云南漢族15個短串聯重復序列基因座遺傳多態性特征及分析①

靳嬋嬋　賀　靜　王　蕾　陳　鵬　楊繼青　李秀玲　蘇　潔　朱寶生

(云南省第一人民醫院遺傳診斷中心，云南省出生缺陷與遺傳病重點實驗室，昆明650032)

?

云南漢族15個短串聯重復序列基因座遺傳多態性特征及分析①

靳嬋嬋賀靜王蕾陳鵬②楊繼青李秀玲蘇潔朱寶生

(云南省第一人民醫院遺傳診斷中心，云南省出生缺陷與遺傳病重點實驗室，昆明650032)

目的：調查云南地區漢族的D8S1179、D21S11、D7S820、CSF1PO、D3S1358、TH01、D13S317、D16S539、D2S1338、D19S433、VWA、TPOX、D18S51、D5S818、FGA 15個短串聯重復序列(Short tandem repeat,STR)基因座的遺傳多態性。方法：收集云南漢族313名無關個體血樣，提取DNA，PCR復合擴增并利用ABI-3130型基因分析儀進行毛細管電泳檢測每個樣本各基因座的等位基因大小，分別統計每個STR基因座各基因型的頻率，并進行Hardy-Weinberg遺傳平衡檢驗。結果：云南漢族這15個STR基因座各基因型頻率分布符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)，雜合度在0.636～0.901，匹配概率在0.034～0.220，單一STR位點的個體識別率在0.780～0.966、非父排除率在0.336～0.797、多態性信息總量在0.555～0.860，聯合使用這15個位點所產生的累積個體識別率大于0.999 999 99，累積非父排除率等于0.999 998 408。與中國其他地區漢族群體這15個STR基因座等位基因頻率分布相比有較高的相似性，但也有輕微的地區差異。結論：云南漢族的D8S1179、D21S11、D7S820、CSF1PO、D3S1358、TH01、D13S317、D16S539、D2S1338、D19S433、VWA、TPOX、D18S51、D5S818、FGA這15個STR基因座具有高度的多態性，與中國其他地區漢族群體有較高的相似性，在法醫學中的親子鑒定和個人識別方面具有較高應用價值。

短串聯重復序列；遺傳多態性；等位基因頻率；雜合度；法醫學

短串聯重復序列(Short tandem repeat,STR)又被稱為微衛星DNA重復序列(microsatellite repeat sequence)或簡單序列重復(Simple sequence repeats,SSRs)，是由2～6個堿基對簡單重復序列串聯形成的DNA序列，在個體之間其拷貝重復數不同就構成了群體中的復等位基因，是人類基因組中最常見的多態性位點[1]。STR基因座廣泛分布于人類基因組，在人類基因組中穩定遺傳，是理想的遺傳標記物。在同一群體中各基因座的等位基因頻率相對穩定，符合遺傳平衡定律(即Hardy-Weinberg定律)。因此，STR遺傳標記的基因分型廣泛應用于遺傳連鎖分析、法醫學DNA數據庫、個體識別、親子鑒定、遺傳制圖、遺傳距離等多個研究領域[2]。本文檢測云南漢族人群的D8S1179、D21S11、D7S820、CSF1PO、D3S1358、TH01、D13S317、D16S539、D2S1338、D19S433、VWA、TPOX、D18S51、D5S818、FGA 15個STR基因座遺傳多態性，通過遺傳平衡檢驗，并與中國其他地區漢族群體及國外其他人群的資料比較不同人群間各基因座的雜合度，探討這15個STR基因座的法醫鑒定應用價值，為其應用提供數據基礎。

1　材料與方法

1.1材料

1.1.1樣本采集對2010年7月到2014年7月在我實驗室進行親子鑒定的共358個案例，其中包括三聯體鑒定191例，二聯體鑒定167例進行分析。抽取受檢人的外周血2 ml EDTA抗凝，采用西安天隆科技有限公司的核酸儀NP968及西安天隆科技有限公司的核酸提取試劑盒，按試劑盒操作步驟提取全血基因組DNA。采用NanoDrop2000超微量分光光度計在190～840 nm光譜測定所提取DNA的濃度及純度，在PCR擴增前將樣品DNA濃度稀釋至20 ng/μl。

1.2方法

1.2.1PCR擴增用AmpFlSTRIdentifiler試劑盒(ApplieBiosysetem,ABI)對15個STR位點(D8S1179、D21S11、D7S820、CSF1PO、D3S1358、TH01、D13S317、D16S539、D2S1338、D19S433、VWA、TPOX、D18S51、D5S818、FGA)進行PCR擴增，同時加入一個Amelogenin性別基因座擴增，作為內部質控和DNA樣本性別檢測。總反應體積10 μl，包括：緩沖液4 μl，引物2 μl，Taq酶1.6 μl，模板DNA 2 μl，無菌去離子水0.4 μl。用ABI 2720型PCR儀擴增，熱循環參數為：95℃預變性11 min，94℃變性1 min、59℃復性1 min、72℃延伸1 min共28個循環，最后60℃延伸60 min。擴增產物4℃保存待檢。

