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基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究補(bǔ)腎安坤湯治療早發(fā)性卵巢功能不全的作用機(jī)制

2022-04-14 07:04:26解小慧劉金星
關(guān)鍵詞:中藥信號(hào)分析

解小慧 劉金星

1.山東中醫(yī)藥大學(xué)第一臨床醫(yī)學(xué)院,山東濟(jì)南 250000;2.山東省中醫(yī)院婦科,山東濟(jì)南 250000

早發(fā)性卵巢功能不全指40 歲之前的女性出現(xiàn)卵巢功能障礙,嚴(yán)重影響女性生育及心理健康[1]。2016 年歐洲人類生殖及胚胎學(xué)會(huì)指南[2],早發(fā)性卵巢功能不全(premature ovarian insufficiency,POI)的診斷標(biāo)準(zhǔn)為:①月經(jīng)過少或停經(jīng)≥4 個(gè)月;②至少2 次血清促卵泡生成素(follicle-stimulating hormone,F(xiàn)SH)>25 IU/L(間隔>4 周)。

劉金星教授認(rèn)為本病的基本病機(jī)為腎陰陽兩虛,應(yīng)滋腎益陰,溫腎助陽,故結(jié)合個(gè)人多年臨床經(jīng)驗(yàn),以二仙湯合二至丸加減制得補(bǔ)腎安坤湯(黃柏,仙茅,知母,熟地黃,巴戟天,淫羊藿,當(dāng)歸,枳殼,香附,續(xù)斷,女貞子)。因復(fù)方中藥“多成分、多途徑、多靶點(diǎn)”協(xié)同作用的特點(diǎn),使其現(xiàn)代化進(jìn)程緩慢[3]。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)有利于指導(dǎo)中藥新藥研發(fā),傳承和發(fā)展中醫(yī)藥事業(yè)[4]。本研究將基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué),分析補(bǔ)腎安坤湯治療POI 的作用機(jī)制。

1 資料與方法

1.1 中藥有效成分的挖掘

根據(jù)中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫與分析平臺(tái)(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP),對(duì)中藥進(jìn)行檢索。根據(jù)研究結(jié)果[5],以口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%和類藥性(drug likeness,DL)≥0.18 為篩選條件。

1.2 檢索中藥相關(guān)靶點(diǎn)

依據(jù)Uniprot,找到靶點(diǎn)對(duì)應(yīng)蛋白。

1.3 中藥有效成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

依托Cytoscape 軟件,得到成分靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)、整理并得到成分靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖。

1.4 檢索POI 靶點(diǎn)基因

依據(jù)Genecards 和OMIM,搜索premature ovarian insufficiency,得到疾病靶點(diǎn)基因,將藥物和疾病靶點(diǎn)基因取交集,得到補(bǔ)腎安坤湯治療POI 的關(guān)鍵作用靶點(diǎn)基因。

1.5 蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(protein-protein interaction,PPI)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

藥物對(duì)疾病的治療效應(yīng)是多個(gè)PPI 的結(jié)果[6]。依托STRING 數(shù)據(jù)庫,獲得蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)互作圖。

1.6 GO 和KEGG 富集分析

為闡明中藥靶點(diǎn)蛋白在基因功能和信號(hào)通路中的作用,行GO 富集分析和KEGG 富集分析[7]。依托DAVID 數(shù)據(jù)庫,取FDR 值由小到大前20 做GO 分析。依托Cluego 軟件,得到KEGG 分析圖。

1.7 分子對(duì)接

選相互作用degree≥20 的靶標(biāo)用DS ViewerPro對(duì)蛋白分子進(jìn)行處理。利用AutoDock Tools 建立蛋白中心格點(diǎn),將候選化合物與7 個(gè)候選靶點(diǎn)進(jìn)行分子對(duì)接,選擇能量最低的結(jié)合模式利用PyMol 作圖。

2 結(jié)果

2.1 補(bǔ)腎安坤湯方劑組成藥物的有效活性成分、靶點(diǎn)、基因篩選

共檢索出150 個(gè)有效成分(淫羊藿23 個(gè),黃柏37 個(gè),仙茅7 個(gè),巴戟天20 個(gè),知母15 個(gè),熟地黃2 個(gè),枳殼5 個(gè),香附18 個(gè),續(xù)斷8 個(gè),女貞子13 個(gè),當(dāng)歸2 個(gè)),將所獲有效成分以O(shè)B 值大小排序,列出前10 個(gè)有效成分。見表1。

表1 補(bǔ)腎安坤湯活性成分

2.2 中藥靶點(diǎn)預(yù)測(cè)及成分-靶點(diǎn)作用網(wǎng)絡(luò)共建

獲得1088 個(gè)成分作用靶點(diǎn)。得到中藥有效成分-靶點(diǎn)作用網(wǎng)絡(luò)圖(圖1),Degree 較大的9 個(gè)節(jié)點(diǎn)可能是關(guān)鍵的化合物或靶點(diǎn)。

