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長鏈非編碼RNA 在乳腺癌中的研究進展△

2021-11-11 08:08:25楊豆宇馬方婧迪麗米娜伊拉木陳芳郭麗英
癌癥進展 2021年12期
關(guān)鍵詞:耐藥乳腺癌研究

楊豆宇,馬方婧,迪麗米娜·伊拉木,陳芳,郭麗英

新疆醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院乳腺外科,烏魯木齊 830000

乳腺癌是全世界女性中最常見的惡性腫瘤,盡管在過去十年中乳腺癌的治療取得了重要進展,但該疾病仍然是嚴重危害人類健康的公共衛(wèi)生問題。抗腫瘤治療方法的發(fā)現(xiàn)和發(fā)展極大地提高了腫瘤患者的生存率和生活質(zhì)量。然而,接受抗腫瘤藥物治療的患者通常會產(chǎn)生明顯的耐藥性,導(dǎo)致療效降低、腫瘤復(fù)發(fā)、轉(zhuǎn)移,最終導(dǎo)致治療失敗。腫瘤的侵襲和轉(zhuǎn)移是一個復(fù)雜的生物學(xué)過程,傳統(tǒng)乳腺癌標(biāo)志物缺乏足夠的靈敏度和特異度,2007 年美國臨床腫瘤學(xué)會(American Society of Clinical Oncology,ASCO)不再推薦傳統(tǒng)腫瘤標(biāo)志 物[ 如 癌 胚 抗 原(carcinoembryonic antigen,CEA)、糖 類 抗 原153(carbohydrate antigen 153,CA153)]作為早期乳腺癌的診斷和術(shù)后隨訪指標(biāo)。近年來,微陣列和高通量測序技術(shù)的發(fā)展使人們更深層次地了解分子生物學(xué),尤其是非編碼RNA。其中長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展、侵襲、轉(zhuǎn)移中具有重要的調(diào)節(jié)作用,是能夠應(yīng)用于腫瘤診斷和預(yù)后判斷的分子標(biāo)志物。lncRNA 是一種長度超過200 個核苷酸的不編碼蛋白質(zhì)的RNA 分子,根據(jù)最新的研究數(shù)據(jù),lncRNA 的組織特異性表達特征可能代表乳腺癌不同階段的組織特異性,因此可作為乳腺癌診斷和預(yù)后的生物標(biāo)志物或治療靶點。本文就lncRNA 在乳腺癌診斷、侵襲與轉(zhuǎn)移、耐藥、治療前景及預(yù)后等方面的研究進展進行綜述。

1 lncRNA 概述

1.1 lncRNA 的發(fā)現(xiàn)

人類基因組測序結(jié)果顯示,具有編碼蛋白質(zhì)功能的基因只占不到全部基因組序列的2%,而在占據(jù)人類基因組98%以上的非蛋白編碼序列中,絕大多數(shù)為lncRNA。lncRNA 起初被認為是基因組轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的“噪聲”,并不具有生物學(xué)功能,然而隨著生物技術(shù)的飛速發(fā)展,lncRNA 于2002 年對小鼠全基因組cDNA 文庫的大規(guī)模測序過程中首次被發(fā)現(xiàn),其生物學(xué)功能逐一被呈現(xiàn)。目前常用于研究lncRNA 的公共數(shù)據(jù)庫包括TCGA、LNCipedia、lncRNAdb、starBase、miRCode、TargetScan、Ensembl、CLIPdb、PARma、lncRNAtor、NONCODE、lnCeDB。lncRNA 是一類轉(zhuǎn)錄本長度超過200 個堿基的RNA,其長度為200~100 000 nt,一般位于細胞核和細胞質(zhì)中,許多l(xiāng)ncRNA 滯留在不同的亞細胞器中,在真核細胞中普遍被轉(zhuǎn)錄。大量數(shù)據(jù)表明,大多數(shù)已鑒定的lncRNA 由RNA 聚合酶Ⅱ(RNA polⅡ)轉(zhuǎn)錄,具有mRNA 樣結(jié)構(gòu),經(jīng)過酶的剪切和加工作用,具有polyA 尾和啟動子結(jié)構(gòu),但由于其序列中缺少開放閱讀框而不具有或者很少具有蛋白質(zhì)編碼功能。研究表明,lncRNA 是腫瘤來源的核酸,可以釋放到周圍循環(huán)中并在血漿和血清中檢測到。