1.2.2毛細管電泳檢測取PCR擴增產物1 μl，加入9 μl LIZ size standard(ABI,USA)甲酰胺混合液(LIZ size standard∶甲酰胺=1∶17)，振蕩混勻后離心；ABI-3130 Genetic Analyzer，POP4(ABI,USA)進行毛細管電泳檢測。檢測結果應用GeneMapperID v3.2軟件(ABI)分析。

1.3統計學分析選擇以上受檢者中313例云南地區漢族無親緣關系個體建立15個STR基因座數據資料，其中男性197名，女性116名。利用Modified-powerstate軟件[3]進行Hardy-Weinberg平衡檢驗，并計算基因頻率(Gene frequency)、雜合度(Heterozygosity,H)、匹配概率(Probability of match,Pm)、個體識別率(Discrimination power,DP)、非父排除率(Power of exclusion,PE)、多態性信息總量(Polymorphism information content,PIC)。累積個體識別率(Total probability of discrimination power,TDP)=1-(1-DP1)(1-DP2)(1-DP3)…(1-DP15)；累積非父排除率(Cumulate Power of Exclusion,CPE)=1-(1-PE1)(1-PE2)(1-PE3)…(1-PE15)。在上述數據的基礎上，應用SPSS19.0軟件對本組云南漢族人群分別與文獻報道的四川(n=210)[4]、廣州(n=156)[5]、浙江(n=598)[6]、臺灣(n=189)[7]、河南(n=274)[8]、濟南(n=420)[9]、新疆(n=269)[10]、遼寧(n=141)[11]、天津(n=57)[12]、山西(n=109)[13]、內蒙古(n=129)[14]、江西(n=200)[15]、海南(n=200)[16]、湖北(n=305)[17]、貴州(n=108)[18]、吉林(n=103)[19]、黑龍江(n=221)[20]、河北(n=345)[21]、江蘇(n=120)[22]、安徽(n=1 000)[23]、陜西(n=446)[24]、福建(n=122)[25]、甘肅(n=215)[26]云南(n=20 204)[27]、湖南(n=288)[28]地區漢族相同檢測基因座的等位基因頻率分布差異進行比較，P<0.05為差異具有統計學意義。

2　結果

2.1云南漢族人群中15個STR基因座的復等位基因型本文云南漢族人群中15個STR基因座的復等位基因型結果如圖1所示，每一個實心豎線表示人類該基因座可見的等位基因。其中STR基因座擴增產物樣本是純合子時為單峰，樣本是雜合子時為雙峰，A1～A4為某男性受檢人的實際檢出結果，B1～B4為某女性受檢人的實際檢出結果。A1至A4從左至右依次為某男性受檢人的D8S1179、D21S11、D7S820、CSF1PO、D3S1358、TH01、D13S317、D16S539、D2S1 338、D19S433、VWA、TPOX、D18S51、Amelogenin、D5S818和FGA基因型。B1至B4為某女性受檢人這15個位點的基因型。Amelogenin為性別識別基因座，男性為雙峰，女性為單峰。

2.2云南漢族人群15個STR基因座的等位基因分布和等位基因頻率本文313份云南漢族人群無關個體DNA樣本的15個STR位點等位基因分布及基因頻率見表1。其中，在D8S1179基因座上檢出等位基因9個，基因型分布36種；D21S11基因座上檢出等位基因15個，基因型分布53種；D7S820基因座上檢出等位基因8個，基因型分布23種；CSF1PO基因座上檢出等位基因8個，基因型分布22種；D3S1358基因座上檢出等位基因8個，基因型分布19種；TH01基因座上檢出等位基因9個，基因型分布24種；D13S317基因座上檢出等位基因8個，基因型分布24種；D16S539基因座上檢出等位基因7個，基因型分布21種；D2S1338基因座上檢出等位基因12個，基因型分布50種；D19S433基因座上檢出等位基因16個，基因型分布45種；VWA基因座上檢出等位基因10個，基因型分布29種；TPOX基因座上檢出等位基因8個，基因型分布15種；D18S51基因座上檢出等位基因19個，基因型分布57種；D5S818 基因座上檢出等位基因11個，基因型分布26種；FGA基因座上檢出等位基因24個，基因型分布80種。利用Modified-powerstate軟件分析，將每個樣本各基因座的等位基因型輸入數據表中，得出各基因座的(復)等位基因分布的遺傳平衡假設的卡方檢驗值，若P>0.05則表明群體中該基因座各等位基因的分布符合Hardy-Weinberg平衡。

