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基于網(wǎng)絡(luò)藥理學的藏藥西紅花“治一切肝病”的藥理作用分析*

2020-04-19 07:12:30史海熠史志龍
關(guān)鍵詞:數(shù)據(jù)庫分析

潘 安,張 淼,史海熠,顧 健,趙 丹,史志龍**

(1. 西南民族大學藥學院 成都 610041;2. 昭通市第一人民醫(yī)院 昭通 657000)

西紅花(Crocus sativusL.)原名番紅花,又名泊夫蘭,撒馥蘭。藏語名喀吉苦功、給薩熱、加央多間[1],原產(chǎn)于伊朗、希臘、西班牙等中東及歐洲地區(qū),唐代經(jīng)西藏傳至內(nèi)地[2],故又稱藏紅花。西紅花作為藥用植物,在中醫(yī)與藏醫(yī)臨床應(yīng)用中有著迥異的功效。藏醫(yī)藥經(jīng)典《晶珠本草》中記載“紅花治一切肝病”,通過配伍調(diào)劑組成的多種藏藥經(jīng)典組方[3]具有疏肝利膽、清熱解毒、健脾胃、利尿等功效。而中醫(yī)多用西紅花治療婦科疾病及跌打損傷[4]。現(xiàn)代臨床研究表明其還具有抗精神失常[5-8]、抗腫瘤[9]、降血糖[10-11]等作用。

課題組前期對《四部醫(yī)典》《晶珠本草》《藏藥于方劑》等藏醫(yī)藥典籍中具有防治肝病功效的藏藥復方進行整理研究時發(fā)現(xiàn),西紅花為使用頻次最高的藏藥,如七味紅花殊勝丸、二十五味松石丸、仁青芒覺、九味牛黃丸等藏藥成方制劑中均配伍西紅花,甚至在很多藏藥復方中西紅花均為治療肝膽疾病的核心藥味[12-13]。早在一千多年前藏醫(yī)就對肝膽疾病有了較為完整的診治方案[14],然而由于藏醫(yī)理論與現(xiàn)代醫(yī)學存在較大差異,限制了藏醫(yī)藥推廣,難以充分發(fā)揮藏醫(yī)藥的療效優(yōu)勢。本研究通過系統(tǒng)生物學方法,明確西紅花治療肝病的臨床應(yīng)用范圍及作用機制,為豐富藏醫(yī)藥理論、擴大西紅花的應(yīng)用范圍提供科學理論支撐。

1 方法

1.1 西紅花化學成分篩選及收集靶點

通過中藥系統(tǒng)藥理學數(shù)據(jù)庫與分析平臺[15](TCMSP,http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php)收集西紅花的化學成分,并結(jié)合其成分的專屬性、口服利用率、生物利用率等進行篩選。繪制化學成分三維結(jié)構(gòu)圖。上傳至PharmMaper 數(shù)據(jù)庫(http://lilab.ecust.edu.cn/pharmmapper/submit_file.php)預測化合物靶點,并刪除重復項。

1.2 構(gòu)建“成分-預測靶點”網(wǎng)絡(luò)及分析

通過Cytoscape 3.7.1 軟件對西紅花的“成分-靶點”進行互作網(wǎng)絡(luò)的建立,并利用軟件中的Networkanalyzer進行拓撲學分析[16]。

1.3 PPI互作網(wǎng)絡(luò)分析及KEGG富集

將預測出的靶點復制到String 數(shù)據(jù)庫(https://string-db.org/)的 Multiple proteins 中 ,Organism 選 擇Homo sapiens 進行分析,選擇互動數(shù)(interaction score)大于90%得到PPI互作網(wǎng)絡(luò)和KEGG通路。

