范金霞,楊 謙,姚 琳,陳 剛
(哈爾濱工業大學生命科學與工程系,150001哈爾濱,yangq@hit.edu.cn)
燃料乙醇因其污染小、具有環境友好型的特點,成為新型燃料資源有望取代日益減少的化石能源(如石油和煤炭)[1].傳統乙醇發酵原料為玉米、淀粉等糧食作物,糧食短缺的今天這一生產方式受到很大的限制.木質纖維素物質(如農作物廢棄物、木屑、薯渣等)是世界上最為豐富的生物質資源[2],由纖維素、半纖維素和木質素組成,其水解產物主要是葡萄糖和木糖.釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)能發酵葡萄糖但不能發酵木糖產生乙醇.80年代以來,眾多的學者進行了木糖菌種的篩選以及菌種遺傳工程改造研究,木糖發酵微生物主要集中在畢氏酵母(Pichia),假絲酵母(Candida)和管囊酵母(Pachyso1en)3個屬[3],構建基因重組菌常用的宿主菌種有釀酒酵母(S.cerevisiae)、運動發酵單胞菌(Zymomonas mobilis)和大腸桿菌(E. coli)[4-6],對絲狀真菌的木糖發酵研究的很少.本試驗從自然界中篩選到一株絲狀真菌發酵木糖產乙醇的菌株,對其進行了形態學和分子生物學鑒定,同時對其發酵特性進行了研究.
1.1.1 試驗菌種
cs-28由本試驗室分離,現已送至中國典型微生物研究所保存.E.coli Top10為本實驗室保存.樹干畢赤酵母(Pichia stipitis)來自中科院微生物研究所.
1.1.2 試劑
Taq DNA聚合酶、dNTP、pMD-18T載體、DNAMarker(DL2000)購自寶生物工程(大連)有限公司;膠回收試劑盒購自上海華舜生物公司,引物合成和測序由上海生工生物技術有限公司完成;木糖購自美國Sigma公司;其他試劑均為國產分析純試劑.
1.1.3 培養基
初篩培養基(PXA):馬鈴薯200 g·L-1,木糖20 g·L-1,瓊脂20 g·L-1,pH值自然.
復篩培養基:木糖2%,酵母粉0.4%,蛋白胨0.2%,(NH4)2SO40.6%,KH2PO40.2%,MgSO4·7H2O 0.2‰,CaCl20.1‰.
發酵培養基:KH2PO40.2%,MgSO4·7H2O 0.2‰,CaCl20.1‰,碳源2%,氮源1.2%.
種子培養基(PX培養基):馬鈴薯200 g· L-1,木糖20 g·L-1,pH值自然.
PDA培養基:馬鈴薯200 g·L-1,葡萄糖20 g ·L-1,瓊脂20 g·L-1.
1.2.1 菌種分離,純化和篩選
取1 g采集的土樣溶于10 mL無菌水中30℃振蕩1 h,經適當稀釋后,涂布于PXA平板上,30℃恒溫培養48 h;挑取生長較快菌落,經多次分離純化,將獲得的絲狀真菌純培養物保存.純化后的單菌落經復篩培養基進行杜氏管發酵試驗進一步篩選,最后利用發酵培養基進行乙醇質量濃度的測定,挑選出乙醇產量最高的菌株作為下一步研究對象.
1.2.2 菌種鑒定
形態學鑒定參考文獻[7].分子生物學鑒定根據18S rRNA ITS序列引物:T1:5'-TCC GTA GGT GAA CCT GCG G-3',T2:5'-TCC TCC GCT TAT TGA TAT GC-3'.基因組DNA提取參見文獻[8]方法進行.PCR反應體系:所有PCR反應均在20 μL標準反應體系中進行,其中含2 μL Buffer緩沖液,1.6 μL 2.5 mmol/L dNTPs,每一引物均1 μL(10 mmol/L),0.125 μL Taq酶,1 μL模板DNA,加無菌超純水至20 μL,于PCR儀上按94℃預變性5 min,然后按94℃、30 s,56℃、30 s,72℃、1 min,循環32次,最后72℃延伸10 min.PCR產物的克隆測序:按照膠回收試劑盒說明回收目的片段,連接克隆載體,轉化大腸桿菌感受態細胞Top10,提取質粒DNA,雙酶切鑒定后,挑取陽性克隆子送至上海生工生物技術有限公司進行測序.測序結果利用NCBI網站的Blastn和DNASTAR進行序列比較分析.
乙醇產量測定采用重鉻酸鉀比色法[9].木糖質量濃度測定采用DNS比色法[10].
1)不同碳源對乙醇產量的影響.選取12種不同的碳源,按質量比2%加入到發酵培養基中.
2)不同氮源對乙醇產量的影響.選擇12種不同的氮源,按質量比1.2%加入到培養基中,以2%的木糖作為碳源,獲得最佳氮源.
3)初始pH值對乙醇產量的影響.用鹽酸調節發酵培養基的初始pH值,分別為5.0、5.2、5.4、5.8、6.0、6.2,確定最佳的發酵酸堿條件.
4)不同溫度對乙醇產量的影響.將接種后的液體培養基分別放在20、24、26、28、30、32、34、36℃的培養箱中靜止培養,比較溫度對產乙醇的影響.
5)不同初始木糖質量濃度對乙醇產量的影響:在發酵培養基中加入質量比分別為2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%的木糖進行發酵,比較乙醇產量.
2.1.1 菌種的分離與篩選
通過對30份土樣中篩選得到能在PXA培養基上生長的菌株58株,利用杜氏管發酵檢測到16種菌株能產氣,對其進行發酵試驗,測定乙醇產量,得到一株產乙醇量最高的菌株cs-28.通過cs-28與樹干畢赤酵母乙醇產量的比較可以看出,cs-28最高乙醇產量在發酵的第144小時,而樹干畢赤酵母在第96小時,cs-28產乙醇的周期比樹干畢赤酵母長,但乙醇產量高于畢赤酵母(圖1).

