Establishment and Application of Abnormal Karyotype Database for Patients withHematological Diseasesin Ningxia
FANMeirong,YANXin,WANGLi,SONGXumei (Medical Experimental Center,General Hospital ofNingxia Medical University, Yinchuan 750004,Ningxia, China)
Abstract:heataofoalooomosoeyoteulsursialeddcalatandoe karyotypedatabseeabsddoosofcessoftarentabtarepreliilalydAatabas ofabnormalboearoomosoarotssesullyablisdonisftaeplatdthomonboalrow chromosomearotyoentmatolocalseassourospitalinstarsreummardtouhslatfoaabe canreasonablyndfectivelystoreandmnagebnoalonearowaryotedatadprovidevarietyofdatarievalfunctioseaile thedatabasesetfataldtiofalal clinicians to better carry out clinical diagnosis and treatment,teaching and research work.
Keywords:Bone marrow chromosome;Database;Access
血液病是一種來源于血液系統(tǒng)的造血干細(xì)胞惡性克隆性疾病,近年來在我國的發(fā)病率正在逐年上升1。隨著細(xì)胞和分子遺傳學(xué)的發(fā)展,越來越多的研究發(fā)現(xiàn)骨髓染色體的異常與血液病的發(fā)生密切相關(guān),大部分的血液病患者中都存在骨髓染色體結(jié)構(gòu)或數(shù)目的畸變,因此骨髓染色體核型分析可作為血液病分型、鑒別診斷、治療等的重要依據(jù),使血液病的診斷分型更加規(guī)范化和科學(xué)化[2.3]。為了科學(xué)收集、整理異常骨髓染色體核型數(shù)據(jù)資料,本研究基于MicrosoftAccess2016版本建立了寧夏地區(qū)異常骨髓染色體核型數(shù)據(jù)庫,還通過該數(shù)據(jù)庫對(duì)我院近兩年異常骨髓染色體病例的核型分布情況作了初步研究,以期使這一醫(yī)療數(shù)據(jù)更好的在醫(yī)技分析、臨床診療、教學(xué)培養(yǎng)、科研等方面發(fā)揮其更大的優(yōu)勢(shì)。
1數(shù)據(jù)來源
將2022年1月-2023年12月寧夏醫(yī)科大學(xué)總醫(yī)院血液內(nèi)科送檢至我科的骨髓染色體病例共計(jì)841例,經(jīng)染色體核型分析后確認(rèn)核型結(jié)果異常的病例共計(jì)132例納入本數(shù)據(jù)庫中。本研究中數(shù)據(jù)庫全部數(shù)據(jù)信息分為基本數(shù)據(jù)和圖片數(shù)據(jù)兩大類:基本數(shù)據(jù)包括患者患者編號(hào)、年齡、血液病分型、骨髓染色體核型結(jié)果、異常染色體號(hào)、染色體異常類型等,圖片數(shù)據(jù)來源于染色體核型分析系統(tǒng)。其中少數(shù)患者在本室另行骨髓染色體芯片檢測(cè),其結(jié)果也納入本數(shù)據(jù)庫中。
2數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建