1.2 lncRNA 的生物學(xué)功能

lncRNA 表現(xiàn)出發(fā)育和組織特異性的表達模式,并與許多生物學(xué)過程有關(guān),例如選擇性剪接、蛋白質(zhì)活性調(diào)節(jié)、蛋白質(zhì)定位改變以及表觀遺傳調(diào)控。一些lncRNA 可以作為小RNA 的前體和沉默微小RNA(microRNA,miRNA)的工具。研究表明,lncRNA 可作為miRNA 海綿體即miRNA 的競爭性抑制劑來降低miRNA 的水平。lncRNA 在分子功能上主要充當(dāng)4 種角色:信號、誘餌、引導(dǎo)、支架。lncRNA 可以作為信號分子發(fā)揮作用,當(dāng)細胞受到特定刺激時,lncRNA 將表現(xiàn)出相應(yīng)的組織特異性。lncRNA 可以作為miRNA 靶點的誘餌,還可以刺激和結(jié)合特定的蛋白質(zhì),然后阻止其下游序列的反應(yīng)。lncRNA 不僅可以招募染色質(zhì)修飾酶或其他蛋白質(zhì)來靶向基因,還可以形成一個蛋白質(zhì)復(fù)合物的結(jié)構(gòu),聚集兩種表面修飾酶。lncRNA 在基因表達的調(diào)控中發(fā)揮廣泛作用,在人類和動物細胞周期調(diào)控、免疫監(jiān)視和胚胎干細胞多能性等過程中發(fā)揮重要作用。lncRNA 可在細胞中調(diào)節(jié)基因表達,影響蛋白質(zhì)定位,并對形成細胞亞結(jié)構(gòu)或蛋白質(zhì)復(fù)合物具有重要作用。lncRNA 可通過與蛋白質(zhì)相互作用調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)的活性和定位。此外,lncRNA 通過將轉(zhuǎn)錄因子募集到其靶基因啟動子上調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄,激活基因表達。因此,lncRNA 與腫瘤的發(fā)生密切相關(guān)。

2 lncRNA 在乳腺癌診斷中的作用

許多l(xiāng)ncRNA 能夠促進惡性腫瘤的發(fā)展、轉(zhuǎn)移和耐藥,并在許多人類惡性腫瘤中表現(xiàn)出較高的組織特異性。研究表明,許多l(xiāng)ncRNA 的表達譜與乳腺癌的不良預(yù)后、生存率和疾病復(fù)發(fā)相關(guān)。重要的是,乳腺癌中組織特異性lncRNA 的表達可以作為臨床上有用的生物標(biāo)志物來區(qū)分正常組織和腫瘤組織或乳腺癌亞型。lncRNA 也可以作為乳腺癌的標(biāo)志物,有助于早期乳腺癌的診斷和提高疾病治療療效。H19 是乳腺癌中首個被發(fā)現(xiàn)的lncRNA,通過多個機制參與乳腺癌的發(fā)生發(fā)展,包括編碼miRNA-675、參與競爭性內(nèi)源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)、與MYC 相互作用等。曹鳴菲等研究發(fā)現(xiàn),長鏈非編碼RNA-ROR(long non-coding RNA-ROR,lincRNA-ROR)在乳腺癌患者的乳腺癌組織和血清中表達上調(diào),術(shù)后其表達水平下降,這一研究支持了lncRNA 作為乳腺癌診斷及預(yù)后預(yù)測標(biāo)志物的觀點。此外,lncRNA 可能有助于乳腺癌的分子分類,MS-lncRNA-BCLIN25 作為人表皮生長因子受體2(human epidermal growth factor receptor 2,HER2)過表達亞型的特異性lncRNA,被發(fā)現(xiàn)通過表觀遺傳修飾和RNA-RNA 相互作用上調(diào)erb-b2 受體酪氨 酸 激 酶2(erb-b2 receptor tyrosine kinase 2,ERBB2)的表達,進而促進腫瘤的發(fā)生。Cedro-Tanda 等研究發(fā)現(xiàn),AC009283.1 高表達可能與腫瘤的發(fā)生有關(guān),并認為其在HER2 富集型乳腺癌中具有潛在的作用。研究表明,SNHG3 在三陰性乳腺癌(triple-negative breast cancer,TNBC)中高表達,其表達沉默可能通過影響miRNA-326/整合素-α5(integrin-α5,ITGA5)軸和抑制Vav2/Rac1 信號通路抑制體外TNBC細胞的惡性發(fā)展。這一結(jié)果說明SNHG3 可作為TNBC 的潛在生物標(biāo)志物。研究表明,lncRNA CASC9 可作為一種新的治療靶點,并可作為診斷乳腺癌的潛在標(biāo)志物。