圖1　15個STR基因座的基因分型圖Fig.1　Genotyping results of fifteen STR loci

表1云南地區漢族群體15個STR等位基因頻率及Hardy-Weinberg平衡檢驗

Tab.1Allele frequences and Hardy-Weinberg Equilibrium test of 15 STR loci in Yunnan Han population

D8S1179AFD21S11AFD7S820AFCSF1POAFD3S1358AF100.112270.00270.00270.003130.002110.063280.03580.17190.053140.035120.13828.20.00690.062100.246150.374130.232290.264100.169110.246160.326140.20029.20.008110.296120.369170.193150.167300.251120.249130.069180.061160.07130.20.026130.046140.011190.008170.014310.123140.005150.003200.002180.00331.20.073320.03232.20.117330.00333.20.054340.00234.20.005χ2=0.259χ2=1.240χ2=0.834χ2=0.039χ2=0.012P=0.611P=0.265P=0.361P=0.844P=0.913

TH01AFD13S317AFD16S539AFD2S1338AFD19S433AF50.00870.00280.011160.00510.20.00260.08580.31590.270170.075110.0036.30.00690.133100.123180.091120.05470.252100.129110.268190.18112.20.00280.051110.238120.222200.133130.2708.30.013120.136130.093210.02713.20.05990.498130.038140.013220.035140.2569.30.042140.010230.20114.20.088100.045240.161150.065250.07515.20.145260.010160.011270.00616.20.03817.20.002180.00218.20.00225.50.002χ2=2.336χ2=0.259χ2=0.082χ2=2.243χ2=3.834P=0.126P=0.610P=0.774P=0.134P=0.050

VWAAFTPOXAFD18S51AFD5S818AFFGAAF130.00270.00270.00270.022100.002140.24080.52690.00290.075130.002150.02290.134110.003100.18817.20.00215.20.002100.008120.032110.302180.042160.171110.296130.198120.252190.046170.232120.032140.232130.144200.048180.219130.002150.176140.01020.20.00518.20.003170.002160.118150.002210.129190.10116.20.003170.00221.20.003200.010170.080210.002220.157180.043220.00222.20.014190.032230.216200.02423.20.011210.035240.152220.01124.20.011230.002250.093240.00525.20.008250.002260.038260.00226.20.002270.008280.006290.00330.20.00232.20.002χ2=0.165χ2=0.403χ2=0.006χ2=0.007χ2=2.107P=0.685P=0.525P=0.940P=0.932P=0.147

Note：A.Allele；F.Frequency.

2.3云南漢族人群15個STR基因座的群體遺傳學參數根據各位點的等位基因多態性，利用Modified-powerstate軟件計算各位點的Pm、PD、PE、PIC、H，以上15個STR位點的Pm在0.034～0.220之間，PD在0.780～0.966之間，PE在0.336～0.797之間，PIC在0.555～0.860之間，H在0.636～0.901之間。這15個STR基因座之間無連鎖遺傳關系，計算的TDP大于0.999 999 99，CPE等于0.999 998 408。提示這15個STR對云南漢族在法醫學中的親子鑒定和個人識別具有較高應用價值，見表2。

