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BET家族基因表達與惡性腫瘤患者總生存期及臨床病理特征的關系

2016-09-07 01:32:02王婧文納飛飛薛建新四川大學華西醫院華西臨床醫學院四川成都6004四川大學華西醫院腫瘤中心胸部腫瘤科四川成都6004
中國醫藥導報 2016年2期
關鍵詞:胃癌乳腺癌

王婧文 唐 菲 鄧 磊,2 納飛飛,2 薛建新,2 盧 鈾,2.四川大學華西醫院 華西臨床醫學院,四川成都 6004;2.四川大學華西醫院腫瘤中心胸部腫瘤科,四川成都 6004

BET家族基因表達與惡性腫瘤患者總生存期及臨床病理特征的關系

王婧文1唐菲1鄧磊1,2納飛飛1,2薛建新1,2盧鈾1,2
1.四川大學華西醫院華西臨床醫學院,四川成都610041;
2.四川大學華西醫院腫瘤中心胸部腫瘤科,四川成都610041

目的 探討新興腫瘤治療靶點bromodomain and extra-terminal(BET)家族基因表達與多種實體惡性腫瘤患者預后及臨床病理特征的關系。方法 使用美國Kaplan Meier plotter在線數據庫,采集腫瘤樣本BET家族基因mRNA水平表達數據及患者臨床數據,在線完成生存分析。 結果 胃癌中,BRD2/BRD3/BRDT高表達組患者總生存期顯著下降(均P<0.01)。這一相關性在乳腺癌中僅見于Luminal B型及HER2+型患者。在肺癌中,鱗癌患者生存期與BET家族基因表達無顯著相關性,腺癌患者生存與BRD3正相關 [風險比95%CI(HR 95%CI):0.22~0.43],與BRDT負相關(HR 95%CI:1.08~1.78)。卵巢癌患者預后與BET家族基因表達正相關(BRD2 HR 95%CI:0.70~0.91,BRD3 HR 95%CI:0.76~1.00,BRDT HR 95%CI:0.71~0.93)。結論 BET家族基因高表達提示胃癌及部分乳腺癌患者預后不良,但在肺癌及卵巢癌中并不提示生存期下降。

BET家族;胃癌;肺癌;乳腺癌;卵巢癌;總生存期

含溴區結構域蛋白(bromodomain proteins,BRD)是細胞賴氨酸殘基乙酰化相關的主要蛋白家族[1],后者是蛋白質翻譯后修飾的重要方式,其功能失調可引起癌基因異常表達與腫瘤形成[2-3]。目前,BRD家族中的亞類bromodomain and extra-terminal(BET)蛋白家族被發現與多種惡性腫瘤的發生發展相關[4]。BET包括廣泛表達的BRD2,BRD3,BRD4及正常情況下僅表達于睪丸組織的BRDT。該家族直接調節MYC家族基因表達,而MYC擴增或過表達在多種血液腫瘤[5-9]和肺癌、胃癌、乳腺癌[10]等實體腫瘤中均為常見突變。此外,BRD3、BRD4還被發現參與惡性腫瘤中睪丸核蛋白基因(NUT基因)相關融合基因的形成[11]。

目前,靶向BET的小分子抑制劑已被應用于腫瘤治療研究,多項血液腫瘤研究取得積極結果[12],乳腺癌[13]、膠質母細胞瘤[14]及胰腺癌[15]等實體瘤臨床前研究也顯示BET抑制劑有效抑制腫瘤生長。在小鼠原發胰腺癌模型研究中,BET抑制劑JQ1展現了比標準化療藥物吉西他濱更為顯著的抑瘤效果。但在現有研究結果中,BET抑制劑在多種腫瘤中只對部分細胞系有效,其機制尚不明朗。研究患者預后及病理特征與特定基因表達的關系可能有助于發現與治療敏感性相關的因素,而目前除1例膀胱癌研究外[16],并無實體腫瘤BET水平與臨床數據的報告。本研究基于Kaplan Meier plotter在線開放數據庫(www.kmplot. com),對實體惡性腫瘤患者預后及臨床病理特征與BET水平的相關性進行了大樣本研究。

