前列腺癌細胞核酸適配體支持向量機分類模型

禹新良

(1.湖南工程學院環境催化與廢棄物再生化湖南省重點實驗室湖南湘潭 411104；2.湖南大學化學生物傳感與計量學國家重點實驗室湖南長沙 410082)

核酸適配體(Aptamer)是單鏈寡核苷酸，它能結合特定的生物靶標，如蛋白質分子、細胞、病毒[1，2]。與抗體相比，核酸適配體具有許多獨特的優勢，包括合成簡單、體外修飾容易、免疫原性小、易于穿透腫瘤組織等[3,4]。核酸適配體的出現，為探索重大疾病早期診斷及靶向治療方法開辟了嶄新的途徑[5，6]。因此，核酸適配體相關技術的研發已經成為化學、生物醫學等領域的熱點課題。

核酸適配體可采用以細胞為靶標的指數富集配體系統進化(Cell-SELEX)技術獲得，從人工合成的DNA/RNA文庫中篩選得到，即通過重復的寡核苷酸序列與標靶的吸附分配、寡核苷酸序列與標靶復合物洗脫、回收，以及聚合酶鏈擴增3個基本步驟，從單鏈寡核苷酸文庫中篩選出能與靶標特異性結合的DNA/RNA適配體[7，8]。

成功的適配體SELEX篩選實驗通常循環次數多，且每輪循環操作耗時、耗力、耗材[9]。基于分子構效關系(QSAR/QSPR)模型方法可以用于分子性質的估算，然后將最有希望滿足某種性能要求的分子用于實驗室的合成與測試[10]。因此，核酸適配體分子構-效關系研究可以節約資源、促進新型適配體開發。每年關于分子構效關系的研究報道超過5 000篇[11]，通常這些研究基于的分子參數是直接從研究的分子體系計算而得。由于核酸適配體實驗數據的缺乏，尤其是核酸適配體分子結構參數提取的困難，目前對核酸適配體開展構-效關系研究的報道極少。……