.8%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)合格后混樣，以AMPure PB磁珠進(jìn)行純化回收，并通過(guò)Agilent 2100生物分析儀和Illumina文庫(kù)定量試劑盒進(jìn)行評(píng)估，上機(jī)測(cè)序委托北京百邁客生物科技有限公司完成。

下機(jī)數(shù)據(jù)以CCS文件呈現(xiàn)，通過(guò)Lima v1.7.0根據(jù)Barcode對(duì)CCS文件進(jìn)行識(shí)別，得到Raw-CCS數(shù)據(jù)并進(jìn)行質(zhì)控過(guò)濾：使用Cutadapt 1.9.1去除數(shù)據(jù)中的引物（Martin，2011），得到Clean-CCS數(shù)據(jù)；通過(guò)UCHIME v4.2鑒定并去除嵌合體序列（Edgar et al.，2011），得到Effective-CCS數(shù)據(jù)；然后以USEARCH處理Reads（Edgar，2013），在97.0%的相似水平下進(jìn)行聚類分析以獲得OTUs。以SILVA為參考數(shù)據(jù)庫(kù)，通過(guò)樸素貝葉斯分類器結(jié)合比對(duì)的方法對(duì)OTUs特征序列進(jìn)行分類學(xué)注釋，得到每個(gè)特征序列對(duì)應(yīng)的物種分類信息，分別在門和屬分類水平上統(tǒng)計(jì)各樣本的微生物群落組成。

1.5統(tǒng)計(jì)分析

通過(guò)QIIME 2 2020.6對(duì)山羊腸道微生物群落進(jìn)行Alpha多樣性分析（Bolyen et al.，2019），使用主坐標(biāo)分析（PCoA）進(jìn)行Beta多樣性分析，并利用LEfSe分析篩選出不同組別間具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異的生物標(biāo)志物（Segataetal.，2011）。此外，以SPSS 22.0對(duì)腸道微生物與山羊體重及日增重進(jìn)行Pearson相關(guān)分析，通過(guò)Metastats在不同分類水平上進(jìn)行組間差異分析。

2結(jié)果與分析

2.1山羊腸道微生物16S rRNA測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)控結(jié)果

對(duì)12份山羊糞便樣本微生物進(jìn)行16S rRNA測(cè)序，共獲得723879條Raw-CCS，經(jīng)質(zhì)控過(guò)濾，去除嵌合體后得到599689條Effective-CCS，各樣本的Raw-CCS比率均在80.0%以上。其中，HN組得到301589條Effective-CCS，HY組得到298100條Effective-CCS。從圖1可看出，當(dāng)采樣序列數(shù)達(dá)10000時(shí)，稀釋曲線逐漸趨于平緩。在97.0%的相似水平下對(duì)所有Effective-CCS進(jìn)行OTU聚類分析，結(jié)果（圖2）顯示，共獲得2385個(gè)OTUs，其中，共有OTUs為1841個(gè)，HN組特有OTUs為265個(gè)，HY組特有OTUs為279個(gè)。

2.2山羊腸道微生物群落Alpha多樣性分析結(jié)果

山羊腸道微生物群落Alpha多樣性分析結(jié)果（表2）顯示，HY組的ACE指數(shù)、Chao1指數(shù)、Simp-son指數(shù)和Shannon指數(shù)均高于HN組，但差異不顯著（rgt;0.05，下同）。此外，所有山羊糞便樣本的測(cè)序結(jié)果覆蓋率均在99.00%以上，即測(cè)序結(jié)果可代表海南黑山羊和海×努雜交山羊腸道微生物的真實(shí)情況。

2.3山羊腸道微生物群落Beta多樣性分析結(jié)果

基于布雷柯蒂斯（Bray-Curtis）距離矩陣的PCoA分析結(jié)果（圖3）顯示，第一主坐標(biāo)（PCoA1）解釋了32.70%的差異性，第二主坐標(biāo)（PCoA2）解釋了13.62%的差異性。2組山羊的大部分樣本坐標(biāo)呈聚集趨勢(shì)，但有小部分樣本偏離主群分布，說(shuō)明HN組和HY組山羊的腸道微生物組成存在潛在差異。

