曹志軍,張智偉,李志國(guó),李碩
作者單位:北京市豐臺(tái)中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)院消化內(nèi)分泌科,北京 100072
結(jié)腸癌(colon cancer, CC)是一種消化道腫瘤,其發(fā)病率、病死率居高不下,防治結(jié)腸癌形式嚴(yán)峻[1-2]。因此,尋找可診治結(jié)腸癌、評(píng)估結(jié)腸癌病人預(yù)后的分子標(biāo)志物,對(duì)改善結(jié)腸癌病人預(yù)后有積極意義。研究發(fā)現(xiàn),自噬、生活方式、長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)表達(dá)失調(diào)、生活環(huán)境、微RNA(microRNA, miRNA)異常表達(dá)等均與結(jié)腸癌發(fā)生發(fā)展有關(guān)[3-4]。lncRNA DNAJC3-AS1 是lncRNA 的一員,其在結(jié)腸癌中呈高表達(dá),lncRNA DNAJC3-AS1 通過(guò)調(diào)節(jié)微RNA-214-3p(microRNA-214-3p, miR-214-3p)表達(dá)進(jìn)而促進(jìn)結(jié)腸癌進(jìn)展,lncRNA DNAJC3-AS1 有望成為診治結(jié)腸癌的潛在靶標(biāo)[5]。結(jié)腸腺瘤性息肉作為結(jié)腸癌的癌前病變,lncRNA DNAJC3-AS1 在其組織中表達(dá)情況及l(fā)ncRNA DNAJC3-AS1 與miR-214-3p 的關(guān)系尚需進(jìn)一步探究。因此,本研究檢測(cè)lncRNA DNAJC3-AS1、miR-214-3p 在不同結(jié)腸疾病中的表達(dá)水平,分析lncRNA DNAJC3-AS1 在結(jié)腸癌中與miR-214-3p 的相關(guān)性,探究lncRNA DNAJC3-AS1、miR-214-3p 與結(jié)腸癌病人預(yù)后的關(guān)系。
1.1 一般資料選取2016 年5 月至2019 年1 月北京市豐臺(tái)中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)院收治的結(jié)腸癌病人86例,其中男47 例,女39 例;年齡范圍為46~72 歲,年齡(59.73±10.34)歲;<60 歲、≥60 歲各43 例;淋巴結(jié)未轉(zhuǎn)移及轉(zhuǎn)移分別54、32例;腫瘤長(zhǎng)徑<5 cm、≥5 cm 分別50、36 例;TNM 分期:Ⅰ~Ⅱ期57 例,Ⅲ~Ⅳ期29例;血管浸潤(rùn)23 例,血管未浸潤(rùn)63 例;分化程度:低分化25 例,中、高分化61 例。另納入同期經(jīng)病理學(xué)診斷為結(jié)腸腺瘤性息肉的病人53 例,男27 例,女26例;年齡范圍為46~72歲,年齡(58.44±10.12)歲。本研究獲得北京市豐臺(tái)中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)院倫理委員會(huì)審批(批號(hào)YLL059)。
結(jié)腸癌納入標(biāo)準(zhǔn):(1)符合《NCCN 結(jié)腸癌臨床診療指南解讀)》[6]中結(jié)腸癌診斷標(biāo)準(zhǔn);(2)受試者對(duì)本研究均知情同意;(3)檢查資料完善,經(jīng)術(shù)后病理確診為原發(fā)性結(jié)腸癌;(4)術(shù)前未接受放化療、激素等抗腫瘤治療。排除標(biāo)準(zhǔn):(1)隨訪資料缺失者;(2)病理診斷不確切者;(3)有嚴(yán)重肺、肝、心、腎功能不全者。
1.2 方法
1.2.1數(shù)據(jù)庫(kù)檢索基本表達(dá)情況 使用lnCAR 數(shù)據(jù)庫(kù)(https://lncar.renlab.org/#1st-screen),仔細(xì)檢索lncRNA DNAJC3-AS1 在不同結(jié)腸組織中的基本情況。
