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基于Oncomine 芯片數據庫分析低密度脂蛋白受體相關蛋白4在甲狀腺乳頭癌中的表達及意義△

2021-10-23 07:25:48馮鑫源田昀靈傅松波邴志桐趙楠洪成恩王素媛龔文倩吳嘯天
癌癥進展 2021年14期
關鍵詞:數據庫差異分析

馮鑫源,田昀靈,傅松波,邴志桐,趙楠,洪成恩,王素媛,龔文倩,吳嘯天

1蘭州大學第一臨床醫學院,蘭州730000

2蘭州大學第一醫院內分泌科,蘭州730000

3中國科學院近代物理研究所,蘭州7300000

甲狀腺癌(thyroid carcinoma,TC)約占所有惡性腫瘤的1%,且在內分泌系統惡性腫瘤中居首位。世界衛生組織對TC 進行分型,其中甲狀腺乳頭狀癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)在人群中最常見,占75%~80%,且惡性度相對較低,臨床預后較好;其次是濾泡性癌、髓樣癌和未分化癌。近年來,中國TC 的發病率呈逐年上升趨勢,在美國TC 已成為威脅人們生命健康的首位疾病。Hucz等研究證實,低密度脂蛋白受體相關蛋白4(lowdensity lipoprotein receptor related protein 4,LRP4)在PTC組織中的表達水平明顯高于相應癌旁組織,提示LRP4 可能是甲狀腺癌的致癌因子。Zhou 等通過對19 例PTC 患者進行轉錄組測序,發現LRP4在腫瘤組織及PTC細胞系中高表達,不同PTC細胞系中的沉默

LRP4

基因,可以抑制腫瘤細胞在組織內的侵襲和增殖,從體外實驗的角度證明了LRP4作為致癌因子的作用。進一步研究發現,LRP4 主要是通過激活細胞上皮-間充質轉化,從而促進PTC的轉移。Oncomine 數據庫是一個基于基因芯片的數據庫和整合數據挖掘平臺,在此數據庫中可根據選題需求設定篩選和挖掘數據的條件。本研究通過篩選Oncomine 數據庫中LRP4 的基因芯片信息,對相關資料進行深入挖掘分析,得出其在PTC中的表達結果及其與預后的關系,現報道如下。

1 資料與方法

1.1 數據檢索

在Oncomine 數據庫中進行檢索,第一步設定篩選條件“Gene:LRP4”可得到LRP4 在不同腫瘤組織中的表達情況。第二步在上述檢索基礎上對分析類型、腫瘤類型、數據類型及參數進行限制,添加檢索條件①“Analysis Type:Cancer

vs

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