2.4云南漢族人群與國內其他地區漢族的等位基因頻率分布比較本文云南漢族人群15個STR基因座與文獻報道的其他地區漢族人群等位基因頻率差異比較得出，云南與四川比較有11個基因座差異具有統計學意義(P<0.05)、與廣州比較有14個基因座差異具有統計學意義(P<0.05)、與浙江比較有5個基因座差異具有統計學意義(P<0.05)、與河南比較有8個基因座差異具有統計學意義(P<0.05)、與濟南比較差異都具有統計學意義(P<0.05)、與新疆比較有10個基因座差異具有統計學意義(P<0.05)、與遼寧比較有14個基因座差異具有統計學意義(P<0.05)，與臺灣13個STR基因座進行比較有10個基因座差異具有統計學意義(P<0.05)，與云南13個STR基因座進行比較有一個基因座差異具有統計學意義(P<0.05)，與天津14個STR基因座進行比較均具有統計學意義(P<0.05)，與山西7個STR基因座進行比較均具有統計學意義(P<0.05)，與內蒙古14個STR基因座進行比較有12個基因座差異具有統計學意義(P<0.05)，與江西15個STR基因座進行比較有10個基因座差異具有統計學意義(P<0.05)，與海南12個STR基因座進行比較有9個基因座差異具有統計學意義(P<0.05)，與湖北15個STR基因座進行比較有7個基因座差異具有統計學意義(P<0.05)，與貴州6個STR基因座進行比較有4個基因座差異具有統計學意義(P<0.05)，與吉林8個STR基因座進行比較均具有統計學意義(P<0.05)，與黑龍江15個STR基因座進行比較有9個基因座差異具有統計學意義(P<0.05)，與河北15個STR基因座進行比較有8個基因座差異具有統計學意義(P<0.05)，與江蘇15個STR基因座進行比較有13個基因座差異具有統計學意義(P<0.05)，與安徽13個STR基因座進行比較有2個基因座差異具有統計學意義(P<0.05)，與陜西15個STR基因座進行比較有3個基因座差異具有統計學意義(P<0.05)，與福建15個STR基因座進行比較有13個基因座差異具有統計學意義(P<0.05)，與甘肅15個STR基因座進行比較有11個基因座差異具有統計學意義(P<0.05)、與湖南13個STR基因座進行比較有9個基因座差異具有統計學意義(P<0.05)。具體見表3。因為每個地區研究的STR位點不同，所以在比較顯著性差異時，用本文云南漢族人群與其他25個地區漢族研究相同的STR基因座比較所得卡方值的平均數作圖，卡方值的平均數由小到大依次為：云南(χ2=13.46)、安徽(χ2=16.26)、陜西(χ2=18.56)、浙江(χ2=18.80)、湖北(χ2=19.51)、湖南(χ2=24.42)、貴州(χ2=25.47)、江西(χ2=26.99)、臺灣(χ2=29.88)、河北(χ2=30.94)、內蒙古(χ2=32.78)、海南(χ2=35.26)、四川(χ2=35.56)、甘肅(χ2=38.80)、新疆(χ2=39.83)、山西(χ2=43.97)、江蘇(χ2=44.94)、廣州(χ2=48.86)、遼寧(χ2=51.11)、黑龍江(χ2=67.21)、吉林(χ2=82.37)、福建(χ2=84.28)、天津(χ2=101.62)、濟南(χ2=107.10)、河南(χ2=147.17)。見圖2。西藏、青海、寧夏、廣西因缺乏相應文獻而無法比較。

表2云南漢族15個STR基因座的群體遺傳學數據(n=313)

Tab.2Population genetic data of fifteen STR loci in Yunnan Han population (n=313)

LociPmDPPEPICH(%)D8S11790.0510.9490.6940.81784.9D21S110.0530.9470.6090.80780.5D7S8200.0800.9200.5390.75476.7CSF1PO0.1180.8820.4950.69174.1D3S13580.1360.8640.4530.66171.6TH010.1510.8490.4530.6371.6D13S3170.0730.9270.5620.76078.0D16S5390.0810.9190.5560.74777.6D2S13380.0370.9630.6630.84683.4D19S4330.0560.9440.5620.79978.0VWA0.0740.9260.6210.77181.2TPOX0.2200.7800.3360.55563.6D18S510.0430.9570.6950.83385.0D5S8180.0820.9180.5730.75078.6FGA0.0340.9660.7970.86090.1

Note：Pm.Probability of match；DP.Discrimination power；PE.Power of exclusion；PIC.Polymorphism information content；H.Heterozygosity.

表3云南漢族人群(n=313)與其他地區漢族人群15個基因座基因頻率比較

Tab.3Comparison of fifteen STR loci frequency among Han population in Yunnan and other areas

LociSichuan[4](n=210)Guangzhou[5](n=156)Zhejiang[6](n=598)Taiwan[7](n=189)Henan[8](n=274)Jinan[9](n=420)Xinjiang[10](n=269)Liaoning[11](n=141)D8S11790.0070.0000.5550.0000.1730.0000.7540.005D21S110.2600.0000.0020.0000.0000.0030.0000.000D7S8200.0000.0000.3130.0480.1860.0200.1030.000CSF1PO0.0000.0660.2030.0310.5940.0000.1560.026D3S13580.0060.0000.5540.0630.4580.0000.3640.000TH010.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.000D13S3170.4330.0320.4960.2070.0660.0000.0000.000D16S5390.9230.0040.2440.0730.2510.0000.0510.000D2S13380.0010.0000.089N/A0.0000.0000.0020.000D19S4330.0160.0010.176N/A0.0000.0000.0130.015VWA0.0030.0040.0180.0000.0420.0000.0000.000TPOX0.0000.0000.0150.0000.0020.0370.0000.089D18S510.0650.0000.2990.0010.0890.0000.0000.000D5S8180.0000.0240.2550.0320.0250.0000.0080.000FGA0.0000.0000.0280.0000.0000.0000.0000.000