1.4 肝病相關(guān)通路及肝病靶點

通過 KEGG 數(shù)據(jù)庫(https://www.kegg.jp/)對“1.3”中保存的KEGG 通路進行檢索并結(jié)合文獻,確定與肝病相關(guān)度較高的通路。利用OMIM、Disgenet數(shù)據(jù)庫獲取病毒性肝炎、酒精性肝病、非酒精性脂肪性肝病、自身免疫性肝病、肝細胞癌、肝纖維化、肝硬化等常見肝病[17-18]的靶點,并將其與西紅花靶點進行對接。

1.5 “活性成分-靶點-疾病”網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及分析

建立“活性成分-靶點-疾病”數(shù)據(jù)庫,并導入Cytoscape 3.7.1軟件中,對其進行分析。

2 結(jié)果

2.1 成分及靶點的篩選

在TCMSP 數(shù)據(jù)庫中檢索到70 種西紅花的化合物,參考其成分的專屬性、口服利用率、生物利用率等篩選出19 種目標化合物(表1),通過TCMSP 數(shù)據(jù)庫檢索的西紅花新苷甲(Crosatoside A)、紅花色素A(Safflor Yellow A)等均只存在于西紅花中;有研究表示西紅花可能的活性成分為藏紅花素(Crocin I、Crocin 2)、藏 紅 花 酸 (Crocetin)等[19-20];通 過PharmMaper 數(shù)據(jù)庫篩選靶點后,得到了包括原癌基因酪氨酸蛋白激酶SRC、p38 絲裂原激活蛋白激酶類(p38MAPK)中的MAPK14 和細胞外蛋白配體表皮生長因子家族中的EGFR[21]等80個靶點。

2.2 構(gòu)建“成分-靶點”網(wǎng)絡(luò)及分析

將藏藥西紅花成分與預測靶點導入Cytoscape 3.7.1 軟件,構(gòu)建“成分-靶點”網(wǎng)絡(luò)(圖1)。西紅花“成分-靶點”網(wǎng)絡(luò)中共有19 個化合物,80 個靶點。靶點Average Degree 為 11.15,以 Degree ≥18 為條件篩選出10個西紅花可能的核心靶點(表2)。

表格 1 西紅花目標化合物

2.3 PPI互作網(wǎng)絡(luò)分析及KEGG通路富集

將80 個西紅花靶點導入String 數(shù)據(jù)庫(https://string-db.org/)得到PPI互作網(wǎng)絡(luò)(圖2),圖中的圈為靶點,其Degree值越大圈越大,度值從大到小,顏色由亮變暗;而邊的綜合得分越高邊越粗,綜合得分從大到小,顏色由亮變暗。并富集出149 條KEGG 通路。這些通路大部分都與癌癥、肝病有關(guān),其中包括前列腺癌(Prostate cancer)、結(jié)腸直腸癌(Colorectal cancer)、胃癌(Gastric cancer)、肝細胞癌(Hepatocellular carcinoma)、乙型肝炎(Hepatitis B)、丙型肝炎(Hepatitis C)等。

2.4 肝病相關(guān)通路及肝病靶點

利用 KEGG 數(shù)據(jù)庫(https://www.kegg.jp/)結(jié)合相應(yīng)文獻將149 條通路逐條檢索,篩選出12 條具有顯著意義(P<0.01)且與肝病相關(guān)度較高的通路(圖3),其中Proteoglycans in cancer 通路可通過調(diào)控Glypicans、Agrin、Versican 等三種蛋白聚糖參與肝癌的發(fā)生及表達等過程[22-24],此外該通路還參與多種類型腫瘤的增殖、黏附、血管生成和轉(zhuǎn)移等生物學過程。MAPK signaling pathway 中活化的ERK 亞族進入細胞核后通過激活相應(yīng)轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控肝星狀細胞的細胞周期來影響其增殖所引起的肝纖維化[25-26];PI3K-Akt signaling pathway 通過影響肝臟細胞外基質(zhì)、肝星狀細胞、肝竇毛細血管化參與肝纖維化[27]。Th17 cell differentiation 通路可分化產(chǎn)生IL-17 和IL-22,有研究表明IL-22 可以促進肝細胞存活,并刺激肝細胞產(chǎn)生急性期蛋白,促進肝細胞在感染或炎癥后的恢復過程[28-32]。經(jīng)過以上分析,可推測西紅花在肝癌、肝纖維化等方面具有潛在的藥物開發(fā)價值。