3 lncRNA 在乳腺癌侵襲和轉(zhuǎn)移中的作用

侵襲和轉(zhuǎn)移是腫瘤細胞重要的生物學(xué)行為。由于lncRNA 具有與DNA、RNA、蛋白質(zhì)及其結(jié)合物相互作用的能力,lncRNA 可通過表觀遺傳調(diào)控、ceRNA 調(diào)控網(wǎng)絡(luò)、促進血管生成、誘導(dǎo)上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)等途徑影響乳腺癌的侵襲與轉(zhuǎn)移。

3.1 lncRNA 介導(dǎo)的基因表達調(diào)控

lncRNA 廣泛參與基因組的調(diào)節(jié),與腫瘤(包括乳腺癌)的發(fā)生、發(fā)展、侵襲和轉(zhuǎn)移具有密切聯(lián)系。研究表明,lncRNA H19 是乳腺癌發(fā)生和轉(zhuǎn)移的驅(qū)動力。熒光素酶檢測結(jié)果表明,H19/miRNA-675-5p 能夠降低泛素連接酶E3 家族(c-Cbl 和Cblb)的表達水平,激活表皮生長因子受體(epidermal growth factor receptor,EGFR)和肝細胞生長因子受體c-met,通過蛋白激酶B(protein kinase B,PKB,又稱AKT)和胞外信號調(diào)節(jié)激酶(extracellular signal-regulated kinase,ERK)途徑促進MDA-MB-231乳腺癌細胞的增殖和遷移。此外,miRNA-675 還參與了H19 促進Slug 表達并抑制上皮鈣黏素(Ecadherin)表達的機制,從而增加了乳腺癌細胞侵襲和轉(zhuǎn)移的可能性。同時,lncRNA H19 和p53 在乳腺癌的發(fā)生和轉(zhuǎn)移過程中可相互作用,腫瘤抑制因子p53 能夠調(diào)節(jié)與細胞周期阻滯和凋亡有關(guān)的下游基因。重要的是,lncRNA H19 基因座被置于細胞周期調(diào)控的核心,尤其是在G期到S 期的過渡期。乳腺癌細胞系中l(wèi)ncRNA H19 表達增強可誘導(dǎo)G/S 期轉(zhuǎn)換,而lncRNA H19 耗竭則阻止細胞進入S 期和增殖。Li 等首次發(fā)現(xiàn)lncRNA H19 是乳腺癌中p53 的靶基因,強調(diào)了腫瘤壞死因子α誘導(dǎo)蛋白8(tumor necrosis factor alpha induced protein 8,TNFAIP8)和p53 在乳腺癌中的相互調(diào)節(jié)作用,lncRNA H19 的表達增強通過競爭性結(jié)合p53 來消除p53 對TNFAIP8 的抑制作用,進而誘導(dǎo)乳腺癌細胞的EMT 和轉(zhuǎn)移。值得注意的是,一項關(guān)于乳腺癌發(fā)生發(fā)展調(diào)控機制的研究顯示,HOX 轉(zhuǎn)錄反義RNA(HOX transcript antisense RNA,HOTAIR)能夠促進乳腺癌轉(zhuǎn)移,部分是通過與多梳抑制復(fù)合物2(polycomb repressive complex 2,PRC2)結(jié)合,誘導(dǎo)PRC2 在全基因組范圍內(nèi)靶向與轉(zhuǎn)移有關(guān)的數(shù)百個基因,其結(jié)果是H3K27 甲基化,在表觀遺傳學(xué)上使這些基因沉默。此外,HOTAIR 通過促進響應(yīng)啟動子區(qū)域的H3K27 甲基化直接抑制WNT 抑制因子1(WNT inhibitory factor 1,WIF1)的表達,從而激活WNT/β-聯(lián)蛋白(β-catenin)信號通路。因此,HOTAIR 在乳腺癌的表觀遺傳調(diào)控中具有關(guān)鍵作用。另有研究表明,lncRNA-乳腺癌抗雌激素耐受 基 因4(breast cancer anti-estrogen resistance 4,BCAR4)通過參與Hippo 和Hedgehog 信號通路調(diào)節(jié)糖代謝,從而在腫瘤轉(zhuǎn)移中發(fā)揮作用,這也可作為TNBC 的潛在治療靶點。雌激素調(diào)節(jié)的lncRNA CUPID1 和CUPID2 則通過抑制DNA 損傷后的細胞周期停滯促進乳腺癌的進展。