圖1 cs-28與樹干畢赤酵母乙醇產量的比較
2.1.2 形態學鑒定
將cs-28放在PDA培養基上培養.該菌株在培養2 d后菌落直徑超過2.5 cm,7 d達8~9 cm;在室溫(25℃)下,菌絲生長良好,棉絮狀至絨毛狀,最初白色,逐漸中央粉色,后期轉變為紫色,培養基反面深紫色(圖2).菌絲經棉蘭染色后顯微鏡觀察結果:菌絲有隔,分枝,透明;有大小兩種類型分生孢子(圖3(a)),小型分生孢子數量較多,從菌絲的側生而單出的瓶狀小梗上長出或從分生孢子梗上長出,不呈鏈生而是假頭狀著生,橢圓形、紡錘形、卵形、逗點形;大型分生孢子時常較少,產于粘孢團中或從分孢子梗上長出;鐮刀形、紡錘形;頂端細胞窄細;有隔,3~6個分隔(圖3(b)).

圖2 cs-28在PDA培養基中生長7 d的菌落形態

圖3 cs-28孢子的顯微觀察
2.1.3 分子生物學鑒定
以cs-28基因組DNA為模板,應用真菌通用的18s rRNA引物進行PCR擴增,得到大約500 bp片段(圖4),將目的片段連接克隆載體pMD-18T后進行測序.利用DNASTAR軟件隊測序結果進行處理后,獲得了535 bp核苷酸序列.通過NCBI網站上Blastn(http://blast.ncbi.nlm. nih.gov/Blast.cgi)進行相似性搜索,結果顯示與Fusarium oxysporum的相似性為100%,結合形態學觀察結果可以確定該菌株為尖孢鐮刀菌(Fusarium oxysporum).