圖1 西紅花“成分-靶點”網(wǎng)絡(luò)圖

表 2 西紅花關(guān)鍵靶點及拓撲學分析

圖2 西紅花網(wǎng)絡(luò)藥理學中蛋白互作網(wǎng)絡(luò)圖

圖3 西紅花網(wǎng)絡(luò)藥理學中肝病相關(guān)通路分析

2.5 西紅花“成分-靶點-疾病”網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及分析

建立“成分-靶點-疾病”網(wǎng)絡(luò)(圖4),結(jié)合此網(wǎng)絡(luò)的拓撲學分析結(jié)果與“成分-靶點”網(wǎng)絡(luò)、肝病相關(guān)通路的分析結(jié)果推斷出西紅花的關(guān)鍵靶點為SRC和EGFR。SRC 為酪氨酸蛋白激酶,有研究表明其在肝癌的治療中扮演著重要的角色[33];EGFR 在肝細胞增殖、抗肝纖維化中都是關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子[34]。通過對“活性成分-靶點-疾病”網(wǎng)絡(luò)的拓撲學分析發(fā)現(xiàn)西紅花對肝細胞癌和病毒性肝炎的靶點匹配率較高,特別是乙型肝炎,通過對Hepatitis B 通路的研究發(fā)現(xiàn)西紅花關(guān)鍵靶點SRC 參與了細胞的增殖與分化過程。

表3 西紅花網(wǎng)絡(luò)藥理學中疾病網(wǎng)絡(luò)拓撲學參數(shù)

圖4 西紅花成分-靶點-疾病網(wǎng)絡(luò)圖

3 討論

西紅花在中醫(yī)理論中多用于治療婦科疾病,網(wǎng)絡(luò)拓撲學分析中發(fā)現(xiàn)的ESR1 可能同乳腺癌的治療有著密切的聯(lián)系[35],并且富集出的通路中雌激素信號通路與靶點匹配程度較高。

西紅花在藏醫(yī)藥中的應(yīng)用相比于中醫(yī)更為廣泛也更為悠久,在《晶珠本草》中記載“西紅花可治療一切肝病”,根據(jù)藏醫(yī)藥經(jīng)典《四部醫(yī)典》的核心理論三因?qū)W說——“隆、赤巴、培根”,將臨床上的每種肝病細分為“隆”盛型,“赤巴”盛型,“培根”盛型[36],又因現(xiàn)代醫(yī)學理論上劃分肝病范圍與藏醫(yī)理論劃分肝病依據(jù)不同,通過本研究,我們初步對應(yīng)了現(xiàn)代醫(yī)學理論西紅花治療肝病范圍與藏醫(yī)藥理論治療肝病的范圍。西紅花可以對各類常見肝病都具有一定的防治作用,根據(jù)《四部醫(yī)典》記載“赤巴”病入侵肝臟時,肌肉顏色呈青色、肝區(qū)疼痛、頭痛、眼痛、唾液粘稠等癥狀可對應(yīng)現(xiàn)代醫(yī)學理論的肝腫瘤、病毒性肝炎等。

現(xiàn)今傳統(tǒng)藏醫(yī)藥由于宗教、文化、習俗等差異導致非藏區(qū)的人們對其接受度不高,限制了藏醫(yī)藥的發(fā)展。本研究利用網(wǎng)絡(luò)藥理學方法,對西紅花防治肝病的機制進行了初步闡述,明確了西紅花在臨床的用藥范圍,為西紅花的應(yīng)用與推廣提供新的思路和科學支撐。

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