圖1 中藥有效成分-靶點(diǎn)作用網(wǎng)絡(luò)圖

2.3 POI 靶點(diǎn)基因、補(bǔ)腎安坤湯治療POI 關(guān)鍵基因檢索

檢索到POI 靶點(diǎn)基因2718 個(gè),166 個(gè)關(guān)鍵靶點(diǎn)。

2.4 補(bǔ)腎安坤湯治療POI 的PPI 網(wǎng)絡(luò)分析

得到關(guān)鍵靶點(diǎn)基因網(wǎng)絡(luò)互作圖(圖2),該網(wǎng)絡(luò)包含153 個(gè)節(jié)點(diǎn),1080 種相互作用關(guān)系,Degree≥20 的節(jié)點(diǎn)9 個(gè),可能為補(bǔ)腎安坤湯治療POI 的關(guān)鍵蛋白。

圖2 蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)

2.5 GO 富集分析

GO 富集結(jié)果124 個(gè),取FDR 值由小到大前20個(gè)GO 條目繪制條形圖,核心靶點(diǎn)的GO 功能富集在細(xì)胞表面等方面較為集中。見圖3。

圖3 GO 富集分析

2.6 KEGG 代謝通路富集分析

KEGG 分析共獲得228 條通路,顯著性靠前的通路主要有Pathways in cancer 等。見圖4。

圖4 KEGG 分析

2.7 分子對(duì)接

對(duì)9 個(gè)候選化合物與蛋白互作網(wǎng)絡(luò)中degree≥20 中的靶點(diǎn)進(jìn)行分子對(duì)接,其結(jié)合能(表2),選取最優(yōu)結(jié)合模式作圖(圖5)。

圖5 分子對(duì)接模式

3 討論

通過分析,槲皮素、山柰酚、木犀草素、β-谷甾醇、柚皮素等為補(bǔ)腎安坤湯中的關(guān)鍵成分。槲皮素促進(jìn)卵巢卵泡發(fā)育和成熟,通過在體內(nèi)和體外上調(diào)一些氧化應(yīng)激相關(guān)基因的表達(dá)來增加卵巢的抗氧化能力[8-11]。木犀草素、β-谷甾醇、柚皮素[12-14]能夠有效促進(jìn)卵巢顆粒細(xì)胞分泌雌二醇。以上提示,補(bǔ)腎安坤湯可能作用于槲皮素等靶點(diǎn)在抗氧化、刺激甾體激素分泌、提高卵巢功能等方面發(fā)揮作用。對(duì)于cAMP 信號(hào)通路的研究[15-18],F(xiàn)SH 和LH 與其同源受體的結(jié)合導(dǎo)致腺苷酸環(huán)化酶的激活和cAMP 的產(chǎn)生,通過其激活的特異性信號(hào)通路可以生成雌酮和雌二醇,調(diào)節(jié)卵巢功能。通過張博等[19]、Detti等[20]的研究,甲狀腺激素通路對(duì)女性排卵等生殖功能有重要作用。腫瘤抑制因子p53是一種轉(zhuǎn)錄因子,能誘導(dǎo)細(xì)胞周期停滯、衰老或凋亡,Makrigiannakis等[21]發(fā)現(xiàn),p53 及其依賴通路在卵泡閉鎖中起重要作用,對(duì)人類卵泡發(fā)育和黃體功能具備重要的調(diào)節(jié)作用。何連利[22]、張晨曦[22-23]均研究顯示,p53信號(hào)通路在卵泡發(fā)育中必不可少。李德保等[24]研究證明激活或抑制Akt 可以影響眾多下游信號(hào)分子。陳薪等[25]實(shí)驗(yàn)分析表示,當(dāng)卵巢功能下降時(shí),PI3K-AktmTOR 受到抑制,減少顆粒細(xì)胞增殖;當(dāng)PI3K-Akt 被抑制時(shí),降低了細(xì)胞的增殖,進(jìn)一步惡化卵巢功能。以上顯示,補(bǔ)腎安坤湯可以通過cAMP 信號(hào)通路、甲狀腺激素信號(hào)通路、p53 信號(hào)通路等對(duì)POI 產(chǎn)生多方面的治療作用。綜上所述,本研究通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法發(fā)現(xiàn)補(bǔ)腎安坤湯中槲皮素、木犀草素、β-谷甾醇、柚皮素等多種成分可作用于JUN、MAPK3、MAPK1 等多個(gè)靶點(diǎn),通過cAMP 信號(hào)通路、甲狀腺激素信號(hào)途徑、p53 信號(hào)通路等多條信號(hào)通路治療POI,同時(shí),分子對(duì)接發(fā)現(xiàn)補(bǔ)腎安坤湯中的多種成分與核心靶點(diǎn)有較好的結(jié)合,為其進(jìn)一步藥理研究及臨床應(yīng)用提供理論基礎(chǔ)。

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