LociTianjing[12](n=57)Shanxi[13](n=109)Neimenggu[14](n=129)Jiangxi[15](n=200)Hainan[16](n=200)Hubei[17](n=305)Guizhou[18](n=108)Jilin[19](n=103)D8S11790.0000.0070.2600.0120.0000.172N/A0.000D21S110.0000.0000.0010.0010.0000.001N/AN/AD7S8200.000N/A0.0000.2920.0000.0030.000N/ACSF1PO0.0000.0000.0000.1180.1070.0270.0040.000D3S13580.000N/A0.0030.0010.0010.639N/A0.000TH010.000N/AN/A0.000N/A0.0000.000N/AD13S3170.000N/A0.0000.1000.0480.5370.0660.006D16S5390.000N/A0.0580.0930.1010.8790.074N/AD2S13380.000N/A0.0390.0020.0020.011N/AN/AD19S4330.000N/A0.0030.000N/A0.021N/AN/AVWA0.0000.0110.0290.4260.0150.202N/A0.005TPOXN/A0.0060.0240.002N/A0.0380.0000.000D18S510.0000.0000.0010.0030.0370.086N/AN/AD5S8180.002N/A0.0100.0220.0000.220N/A0.000FGA0.0000.0000.0000.0010.7440.736N/A0.000

LociHeilongjiang[20](n=221)Hebei[21](n=345)Jiangsu[22](n=120)Anhui[23](n=1000)Shaanxi[24](n=446)Fujian[25](n=122)Gansu[26](n=215)Yunnan[27](n=20204)Hunan[28](n=288)D8S11790.5290.0820.0030.2120.6820.0000.1930.4860.000D21S110.0000.0070.0000.2370.1180.0000.0040.7900.041D7S8200.0460.0190.0000.1850.0120.0000.4890.3700.000CSF1PO0.1780.4490.0300.5210.5010.1600.0690.9200.576D3S13580.5740.4390.0880.4700.0560.0600.2530.6820.056TH010.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0000.0020.000D13S3170.0130.0200.0000.0890.1580.0000.0490.5850.773D16S5390.2200.0680.0190.2950.3800.0020.0020.9920.037D2S13380.0000.0120.000N/A0.1260.0000.001N/AN/AD19S4330.0380.1180.000N/A0.0550.0000.006N/AN/AVWA0.0560.5870.0000.1450.0090.0070.0130.6760.001TPOX0.4290.0400.0620.0380.4670.0000.0110.2740.000D18S510.0040.0000.0000.1390.0520.0000.0000.4300.040D5S8180.0140.2530.0020.3930.3800.0010.0010.6050.219FGA0.0000.0020.0010.9910.3030.0000.0000.5210.012

Note：N/A.Not applicable (data unable to compare which were lack in references).

圖2　云南地區漢族與國內其他25個地區漢族15個基因座基因頻率比較Fig.2　Mean chi-square values of fifteen STR loci frequency were compared among Han population in Yunnan and other twenty-five areasNote: Colour turning from green to red represented gradually increased differences. N/A means:Not applicable(data unable to compare which were lack in references).

3　討論

本文對云南漢族人群沒有親緣關系的313例樣本進行遺傳多態性研究的15個基因座中包含了美國聯邦調查局建立的CODIS系統中的13個基因座：D8S1179、D21S11、D7S820、CSF1PO、D3S1358、TH01、D13S317、D16S539、VWA、TPOX、D18S51、D5S818、FGA，另外又增加了D2S1338,D19S433兩個STR基因座。本文云南漢族人群隨機群體的數據顯示，所有位點的等位基因頻率均符合Hardy-Weinberg平衡，可用于親子鑒定和個體識別。

本文313例云南漢族無關個體的15個STR基因座中，FGA基因座屬復雜重復序列，其等位基因最多有24個、基因型分布最廣達80種，其核心序列最大重復次數為32.2，這與丁浩強等[5]結果相一致，基因座D21S11、D2S1338、D18S51檢測到的基因型均在50種以上，而D3S1358、TPOX、D16S539基因座的基因型為小于22種，等位基因序列為7～8個之間，為簡單重復序列。PIC除TPOX外均大于0.63。

Gill等[29]提出，若基因座的個體識別率DP≥0.9、雜合度H≥0.7、多態性信息總量PIC≥0.7，則具有較高的法醫應用價值。本文檢測人群的15個STR基因座中，DP除了CSF1PO、D3S1358、TH01、TPOX外，其余各基因座均大于0.9，而CSF1PO、D3S1358、TH01基因座DP值均大于0.84；H除了TPOX外其余基因座均大于0.7，其中除了TPOX、CSF1PO、D3S1358、TH01其余雜合度均大于0.75；而PIC除了CSF1PO、D3S1358、TH01、TPOX基因座外均大于0.7；其中FGA基因座的DP、PE、PIC、H值均為所有基因座中的最大值，說明云南地區漢族人群的FGA基因多態性程度高，應用價值最高；基因座CSF1PO、D3S1358、TH01、TPOX多態性程度較低，法醫學應用價值相對較低，但若聯合應用則可彌補其單個基因座個體識別率低的缺點。