1.2.2采集標(biāo)本 于手術(shù)時(shí)或進(jìn)行腸鏡時(shí)采集受試者不同結(jié)腸組織或息肉,包括結(jié)腸癌組織、癌旁組織(距結(jié)腸癌腫瘤邊緣>4 cm)或結(jié)腸腺瘤性息肉,而后以生理鹽水對(duì)采集到的樣本進(jìn)行仔細(xì)地清理,并立即放入液氮罐過(guò)夜,而后于-70 ℃冰箱存儲(chǔ)。
1.2.3實(shí)時(shí)熒光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)法檢測(cè)組織lncRNA DNAJC3-AS1、miR-214-3p表達(dá)水平 首先將樣本全部研碎,提取總RNA(TRIzol Reagent,上海信帆生物,A1084)、制備cDNA(M-MLV first strand cDNA Synthesis Kit,OMEGA,TQ2501-01)、擴(kuò)增cDNA(SYBR Green Realtime PCR Master Mix,南京賽泓瑞,QPK-201;熒光定量PCR 儀,ABI 公司,ViiA7)、得CT 值。擴(kuò)增數(shù)據(jù)設(shè)置:97.4 ℃ 9 min;96.3 ℃ 20 s,62.5 ℃ 40 s,60 ℃15 s,40 個(gè)循環(huán)。內(nèi)參選擇:GAPDH、U6,序列見表1。兩目的基因的相對(duì)表達(dá)量以2-ΔΔCt法計(jì)算。
表1 lncRNA DNAJC3-AS1及其內(nèi)參GAPDH,miR-214-3p及其內(nèi)參U6引物序列
1.2.4生物信息學(xué)網(wǎng)站預(yù)測(cè)相關(guān)性 采用網(wǎng)站(https://starbase.sysu.edu.cn/)預(yù)測(cè)lncRNA DNAJC3-AS1與miR-214-3p的可能相關(guān)性。
1.3 隨訪結(jié)腸癌病人進(jìn)行為期8~36 個(gè)月的隨訪,期間全面記錄其生存情況,以電話/門診為主要隨訪方式,此次隨訪的起點(diǎn)為手術(shù)次日,終點(diǎn)為2022年1月或死亡。
1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法SPSS 25.0 軟件分析數(shù)據(jù)。計(jì)量資料以±s描述,兩組間比較行t檢驗(yàn),三組間比較行單因素方差分析,進(jìn)一步兩兩比較行SNK-q檢驗(yàn);計(jì)數(shù)資料以例(%)表示,行χ2檢驗(yàn);結(jié)腸癌組織中l(wèi)ncRNA DNAJC3-AS1 表達(dá)水平與miR-214-3p 相關(guān)性以Pearson 法分析;結(jié)腸癌組織lncRNA DNAJC3-AS1、miR-214-3p 表達(dá)水平與結(jié)腸癌病人預(yù)后的關(guān)系使用Kaplan-Meier生存曲線分析,行l(wèi)ogrank檢驗(yàn)。檢驗(yàn)水準(zhǔn)α=0.05。
2.1 lnCAR 數(shù)據(jù)庫(kù)中正常結(jié)腸組織、結(jié)腸癌組織lncRNA DNAJC3-AS1 表達(dá)水平比較lnCAR 數(shù)據(jù)庫(kù)分析顯示,與正常結(jié)腸組織(4.00±0.36)相比,結(jié)腸癌組織(4.40±0.49)lncRNA DNAJC3-AS1 表達(dá)水平升高(t=3.62,P<0.05)。
2.2 癌旁/結(jié)腸癌組織、結(jié)腸腺瘤性息肉中l(wèi)ncRNA DNAJC3-AS1、miR-214-3p 表達(dá)水平比較結(jié)腸癌組織中l(wèi)ncRNA DNAJC3-AS1 表達(dá)水平較癌旁、息肉中更高(P<0.05),miR-214-3p 表達(dá)水平低于癌旁組織、結(jié)腸腺瘤性息肉(P<0.05);結(jié)腸腺瘤性息肉中l(wèi)ncRNA DNAJC3-AS1 表達(dá)水平較癌旁高(P<0.05),miR-214-3p表達(dá)水平較癌旁低(P<0.05)。見表2。