2.4山羊腸道微生物群落組成分析結(jié)果

2.4.1門分類水平上的山羊腸道微生物組成在2組山羊糞便樣本中共檢測(cè)到25種菌門，相對(duì)豐度排前10的菌門如圖4-A所示。其中，厚壁菌門（Fir-micutes）、擬桿菌門（Bacteroidota）、疣微菌門（Verru-comicrobiota）、彎曲菌門（Campylobacterota）、螺旋菌門（Spirochaetota）和變形菌門（Proteobacteria）為六大優(yōu)勢(shì)菌門，其相對(duì)豐度總和均占HN組和HY組山羊腸道微生物總量的99.00%以上。經(jīng)Metastats分析發(fā)現(xiàn)，在HN組與HY組間各菌門的相對(duì)豐度差異均不顯著。

2.4.2屬分類水平上的山羊腸道微生物組成在2組山羊糞便樣本中共檢測(cè)到339種菌屬，相對(duì)豐度排前25的菌屬如圖4-B所示。山羊腸道微生物群落中相對(duì)豐度排名前10的優(yōu)勢(shì)菌屬分別是毛螺菌科未知菌屬（unclassified_Lachnospiraceae）、毛螺菌科NK4A136菌群（Lachnospiraceae_NK4A136_group）、UCG_005、uncultured_rumen_bacterium、理研菌科RC9腸道菌群（Rikenellaceae_RC9_gut_group）、擬桿菌屬（Bacteroides）、毛螺菌科AC2044菌群（Lachno-spiraceae_AC2044_group）、克里斯滕森菌科R_7菌群（Christensenellaceae R 7 group）、瘤胃球菌屬（Ru-minococcus）及unclassified_［Eubacterium］_coprosta-noligenes_group，占HN組山羊腸道微生物總量的58.67%以上，占HY組山羊腸道微生物總量的54.80%以上。經(jīng)Metastats分析發(fā)現(xiàn)，Monoglobus在HY組的相對(duì)豐度顯著高于HN組（Plt;0.05，下同）。

2.5山羊腸道微生物組間差異分析結(jié)果

LEfSe分析結(jié)果（圖5和圖6）表明，當(dāng)LDA分值≥2時(shí)，HN組山羊腸道微生物的生物標(biāo)志物有腸球菌科（Enterococcaceae）、腸球菌屬（Enterococcus）、Family_XIII_UCG_001、Clostridium_methylpentosum_group和unclassified_Clostridium_methylpentosum_group；HY組山羊腸道微生物的生物標(biāo)志物為短促生乳桿菌屬（Levilactobacillus）和顫螺旋菌科未知菌屬（unclassified_Oscillospiraceae）。

2.6腸道微生物與山羊生長(zhǎng)速度的相關(guān)分析結(jié)果

選取山羊腸道微生物群落中相對(duì)豐度排前10的菌門和排名前30的菌屬，分別與山羊體重及平均日增重進(jìn)行Pearson相關(guān)分析，結(jié)果（圖7）表明：在HN組，另枝菌屬（Alistipes）相對(duì)豐度與山羊的體重呈極顯著正相關(guān)（Plt;0.01），與平均日增重呈顯著正相關(guān)（圖7-B）。在HY組，厚壁菌門相對(duì)豐度與山羊的體重及平均日增重呈顯著正相關(guān)（圖7-C）。將2組山羊群體合并為一個(gè)群體進(jìn)行分析，結(jié)果顯示，厚壁菌門相對(duì)豐度與山羊的平均日增重呈顯著正相關(guān)（圖7-E），Monoglobus相對(duì)豐度與山羊的體重呈顯著正相關(guān)（圖7-F）。