以本文云南地區漢族人群分別與四川、廣州、浙江、臺灣、河南、濟南、新疆、遼寧等地區漢族相同基因座的等位基因頻率分布差異進行統計學分析，結果顯示分別與四川相比D8S1179、D7S820、CSF1PO、D3S1358、TH01、D2S1338、D19S433、VWA、TPOX、D5S818、FGA共11個STR基因座差異具有統計學意義；與廣州相比D8S1179、D21S11、D7S820、D3S1358、TH01、D13S317、D16S539、D2S1338、D19S433、VWA、TPOX、D18S51、D5S818、FGA共14個STR基因座差異具有統計學意義；與浙江相比D21S11、TH01、VWA、TPOX、FGA共5個STR基因座差異具有統計學意義；與臺灣相比D8S1179、D21S11、D7S820、CSF1PO、TH01、VWA、TPOX、D18S51、D5S818、FGA共10個STR基因座差異具有統計學意義；與河南相比D21S11、TH01、D2S1338、D19S433、VWA、TPOX、D5S818、FGA共8個STR基因座差異具有統計學意義；與濟南相比D8S1179、D21S11、D7S820、CSF1PO、D3S1358、TH01、D13S317、D16S539、D2S1338、D19S433、VWA、TPOX、D18S51、D5S818、FGA共15個STR基因座差異具有統計學意義；與新疆相比D21S11、TH01、D13S317、D2S1338、D19S433、VWA、TPOX、D18S51、D5S818、FGA共10個STR基因座差異具有統計學意義；與遼寧相比D8S1179、D21S11、D7S820、CSF1PO、D3S1358、TH01、D13S317、D16S539、D2S1338、D19S433、VWA、D18S51、D5S818、FGA共14個STR基因座差異具有統計學意義；與云南相比只有TH01基因座差異具有統計學意義；與天津相比D8S1179、D21S11、D7S820、CSF1PO、D3S1358、TH01、D13S317、D16S539、D2S1338、D19S433、VWA、D18S51、D5S818、FGA共14個STR基因座差異具有統計學意義；與山西相比D8S1179、D21S11、CSF1PO、VWA、TPOX、D18S51、FGA共7個STR基因座差異具有統計學意義；與內蒙古相比D21S11、D7S820、CSF1PO、D3S1358、D13S317、D2S1338、D19S433、VWA、TPOX、D18S51、D5S818、FGA共12個STR基因座差異具有統計學意義；與江西相比D8S1179、D21S11、D3S1358、TH01、D2S1338、D19S433、TPOX、D18S51、D5S818、FGA共10個STR基因座差異具有統計學意義；與海南相比D8S1179、D21S11、D7S820、D3S1358、D13S317、D2S1338、VWA、D18S51、D5S818共9個STR基因座差異具有統計學意義；與湖北相比D21S11、D7S820、CSF1PO、TH01、D2S1338、D19S433、TPOX共7個STR基因座差異具有統計學意義；與貴州相比D7S820、CSF1PO、TH01、TPOX共4個STR基因座差異具有統計學意義；與吉林相比D8S1179、CSF1PO、D3S1358、D13S317、VWA、TPOX、D5S818、FGA共8個STR基因座差異具有統計學意義；與黑龍江相比D21S11、D7S820、TH01、D13S317、D2S1338、D19S433、D18S51、D5S818、FGA共9個STR基因座差異具有統計學意義；與河北相比D21S11、D7S820、TH01、D13S317、D2S1338、TPOX、D18S51、FGA共8個STR基因座差異具有統計學意義；與江蘇相比D8S1179、D21S11、D7S820、CSF1PO、TH01、D13S317、D16S539、D2S1338、D19S433、VWA、D18S51、D5S818、FGA共13個STR基因座差異具有統計學意義；與安徽相比TH01、TPOX共2個STR基因座差異具有統計學意義；與陜西相比D7S820、TH01、VWA共3個STR基因座差異具有統計學意義；與福建相比D8S1179、D21S11、D7S820、TH01、D13S317、D16S539、D2S1338、D19S433、VWA、TPOX、D18S51、D5S818、FGA共13個STR基因座差異具有統計學意義；與甘肅相比D21S11、TH01、D13S317、D16S539、D2S1338、D19S433、VWA、TPOX、D18S51、D5S818、FGA共11個STR基因座差異具有統計學意義；與湖南相比D8S1179、D21S11、D7S820、TH01、D16S539、VWA、TPOX、D18S51、FGA共9個STR基因座差異具有統計學意義。可見同一民族不同地域人群之間基因頻率分布存在一定的差異，因此分別調查統計各個地區人群的群體遺傳學資料是有必要的。

