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基于多數據集分析10型膠原α1鏈和分泌型磷蛋白1在肺腺癌中的表達及臨床意義

2021-03-07 07:30:34劉美岑劉蕾
癌癥進展 2021年24期
關鍵詞:肺癌數據庫因素

劉美岑,劉蕾

解放軍北部戰區總醫院呼吸與重癥醫學科,沈陽 110016

肺癌是最常見的惡性腫瘤之一,是腫瘤相關死亡的主要原因。非小細胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)是肺癌的主要組織學亞型,占肺癌患者的85%。肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)和肺鱗狀細胞癌(lung squamous cell carcinoma,LUSC)是最常見的 NSCLC 亞型。其中,LUAD是NSCLC中最常見的組織學亞型,占NSCLC的50%以上。大約70%的肺癌患者被診斷時為晚期,此時患者已經錯過了接受手術、化療和放療的機會。中晚期就診、缺乏可靠的生物標志物、不精準的治療靶點已成為治療LUAD的主要障礙。因此,早期診斷和治療對于改善患者的預后和生活質量至關重要。10型膠原α1鏈(collagen typeⅩ alpha 1 chain,COL10A1)基因編碼的產物是10型膠原蛋白的α1鏈,是一種主要的間質基質成分。它通過形成同源三聚體,組成10型膠原蛋白。COL10A1在許多實體腫瘤中表達升高,如結腸癌、食管癌和乳腺癌,并在關鍵的細胞過程中發揮重要作用,如細胞增殖、遷移、侵襲和腫瘤血管生成。分泌型磷蛋白1(secreted phosphoprotein 1,SPP1)是一種分泌型磷酸化糖磷蛋白,人類

SPP1

基因位于第4號染色體(4q13)上,有7個外顯子和6個內含子。該蛋白可由多種細胞分泌,如破骨細胞、巨噬細胞、上皮細胞和內皮細胞,涉及多種生物學功能。本研究利用癌癥基因組圖譜(The Cancer Genome Atlas,TCGA)等數據庫中的基因組和臨床數據,運用生物信息學技術分析

COL10A1

、

SPP1

mRNA表達與LUAD診斷和預后的關系,預測COL10A1和SPP1參與LUAD發生發展的作用機制,探討COL10A1和SPP1在LUAD診斷及預后中的意義。

1 資料與方法

1.1 資料收集

從TCGA公共數據庫(https://tcga-data.nci.nih.gov/)下載

COL10A1

SPP1

基因mRNA測序數據集及與之相一致的患者臨床資料。僅保留臨床資料和生存信息完整的病例,共納入LUAD患者594例。……
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