3.2 lncRNA 介導(dǎo)的ceRNA 調(diào)控網(wǎng)絡(luò)

乳腺癌的侵襲和轉(zhuǎn)移是多種分子機制綜合作用的結(jié)果,包括ceRNA 網(wǎng)絡(luò)。其中,lncRNA 相關(guān)的ceRNA 網(wǎng)絡(luò)通過海綿化miRNA 在腫瘤的侵襲和轉(zhuǎn)移中發(fā)揮至關(guān)重要的作用。TP73-AS1 是在人類染色體1p36 上新發(fā)現(xiàn)的lncRNA,TP73-AS1 介導(dǎo)的miRNA/mRNA 網(wǎng)絡(luò)有助于乳腺癌的發(fā)生和發(fā)展。TP73-AS1 的表達與臨床中乳腺癌的遠處轉(zhuǎn)移具有顯著關(guān)聯(lián)。Liu 等研究發(fā)現(xiàn),TP73-AS1 基因敲除可抑制乳腺癌細胞增殖、遷移和侵襲,且可通過靶向miRNA-125a 和上調(diào)異黏蛋白(metadherin,MTDH)的表達促進體外乳腺癌細胞凋亡,提示TP73-AS1/miRNA-125a/MTDH 是導(dǎo)致乳腺癌惡性進展的一條新的途徑。研究最多的lncRNA 之一是X 染色體失活特異性轉(zhuǎn)錄因子(X inactive specific transcript,XIST),它是從雌性哺乳動物的X 染色體失活中心轉(zhuǎn)錄而成。研究表明,XIST 通過miRNA-155/尾側(cè)型同源轉(zhuǎn)錄因子1(caudal type homeobox 1,CDX1)軸抑制乳腺癌細胞的生長、遷移和侵襲。Liu 等研究證實,XIST 通過充當(dāng)miRNA-362-5p 的ceRNA 并調(diào)節(jié)泛素相關(guān)蛋白1(ubiquitin associated protein 1,UBAP1)的表達抑制乳腺癌的進展。此外,H19 作為ceRNA 與miRNA-152結(jié)合,miRNA-152 能夠直接作用于DNA 甲基轉(zhuǎn)移酶1(DNA methyltransferase 1,DNMT1)。H19 的過表達降低了miRNA-152 對DNMT1 表達的抑制作用,從而促進了乳腺癌細胞MCF-7 和MDA-MB-231 的增殖和侵襲。H19 是miRNA-93-5p 的靶點,該分子可上調(diào)miRNA-93-5p 靶點信號轉(zhuǎn)導(dǎo)及轉(zhuǎn)錄激活因子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)的表達水平,STAT3 可顯著促進乳腺癌細胞MCF-7 和MDA-MB-231 的增殖、遷移和侵襲。H19 充當(dāng)ceRNA 使let-7 家族的miRNA 海綿化并促進核心多能性因子LIN28 的表達。H19、let-7a/b 和LIN28 形成了一個雙負反饋環(huán),對乳腺癌干細胞的遷移產(chǎn)生了深遠的影響。這種ceRNA 調(diào)節(jié)作用可釋放缺氧誘導(dǎo)因子-1α(hypoxia-inducible factor-1α,HIF-1α),導(dǎo)致丙酮酸脫氫酶激酶1 表達增加,從而影響乳腺癌干細胞的重編程。在TNBC 中,lincRNA-ROR 高表達,且lincRNA-ROR可發(fā)揮ceRNA 的功能,沉默miRNA-145 的表達可使其下游重要的靶基因ADP 核糖基化因子6(ADP ribosylation factor 6,ARF6)水平升高,進而改變上皮鈣黏素的定位及細胞間連接,從而促進乳腺癌的侵襲和轉(zhuǎn)移。