考慮到數(shù)據(jù)庫維護(hù)的可操作性和實(shí)用性兩個(gè)方面,選用廣泛使用的Access建立數(shù)據(jù)庫。建數(shù)據(jù)庫前對(duì)異常骨髓染色體核型病患的臨床資料進(jìn)行分析,使所設(shè)計(jì)字段能夠全面涵蓋并充分反映病例特點(diǎn)。所設(shè)計(jì)數(shù)據(jù)庫中包括用戶管理、數(shù)據(jù)管理、信息查詢、圖片處理、知識(shí)及教學(xué)等共5大模塊21項(xiàng)內(nèi)容,見圖1。啟動(dòng)Access2016創(chuàng)建空白數(shù)據(jù)庫,設(shè)計(jì)異常骨髓染色體核型數(shù)據(jù)庫字段項(xiàng),所設(shè)字段涵蓋了數(shù)據(jù)庫所需的21項(xiàng)內(nèi)容。將設(shè)計(jì)完成的不同字段整合成獨(dú)立的數(shù)據(jù)表并在相互間構(gòu)建對(duì)應(yīng)關(guān)系。根據(jù)需求選擇“實(shí)驗(yàn)室內(nèi)部編號(hào)”\"血液病分型”“骨髓染色體核型結(jié)果\"“異常染色體號(hào)\"和\"染色體異常類型\"共5個(gè)字段建立查詢,可按一個(gè)或多個(gè)條件進(jìn)行查詢。上傳相應(yīng)病例的骨髓染色體核型結(jié)果圖片并完善窗體結(jié)構(gòu)和功能,最后增加導(dǎo)航窗體與登錄窗體。

3數(shù)據(jù)庫的功能
數(shù)據(jù)庫共包括5大模塊21項(xiàng)內(nèi)容。用戶管理模塊用于使用前登錄等相關(guān)操作,管理員賬戶登錄后統(tǒng)一管理設(shè)置其他登錄賬號(hào)和密碼,保護(hù)數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)安全。數(shù)據(jù)管理模塊包括添加、刪除、修改、保存及打印模塊,可對(duì)上傳的異常骨髓染色體核型圖片及數(shù)據(jù)進(jìn)行相關(guān)操作,隨時(shí)整理更新系統(tǒng)中的數(shù)據(jù)資料,數(shù)據(jù)庫中資源可隨時(shí)擴(kuò)充修改,能夠更好地實(shí)現(xiàn)資源管理,加強(qiáng)資源的有效利用。數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)由相關(guān)醫(yī)技人員或經(jīng)培訓(xùn)實(shí)習(xí)人員進(jìn)行錄入,根據(jù)科室歷年紙質(zhì)骨髓染色體分析記錄單篩選異常病例,實(shí)驗(yàn)室信息系統(tǒng)中查詢病例信息,染色體核型分析軟件中查詢并導(dǎo)出異常骨髓染色體核型圖片。將上述信息錄入數(shù)據(jù)庫系統(tǒng),原則上不對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行過多的處理,盡量保證原始資料完整性。對(duì)一些常用固定的信息,如血液病分型、骨髓染色體異常類型、異常骨髓染色體號(hào)等采用下拉式列表點(diǎn)選輸人,節(jié)省時(shí)間并減少錯(cuò)誤。其中嵌合體核型中每一種異常核型對(duì)應(yīng)的骨髓染色體圖片均需上傳。信息查詢模塊可按照病例中不同的信息進(jìn)行查詢,且在基本查詢數(shù)據(jù)的基礎(chǔ)上,增加了高級(jí)查詢功能,支持以多字段限定查詢,不同的查詢條件適用于不同情況下學(xué)習(xí)工作的需求。數(shù)據(jù)庫建成后,在信息查詢模塊下的\"按血液病分型\"中依次輸入不同關(guān)鍵字查詢相應(yīng)的異常骨髓染色體核型病例及其臨床資料。圖片處理模塊包括編輯、比對(duì)、放映等功能,在對(duì)異常骨髓染色體圖片進(jìn)行學(xué)習(xí)的過程中,可對(duì)圖片進(jìn)行放大、縮小、比對(duì)等操作,便于對(duì)圖片進(jìn)行充分地識(shí)別與記憶,放映模塊可將骨髓染色體圖片間隔一定時(shí)間進(jìn)行放映,便于教學(xué)時(shí)進(jìn)行演示及講解。知識(shí)及教學(xué)包括染色體圖譜、血液病知識(shí)、考試系統(tǒng)共3個(gè)模塊,染色體圖譜和血液病知識(shí)模塊可隨時(shí)上傳相關(guān)的學(xué)習(xí)資料,及時(shí)更新國內(nèi)外最新研究成果及相關(guān)文獻(xiàn),瀏覽學(xué)習(xí)核型圖片有疑問時(shí)可隨時(shí)查閱。考試模塊可由出題者從數(shù)據(jù)庫中選擇部分異常骨髓染色體核型圖片,隱藏結(jié)果提供給考試人員,相關(guān)考試人員登錄答題后系統(tǒng)可根據(jù)數(shù)據(jù)庫中答案進(jìn)行自動(dòng)閱卷。
