摘 要 GoPubMed是最新的對PubMed進行智能檢索的工具,本文利用GoPubMed對PubMed收錄的江蘇省血液研究所發表的論文進行了分析。
關鍵詞 GoPubMed PubMed 信息分析
AbstractGoPubMed is the latest,conducting intelligent search tool to PubMed.The text analyzes the papers published by Jiangsu Institute of Hematology,indexed into PubMed by using GoPubMed.
Key WordsGoPubMed;PubMed;information analysis
GoPubMed是德國Transinsight公司開發的生命科學語義搜索引擎,其網址為:http://www.gopubmed.com/。其2008年12月推出的4.0版獲2009年度德國Red Dot設計大獎:傳播設計領域(圖形用戶界面與交互工具)之至尊獎(the best of the best)。該引擎是基于知識和語義計算處理的智能檢索系統。其數據源與美國國立醫學圖書館的PubMed完全一樣,其本身并沒有數據庫,其原理為將讀者檢索提問詞提交給PubMed,接收PubMed的檢索結果,利用GO(gene ontology,GO-基因本體)和MESH(醫學主題詞表)對檢索結果進行提煉,利用算法從中提取GO術語和MESH主題詞,自動生成臨時基因本體和醫學主題詞表,從而對檢索結果進行分類,讀者可以根據這些分類快速找到需要的文獻[1]。
GoPubMed統計分析功能具有對所有檢索結果或單獨對分類類目中的術語在PubMed中檢索得到的文獻進行的統計分析,提供的4W分析(What,Who,Where,When)可以直觀地提供給我們包括對檢索到文獻從年代分布、核心著者、核心期刊、著者分布的可視化地圖。
資料與方法
由于GoPubMed的數據源取自PubMed,故我們研究的對象論文為江蘇省血液研究所(Jiangsu Institute of Hematology)發表的被PubMed收錄的論文。
研究方法:使用GoPubMed檢索引擎,輸入檢索詞“Jiangsu Institute of Hematology”進行檢索,并對檢索結果進行分析。
圖2 Who分析顯示核心作者
圖5Who分析的研究者合作關系網絡
圖6When分析的發表文獻時間分布和趨勢
圖8Where分析的世界地理分布
結 果
檢索出相關文獻323篇。What分析:顯示該所的研究內容與研究方向主要為白血病、基因表達、骨髓移植、抗原電泳實驗、淋巴胚前體細胞白血病、細胞遺傳學等(圖1)。
圖1 What分析顯示研究方向
Who分析:該所的核心作者:阮長耿教授-資深作者(Senior Author)(圖2)。
核心作者群:阮長耿教授、薛永權教授、陳子興教授。其他高產作者還有潘金蘭、岑建農、白霞、王兆鉞、吳德沛、吳亞芳等(圖3)。
論文發表的核心期刊:依次為中華血液學雜志(77篇),中國實驗血液學雜志(45篇),中華醫學雜志(20篇),中華醫學遺傳學雜志(18篇),中華內科雜志(17篇)等(圖4)。
該所研究人員的合作關系網絡圖,見圖5。
圖4Who分析的核心期刊
When分析:該所發表文獻時間分布和趨勢(圖6)。
Where分析:江蘇省血液研究所研究成果的世界地理分布圖(圖7、8)。
圖7 Where分析的國家和城市分布
討 論
GoPubMed是優秀的智能檢索工具。不僅可以對一個研究機構發表的文獻進行分析從而揭示其研究方向、核心作者、研究趨勢等,還可以針對某一研究課題進行分析,總結出該課題領域的最新相關情況。必將在醫學研究中越來越多地發揮重要作用。
參考文獻
1 許培揚,張玢.GoPubMed用于醫學科技查新的信息分析[J].醫學信息學雜志,2008,29(10):25-29.
圖3 Who分析的核心作者群