3討論

腸道微生物在保障宿主健康及其免疫力方面發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。腸道微生物通過(guò)利用蛋白質(zhì)和碳水化合物進(jìn)行代謝，得到短鏈脂肪酸，而短鏈脂肪酸不僅能供給機(jī)體能量，還可通過(guò)結(jié)合G蛋白偶聯(lián)受體及促進(jìn)組蛋白乙酰化等方式，調(diào)控機(jī)體健康水平，具有抗炎、維持腸道穩(wěn)態(tài)和預(yù)防疾病的功能作用（Simpson and Campbell，2015；Fu et al.，2019；Zhao et al.，2019；van der Hee and Wells，2021）。此外，腸道微生物區(qū)系受飲食、遺傳及外界環(huán)境等因素的影響，而腸道微生物區(qū)系的改變又能進(jìn)一步影響宿主的表型性狀。山羊作為草食動(dòng)物，其飲食結(jié)構(gòu)中膳食纖維占比較高，導(dǎo)致山羊腸道內(nèi)存在大量消化膳食纖維的菌群，以便于將膳食纖維代謝為短鏈脂肪酸，而有利于機(jī)體吸收。本研究中，2組山羊雖然采用統(tǒng)一的飼養(yǎng)管理標(biāo)準(zhǔn)，較好地限制了飲食及環(huán)境等因素對(duì)機(jī)體腸道微生物組成的影響，但其腸道微生物組成仍存在一定差異，由此推測(cè)是努比亞山羊基因的引入致使雜交山羊腸道微生物組成較海南黑山羊有所改變，且這些腸道微生物組成變化或許對(duì)雜交山羊優(yōu)良性狀的形成有促進(jìn)作用。

為了從腸道微生物層面揭示雜交山羊擁有良好生長(zhǎng)性狀的內(nèi)在機(jī)理，本研究分別采集海南黑山羊和海×努雜交山羊的糞便樣本進(jìn)行16S rRNA測(cè)序分析，結(jié)果顯示，在門分類水平上，2組山羊腸道微生物均以厚壁菌門和擬桿菌門為絕對(duì)優(yōu)勢(shì)菌門，與Cao等（2023）的研究結(jié)果一致。厚壁菌門和擬桿菌門作為哺乳動(dòng)物腸道中最具優(yōu)勢(shì)的菌門（Ley et al.，2008），均可分解利用膳食纖維，而增強(qiáng)宿主對(duì)營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的吸收利用（McKee et al.，2021；Sun et al.，2023）。在屬分類水平上，2組山羊腸道的優(yōu)勢(shì)菌屬包括毛螺菌科未知菌屬、毛螺菌科NK4A136菌群、UCG_005及理研菌科RC9腸道菌群等，與Zhi等（2022）的研究結(jié)果相似。毛螺菌科各菌屬和理研菌科RC9腸道菌群均可發(fā)酵膳食纖維及其他糖類，而產(chǎn)生大量短鏈脂肪酸，進(jìn)而調(diào)節(jié)宿主生理功能并提供能量，供宿主生長(zhǎng)所需及日常活動(dòng)消耗（Ahmad etal.，2022；Zaplana et al.，2023）。Monoglo-bus于2017年從人類糞便中首次分離獲得，是一種具有果膠及膳食纖維代謝功能的腸道微生物，可能與機(jī)體的健康相關(guān)（Kimetal.，2017；Li etal.，2024）。本研究發(fā)現(xiàn)，Monoglobus在海×努雜交山羊腸道中的相對(duì)豐度顯著高于海南黑山羊。在海南黑山羊腸道生物標(biāo)志物中，腸球菌科及其腸球菌屬包含多種致病性細(xì)菌（Fiore et al.，2019）；Clostridium_methyl-pentosum_group能以戊糖或甲基戊糖為底物進(jìn)行代謝，而產(chǎn)生短鏈脂肪酸（Himelbloom and Canale-Parola，1989）。在海×努雜交山羊腸道生物標(biāo)志物中，短促生乳桿菌屬是一種常見(jiàn)的益生菌，通常存在于母乳中，可產(chǎn)生大量γ-氨基丁酸，具有增強(qiáng)免疫的作用（Wu and Shah，2017；Duraisamyet al.，2022），故推測(cè)海×努雜交山羊腸道免疫水平高于海南黑山羊。γ-氨基丁酸是一種抑制性神經(jīng)遞質(zhì)，當(dāng)其與受體結(jié)合后可引起鉀離子外流及氯離子內(nèi)流，而導(dǎo)致突觸后膜超極化，降低神經(jīng)元的興奮性。γ-氨基丁酸還具有擴(kuò)張血管、抗氧化、抗抑郁、促進(jìn)生長(zhǎng)激素分泌及抗腫瘤細(xì)胞增殖等功能（Sarasa etal.，2020）。顫螺旋菌科未知菌屬則在膳食纖維的降解過(guò)程中發(fā)揮關(guān)鍵作用，常被認(rèn)為是丁酸鹽的生產(chǎn)者（Rang et al.，2023），可為海×努雜交山羊提供了更好的膳食纖維消化能力。