4應(yīng)用效果
4.1數(shù)據(jù)庫的運(yùn)行基于Access2016版本建立的寧夏地區(qū)異常骨髓染色體核型數(shù)據(jù)庫運(yùn)行穩(wěn)定、快速,數(shù)據(jù)自動(dòng)備份,未出現(xiàn)數(shù)據(jù)丟失、錯(cuò)誤等情況。數(shù)據(jù)庫界面簡(jiǎn)潔美觀,圖2所示為數(shù)據(jù)管理模塊中所顯示的部分患者資料及骨髓染色體核型圖界面,點(diǎn)擊右側(cè)患者資料可切換左側(cè)對(duì)應(yīng)骨髓染色體核型圖片,直觀的將核型結(jié)果與相應(yīng)骨髓染色體核型圖片進(jìn)行對(duì)應(yīng)學(xué)習(xí)。
4.2數(shù)據(jù)庫中異常骨髓染色體核型分布情況2022-2023年我院841例惡性血液病患者中,檢出異常骨髓染色體核型病例132例,異常率為 1 5 . 7 0 % 。其中檢出單純數(shù)目異常15例,單純結(jié)構(gòu)異常72例,結(jié)構(gòu)數(shù)目均異常病例45例。其中急性髓細(xì)胞白血病(AML)49例,急性淋巴細(xì)胞白血病(ALL)13例,慢性粒細(xì)胞白血病(CML)27例,慢性淋巴細(xì)胞白血病(CLL)9例,骨髓增生異常綜合征(MDS)23例,多發(fā)性骨髓瘤(MM)11例。本數(shù)據(jù)庫中收集診斷的49例AML中包括數(shù)目異常和結(jié)構(gòu)異常,數(shù)目異常主要表現(xiàn)為非整倍體異常,結(jié)構(gòu)異常多為染色體特異性重排,如t(15;17)多見于AML-M3,t(8;21)大多診斷為AML-M2和AML-M4亞型,AML-M4EO患者多可檢測(cè)到inv(16)或t(16;16)異常。13例ALL中檢測(cè)到t(4;11)、t(1;19)
等非特異性異常核型。27例CML中大多數(shù)患者存在典型費(fèi)城染色體即t(9;22)異常,也可檢測(cè)到附加其他額外染色體的復(fù)雜重排,如t(9;22;12)、t(9;22;18)、46,XY,t(5;9;22)等,此外CML中也可見伴染色體數(shù)目異常。CLL所占比例較低,本研究共檢出9例異常核型,均為染色體的缺失或增加等非平衡性改變。23例MDS中異常核型主要包括常見的結(jié)構(gòu)異常 d e l( 5 ) . d e l( 2 0 ) . d e l( 7 ) 及數(shù)目異常 - 7 、 + 8 、 - Y 等,另外
等異常的檢出,也豐富了MDS的核型數(shù)據(jù)。此外本數(shù)據(jù)庫中目前共收納11例MM異常核型患者,均為數(shù)目和結(jié)構(gòu)較復(fù)雜的核型,異常幾乎可涉及大部分的染色體,見表1。



5討論
骨髓染色體核型分析屬形態(tài)學(xué)相關(guān)檢查項(xiàng)目,異常核型的檢出主要依靠專業(yè)技術(shù)人員的經(jīng)驗(yàn)來識(shí)別判斷,提高異常骨髓染色體識(shí)別能力最高效的途徑就是結(jié)合臨床診斷對(duì)各類異常核型圖片進(jìn)行系統(tǒng)全面的學(xué)習(xí),因此骨髓染色體核型分析人員需要高效專業(yè)的培訓(xùn)及考試模式。臨床醫(yī)生面向患者也需要針對(duì)骨髓染色體核型結(jié)果做出科學(xué)的解釋及診斷,而這也是很多臨床醫(yī)生的薄弱之處。在實(shí)驗(yàn)室專用的染色體核型分析軟件及信息系統(tǒng)中均無法自動(dòng)區(qū)分出骨髓染色體的正常核型及異常核型,要從其中找出異常核型圖片進(jìn)行學(xué)習(xí)需要依次點(diǎn)開所有病例來確認(rèn)是否為異常核型,過程繁雜且學(xué)習(xí)無任何系統(tǒng)性和針對(duì)性。目前國內(nèi)尚缺少一種公認(rèn)快捷方便的查詢學(xué)習(xí)異常骨髓染色體核型圖片的數(shù)據(jù)庫可供查閱。