1 材料與方法

1.1數據庫

Kaplan Meier plotter建庫方法如前期文獻所述[17-19]。數據庫目前包含10 188例樣本,54 675個基因由微陣列檢測技術得出的mRNA水平表達數據。其中乳腺癌4142例,中位隨訪時間69個月;肺癌2437例,中位隨訪時間40個月;卵巢癌1648例,中位隨訪時間49個月;胃癌1065例,中位隨訪時間33個月。并非所有病例包含完整臨床信息。

1.2數據采集

研究數據采集于2015年10月,數據庫包含BRD2、BRD3及BRDT數據,不包含BRD4數據。基因水平、臨床病理及總生存期信息完整的樣本被納入統計。

1.3統計學方法

總生存期(overall survival,OS)為截至死亡或末次隨訪時間。生存分析采用Kaplan-Meier法,組間差異比較基于Log-rank檢驗,以P<0.05為差異有統計學意義。各組高-低表達cut-off值為基于ROC (receiver operating characteristic)曲線分析的最優值。統計分析及最優值計算均在數據庫中在線完成。

2 結果

2.1BET基因表達與預后

生存分析共納入胃癌876例,肺癌1926例,卵巢癌1582例,乳腺癌1117例。

2.2.1胃癌胃癌患者中,BRD2/BRD3/BRDT高表達組患者總生存期顯著下降(均P<0.01),BRD2、BRD3 及BRDT高表達均為OS的不良預后因素 (圖1),風險比(HR)分別為1.63(95%CI:1.34~1.97)、1.27(95% CI:1.07~1.52)及1.51(95%CI:1.27~1.78)。根據臨床病理特征進行亞組分析(表1)后發現:TNM總分期Ⅰ~Ⅱ期患者中,僅有BRD3表達與Ⅰ期患者預后達到統計相關,而在Ⅲ~Ⅳ期患者中,僅有BRD3與Ⅳ期患者生存的相關性無統計學意義(P>0.05);在淋巴結轉移陰性的患者中,僅有BRD3(HR:2.69,95%CI:1.12~6.43)與OS顯著相關,而在淋巴結轉移陽性患者中3個檢測基因均與OS統計學相關;在HER2陰性的患者中3個基因高表達均提示不良預后,而HER2陽性患者中僅有BRD2與OS顯著相關。

圖1 BET家族基因表達與胃癌患者總生存期的關系

表1 BET家族基因表達對各臨床病理類型胃癌患者總生存期的預后價值

在肺癌整體生存分析(表2)中,BRD3高表達提示預后較好(HR 95%CI:0.51~0.70),BRD2、BRDT與OS無明顯相關。亞組分析提示,肺鱗癌預后與BET基因表達無顯著相關性,但在肺腺癌中BRD3高表達患者預后顯著優于低表達患者 (HR 95%CI:0.22~0.43),而BRDT高表達則提示預后不良(HR 95%CI:1.08~1.78)。

在乳腺癌患者整體生存分析(表2)中,BET家族均未體現與患者生存的相關性。但在亞組分析中,BRD2、BRD3高表達可提示Luminal B型及HER2+型患者預后不良,BRD3高表達還與基底細胞樣癌預后不良相關。在卵巢癌患者中(表2),BET家族基因高表達提示患者預后更好(BRD2 HR 95%CI:0.70~0.91,BRD3 HR 95%CI:0.76~1.00,BRDT HR 95%CI:0.71~0.93)。

表2 BET家族基因表達與肺癌、卵巢癌及乳腺癌患者總生存期的關系

2.2BET表達與胃癌、乳腺癌患者臨床病理特征的關系

因無法獲取原始數據進行均值計算及組間比較,本研究僅記錄各亞組基因表達中位值作為參考。在胃癌(表3)患者中,BRD2及BRDT水平在HER2陽性、陰性及不同Lauren分型的亞組患者中可能存在一定差異。而在乳腺癌 (表4)患者中,BRD2、BRD3及BRDT均顯示在不同亞組間有較為明顯的差異趨勢:在性激素受體陽性的Luminal A型及Luminal B型患者中,3個基因表達水平均高于性激素受體陰性的HER2+型及基底細胞癌型患者;TP53野生型患者BET家族基因表達水平也整體高于TP53突變型患者。

表3 胃癌各臨床病理類型中BET家族基因表達(中位值)

表4 乳腺癌各臨床病理亞組中BET家族基因表達(中位值)