本文所調查云南地區漢族人群15個STR基因座的等位基因頻率分布，與四川、廣州、浙江、臺灣、河南、濟南、新疆、遼寧、天津、山西、內蒙古、江西、海南、湖北、貴州、吉林、黑龍江、河北、江蘇、安徽、陜西、福建、甘肅、湖南、云南各地區漢族差異存在某種地理變化規律，即離云南遷徙距離越遠的地區差異越大，見圖2。此現象可能與中國歷史上漢族人群的大規模遷徙事件有關[30]，尚需對更多的人類基因組多態性位點檢測和研究。但也有部分地區不符合地理變化規律，這可能是由于各地區論文發表年代及所用檢測方法不同，檢測的精確度存在差異，以及中國人口的流動性，使得云南人群與其他地區人群的比較只是一個相對粗略的比較，要進行精確比較應統一檢測的方法學，使檢測結果更具有可比性。

本文報告云南漢族人群中15個STR基因座中D8S1179、D21S11、D7S820、D13S317、D16S539、D2S1338、D19S433、VWA、D18S51、D5S818、FGA具有較高個體識別能力、高的雜合度、高信息含量及較高多態性，聯合使用可對本地人群的法醫學親子鑒定及個人識別具有極高的準確性。

[1]Dore MP,Realdi G,Mura D,etal.Genomic instability in chronic viral hepatitis and hepatocellular carcinoma[J].Hum Pathol,2001,32 (7):698-703.

[2]Deng YJ,Zhu BF,Shen CM,etal.Genetic polymorphism analysis of 15 STR loci in Chinese Hui ethnic group residing in Qinghai province of China[J].Mol Biol Rep,2011,38 (4):2315-2322.

[3]趙方,伍新堯,蔡貴慶,等.Modified-Powerstates 軟件在法醫生物統計中應用[J].中國法醫學雜志,2003,18 (5):297-298.

[4]李英碧,吳謹,侯一平,等.成都漢族群體 15 個短串聯重復序列基因座遺傳多態性[J].中華醫學遺傳學雜志,2005,22 (2):169-173.

[5]丁浩強,葉欣,羅廣平,等.廣州地區漢族群體 15 個短串聯重復序列基因座遺傳多態性分析[J].中國免疫學雜志,2011,27 (6):521-523.

[6]陳雁,朱宇寧,呂時銘,等.浙江省漢族人群 18-STR 基因座的分型資料及其應用[J].中山大學學報:醫學科學版,2010,31 (1):122-128.

[7]劉秋玲,呂德堅,陸惠玲,等.臺灣漢族群體 15 個 STR 基因座的遺傳多態性[J].法律與醫學雜志,2004,10 (4):245-247.

[8]Wang HD,Wu D,Feng ZQ,etal.Genetic polymorphisms of 20 short tandem repeat loci from the Han population in Henan,China[J].Electrophoresis,2014,35 (10):1509-1514.

[9]Tang J,Zhang J,Jiang F,etal.Genetic analyzing of 15 STR loci in a Han population of Jinan (northern China)[J].Legal Med,2009,11 (3):144-146.

[10]王樂,趙興春,張建,等.新疆巴州地區漢族人群 18 個 STR 位點的遺傳多態性[J].中國輸血雜志,2013,26 (10):1015-1017.

[11]李克研,喻少波,郝春雨,等.遼寧省漢族人群 15 個短串聯重復序列基因座的遺傳多態性[J].解剖學雜志,2010,33 (2):248-251.

[12]李小廷,丁連發,洪燕敏,等.天津市漢族群體 15 個 STR 基因座遺傳多態性[J].天津醫科大學學報,2010,16(4):665-666.

[13]董祖鑫,郭晉榮,嚴江偉,等.山西地區漢族 15 個 STR 基因座遺傳多態性[J].中國法醫學雜志,2005,19 (4):230-231.

[14]張貴芹,裴黎,馬原,等.內蒙古漢族群體 15 個 STR 基因座遺傳多態性[J].中國法醫學雜志,2008,23 (4):265-266.

[15]周文斌,裴君.江西漢族人群 15 個 STR 基因座的多態性調查[J].法律與醫學雜志,2006,13 (1):53-54.

[16]金鑫,姜成濤,涂政,等.海南漢族人群 14 個 STR 基因座遺傳多態性[J].中國法醫學雜志,2008,23 (2):116-117.

[17]易少華,楊榮芝,梅焜,等.湖北漢族人群 15 個 STR 基因座的遺傳多態性[J].華中科技大學學報:醫學版,2010,39 (1):91-93.

[18]金稀,姜成濤,齊鳳,等.貴州漢族人群 6 個 STR 基因座的多態性[J].中國法醫學雜志,2001,16 (4):213-213.

[19]王冰梅,莊文越,項小豐,等.吉林地區漢族人群 12 個 STR 基因座的遺傳多態性[J].第四軍醫大學學報,2005,26(22):2072-2075.

[20]魏福軍,趙興春,張建,等.大慶地區漢族群體 18 個 STR 基因座遺傳多態性[J].刑事技術,2014,39(6):44-46.

