Hsa-miR-486 -5p 的腫瘤及細胞骨架相關靶基因的預測分析

孫慧燕 楊曉明 王立生

microRNAs(miRNAs)是大小為19 ～25bp 的非編碼小RNA，其可以在轉錄后和(或)轉錄水平負調控靶基因的表達［1，2］。Hsa-miR-486 -5p 是由鄭曉飛教授課題組于2005 年利用人胎肝組織研究microRNA 鑒定方法時首先鑒定并注冊的5 種新microRNAs(miR-483 ～miR -487)之一［3］。目前，關于miR -486 的表達及生物學功能的文獻報道非常有限。2010 年，由Olson 所指導課題組在Proc Natl Acad Sci上闡明miR -486 在肌肉高表達，并可能是PI3K/AKT 的調控基因，預言miR -486 在肌肉萎縮的病理生理過程中起重要作用［4］。2011 年，由Kunke 所指導課題組在《Skeletal Muscle》雜志上進一步闡明miR-486 在杜興肌肉營養不良癥(duchenne muscular dystrophy，DMD)的病理過程中起到重要調控作用［5］。在這兩篇文章中都提到miR -486 的宿主基因為ANK1，而后者屬于錨蛋白家族，與細胞骨架運動密切相關。Kim 等［6］認為，miR -486 -5p 是SIRT1 的內源性抑制劑，能誘導人脂肪組織來源的間充質干細胞(human adipose tissue - derived mesenchymal stem cells，hAT - MSCs)復制性衰老，而SIRT1 被證實是miR-486 -5p 的靶基因。有研究者認為，miR -486在胃癌中是一新的抑癌miRNA，其靶基因為抗凋亡基因OLFM4［7］。PNAS 提到miR-486 在肺癌中表達降低，其靶基因為胰島素生長因子信號途徑中的IGF1、IGF1R 及PIK3R1 等，miR -486 很可能是肺癌的一個新的抑癌基因［8］。目前，對miR -486 的認識還很不清楚，甚至在不同的組織其作用是相反的。因此，有必要借助生物信息學的一些預測軟件結合筆者的實驗數據進行分析，以利于得出更客觀的結論。TargetScan 是由MIT 提供的在線對microRNAs 進行靶基因預測的軟件之一，其能鏈接microRNA 相應靶基因的研究數據，并能提供靶基因3'UTRs 相關信息。在筆者的實驗過程中，發現miR -486 對癌細胞的遷移、增殖和細胞形態產生了影響。因此，利用TargetScan 5.2 軟件對其促癌及細胞骨架相關靶基因進行了預測研究，以期對miR -486 的進一步研究起到指導作用。……