3 討論

BET家族已成為新興的腫瘤治療靶點,自2013年起已有數項一期臨床試驗(NCT01587703,NCT 01713582,NCT01949883,NCT01987362,NCT01943851)開展。在大多數情況下,治療靶點基因表達陽性/表達水平較高的患者更可能從治療中獲益。因此,BET家族基因表達與惡性腫瘤患者生存期和臨床病理特征的研究可能有助于發現對治療敏感的群體。

本研究發現,BET基因高表達與胃癌患者預后不良相關,這一結果與前期文獻中BRD4在膀胱癌患者中的預后意義一致[16]。亞組分析提示,相較于HER2陽性患者,HER2陰性胃癌患者生存與BET基因表達有更普遍的相關性。在整體分析未表現出BET基因預后意義的乳腺癌患者中,生存期與BRD2/BRD3相關的亞組為HER2+及Luminal B型 (含HER2陽性、HER2陰性)。以上結果提示BET家族可能與HER2有一定關聯,但目前尚無相關研究,有待進一步探索。對BET基因表達與乳腺癌患者病理特征的觀察還提示,TP53野生型患者BET基因表達水平明顯較高;而在血液系統腫瘤前期研究中曾有研究者發現,TP53野生型的急性髓系白血病細胞系對BET小分子抑制劑JQ1更為敏感[20]。肺腺癌及卵巢癌中發現的BET表達水平與患者預后正相關,則尚需進一步機制研究探討。

值得注意的是,基于mRNA水平的統計結果仍需要蛋白水平的驗證支持。除此之外,BRD4是BET家族中研究最多、最為深入的基因,但該數據庫中的樣本未進行該基因的檢測。以上問題需要進一步的基于臨床標本的大樣本研究予以解決。

綜上所述,本研究結果提示BET家族基因高表達在胃癌患者及部分乳腺癌患者中提示不良預后,而在肺腺癌、卵巢癌患者中卻與更長的總生存期相關,為BET小分子抑制劑在實體瘤中的研究對象選擇提供了參考依據。

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Association of BET family expression with overall survival and clinicopathological factors in malignant tumor patients

WANG Jingwen1TANG Fei1DENG Lei1,2NA Feifei1,2XUE Jianxin1,2LU You1,2
1.West China Hospital West China School of Clinical Medicine,Sichuan University,Sichuan Province,Chengdu610041,China;2.Department of Thoracic Oncology,Cancer Center,West China Hospital,Sichuan University,Sichuan Province,Chengdu610041,China

Objective To evaluate the association between a potential therapeutic target,bromodomain and extra-terminal(BET)family,and the prognosis and clinicopathological features in malignant solid tumor patients.Methods Online cancer database(Kaplan Meier plotter)was used to retrieve data of BET family expression and clinicopathological information,all the survival analysis were performed on the database system.Results Higher expression of BRD2,BRD3 and BRDT were significantly correlated with worse overall survival in gastric patients(all P<0.01),while this correlation was only also identified in Luminal B and HER2+(intrinsic subtype)breast cancer.In lung cancer,squamous cells carcinoma patients' survival were not significantly associated with BET expression,but adenocarcinoma patients' survival were positive correlated with BRD3[Hazard Ratio 95%CI(HR 95%CI:0.22-0.43)and negative correlated with BRDT(HR 95%CI:1.08-1.78).In ovarian cancer patients,the overall survival was positive correlated with all the three members(BRD2 HR 95%CI:0.70-0.91,BRD3 HR 95%CI:0.76-1.00,BRDT HR 95%CI:0.71-0.93). Conclusion Higher expression of BET family predicts poor prognosis in gastric cancer patients and HER2+/basal-like breast cancer patients,but not in lung cancer and ovarian cancer patients.

BET family;Gastric cancer;Lung cancer;Breast cancer;Ovarian cancer;Overall survival

R73

A

1673-7210(2016)01(b)-0069-05

2015-10-08本文編輯:蘇暢)

國家自然科學基金面上項目(81472808)。

王婧文(1989.10-),女,博士;研究方向:放射性肺損傷。

盧鈾(1964.10-),男,碩士,教授,博士研究生導師,四川大學華西醫院腫瘤中心胸部腫瘤科主任;研究方向:腫瘤放療及綜合治療。

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