表2 癌旁/結(jié)腸癌組織、結(jié)腸腺瘤性息肉lncRNA DNAJC3-AS1、miR-214-3p表達(dá)水平比較/± s
表2 癌旁/結(jié)腸癌組織、結(jié)腸腺瘤性息肉lncRNA DNAJC3-AS1、miR-214-3p表達(dá)水平比較/± s
注:lncRNA DNAJC3-AS1為長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)DNAJC3-AS1,miR-214-3p為微RNA-214-3p。①與癌旁組織比較,P<0.05。②與結(jié)腸腺瘤性息肉比較,P<0.05。
miR-214-3p 1.01±0.34 0.67±0.22①0.31±0.10①②177.31<0.001組別癌旁組織結(jié)腸腺瘤性息肉結(jié)腸癌組織F值P值例數(shù)86 53 86 lncRNA DNAJC3-AS1 1.04±0.35 1.71±0.57①2.63±0.88①②130.32<0.001
2.3 結(jié)腸癌組織lncRNA DNAJC3-AS1、miR-214-3p 表達(dá)水平與病理特征關(guān)系分析以結(jié)腸癌組織lncRNA DNAJC3-AS1、miR-214-3p 檢測(cè)結(jié)果均值(2.63、0.31)為界,低于均值為低表達(dá)組,lncRNA DNAJC3-AS1(42 例)、miR-214-3p(45 例),以高于或等于均值為高表達(dá)組,lncRNA DNAJC3-AS1(44例)、miR-214-3p(41 例)。結(jié)腸癌組織lncRNA DNAJC3-AS1、miR-214-3p 表達(dá)水平在性別、年齡、腫瘤大小方面,分布差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),但在不同分化程度、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、血管浸潤(rùn)、TNM 分期方面,分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。見表3。
表3 結(jié)腸癌組織lncRNA DNAJC3-AS1、miR-214-3p表達(dá)水平與結(jié)腸癌病人臨床病理特征關(guān)系/例(%)
2.4 結(jié)腸癌組織中l(wèi)ncRNA DNAJC3-AS1 表達(dá)水平與miR-214-3p的相關(guān)性生物信息學(xué)分析顯示,lncRNA DNAJC3-AS1與miR-214-3p存在結(jié)合位點(diǎn)。
結(jié)腸癌組織中,經(jīng)Pearson 法分析,結(jié)果提示,lncRNA DNAJC3-AS1 與miR-214-3p 呈負(fù)相關(guān)(r=-0.58,P<0.05)。見圖1。
圖1 結(jié)腸癌組織中l(wèi)ncRNA DNAJC3-AS1表達(dá)水平與miR-214-3p的相關(guān)性
2.5 結(jié)腸癌組織lncRNA DNAJC3-AS1、miR-214-3p 表達(dá)水平與結(jié)腸癌病人預(yù)后的關(guān)系隨訪全部結(jié)束后,86例結(jié)腸癌病人共死亡21例。Kaplan-Meier 生存曲線分析顯示,lncRNA DNAJC3-AS1 低表達(dá)組生存期34.69 個(gè)月,95%CI:(33.37,36.02),長(zhǎng)于lncRNA DNAJC3-AS1 高表達(dá)組29.75 個(gè)月,95%CI:(27.01,32.49),log-rank 檢驗(yàn)顯示,累積生存率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=9.96,P=0.002);miR-214-3p 低表達(dá)組生存期30.16 個(gè)月,95%CI:(27.51,32.80),短于高表達(dá)組34.37 個(gè)月,95%CI:(32.83,35.90),log-rank 檢驗(yàn)顯示,累積生存率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=6.52,P=0.011)。