近年來隨著計(jì)算機(jī)技術(shù)的快速發(fā)展,醫(yī)學(xué)信息學(xué)技術(shù)已經(jīng)廣泛應(yīng)用于醫(yī)學(xué)工作和科學(xué)研究的各個(gè)方面[4.5]。專題數(shù)據(jù)庫技術(shù)是指將某一領(lǐng)域的信息加以集合,成為高度結(jié)構(gòu)化的不包含冗繁數(shù)據(jù)的集合,這些數(shù)據(jù)獨(dú)立存儲(chǔ)且可隨時(shí)進(jìn)行增加、刪減、修改等操作,同時(shí)可以服務(wù)于一種或多種的應(yīng)用。其中醫(yī)學(xué)專題型數(shù)據(jù)庫的產(chǎn)生使得在滿足研究某種特定疾病的同時(shí)也從另一個(gè)角度為臨床工作提供服務(wù)。目前國內(nèi)已建立多個(gè)針對(duì)特定疾病或人群的專科信息數(shù)據(jù)庫,如重癥醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫、皮膚擴(kuò)張術(shù)臨床病例數(shù)據(jù)庫、腦血管病數(shù)據(jù)庫等。而大型全面的異常骨髓染色體核型數(shù)據(jù)庫目前還沒有成熟的模式可供參考。
Access是微軟公司開發(fā)的具有強(qiáng)大的數(shù)據(jù)處理、統(tǒng)計(jì)分析和查詢能力的軟件系統(tǒng),在構(gòu)建中小型數(shù)據(jù)庫方面具有明顯的優(yōu)勢(shì),具有專業(yè)的數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng)應(yīng)具備的錄人效率高、搜索功能完善、儲(chǔ)存時(shí)間永久等各項(xiàng)功能,且可與Excel及SPSS等數(shù)據(jù)分析軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)互通[10,11]。Access操作簡(jiǎn)單易學(xué),可低成本的滿足非計(jì)算機(jī)專業(yè)人員的需求,所以國內(nèi)臨床專題型數(shù)據(jù)庫大多是基于Access而建立。本研究基于Access所建立的寧夏地區(qū)血液患者異常骨髓染色體核型數(shù)據(jù)庫系統(tǒng),通過收集異常骨髓染色體核型數(shù)據(jù)形成一個(gè)系統(tǒng)完善的包含病患相關(guān)診療數(shù)據(jù)的大型資料庫,詳盡掌握患者資料及骨髓染色體核型圖片,闡明骨髓染色體疾病相關(guān)臨床表征,數(shù)據(jù)庫可直接應(yīng)用于異常骨髓染色體核型病例的存儲(chǔ)、整理及科研工作,也可作為教學(xué)輔助工具。
對(duì)于實(shí)驗(yàn)室從事骨髓染色體分析的工作人員而言,本研究中數(shù)據(jù)庫的建立極大地解決了對(duì)各種異常骨髓染色體核型進(jìn)行系統(tǒng)學(xué)習(xí)的需求。相關(guān)人員可在數(shù)據(jù)庫中按照患者編號(hào)、異常染色體號(hào)、異常類型等條目將庫內(nèi)所有數(shù)據(jù)排序,依次進(jìn)行學(xué)習(xí),也可遵循數(shù)據(jù)庫強(qiáng)大的檢索功能查詢出某一個(gè)病例或某一種異常類型進(jìn)行學(xué)習(xí)。另外可利用本數(shù)據(jù)庫的考試功能定期對(duì)從事相關(guān)工作的人員進(jìn)行考核,系統(tǒng)可由出題者選取數(shù)據(jù)庫中異常核型圖片并隱藏核型結(jié)果進(jìn)行考試,考試結(jié)束后系統(tǒng)可根據(jù)庫內(nèi)結(jié)果自動(dòng)打分。