3.3 lncRNA 介導(dǎo)的腫瘤血管生成

腫瘤血管生成是腫瘤生長和轉(zhuǎn)移的重要過程,由于新生血管的形成,腫瘤細胞可以獲得生長和傳播所需的營養(yǎng)物質(zhì),從而導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生、發(fā)展和轉(zhuǎn)移。研究表明,lncRNA NR2F1-AS1 可能通過海綿化miRNA-338-3p 誘導(dǎo)乳腺癌血管生成。Zhang 等研究證實胰島素樣生長因子1(insulin like growth factor 1,IGF1)可以直接與miRNA-338-3p 結(jié)合,同時lncRNA NR2F1-AS1 也可以對IGF1的表達進行正調(diào)控,因此,lncRNA NR2F1-AS1 可以海綿化miRNA-338-3p,保護IGF1 不受抑制。據(jù)報道,IGF1 可與內(nèi)皮細胞中的胰島素樣生長因子1受體(insulin like growth factor 1 receptor,IGF1R)結(jié)合以促進血管生成,并且IGF1R 的激活可進一步激活ERK 通路。lncRNA NR2F1-AS1 可誘導(dǎo)乳腺癌細胞中IGF1 的表達,從而提高人臍靜脈內(nèi)皮細 胞(human umbilical vein endothelial cell,HUVEC)中IGF1R 和ERK1/2 的磷酸化。因此,lncRNA NR2F1-AS1 可 通過海綿化miRNA-338-3p 及IGF1/IGF1R/ERK 途徑促進乳腺癌血管生成。

3.4 lncRNA 介導(dǎo)的EMT 激活機制

EMT 是上皮細胞在形態(tài)學(xué)上發(fā)生向間充質(zhì)細胞表型轉(zhuǎn)變并獲得遷移能力的過程。EMT 可導(dǎo)致細胞骨架重組、細胞間黏附喪失、頂端-基底極性異常,從而增強腫瘤細胞的活力和侵襲能力。據(jù)報道,lncRNA H19 可調(diào)節(jié)腫瘤細胞中多種EMT 相關(guān)基因的表達。H19的過表達降低了上皮標(biāo)志物上皮鈣黏素的表達并誘導(dǎo)了間充質(zhì)標(biāo)志物波形蛋白的表達,從而導(dǎo)致細胞中間充質(zhì)樣形態(tài)變化延長。此外肺腺癌轉(zhuǎn)移相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子1(metastasis associated lung adenocarcinoma transcript 1,MALAT1)可與RNA 結(jié)合蛋白HuR 結(jié)合并形成抑制性復(fù)合物,這種復(fù)合物通過與腫瘤干細胞標(biāo)志物

CD133

的啟動子結(jié)合對CD133 進行負性調(diào)控,影響EMT 的進行,從而影響乳腺癌的侵襲和轉(zhuǎn)移。

4 lncRNA 在乳腺癌耐藥中的作用

雖然多種化療藥物及內(nèi)分泌治療藥物改善了乳腺癌患者的總體生存率和生活質(zhì)量,但仍有部分患者出現(xiàn)耐藥,阻礙其治療,乳腺癌仍然是全世界女性惡性腫瘤相關(guān)死亡的主要原因。lncRNA 通過賦予細胞耐藥表型的多種機制在調(diào)節(jié)內(nèi)源性和獲得性耐藥中發(fā)揮著動態(tài)作用。

