Hsa-miR-486 -5p 的腫瘤及細(xì)胞骨架相關(guān)靶基因的預(yù)測分析

孫慧燕 楊曉明 王立生

microRNAs(miRNAs)是大小為19 ～25bp 的非編碼小RNA，其可以在轉(zhuǎn)錄后和(或)轉(zhuǎn)錄水平負(fù)調(diào)控靶基因的表達(dá)［1，2］。Hsa-miR-486 -5p 是由鄭曉飛教授課題組于2005 年利用人胎肝組織研究microRNA 鑒定方法時(shí)首先鑒定并注冊的5 種新microRNAs(miR-483 ～miR -487)之一［3］。目前，關(guān)于miR -486 的表達(dá)及生物學(xué)功能的文獻(xiàn)報(bào)道非常有限。2010 年，由Olson 所指導(dǎo)課題組在Proc Natl Acad Sci上闡明miR -486 在肌肉高表達(dá)，并可能是PI3K/AKT 的調(diào)控基因，預(yù)言miR -486 在肌肉萎縮的病理生理過程中起重要作用［4］。2011 年，由Kunke 所指導(dǎo)課題組在《Skeletal Muscle》雜志上進(jìn)一步闡明miR-486 在杜興肌肉營養(yǎng)不良癥(duchenne muscular dystrophy，DMD)的病理過程中起到重要調(diào)控作用［5］。在這兩篇文章中都提到miR -486 的宿主基因?yàn)锳NK1，而后者屬于錨蛋白家族，與細(xì)胞骨架運(yùn)動(dòng)密切相關(guān)。Kim 等［6］認(rèn)為，miR -486 -5p 是SIRT1 的內(nèi)源性抑制劑，能誘導(dǎo)人脂肪組織來源的間充質(zhì)干細(xì)胞(human adipose tissue - derived mesenchymal stem cells，hAT - MSCs)復(fù)制性衰老，而SIRT1 被證實(shí)是miR-486 -5p 的靶基因。有研究者認(rèn)為，miR -486在胃癌中是一新的抑癌miRNA，其靶基因?yàn)榭沟蛲龌騉LFM4［7］。PNAS 提到miR-486 在肺癌中表達(dá)降低，其靶基因?yàn)橐葝u素生長因子信號(hào)途徑中的IGF1、IGF1R 及PIK3R1 等，miR -486 很可能是肺癌的一個(gè)新的抑癌基因［8］。目前，對miR -486 的認(rèn)識(shí)還很不清楚，甚至在不同的組織其作用是相反的。因此，有必要借助生物信息學(xué)的一些預(yù)測軟件結(jié)合筆者的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，以利于得出更客觀的結(jié)論。TargetScan 是由MIT 提供的在線對microRNAs 進(jìn)行靶基因預(yù)測的軟件之一，其能鏈接microRNA 相應(yīng)靶基因的研究數(shù)據(jù)，并能提供靶基因3'UTRs 相關(guān)信息。在筆者的實(shí)驗(yàn)過程中，發(fā)現(xiàn)miR -486 對癌細(xì)胞的遷移、增殖和細(xì)胞形態(tài)產(chǎn)生了影響。因此，利用TargetScan 5.2 軟件對其促癌及細(xì)胞骨架相關(guān)靶基因進(jìn)行了預(yù)測研究，以期對miR -486 的進(jìn)一步研究起到指導(dǎo)作用。……