結(jié)腸癌是一種發(fā)生率較高的胃腸道腫瘤,多數(shù)結(jié)腸癌病人是由腺瘤性息肉發(fā)展而成,若在病變?cè)缙谶M(jìn)行干預(yù)治療,則可較好地改善結(jié)腸癌預(yù)后[7-8]。因此,積極尋找與結(jié)腸腺瘤性息肉、結(jié)腸癌相關(guān),且可評(píng)估結(jié)腸癌預(yù)后的指標(biāo),對(duì)延長(zhǎng)結(jié)腸癌病人生存期尤其重要。
lncRNA 可與miRNA 結(jié)合,并對(duì)miRNA 調(diào)控下游靶基因之過(guò)程產(chǎn)生作用[9-11]。近期報(bào)道顯示,lncRNA ROR1-AS1 在結(jié)腸癌中呈過(guò)表達(dá),其可促進(jìn)結(jié)腸癌細(xì)胞增殖,抑制結(jié)腸癌細(xì)胞凋亡,從而在結(jié)腸癌發(fā)展中起促進(jìn)作用[12];另外,lncRNA 小核仁RNA 宿主基因12 通過(guò)調(diào)節(jié)miR-15a 表達(dá),進(jìn)而在結(jié)腸癌中發(fā)揮促進(jìn)作用,為治療結(jié)腸癌提供新靶點(diǎn)[13]。以上研究表明,lncRNA 可能參與結(jié)腸癌發(fā)生發(fā)展。近期研究顯示,lncRNA DNAJC3-AS1 在肝細(xì)胞癌中表達(dá)上調(diào),其通過(guò)調(diào)節(jié)miR-27b 表達(dá)進(jìn)而促進(jìn)肝細(xì)胞癌發(fā)展,lncRNA DNAJC3-AS1 可能是治療肝細(xì)胞癌的潛在靶點(diǎn)[14];Tang 等[15]研究發(fā)現(xiàn),lncRNA DNAJC3-AS1 通過(guò)影響相關(guān)信號(hào)通路進(jìn)而促進(jìn)結(jié)直腸癌(colorectal cancer, CRC)發(fā)展,且其與CRC 病人預(yù)后有關(guān),lncRNA DNAJC3-AS1 有望成為診治CRC的新靶點(diǎn)。本研究顯示,結(jié)腸癌組織中l(wèi)ncRNA DNAJC3-AS1表達(dá)水平高于癌旁組織、結(jié)腸腺瘤性息肉,與Han 等[5]的發(fā)現(xiàn)一致,且符合lnCAR 數(shù)據(jù)庫(kù)檢索趨勢(shì),提示lncRNA DNAJC3-AS1 可能與結(jié)腸癌病理變化關(guān)系密切,分析原因,lncRNA DNAJC3-AS1 可調(diào)節(jié)miRNA 表達(dá),并在此過(guò)程中參與結(jié)腸癌細(xì)胞的增殖及凋亡,因此發(fā)揮了一定的促癌作用;且結(jié)腸腺瘤性息肉中l(wèi)ncRNA DNAJC3-AS1表達(dá)水平高于癌旁組織,提示lncRNA DNAJC3-AS1可能參與結(jié)腸腺瘤性息肉發(fā)生發(fā)展,測(cè)定結(jié)腸組織lncRNA DNAJC3-AS1 表達(dá)水平,可能有助于臨床判定病人病情。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),結(jié)腸癌組織lncRNA DNAJC3-AS1表達(dá)水平在不同分化程度、TNM分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、血管浸潤(rùn)等情況下分布顯著不同,提示lncRNA DNAJC3-AS1 可能影響結(jié)腸癌疾病進(jìn)展,檢測(cè)結(jié)腸癌組織lncRNA DNAJC3-AS1 表達(dá)水平可輔助判斷結(jié)腸癌病人病情,有益于臨床制定針對(duì)性治療方案。此外,本研究中l(wèi)ncRNA DNAJC3-AS1 高表達(dá)組結(jié)腸癌病人累積生存率低于lncRNA DNAJC3-AS1 低表達(dá)組,提示lncRNA DNAJC3-AS1與結(jié)腸癌病人預(yù)后密切相關(guān),lncRNA DNAJC3-AS1有望成為評(píng)估結(jié)腸癌病人預(yù)后的標(biāo)志物。