4.1 lncRNA H19

高水平的H19 通常與惡性腫瘤患者的不良預(yù)后相關(guān),并與各種惡性腫瘤的化療耐藥相關(guān)。H19是雌激素受體α(estrogen receptor α,ERα)的下游靶分子,ERα的表達可改變H19 水平,通過抑制促凋亡基因

BIK

NOXA

的表達,降低紫杉醇(paclitaxel,PTX)治療后的細胞凋亡率。內(nèi)分泌治療被廣泛應(yīng)用于ERα陽性乳腺癌的治療中,但內(nèi)分泌治療抵抗(endocrine therapy resistance,ETR)的頻繁發(fā)生導(dǎo)致了疾病復(fù)發(fā)率增加,患者的總生存時間減少。原發(fā)性乳腺腫瘤中H19 與ERα的表達水平呈正相關(guān)。H19 可在轉(zhuǎn)錄和蛋白質(zhì)水平上調(diào)節(jié)ERα的表達,阻斷NOTCH 和c-met 信號通路可顯著下調(diào)H19/ERα的表達水平。這種信號通路的藥物抑制劑有助于逆轉(zhuǎn)對內(nèi)分泌治療的抵抗,如他莫昔芬和氟維司群。Wang 等研究表明,H19 表達上調(diào)可通過H19/S-腺苷基高半胱氨酸水解酶(Sadenosylhomocysteine hydrolase,SAHH)/DNA 甲基轉(zhuǎn) 移 酶3β(DNA methyltransferase 3 beta,DNMT3B)軸降低

Beclin1

啟動子區(qū)的甲基化,增強雌激素受體(estrogen receptor,ER)陽性乳腺癌細胞的自噬作用,并最終導(dǎo)致三苯氧胺耐藥。此外,H19 的過表達增強了乳腺癌細胞對多柔比星(doxorubicin)的耐藥性。H19 誘導(dǎo)多柔比星耐藥的主要效應(yīng)蛋白可能包括多藥耐藥蛋白1(multidrug resistance protein 1,MDR1)和多藥耐藥蛋白4(multidrug resistance protein 4,MDR4)。泛素連接酶cullin 4A(CUL4A)被認為是介導(dǎo)H19 和MDR1表達的一個重要因素,CUL4A 的高表達損害了細胞對多柔比星的化療敏感性,導(dǎo)致接受化療的乳腺癌患者的生存率降低。總之,H19 能夠影響乳腺癌細胞的耐藥性和化療敏感性,使乳腺癌細胞對化療藥物的反應(yīng)減弱,導(dǎo)致腫瘤治療的療效下降。

4.2 lincRNA-ROR

近年來大量臨床藥物研究表明,lincRNA-ROR表達上調(diào)可導(dǎo)致乳腺癌化療耐受,是乳腺癌多重耐藥的一個標(biāo)志物。據(jù)報道,lincRNA-ROR 在乳腺癌中可通過抑制miRNA-205-5p 的表達和增強鋅指E-盒結(jié)合同源異形盒1(zinc finger E-box binding homeobox 1,ZEB1)、鋅指E-盒結(jié)合同源異形盒2(zinc finger E-box binding homeobox 2,ZEB2)轉(zhuǎn)錄因子的表達促進EMT 過程,從而促進乳腺癌細胞侵襲和三苯氧胺抵抗。另有研究表明,由于lincRNA-ROR 可以充當(dāng)miRNA-194-3p 的ceRNA海綿并下調(diào)其表達,因此通過lincRNA-ROR/miRNA-194-3p/甲 基 化CpG 結(jié) 合 蛋 白2(methyl-CpG binding protein 2,MECP2)調(diào)控軸,lincRNA-ROR 可以下調(diào)雷帕霉素靶蛋白(mechanistic target of rapamycin kinase,MTOR)水平以抑制血管生成,然后降低乳腺癌細胞對雷帕霉素的敏感性。此外,lincRNA-ROR 可通過沉默miRNA-34a 的表達抑制吉西他濱誘導(dǎo)的乳腺癌細胞自噬和凋亡。總之,高表達的lincRNA-ROR 可促進波形蛋白、神經(jīng)型鈣黏蛋白的表達,抑制上皮黏蛋白的mRNA 及蛋白表達,進而導(dǎo)致對5-氟尿嘧啶、PTX、他莫昔芬、吉西他濱等藥物耐受,是乳腺癌化療、激素治療泛耐藥的一個分子標(biāo)志物。