圖4 cs-28 18s rRNA片段擴增結果
2.2.1 不同碳源對乙醇發酵的影響
選取12種不同的碳源進行發酵試驗,結果見圖5,cs-28對蔗糖、葡萄糖發酵產乙醇能力最強,對乳糖的發酵能力最弱.對12種碳源均有不同程度的乙醇發酵能力,其碳源應用譜廣泛,有望成為工業發酵待選菌種.

圖5 不同碳源對cs-28乙醇產量的影響
2.2.2 不同氮源對乙醇發酵的影響
不同氮源對cs-28發酵產乙醇的試驗結果見圖6.可以看出,有機氮源比無機氮源產乙醇的量高.在有機氮源中yeast extract的產乙醇量最高,達4.28 g·L-1,與黃豆面發酵效果持平,考慮到發酵成本,以下的發酵試驗中采用黃豆面作為氮源.在無機氮源中,硝態氮比銨態氮效果好.其中NaNO3的發酵效率最高,達2.61 g·L-1.

圖6 不同氮源對cs-28乙醇產量的影響
2.2.3 不同溫度對乙醇發酵的影響
溫度對乙醇發酵的影響很大,溫度過高會增加乙醇的蒸發,溫度過低影響菌體生長,從而影響乙醇產量.試驗結果(圖7)表明:隨著溫度的升高,乙醇產量逐漸升高,溫度為30℃時乙醇產量最高,隨后逐漸下降.

圖7 不同溫度對cs-28乙醇產量的影響
2.2.4 初始pH值對乙醇發酵的影響
初始pH值分別設為5.4、5.6、5.8、6.0、6.2,隨著pH值的升高乙醇產量呈上升趨勢,pH為6.0時乙醇產量最高,為5.51 g·L-1,隨后又急劇下降(圖8).

圖8 不同pH對cs-28乙醇產量的影響
2.2.5 初始木糖質量濃度對乙醇發酵的影響
初始木糖質量濃度對乙醇產量的影響極大,隨著木糖質量濃度的增加,乙醇產量也逐漸增加,但是乙醇產率卻逐漸下降(圖9),初始木糖質量濃度為20 g·L-1,乙醇產率最高,即木糖轉化率最高.