本數(shù)據(jù)庫的使用可切實(shí)提高骨髓染色體分析人員的專業(yè)技術(shù)能力,提高醫(yī)療質(zhì)量。對(duì)于臨床醫(yī)生而言,在日常診療工作中需要針對(duì)骨髓染色體核型報(bào)告給患者做出相應(yīng)解釋、確定血液病分型進(jìn)而確定診療方案。異常骨髓染色體核型數(shù)據(jù)庫對(duì)于臨床醫(yī)生更有意義的是可詳盡掌握各類血液病患者疾病資料,利于科學(xué)評(píng)價(jià)、指導(dǎo)治療,對(duì)于臨床相似病例的診療做到有例可循。對(duì)于針對(duì)學(xué)生、實(shí)習(xí)生、進(jìn)修生等群體的教學(xué)工作,在實(shí)際臨床教學(xué)實(shí)踐中本數(shù)據(jù)庫可與多媒體相結(jié)合,通過放映核型圖片以形象化、直觀化的效果達(dá)到臨床教學(xué)的目的。
細(xì)胞遺傳學(xué)分析可發(fā)現(xiàn)染色體的克隆性異常,在血液病分型診斷、臨床治療及判斷預(yù)后中均發(fā)揮不可替代的作用,同時(shí)也有助于發(fā)現(xiàn)與疾病有關(guān)的新的基因及位點(diǎn),豐富血液系統(tǒng)疾病的實(shí)驗(yàn)室診斷方法[12]。特異性染色體重排對(duì)判斷預(yù)后有著重要的作用,如AML中單純的t(8;21)、t(15;17)、inv(16)等是預(yù)后較好的核型,提示有較長的緩解期及生存期,出現(xiàn)
等提示中等預(yù)后,而出現(xiàn)-5、-7、t(9;11)或其他復(fù)雜異常核型提示預(yù)后不良或極差[13]。ALL中成人出現(xiàn)超二倍體提示預(yù)后較差,而兒童中出現(xiàn)超二倍體提示預(yù)后較好但容易復(fù)發(fā)[14]。CML中費(fèi)城染色體的變異除Y染色體很少累及,其余染色體均可見涉及,而費(fèi)城染色體合并額外染色體異常的患者預(yù)后較差[15]。CLL患者中出現(xiàn)del(13q)提示預(yù)后較好,出現(xiàn) + 1 2 或2種及以上異常核型提示預(yù)后中等,而出現(xiàn)del(11q)和 d e l( 1 7 p) 則提示預(yù)后較差[]。MDS中核型出現(xiàn)
提示預(yù)后中等,男性Y染色體的獲得性缺失在排除因年齡過高造成的體質(zhì)性異常后提示預(yù)后較好,
的出現(xiàn)均提示預(yù)后較好,而出現(xiàn)- ? 7 , d e l( 7 q) 及復(fù)雜核型則是預(yù)后較差的標(biāo)志[。MM是漿細(xì)胞惡性增殖性疾病,染色體異常克隆性變化通常較復(fù)雜,可合并多種結(jié)構(gòu)及數(shù)量異常,出現(xiàn)如非超二倍體
等與MM預(yù)后不良相關(guān),而t(11;14)則通常提示預(yù)后較好[18.19]。標(biāo)記染色體是一種無法確定其來源的片段性染色體,往往提示與不良預(yù)后相關(guān),是血液病復(fù)發(fā)和預(yù)后差的危險(xiǎn)因素[20]。
綜上所述,本研究所建立的基于Access的血液病患者異常骨髓染色體核型數(shù)據(jù)庫,可對(duì)我院的異常骨髓染色體核型完整資料進(jìn)行結(jié)構(gòu)化管理,數(shù)據(jù)庫具備高效易用的錄人與檢索功能、豐富便捷的醫(yī)學(xué)知識(shí)庫、簡(jiǎn)單省時(shí)的考試系統(tǒng),是醫(yī)技人員、臨床醫(yī)生及學(xué)生等進(jìn)行染色體分析、臨床診療和科研不可或缺的重要工具。后續(xù)我們會(huì)將工作中的異常核型病例定期納入其中,繼續(xù)擴(kuò)大本數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)內(nèi)容。
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收稿日期:2024-03-17;修回日期:2024-03-26