4.3 lncRNA HOTAIR

HOTAIR 的異常表達已被廣泛地作為不同實體瘤的耐藥標(biāo)志物。Xue 等研究結(jié)果表明,37 個lncRNA 基因被雌激素抑制并在三苯氧胺耐藥細胞中被上調(diào)。

HOTAIR

是三苯氧胺耐藥乳腺癌中主要上調(diào)lncRNA 的基因,它能夠與ER 相互作用,抑制ER 的表達,且在缺乏配體的情況下也能增強其轉(zhuǎn)錄活性。HOTAIR 過表達可誘導(dǎo)ER 靶基因表達,如

GREB1

TFF1

c

-

myc

。另一項研究表明,在抗曲妥珠單抗的乳腺癌細胞株中,HOTAIR 過表達。在這些細胞中,HOTAIR 能夠促進腫瘤細胞從G期向S 期轉(zhuǎn)變,抑制細胞凋亡。

4.4 其他lncRNA

研究表明,lncRNA-ATB 高表達與曲妥珠單抗耐藥相關(guān),并且對乳腺癌細胞侵襲和曲妥珠單抗耐藥具有多效性作用。另有研究發(fā)現(xiàn),敲除曲妥珠單抗耐藥細胞中的生長抑制特異性基因5(growth arrest specific 5,GAS5)可導(dǎo)致磷酸酶與張力蛋白同源物(phosphatase and tensin homolog,PTEN)表達降低。PTEN 在人類中廣泛表達,它可使磷脂酰肌醇-3,4,5-三磷酸(phosphatidylinositol 3,4,5-triphosphate,PIP3)去磷酸化,并負性調(diào)節(jié)AKT/磷脂酰肌醇-3-羥激酶(phosphatidylinositol 3-hydroxy kinase,PI3K)途徑,這是一種已知的提高藥物敏感性的信號途徑。這些發(fā)現(xiàn)表明,GAS5 的下調(diào)可以導(dǎo)致曲妥珠單抗耐藥乳腺癌細胞中

PTEN

基因的去抑制,從而導(dǎo)致乳腺癌細胞對曲妥珠單抗耐藥。結(jié)腸癌相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子2(colon cancer associated transcript 2,CCAT2)、BCAR4 以及尿路上皮癌相關(guān)基因1(urothelial cancer associated 1,UCA1)在三苯氧胺耐藥乳腺癌細胞中高表達,CCAT2 通過ERK/促分裂原活化的蛋白激酶(mitogenactivated protein kinase,MAPK)信號通路在ER陽性乳腺癌細胞三苯氧胺耐藥中發(fā)揮重要作用,BCAR4 在三苯氧胺耐藥中的作用由ERBB2/erb-b2受體酪氨酸激酶3(erb-b2 receptor tyrosine kinase 3,ERBB3)信號通路驅(qū)動,而UCA1 被認為通過激活A(yù)KT/MTOR 信號通路促進乳腺癌細胞對三苯氧胺的耐藥性。