圖9 初始木糖質量濃度對cs-28乙醇產量的影響
本試驗篩選到的發酵木糖產乙醇的菌種為尖孢鐮刀菌,據文獻[11-12]報道,尖孢鐮刀菌不僅能產生多種纖維素酶系和半纖維素酶系,同時還具有降解多環芳烴蒽和苯酚的能力[13-14],這為環境固體廢棄物和多環芳烴物質的降解提供了優良菌種.Panagiotou G等[15]利用尖刀鐮刀菌F3實現纖維素的同時糖化和發酵.尖孢鐮刀菌利用硝態氮的能力優于銨態氮,這與Naim M S等[16]研究的結果一致.同樣是絲狀真菌,最適的發酵初始pH值不近相同,雖然都在微酸性條件下,尖孢鐮刀菌最適pH為6.0,而粗糙脈孢霉的最適pH為5.0[17].不同菌種對糖質量濃度的適應能力不一樣,釀酒酵母在高糖溶液(300 g·L-1)中仍然可以進行發酵,而尖孢鐮刀菌的最適木糖質量濃度(20 g·L-1),比Pachysolen tannophilus的最適木糖質量濃度[18]低,這可能與細胞膜透性和滲透壓有關[19].
1)篩選到一株發酵木糖產乙醇的菌種cs-28,經過形態學和生物學鑒定為尖孢鐮刀菌(Fusarium oxysporum).
2)最適的發酵條件溫度為30℃;pH值為6.0;最適有機碳源為酵母提取物,無機碳源為NaNO3.
3)尖孢鐮刀菌(F.oxysporum)具有發酵多種碳源的特性,為秸稈的資源化利用和能源的生產提供了新的菌種資源.
[1] OLESKOWICZ-POPIEL P,LISIECKI P,HOLMNIELSEN J B,et al.Ethanol production from maize silage as lignocellulosic biomass in anaerobically di-gested and wet-oxidized manure[J].Bioresource Technology,2008,99(13):5327-5334.
[2] CARDONA ALZATE C A,SANCHEZ TORO O J. Energy consumption analysis of integrated flowsheets for production of fuel ethanol from ligocellulosic biomass[J].Energy,2006,31(13):2447-2459.
[3] 牟建樓,王頡,張偉,等.木糖發酵微生物的研究進展[J].纖維素科學與術,2004,12(2):35-40.
[4] CHU B C H,LEE H.Genetic improvement of Saccharomyces cerevisiae for xylose fermentation[J].Biotechnology Advances,2007,25(5):425-441.
[5] ZHANG Xiaomei,CHEN Guanjun,LIU Weifeng.Reduction of xylose to xylitol catalyzed by glucose-fructose oxidoreductase from Zymomonas mobilis[J]. FEMS Microbiology Letters,2009,293(2):214-219.
[6] WANG Zhanchao,CHEN Ming,XU Yuquan,et al. An ethanol-tolerant recombinant Escherichia coli expressing Zymomonas mobilis pdc and adhB genes for enhanced ethanol production from xylose[J].Biotechnology Letters,2008,30(3):657-663.
[7] 魏景超.真菌鑒定手冊[M].上海:上海科學技術出版社,1979:487-642.
[8] J.薩姆布魯克,D.W.拉賽爾.分子克隆實驗指南[M].3版.北京:科學出版社,2002:492-499.
[9] 牟建樓,王頡,張偉,等.乙醇的測定方法綜述[J].釀酒,2006,33(2):45-48.
[10] ZHAO Lei,ZHANG Xu,TAN Tianwei.Influence of various glucose/xylose mixtures on ethanol production by Pachysolen tannophilus[J].Biomass and Bioenergy, 2008, doi: 10.1016/j. biombioe. 2008.02.011.
[11] CALERO-NIETO F,HERA C,DI PIETRO A,et al.Regulatory elements mediating expression of xylanase genes in Fusarium oxysporum[J].Fungal Genetics and Biology,2008,45(1):28-34.
[12] XIROS C,KATAPODIS P,CHRISTAKOPOULOS P. Evaluation of Fusarium oxysporum cellulolytic system for an efficient hydrolysis of hydrothermally treated wheat straw[J].Bioresoure Technology,2009,100 (21):5362-5365.
[13] 陳芳艷,毛莉,唐玉斌,等.外加碳源對尖鐮孢菌降解蒽的影響[J].水處理技術,2007,33(8):54 -58.
[14] PARK J Y,HONG J W,GADD G M.Phenol degradation by Fusarium oxysporum GJ4 is affected by toxic catalytic polymerization mediated by copper oxide[J].Chemosphere,2009,75(6):765-771.
[15] PANAGIOTOU G,CHRISTAKOPOULOS P,OLSSON L.Simultaneous saccharification and fermentation of cellulose by Fusarium oxysporum F3-growth characteristics and metabolite profiling[J].Enzyme and Microbial Technology,2005,36(5/6):693-699.
[16] NAIM M S,SHAROUBEEM H H.Carbon and nitrogen requirements of Fusarium oxysporum causing cotton wilt[J].Mycopathologia,1964,22(1):59-64.
[17] ZHANG Xiao,ZHU Dongqing,WANG Dan,et al. Study on xylose fermentation by Neurospora crassa[J].Acta Microbiologica Sinica,2003,43(4):466 -472.
[18] BRAVO V,CCMACHO F,SANCHEZ S,et al.Influence of the concentrations of D-xylose and yeast extract on ethanol production by Pachysolen tannophilus[J].Journal of Fermentation and Bioengineering,1995,79(6):566-571.
[19] 鄭美娟,余華順.酵母菌耐高滲機理研究[J].釀酒科技,2008,172(10):37-40.