miRNA 可參與血管生成,與結(jié)腸癌的細(xì)胞增殖有關(guān),并且參與了上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(epithelial-mesenchymal transition, EMT)的控制,與胃癌、結(jié)腸癌病理發(fā)展相關(guān)[16-18]。研究發(fā)現(xiàn),miR-214-3p 作為miRNA 的一員,其在肝細(xì)胞癌中低表達(dá),miR-214-3p 可與靶基因結(jié)合進(jìn)而在肝細(xì)胞癌中發(fā)揮抑癌作用[19];另外,miR-214-3p 在CRC 中表達(dá)下調(diào),其靶向結(jié)合有關(guān)基因,進(jìn)而抑制CRC 的惡性行為,miR-214-3p可能是CRC 的治療靶點(diǎn)[20]。本研究中癌旁組織、結(jié)腸腺瘤性息肉、結(jié)腸癌組織的miR-214-3p 檢測(cè)結(jié)果逐步降低,類似于與Han 等[5]的發(fā)現(xiàn),提示miR-214-3p 或許與結(jié)腸癌的初步病變有關(guān),推測(cè)低水平miR-214-3p 抑制結(jié)腸癌細(xì)胞增殖的作用減弱,促進(jìn)結(jié)腸癌細(xì)胞凋亡能力降低,從而影響結(jié)腸癌發(fā)展。為探究其與病理的關(guān)系進(jìn)一步研究,發(fā)現(xiàn)結(jié)腸癌病人處于低分化、TNM 后期(Ⅲ~Ⅳ期)、有血管浸潤(rùn)及淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移狀態(tài)下時(shí)miR-214-3p 低表達(dá)比例更高,因此miR-214-3p 除與結(jié)腸癌發(fā)病有關(guān)外還可能與進(jìn)展有關(guān),此結(jié)果提示miR-214-3p 可能用于結(jié)腸癌的診治及嚴(yán)重程度輔助判斷。此外,本研究中miR-214-3p 低表達(dá)結(jié)腸癌病人累積生存率更低,提示結(jié)腸癌病人組織中miR-214-3p 檢測(cè)結(jié)果越低,則預(yù)后也越差,檢測(cè)結(jié)腸癌組織miR-214-3p 表達(dá)水平有利于評(píng)估結(jié)腸癌病人預(yù)后情況。
經(jīng)生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),lncRNA DNAJC3-AS1與miR-214-3p 具有結(jié)合位點(diǎn)。為驗(yàn)證本研究與網(wǎng)站的一致性,進(jìn)行了進(jìn)一步的相關(guān)性分析,結(jié)果顯示,二者水平呈負(fù)相關(guān),提示二者可能共同影響結(jié)腸癌發(fā)生及病理進(jìn)展過(guò)程,推測(cè)二者可靶向結(jié)合,進(jìn)而協(xié)同影響結(jié)腸癌疾病過(guò)程,但其機(jī)制后期將結(jié)合基礎(chǔ)研究,進(jìn)行深入探討。
綜上,癌旁組織、結(jié)腸腺瘤性息肉、結(jié)腸癌組織中l(wèi)ncRNA DNAJC3-AS1 表達(dá)依次上調(diào),miR-214-3p表達(dá)依次下調(diào),結(jié)腸癌組織中l(wèi)ncRNA DNAJC3-AS1表達(dá)水平與miR-214-3p 呈負(fù)相關(guān),且二者均與部分病理特征如分化程度、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、血管浸潤(rùn)、TNM分期等及病人預(yù)后相關(guān),臨床上可為結(jié)腸癌的輔助診治及疾病進(jìn)展程度提供一定的參考且可為結(jié)腸癌的預(yù)后預(yù)測(cè)發(fā)展新策略。但本研究屬小樣本分析,下一步將利用大規(guī)模樣本驗(yàn)證lncRNA DNAJC3-AS1、miR-214-3p與結(jié)腸癌病人預(yù)后的關(guān)系。