5 靶向lncRNA 治療乳腺癌的方法

lncRNA 在腫瘤組織和正常組織中的表達具有差異。已有研究發(fā)現(xiàn)lncRNA 參與多種細胞過程并導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生、發(fā)展,這些研究促進了針對致癌lncRNA 惡性腫瘤新療法的發(fā)展。然而,將lncRNA 作為靶點應(yīng)用于新的治療方法需要更深入的研究。目前多種方法通過靶向lncRNA 并調(diào)節(jié)其表達以達到治療目的,包括靶l(wèi)ncRNA 的失穩(wěn)和降解、適配體對lncRNA 功能的破壞、小分子抑制劑對lncRNA 結(jié)合位點的掩蔽作用、Morpholinos 以及CRISPR/Cas9 技術(shù)等。采用RNA 干擾(RNA interference,RNAi)介導(dǎo)的基因沉默技術(shù)選擇性沉默lncRNA 是臨床中應(yīng)用的一種方法。基因治療是向乳腺癌細胞傳遞抑癌基因lncRNA 的另一種治療方法。然而,需要指出的是,在實施治療性RNAi 和基因治療的過程中仍然存在許多技術(shù)挑戰(zhàn)。另一種策略是利用反義寡核苷酸(antisense oligonucleotide,ASO)、單鏈DNA 或RNA 分子靶向lncRNA,這些分子能夠與靶RNA 結(jié)合,并通過核糖核酸酶H1(ribonuclease H1,RNASEH1)促進其沉默。已有研究證實了利用ASO 阻斷MALAT1 可以阻止肺癌細胞的轉(zhuǎn)移。ASO 可以設(shè)計成靶向其他具有致癌作用的lncRNA,從而限制其表達。因此,lncRNA 分子可能是乳腺癌患者的“下一代”治療選擇。

6 lncRNA 作為乳腺癌預(yù)后標(biāo)志物

近幾十年來越來越多的證據(jù)表明,lncRNA 在腫瘤發(fā)展的各種過程中發(fā)揮著重要作用,lncRNA的差異表達模式已被認為是腫瘤診斷和預(yù)后評估的潛在有效生物標(biāo)志物。研究報道,血清HIF-1α穩(wěn)定長鏈非編碼RNA(HIF-1α-stabilizing long noncoding RNA,HISLA)表達與乳腺癌的組織學(xué)分級、TNM 分期和遠處器官轉(zhuǎn)移顯著相關(guān),受試者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲線分析顯示,血清HISLA 可用于乳腺癌患者與健康對照者的鑒別,且HISLA 高表達與患者的總體預(yù)后不良密切相關(guān)。這些發(fā)現(xiàn)表明血清HISLA 水平可作為乳腺癌患者的預(yù)后預(yù)測因子。另有一項研究確定了8 個免疫相關(guān)的lncRNA 作為乳腺癌患者潛在的預(yù)后工具,它與風(fēng)險值、腫瘤狀態(tài)和生存情況密切相關(guān)。這為乳腺癌中免疫相關(guān)lncRNA 的研究提供了新的視角,并有助于發(fā)現(xiàn)預(yù)后和免疫治療的潛在生物標(biāo)志物。此外,一個新的與自噬相關(guān)的預(yù)后風(fēng)險模型以及一個與乳腺癌干細胞相關(guān)的lncRNA 集合相繼被發(fā)現(xiàn),在未來,通過前瞻性研究的驗證,lncRNA 可能會提高預(yù)測的準確性,并指導(dǎo)乳腺癌患者的個體化治療。

7 小結(jié)

lncRNA 作為基因表達的重要調(diào)控因子,具有廣泛的功能,能夠通過多種途徑影響乳腺癌的發(fā)生發(fā)展。lncRNA 在鑒別正常組織、腫瘤組織甚至乳腺癌不同分期方面的潛力尚需進一步研究,使其成為乳腺癌診斷和預(yù)后預(yù)測生物標(biāo)志物。各種lncRNA 通過調(diào)控靶基因的表達、編碼腫瘤抑制因子miRNA 和控制信號通路促進乳腺癌耐藥。因此,靶向lncRNA 可能成為乳腺癌耐藥的一種潛在的治療方法。基于RNA 的治療新進展使lncRNA成為新的治療靶點,可能為更安全、更有效地治療乳腺癌提供新的希望。然而,RNA 治療技術(shù)的發(fā)展仍然存在許多共同的挑戰(zhàn),包括缺乏安全、特異和有效的載體類型,不確定最佳劑量方案以及非靶向效應(yīng)。本研究討論了一些與乳腺癌密切關(guān)聯(lián)的lncRNA,它們有可能作為乳腺癌診斷、預(yù)后預(yù)測的生物標(biāo)志物。盡管lncRNA 可能具有治療價值,但在其應(yīng)用于臨床之前仍需進一步研究,還需要克服許多挑戰(zhàn)。

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