[21]裴黎,張貴芹,叢斌,等.河北漢族人群 15 個 STR 基因座的遺傳多態性[J].河北醫科大學學報,2008,29 (3):455-457.

[22]俞衛東,閔涯鄰,張斌,等.江蘇地區漢族人群 15 個 STR 基因座頻率調查[J].中國法醫學雜志,2004,18 (4):245-246.

[23]楊玉玲,王冬花,陳玲,等.安徽漢族人群 15 個 STR 基因座遺傳多態性[J].法醫學雜志,2007,23 (1):36-38.

[24]Wu YM,Zhang XN,Zhou Y,etal.Genetic polymorphisms of 15 STR loci in Chinese Han population living in Xi′an city of Shaanxi Province[J].Forensic Sci Int-Gen,2008,2 (2):e15-e18.

[25]Hu S,Wu D,Xu X,etal.Genetic profile of 15 STR loci in the Minnan population in Southeast China[J].Forensic Sci Int,2005,152 (2):263-265.

[26]陶曉嵐,聶笑聯,張杰.甘肅地區漢族人群 15 個 STR 基因座遺傳多態性[J].中國法醫學雜志,2006,21 (5):306-307.

[27]余建華,高靜,向超杰,等.云南漢族人群 15 個常染色體 STR 基因座的遺傳多態性與 OL 等位基因的研究[J].昆明醫科大學學報,2014,35 (7):27-31.

[28]劉秋玲,呂德堅,陳麗嫻,等.湖南漢族人群 15 個 STR 基因座的遺傳多態性[J].中國法醫學雜志,2004,19 (2):98-99.

[29]Gill P,Urquhart A,Millican E,etal.A new method of STR interpretation using inferential logic-development of a criminal intelligence database[J].Int J Legal Med，1996,109 (1):14-22.

[30]林超民.漢族移民與云南統一[J].云南民族大學學報:哲學社會科學版,2005,22 (3):106-113.

[收稿2016-03-19修回2016-04-20]

(編輯張曉舟)

Analysis on characteristics of fifteen short tandem repeat genetic polymorphisms in Yunnan Han population

JIN Chan-Chan,HE Jing,WANG Lei,CHEN Peng,YANG Ji-Qing,LI Xiu-Ling,SU Jie,ZHU Bao-Sheng.

Genetic Diagnosis Center,Key Laboratory for Birth Defects and Genetic Diseases,the First People′s Hospital of Yunnan Province，Kunming 650032，China

Objective:To research on the genetic polymorphism distributions of fifteen short tandem repeat (STR) loci(D8S1179,D21S11,D7S820,CSF1PO,D3S1358,TH01,D13S317,D16S539,D2S1338,D19S433,VWA,TPOX,D18S51,D5S818,FGA) in Han race of Yunnan.Methods: A total of 313 specimens were collected from the unrelated individuals in Yunnan Han population.Genome DNA was extracted and amplified by multiplex PCR technique,the PCR products were analyzed by ABI-3130 genetic analyzer capillary electrophoresis detection,collected statistics of each STR loci genotypic frequency,and carried out the Hardy-Weinberg Genetic balance test.Results: No significant deviation from the Hardy-Weinberg Equilibrium was observed(P>0.05),the heterozygosity of the fifteen STR loci in Yunnan Han population were found to be 0.636-0.901,Probability match was 0.034-0.220.Discrimination power of signal STR loci was 0.780-0.966,power of paternity exclusion was 0.336-0.797,polymorphism information content was 0.555-0.860,the combined accumulation discrimination power and exclusion probability for the 15 STR loci in Yunnan Han population were determined to be more than 0.999 999 99 and 0.999 998 408.The allele frequency of the 15 STR loci had a similarity compared with other areas in China,but also had a slight regional differences.Conclusion: The 15 STR loci(D8S1179,D21S11,D7S820,CSF1PO,D3S1358,TH01,D13S317,D16S539,D2S1338,D19S433,VWA,TPOX,D18S51,D5S818,FGA) demonstrate high genetic polymorphism in Yunnan Han population,they have a high forensic science application value in paternity testing and individual identification.

Short tandem repeat;Genetic polymorphism;Allele frequency;Heterozygosity;Forensic medicine

10.3969/j.issn.1000-484X.2016.10.005

靳嬋嬋(1986年-)，女，碩士，技師，主要從事醫學遺傳學方面的研究，E-mail：jinchanchan2009@126.com。

及指導教師：朱寶生(1964年-)，男，碩士，教授，主要從事醫學遺傳學方面的研究，E-mail：bszhu@aliyun.com。

R392.11

A

1000-484X(2016)10-1428-09

①本文為云南省衛生領軍人才項目(L-201201)。

②云南省第一人民醫院司法鑒定中心，昆明650032。