為進(jìn)一步探究山羊腸道微生物與生長(zhǎng)性狀之間的相關(guān)性，本研究還分別對(duì)2組山羊腸道微生物與體重及平均日增重進(jìn)行Pearson相關(guān)分析，結(jié)果發(fā)現(xiàn)，海×努雜交山羊腸道微生物中的厚壁菌門與體重及平均日增重呈顯著正相關(guān)，可能是厚壁菌門給海×努雜交山羊帶來(lái)更好的膳食纖維代謝功能所致，膳食纖維是山羊飼料最重要的組成部分，較高的厚壁菌門相對(duì)豐度有助于山羊?qū)︼暳系南铡４送猓癖诰T與擬桿菌門比值較高的腸道微生物結(jié)構(gòu)能更好地幫助宿主利用能量，與宿主的肥胖息息相關(guān)（DiBaise etal.，2008）。在海南黑山羊腸道微生物中，另枝菌屬與體重呈極顯著正相關(guān)，與平均日增重呈顯著正相關(guān)。另枝菌屬是一種革蘭氏陰性厭氧菌，其主要代謝產(chǎn)物為乙酸鹽和丙酸鹽，通常與健康的腸道微生物代謝狀態(tài)相關(guān)（Parker et al.，2020；Xu et al.，2022）。另枝菌屬相對(duì)豐度與體重增長(zhǎng)呈正相關(guān)，可能是由于海南黑山羊正處于生長(zhǎng)發(fā)育期，擁有健康穩(wěn)定的代謝狀態(tài)是確保發(fā)育期山羊體重增長(zhǎng)的關(guān)鍵。本研究將2組山羊合并為一個(gè)群體進(jìn)行分析，結(jié)果發(fā)現(xiàn)，厚壁菌門相對(duì)豐度與山羊的平均日增重呈顯著正相關(guān)，Monoglobus相對(duì)豐度與山羊的體重呈顯著正相關(guān)，故推測(cè)Monoglobus的膳食纖維及果膠代謝能力對(duì)山羊生長(zhǎng)發(fā)育有促進(jìn)作用，但其代謝功能及對(duì)宿主機(jī)體的影響仍需進(jìn)一步驗(yàn)證。

4結(jié)論

海南黑山羊與海×努雜交山羊的腸道微生物組成存在一定差異，其中Monoglobus在海×努雜交山羊中的相對(duì)豐度顯著高于海南黑山羊。此外，腸道微生物中的厚壁菌門、另枝菌屬和Monoglobus可能是調(diào)控山羊生長(zhǎng)性能的關(guān)鍵菌群，為育肥山羊靶向型飼料添加劑的選擇提供了新方向。

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（責(zé)任編輯：蘭宗寶）